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        木通屬植物種質(zhì)資源的SRAP分析

        2016-05-14 08:41:20黃佩蓓陳世華王飛曾賢
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年7期
        關(guān)鍵詞:遺傳多樣性

        黃佩蓓 陳世華 王飛 曾賢

        摘要:采用SRAP標(biāo)記技術(shù),對(duì)木通屬25份藥用植物材料進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明,在選用的12對(duì)引物中,共檢測(cè)到173條多態(tài)性條帶,多態(tài)性比率達(dá)83.2%,相似系數(shù)變化范圍為0.275 8~0.931 0,UPGMA聚類分析將25個(gè)供試樣品分為二類:五葉木通為一類,白木通和三葉木通聚為一類:SRAP標(biāo)記適合木通屬植物的遺傳多樣性、親緣關(guān)系分析。

        關(guān)鍵詞:木通屬;相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(SRAP);遺傳多樣性

        木通屬植物作為中國(guó)傳統(tǒng)中藥材,目前國(guó)內(nèi)外研究的主要有3種:木通(俗稱五葉木通)、三葉木通及其變種白木通。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,近年來RAPD、AFLP分子標(biāo)記技術(shù)相繼成功應(yīng)用于木通屬植物的研究,但RAPD穩(wěn)定性差、擴(kuò)增產(chǎn)率低,AFLP技術(shù)復(fù)雜,使其應(yīng)用受限。SRAP(Sequence-related amplified polymorphism,相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性)是一種新型的分子標(biāo)記技術(shù),它結(jié)合了RAPD和AFLP分析的優(yōu)點(diǎn),操作簡(jiǎn)便、結(jié)果穩(wěn)定、中等產(chǎn)率、成本低,目前已被廣泛應(yīng)用,但利用SRAP標(biāo)記技術(shù)分析木通屬植物遺傳多樣性的研究尚未見報(bào)道。為此,運(yùn)用SRAP標(biāo)記技術(shù)分析25份木通屬藥用植物的遺傳多樣性,旨在為木通屬藥用植物的選種栽培提供參考,并探討SRAP標(biāo)記在木通屬藥用植物種質(zhì)資源研究中的可行性。

        1.材料與方法

        1.1材料

        供試材料均采自江西省境內(nèi),由江西中醫(yī)藥大學(xué)賴學(xué)文教授鑒定。具體材料名稱及來源地見表1。

        1.2方法

        1.2.1DNA提取 取新鮮嫩葉約0.1 g,參照王飛等的方法分別提取不同材料的總DNA。

        1.2.2SRAP分析 SRAP引物采用Li等公布的序列,由上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成(表2)。

        SRAP-PCR反應(yīng)體系(25 μL總體積):模板DNA90 ng,dNTPs 200 μmol/L,Taq DNA聚合酶1 u,引物0.4 μmol/L,10xPCR Buffer 2.5 μL,其余用ddH2O補(bǔ)齊。SRAP-PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性3 min;94℃1 min,35℃1 min,72℃2 min,5個(gè)循環(huán);94℃1 min,55℃1 min,72℃1 min,35個(gè)循環(huán):72℃延伸10 min;4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),在紫外凝膠成像系統(tǒng)上觀察和記錄。

        1.2.3數(shù)據(jù)處理 根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果,每個(gè)樣品的擴(kuò)增帶數(shù)按有帶賦值為“1”(強(qiáng)帶和弱帶同記),無帶為“0”,建立“1”和“0”型數(shù)據(jù)。利用NTSYS軟件計(jì)算相似系數(shù),用UPGMA進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建樹狀圖。

        2.結(jié)果與分析

        2.1SRAP多態(tài)性分析

        采用42對(duì)引物組合對(duì)25份木通屬植物材料進(jìn)行擴(kuò)增,其中12對(duì)引物組合可擴(kuò)增出清晰的多態(tài)性條帶,擴(kuò)增結(jié)果及多態(tài)性信息見表3。從表3可以看出,共檢測(cè)到清晰條帶208條,其中多態(tài)性條帶173條,平均每對(duì)引物產(chǎn)生14.4條多態(tài)性條帶,平均多態(tài)率為83.2%,表明木通屬植物具有較為豐富的遺傳多樣性。不同引物組合擴(kuò)增條帶大小集中在100~1 400bp。

        引物組合Me4-Em8擴(kuò)增結(jié)果見圖1。圖1表明,SRAP分子標(biāo)記能檢測(cè)出較多的木通屬植物的遺傳位點(diǎn),獲得多態(tài)性相對(duì)較好的PCR結(jié)果,SRAP標(biāo)記適合木通屬植物的遺傳多樣性分析。

        2.2聚類分析

        采用NTSYS-PC軟件對(duì)這些擴(kuò)增條帶進(jìn)行遺傳差異的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,其相似系數(shù)結(jié)果見表4,聚類分析結(jié)果見圖2。

        從表4可以看出,25份供試材料的相似系數(shù)變化范圍在0.275 8-0.931 0之間。白木通和三葉木通的相似系數(shù)在0.517 2~0.758 6之間,均值為0.637 9:白木通和五葉木通的相似系數(shù)在0.275 8-0.620 6之間,均值為0.448 2:而三葉木通和五葉木通的相似系數(shù)在0.310 3-0.689 6之間,均值為0.500 0。由相似系數(shù)可以看出,三葉木通和白木通的遺傳相似系數(shù)最大,二者親緣關(guān)系較近:白木通與五葉木通的遺傳相似系數(shù)最小,二者親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

        從圖2可以看出,根據(jù)SRAP標(biāo)記得到25份材料的聚類結(jié)果顯示,在相似系數(shù)0.45處可將參試材料分為2類,白木通和三葉木通聚為一類,五葉木通聚為一類:白木通與三葉木通聚為一類后,最終和五葉木通聚為一類。大部分來自相同或相似生態(tài)地理環(huán)境的能聚為一類,表現(xiàn)地域相似性,如來自廬山的白木通聚為一類(C2、C3),來自井岡山的白木通聚為一類(c4、v5),來自南昌梅嶺的三葉木通聚為一類(V8、V9、V10和V11、V12、V14、),三清山的聚為一類(V16、V17),云居山的聚為一類(V18、V19)。

        3.小結(jié)

        試驗(yàn)采用12對(duì)SRAP標(biāo)記引物對(duì)25個(gè)木通屬植物樣品基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,得到清晰條帶208條,多態(tài)性條帶173條,多態(tài)性比率為83.2%,表明SRAP技術(shù)對(duì)木通屬植物的擴(kuò)增具有較高的效率,適于其種質(zhì)遺傳變異檢測(cè),是一種有效、可靠的分子標(biāo)記,將為進(jìn)一步開展木通屬種質(zhì)資源的鑒定及其良種選育工作奠定基礎(chǔ)。

        聚類分析結(jié)果表明,3種木通屬植物有明顯的界限,白木通聚為一類,三葉木通聚為一類,五葉木通聚為一類,白木通與三葉木通聚為一類后,最終和五葉木通聚為一類:此結(jié)果與傳統(tǒng)分類結(jié)果相符。

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