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        蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊在小菜蛾蛋白質(zhì)基因組研究方面獲得突破

        2016-03-27 13:59:50
        蔬菜 2016年5期
        關鍵詞:中腸小菜蛾殺蟲劑

        蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊在小菜蛾蛋白質(zhì)基因組方面取得重要突破,相關研究成果近期在線發(fā)表在蛋白組學權威期刊Molecular & Cellular Proteomics(分子與細胞蛋白組學)上。

        隨著高通量測序技術的不斷發(fā)展,上萬種生物的全基因組DNA序列被測序完成。其基因組的注釋主要基于預測軟件和已知蛋白的同源搜索,不可避免地導致編碼蛋白質(zhì)基因的錯誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外,由于缺少肽段等信息,大量基因被注釋為未知功能或假設的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)基因組(Proteogenomics)是一種利用蛋白質(zhì)組學的相關數(shù)據(jù)對基因組進行注釋校正的新方法,由于其結合了大量生物體蛋白質(zhì)氨基酸信息,從而有力地彌補了基因組上基因?qū)ふ液妥⑨尩牟蛔?。小菜蛾是一種世界性重要農(nóng)業(yè)害蟲,每年因小菜蛾造成的損失高達40億~50億美元。小菜蛾幾乎對所有的殺蟲劑均產(chǎn)生了不同程度的抗藥性,包括微生物殺蟲劑Bt。蟲害防控創(chuàng)新團隊利用shotgun HPLC-ESI-MS/MS對小菜蛾幼蟲中腸蛋白質(zhì)進行測定,結合其基因組數(shù)據(jù),完成了首個小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質(zhì)譜圖,鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲劑抗性相關的蛋白質(zhì),同時,還糾正了小菜蛾的基因注釋,鑒定了大量新基因以及新的基因剪切形式,相關研究結果為闡明小菜蛾對Bt殺蟲劑抗性調(diào)控網(wǎng)絡提供了重要的遺傳信息。

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