湄洲灣潮間帶底棲生物多樣性

黃雅琴，李榮冠，王建軍，等

生物學基礎學科

湄洲灣潮間帶底棲生物多樣性

黃雅琴，李榮冠，王建軍，等

為了了解福建省湄洲灣潮間帶底棲生物的物種多樣性、數(shù)量時空分布及群落結構現(xiàn)狀，2005年11月和2006年4月在湄洲灣潮間帶選擇了靈川（Mch1）、蘇厝（Mch2）、郭厝（Mch3）、東吳（Mch4）和東橋（Mch5）5條斷面進行了調(diào)查。共鑒定潮間帶底柄生物225種，其中多毛類、軟體動物和甲殼動物占總種數(shù)的88.00%，三者構成潮間帶底棲生物的主要類群。斷面間比較，東橋斷面種數(shù)較多，蘇厝斷面較少。季節(jié)比較，春季各斷面種類較秋季多。平均生物量22.91 g/m2，以軟體動物居第一位，甲殼動物居第二位；平均棲息密度為388/m2，以多毛類居第一位，軟體動物居第二位。生物量以中潮區(qū)＞低潮區(qū)＞高潮區(qū)；棲息密度以低潮區(qū)＞中潮區(qū)＞高潮區(qū)。調(diào)查結果顯示湄洲灣潮間帶底棲生物物種多樣性較高，群落結構相對穩(wěn)定。

濱海濕地；生態(tài)；群落結構

來源出版物：生物多樣性， 2010， 18（2）: 156-161

入選年份：2012

甲醛誘導的磷酸化減弱Tau蛋白與DNA相互作用

盧靜，苗君葉，潘榮，等

異常磷酸化Tau蛋白是神經(jīng)纖維纏結的主要成分，也是老年癡呆的典型病理特征之一。本實驗室前期報道了Tau蛋白具有保護DNA的作用，但磷酸化對Tau與DNA相互作用的影響需要進行探索，這對于揭示 Tau蛋白異常磷酸化與神經(jīng)細胞死亡之間的關系具有一定的參考價值。本文采用甲醛孵育N2a細胞，引起了細胞內(nèi)Tau蛋白的過度磷酸化。實驗結果進一步顯示，甲醛孵育組的細胞核內(nèi)磷酸化Tau蛋白與DNA非共定位存在，而對照組細胞核內(nèi)Tau蛋白與DNA存在一定程度的共定位現(xiàn)象。電泳遷移率實驗檢測GSK-3β催化的磷酸化Tau蛋白與DNA的結合情況，可以觀察到磷酸化減弱了Tau蛋白與DNA的相互結合。這些結果表明，異常磷酸化可以使Tau蛋白喪失對DNA的保護作用，這可能是Tau蛋白異常磷酸化引起DNA損傷甚至細胞死亡的原因之一。

內(nèi)源甲醛；Tau蛋白；磷酸化；DNA；保護作用；細胞死亡；認知功能損傷

來源出版物：生物化學與生物物理進展， 2011， 38（12）: 1113-1120

入選年份：2013

小麥轉(zhuǎn)基因方法及其評述

葉興國，陳明，杜麗璞，等

小麥是遺傳轉(zhuǎn)化比較困難的作物之一。為了克服小麥基因工程育種和功能基因組學研究的障礙，人們分別嘗試利用基因槍、花粉管通道、超聲波、離子束注入，激光微柬穿刺、PEG（Polyethylene glycol）、電擊和農(nóng)桿菌等方法轉(zhuǎn)化小麥。涉及的受體材料包括幼胚、成熟胚、花藥愈傷組織、幼穗，芽尖和花器官。文章對小麥主要遺傳轉(zhuǎn)化方法及其應用進行了介紹、回顧和評述，分析、比較了獲得安全型轉(zhuǎn)基因小麥的幾種策略，以期增強讀者對小麥轉(zhuǎn)基因技術和進展的了解，促進小麥轉(zhuǎn)化技術的持續(xù)改進和提高。

小麥；遺傳轉(zhuǎn)化

來源出版物：遺傳， 2011， 33（5）: 422-430

入選年份：2013

飼料脂肪水平對吉富羅非魚生產(chǎn)性能、營養(yǎng)物質(zhì)消化及血液生化指標的影響

王愛民，韓光明，封功能，等

為探討吉富羅非魚對脂肪的適宜需求量，將 630尾［（2.63±0.16）g］吉富羅非魚隨機分成6個脂肪組的飼料組（1.73%、3.71%、5.69%、7.67%、9.64%和16.55%），每組設置3個重復，每個重復35尾，第1組為對照組，投喂基礎日糧（含脂肪1.73%），另外5組為試驗組，在基礎日糧中分別添加2%、4%、6%、8%、15%的魚油，飼養(yǎng)90 d后測定生長、餌料系數(shù)、營養(yǎng)物質(zhì)表觀消化率及血液常規(guī)生化指標。結果顯示，隨著飼料脂肪水平提高，增重率和特定生長率呈現(xiàn)一個先上升后下降的趨勢（P＜0.05），蛋白質(zhì)效率極顯著地提高（P＜0.01），餌料系數(shù)極顯著地下降（P＜0.01）。增重率與飼料脂肪水平的二次多項式回歸分析顯示，吉富羅非魚獲得最高增長所需飼料的最佳脂肪水平為9.34%。飼料脂肪水平對粗蛋白表觀消化率和飼料干物質(zhì)表觀消化率無顯著影響（P＞0.05），飼料脂肪水平增加顯著提高了粗脂肪和磷的表觀消化率（P＜0.05）。未添加魚油的 1.73%組血液中白蛋白和白球比均顯著高于其他組（P＜0.05），隨著飼料脂肪水平的提高，膽固醇的濃度及堿性磷酸酶的活性極顯著地上升（P＜0.01）。飼料脂肪水平對血糖濃度有顯著影響（P＜0.05），對甘油三酯濃度、谷丙和谷草轉(zhuǎn)氨酶的活性無顯著影響（P＞0.05）。結果表明，飼料中的脂肪水平可以促進吉富羅非魚對脂肪和磷的表觀消化率，但是脂肪水平過高會對魚體增重及血液生化參數(shù)產(chǎn)生負作用，從生產(chǎn)上來說吉富羅非魚魚種對脂肪的適宜需求量為7.67%～9.34%。

吉富羅非魚；脂肪水平；生產(chǎn)性能；表觀消化率；血液生化指標

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（1）: 80-87

入選年份：2013

黃芪多糖對齊口裂腹魚生長、體組成和免疫指標的影響

向梟，陳建，周興華，等

試驗研究黃芪多糖對齊口裂腹魚生長性能、體組成及免疫指標的影響。以450尾健康的齊口裂腹魚［體重（6.98±0.43）g；體長（9.11±0.25）cm］為試驗對象，隨機分為5組（C1、C2、C3、C4、C5），每組3個重復，每重復30尾試驗魚。C1、C2、C3、C4、C5組分別投喂在等氮等能（蛋白質(zhì)含量38.29%，能量15.73 nl/kg）的基礎料中分別添加 0、0.02、0.04、0.06、0.08%的黃芪多糖制成5種試驗飼料，養(yǎng)殖齊口裂腹魚50d。結果表明：飼料中未添加黃芪多糖組的增重率（WGR）、特定生長率（SGR）、飼料蛋白效率（PER）均顯著低于黃芪多糖添加組（P＜0.05），而餌料系數(shù)（FCR）則顯著高于黃芪多糖添加組（P＜0.05）。當黃芪多糖添加水平為0.04%時，試驗魚的WGR、SGR、PER均達到最大（分別為110.31%、1.86%/d和182.07%），F(xiàn)CR最低（1.44），與其他各組差異顯著（P＜0.05）；以WGR、SGR、PER、FCR為指標，利用直線和拋物線回歸分析表明，齊口裂腹魚生長性能最佳時黃芪多糖添加水平為 0.045%～0.074%；對齊口裂腹魚機體組成分析表明，黃芪多糖對魚體粗灰分和水分影響不顯著（P＞0.05），黃芪多糖添加水平為0.06%時機體粗蛋白最高，但與黃芪多糖添加水平為 0.04%時無明顯差異（P＞0.05）；粗脂肪含量在黃芪多糖添加水平為0.04%時最高，與其他各組差異顯著（P＜0.05）；未添加黃芪多糖組血清免疫酶活性顯著低于黃芪多糖添加組，齊口裂腹魚血清免疫酶活性在一定范圍內(nèi)隨黃芪多糖的增加而增強。黃芪多糖添加水平為 0.04%時，堿性磷酸酶（ALP）活性最高；酸性磷酸酶（ACP）活性在黃芪多糖添加水平 0.06%時最大；黃芪多糖添加水平應在0.06～0.08%時，溶菌酶（LSZ）、超氧化歧化酶（SOD活性趨于穩(wěn)定。這說明黃芪多對齊口裂腹魚的生長和免疫力有明顯的促進作用。綜合考慮齊口裂腹魚生長性能和免疫能力最佳時黃芪多糖添加水平為0.04～0.074%。

黃芪多糖；生長；機體組成；免疫；齊口裂腹魚

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（2）: 291-299

入選年份：2013

建鯉GHR基因多態(tài)性及與增重相關的SNP位點的篩選

陶文靜，馬龍俊，阮瑞霞，等

生長激素是調(diào)控動物生長的關鍵因子，它通過與膜蛋白生長激素受體結合后發(fā)揮作用，因此生長激素受體基因的變異對動物生長有著重要的影響。實驗根據(jù)已分離的4個建鯉jlGHRs基因，通過測定來自6尾建鯉的序列，共找到38個SNP位點。使用PCR-RFLP方法檢測了353尾建鯉在其中5個SNP位點（1a內(nèi)含子3 A43G、1a外顯子8 A361G、1b外顯子8 C12T、2a外顯子8 A555G和2b外顯子8 A315G）的基因型，分析了不同基因型與生長性狀的相關性。結果表明5個位點均與增重顯性相關；1a內(nèi)含子3 A43G還與體高/體長和體厚/體長顯性相關；1b外顯子8 C12T與體高/體長和尾柄高/尾柄長顯性相關；1a外顯子8 A361G和2a外顯子8A555G也與尾柄高/尾柄長顯性相關。數(shù)據(jù)分析還顯示增重標記個數(shù)富集4個以上的個體明顯比標記少的個體生長快，在選育群中增重標記數(shù)有 2個的個體最多占30%，而增重標記數(shù)4個以上的只占14%，說明存在著較大的選育空間。實驗篩選的5個位點可以作為建鯉分子育種的有效標記。

建鯉；GHR；多態(tài)性；增重；體型；相關性

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（4）: 622-629

入選年份：2013

一株草魚呼腸孤病毒弱毒株的分離、鑒定及免疫原性初步分析

曾偉偉，王慶，劉永奎，等

從江西南昌患出血病草魚體內(nèi)分離出的草魚病毒（暫命名為JX09-01）能使草魚腎臟細胞（CIK）、草魚肝細胞（L8824）、草魚吻端成纖維細胞（PSF）產(chǎn)生明顯的細胞病變效應（CPE）。感染 CIK細胞固定后經(jīng)電鏡觀察，發(fā)現(xiàn)細胞質(zhì)內(nèi)有大量病毒聚集，形態(tài)和排列方式與已報道的草魚呼腸孤病毒（Grass carp reovirus，GCRV）相似。針對GCRV 873株S6基因設計的簡并引物可以從病料組織和感染細胞中擴增出目的條帶，而針對GCRVHZ08株S6基因設計特異性引物未能擴增出目的條帶。對JX09-01株的S6全基因進行序列分析表明，其核苷酸序列同GCRV 873株和HZ08株的同源性分別是 99.3%和 30.4%，推導出的氨基酸序列同源性分別是98.6%和30%，說明草魚病毒JX09-01株為草魚呼腸孤病毒。用JX09-0l株接種當年8～10 cm左右的草魚，沒有明顯的臨床癥狀，不能致草魚死亡。用傳代至 15代的CIK細胞病毒液進行免疫保護試驗，結果顯示其對強毒株的免疫保護率達到86.7%。實驗結果初步顯示，新分離到的JX09-01為草魚呼腸孤病毒弱毒株，可作為弱毒疫苗的候選毒株。

草魚呼腸孤病毒；分離；鑒定；序列分析；免疫原性

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（5）: 790-795

入選年份：2013

太湖大型底棲動物群落結構及多樣性

蔡永久，龔志軍，秦伯強

為揭示現(xiàn)階段太湖大型底棲動物群落現(xiàn)狀及其對生態(tài)環(huán)境變化的響應。于2007年2月—2008年11月對太湖大型底棲動物進行為期兩周年的季度調(diào)查。30個采樣點共記錄底棲動物3門7綱19科40種，底柄動物平均密度和生物量空間差異較大，平均密度高值出現(xiàn)在梅梁灣、竺山灣及河口，主要為寡毛綱顫蚓類；平均生物量高值出現(xiàn)在貢湖灣、西湖區(qū)、東太湖和東部湖灣，主要為軟體動物?；舾λz蚓（Limnodrilus hoffmeisteri）、中華河吲（Rhyacodrilus sinicus）、河蜆（Corbicula fluminea）、銅銹環(huán)棱螺（Bellamya aeruginosa）、中國長足搖蚊（Tanypus chinensis）和鉤蝦屬一種（Gammarus sp.）是現(xiàn)階段太湖大型底棲動物的優(yōu)勢種。聚類分析將30個采樣點分成3組，相似性分析檢驗表明各聚類組大型底棲動物群落具有顯著差異（P＜0.05）。多樣性分析結果表明，東太湖和東部湖灣物種多樣性、豐富度和均勻度最高，優(yōu)勢種為腹足綱螺類；梅梁灣、竺山灣及河口多樣性最低、密度最高，霍甫水絲蚓和中華河蚓在該區(qū)占據(jù)絕對優(yōu)勢；貢湖灣、湖心和西湖區(qū)多樣性處于中等水平，其優(yōu)勢種為河蜆。研究結果表明營養(yǎng)水平、底質(zhì)類型以及水生植被的分布是決定太湖大型底棲動物群落結構及多樣性的關鍵因子。

顫蚓科；軟體動物；功能攝食類群；空間分布格局；富營養(yǎng)化

來源出版物：生物多樣性， 2010， 18（1）: 50-59

入選年份：2013

中華絨螯蟹微衛(wèi)星標記與生長性狀相關性的初步分析

吳滟，付春鵬，蔣速飛，等

研究采用 30個微衛(wèi)星標記分析同池養(yǎng)殖的長江水系中華絨螯蟹群體，以篩選生長性狀（體重、體長和體寬）相關的分子標記。結果表明，位點ESIN33、ESC29和ESC57與體重、體寬和體高呈極顯著相關（P＜0.01）；位點ESC65與體高、體寬呈極顯著相關（P＜0.01），與體重呈顯著相關（P＜0.05）。不同基因型間的多重比較表明，ESIN33位點的AC基因型、ESC29位點的DD基因型、ESC65位點的BB基因型的平均體重、體寬和體高均高于其他基因型，且差異顯著，是生長性狀的優(yōu)勢基因型。研究結果可為中華絨螯蟹的分子標記輔助選育提供參考。

中華絨螯蟹；微衛(wèi)星；生長性狀；相關性分析

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（2）: 197-202

入選年份：2014

南極磷蝦種群生物學研究進展Ⅰ：年齡、生長與死亡

朱國平

南極磷蝦通常是指南極大磷蝦（Euphausia superba Dana，1852），它隸屬于節(jié)肢動物門（Arthropoda）、甲殼綱（Crustacea）、磷蝦目（Euphausiacea）、磷蝦科（Euphausiidae）、磷蝦屬（Euphausia），個體最大體長可達65 mm，體重2 g，漁業(yè)捕撈的主要磷蝦群體為體長介于40～65 mm的較大成體。南極磷蝦是南極海域磷蝦類中數(shù)量最多，個體最大種類，是漁業(yè)的捕撈對象，最大密度分布在大西洋區(qū)。

南極磷蝦；種群生物學；年齡；生長；死亡

來源出版物：水生生物學報， 2011， 35（5）: 862-868

入選年份：2014

三疣梭子蟹蛻皮周期中MIH基因mRNA水平與蛻皮激素濃度變化

汪春建，朱冬發(fā)，亓一舟，等

甲殼動物的蛻皮過程被認為是由位于眼柄的 X器-竇腺復合體（XO-SG）分泌蛻皮抑制激素（MIH）通過調(diào)節(jié)Y器（YO）合成蛻皮激素而調(diào)控的。通過實時熒光定量PCR（qRT-PCR）發(fā)現(xiàn)MIH基因在三疣梭子蟹眼柄X器-竇腺復合體中表達最強。采用qRT-PCR分析了MIH基因在三疣梭子蟹蛻皮周期中的表達變化，結果表明；A期為（0.42±0.08）倍，B期為（1.09±0.09）倍，C期為（1.35±0.16）倍，D0亞期為（1.00±0.10）倍，D1亞期（0.78±0.07）倍，D2亞期為（0.27±0.08）倍，D3/4亞期為（0.20±0.04）倍。采用高效液相色譜-電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）法完成了三疣梭子蟹蛻皮周期中蛻皮激素（20E）濃度變化的測定。A/B期蛻皮激素的濃度較低，低于儀器檢測限0.33 pg，C期為（1.666±0.762）ng/mL，D0亞期為（4.047±1.5133）ng/mL，D1亞期為（6.756±4.928）ng/mL，D2亞期為（8.609±3.827）ng/mL，D3亞期為（19.534±4.799）ng/mL，D4亞期為 11.616 ng/mL。在三疣梭子蟹蛻皮周期中，MIH基因表達量與血淋巴中蛻皮激素濃度呈現(xiàn)一定拮抗性，揭示MIH抑制Y器合成蛻皮激素而調(diào)控著三疣梭子蟹蛻皮的發(fā)生和進行。

三疣梭子蟹；蛻皮周期；蛻皮抑制激素；實時熒光定量PCR；高效液相色譜-電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜

來源出版物：水生生物學報， 2013， 37（1）: 22-28

入選年份：2014

細胞自噬的研究方法

馬泰，孫國平，李家斌

細胞自噬的研究是目前生物醫(yī)學領域熱點之一，廣泛參與各種生理和病理過程。目前普遍采用的自噬檢測方法包括電鏡、免疫熒光、蛋白質(zhì)印跡等方法檢測自噬體及其標志蛋白。研究的深入對自噬的檢測方法也提出了更高的要求，自噬功能障礙包括自噬體形成和降解障礙，因此，準確全面地評估自噬不僅包括自噬體的檢測，還包括動態(tài)觀察整個自噬性降解的過程是否順暢（即自噬潮分析）。另外，通過藥物或基因干預技術來人為地調(diào)控自噬以觀察其在體內(nèi)體外模型中的作用也是自噬分析的重要內(nèi)容。需要注意的是，任何一種方法單獨應用均不能作為自噬的依據(jù)，對任何方法得到的結果進行解釋時必須慎重，特別是不能將自噬體的增多減少或自噬相關蛋白表達的高低等同于自噬的增強或減弱。

細胞自噬；自噬體；微管相關蛋白1輕鏈3；自噬潮；檢測方法

來源出版物：生物化學與生物物理進展， 2012， 39（3）: 204-209

入選年份：2014

中藥治療阿爾茨海默病的作用特點

李林，張?zhí)m

阿爾茨海默病（AD）是一種多因素相關的復雜性疾病，目前臨床治療效果不佳。僅針對單靶點或單致病途徑的藥物不易取得好的療效。另一個重要原因是干預時機太晚，當診斷出癡呆時患者腦內(nèi)已有大量神經(jīng)元死亡。因此，應當針對多靶點、多途徑治療，同時將治療時機提前到癡呆發(fā)生前，才有可能在AD的藥物干預領域?qū)崿F(xiàn)新的突破。本文綜述了作者近十多年來在中藥治療AD方面的研究工作，包括中藥新復方參烏膠囊、中藥提取物何首烏二苯乙烯苷、山茱萸環(huán)烯醚萜苷、淫羊藿黃酮和淫羊藿苷對多種擬AD動物模型和細胞模型的影響及其作用機制。這些中藥的特點是作用在AD復雜發(fā)病機制的多靶點和多途徑，尤其是具有神經(jīng)保護和神經(jīng)營養(yǎng)/再生作用，且對線粒體和突觸具有明顯的保護作用，可望用于AD的早期干預或輕度認知障礙期（MCD的治療，從而阻止或延緩癡呆的發(fā)生與進程。

阿爾茨海默?。恢委?；中藥；參烏膠囊；何首烏二苯乙烯苷；山茱萸環(huán)烯醚萜苷；淫羊藿黃酮；淫羊藿苷；動物模型；細胞模型

來源出版物：生物化學與生物物理進展， 2012， 39（8）: 816-828

入選年份：2014

長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法

夏天，肖丙秀，郭俊明

長鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）通過多種機制發(fā)揮其生物學功能，這些機制包括基因印記、染色質(zhì)重塑、細胞周期調(diào)控、剪接調(diào)控、mRNA降解和翻譯調(diào)控等。lncRNA通過這些作用機制在不同水平進行基因表達調(diào)控。在研究lncRNA功能的過程中，研究方法的建立和應用起著非常重要的作用。目前用于lncRNA研究的主要方法有：微陣列、轉(zhuǎn)錄組測序、Northern印跡、實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應、熒光原位雜交、RNA干擾和RNA結合蛋白免疫沉淀等。文章著重介紹了3種前沿方法，即：在線快速預測RNA與蛋白質(zhì)相互作用的catRAPID、RNA純化的染色質(zhì)分離（Chromatin isolation by RNA purification，ChIRP）以及非編碼 RNA沉默與定位分析技術（Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs，c-KLAN）。

長鏈非編碼RNA；作用機制；基因表達調(diào)控；研究方法

來源出版物：遺傳， 2013， 35（3）: 269-280

入選年份：2014

植物miRNA的進化

魏強，梁永宏，李廣林

鑒于miRNA在植物基因表達調(diào)控中的重要作用，人們已經(jīng)開展對植物miRNA的預測、鑒定、功能和進化等方面的研究。隨著許多模式植物基因組測序的完成，miRNA的基因組學和進化信息的整合為miRNA的起源和進化研究提供了越來越多的證據(jù)和假說，然而尚未見關于植物 miRNA進化方面的系統(tǒng)報道。文章從miRNA的起源以及相應的幾種假說、miRNA的產(chǎn)生和消亡、miRNA的功能進化等幾方面來分析和綜述植物miRNA進化的研究進展。

miRNA；進化；產(chǎn)生和消亡；起源假說

來源出版物：遺傳， 2013， 35（3）: 315-323

入選年份：2014

對家蠶第18連鎖群隱性基因elp、ch-2和mln測交系的分子定位分析

劉先方，馬曉，侯成香，等

家蠶長形卵（elp）、第二隱性赤蟻（ch-2）、暗化型（mln）均為第18染色體上的隱性突變，在經(jīng)典連鎖圖譜上的順序和遺傳距離已經(jīng)排定。文章采用正常卵、正常黑蟻及正常白蛾品種P50與包含此3個隱性突變的三隱性測交系W18組配正反交群體，F(xiàn)1回交W18后獲得回交群體（P50×W18）♀×W18♂和W18♀×（P50×W18）♂，分別記作 BC1F和 BC1M，利用已構建的家蠶SSR分子連鎖圖譜和根據(jù)家蠶基因組精細圖設計的 STS標記，對這3個突變基因elp、ch-2、mln進行了分子定位研究，并根據(jù)家蠶基因組精細圖，將第18連鎖群的經(jīng)典遺傳圖、分子連鎖圖和基因組物理圖進行了對應。整合后的圖譜遺傳距離為 94.2 cm，突變基因和分子標記的排列順序分別與形態(tài)標記連鎖圖和基因組精細圖相一致，研究結果對家蠶第18染色體上其他突變的定位與克隆有重要的借鑒作用。

家蠶；第 18連鎖群；突變；分子標記；基因定位

來源出版物：遺傳， 2013， 35（3）: 373-378

入選年份：2014

山羊GOLA-DQA2基因多態(tài)性與血液免疫性狀的相關分析

邢鳳，秦孜娟，王桂芝，等

文章采用PCR-RFLP技術對萊蕪黑山羊、波爾山羊、魯波山羊3個山羊種群的GOLA-DQA2基因外顯子2進行遺傳多態(tài)性研究，并對其血液免疫指標的效應進行分析。結果表明，3個山羊種群共檢測到4種基因型，由3個等位基因控制；GOLA-DQA2基因外顯子2的第77、79、80和169位的堿基表現(xiàn)出多態(tài)性；多數(shù)血液免疫指標品種效應是主要效應；魯波山羊中，AB基因型的紅細胞計數(shù)、白細胞計數(shù)分別顯著高于BB基因型、BC基因型（P＜0.05）；AB基因型的紅細胞壓積顯著高于BB、BC基因型（P＜0.05）；BC基因型的噬中性粒細胞比率顯著高于 BB基因型（P＜0.05）；波爾山羊和萊蕪黑山羊中，基因型與血液免疫指標之間也有一定的相關性，但沒有達到顯著水平。由上述結果初步推測，在魯波山羊中，AB、BC基因型是影響紅細胞計數(shù)、白細胞總數(shù)、噬中性粒細胞比率等血液免疫指標的重要因素。研究結果揭示GOLA-DQA2基因與血液免疫指標之間有一定的相關性，可為山羊的抗病育種提供一定的參考。

山羊；MHC-DQA2；PCR-RFLP；多態(tài)性；免疫性狀

來源出版物：遺傳， 2013， 35（2）: 185-191

入選年份：2014

Beta多樣性研究進展

陳圣賓，歐陽志云，徐衛(wèi)華，等

Beta多樣性度量時空尺度上物種組成的變化，是生物多樣性的重要組成部分，與許多生態(tài)學和進化生物學問題密切相關，并且其信息可用于保護區(qū)選址和布局規(guī)劃，因此在最近10 a間成為生物多樣性研究的熱點問題之一。多年來，學者們利用各種度量方式和分析方法，在不同地理區(qū)域，對許多生物類群beta多樣性的時空格局和形成機制進行了大量研究。本文主要從beta多樣性的度量方法、時空格局、形成機制及其在生物多樣性保護中的應用等幾個方面，總結了最近 10 a來相關研究的進展。Whittaker（1960）最初提出beta多樣性概念時就缺乏嚴格的定義，隨著概念的不斷演化，度量方法也同樣呈現(xiàn)出多樣化，而度量手段的多樣化非常不利于不同研究之間的比較。目前應用最普遍的度量方法是采用相似性指數(shù)，如Jaccard和Sorensen指數(shù)。最近幾年，新的度量方法還在不斷出現(xiàn)。其中一些方法非常值得注意。Beta多樣性具有時空尺度和分類尺度依賴性，一般隨分析粒度（grain）的增加而降低。雖然有些研究表明beta多樣性隨緯度增加而降低，但學者們并沒有達成共識。山區(qū)和生物地理區(qū)的交界處beta多樣性都比較高，因而需要在這些地區(qū)增加保護區(qū)的面積或者數(shù)量以囊括物種變化梯度。對時間尺度上beta多樣性的研究表明，氣候變化確實導致了物種組成在時間上的變化，并且物種在不同大陸和地區(qū)間的遷移導致了生物同質(zhì)化。擴散過程和生態(tài)位過程共同決定了beta多樣性，只是這兩個過程的相對重要性依尺度、地理區(qū)域和物種類群的不同而有所差異。綜上所述，我們認為未來beta多樣性研究的熱點問題是：1）不同生物類群的進化歷史和生物學特征對 beta多樣性的影響；2）不同的時空尺度對 beta多樣性及其維持機制的影響；3）人類活動對beta多樣性的影響。

beta多樣性；擴散限制；生態(tài)位限制；時空格局

來源出版物：生物多樣性， 2010， 18（4）: 323-335

入選年份：2014

植物DNA條形碼促進系統(tǒng)發(fā)育群落生態(tài)學發(fā)展

裴男才，張金龍，米湘成，等

系統(tǒng)發(fā)育群落生態(tài)學是近年興起的一個重要牛態(tài)學研究分支，它以群落生態(tài)學為基礎并引入了系統(tǒng)發(fā)育的分析方法，全面動態(tài)地反映了群落中物種內(nèi)和物種間的相互作用關系，揭示了群落格局形成的生態(tài)學過程，研究了生物多樣性的形成及維持機制。巴拿馬 BCI（Barro Colorado Island）樣地的成功例子說明，在固定樣地進行長期的群落生態(tài)與系統(tǒng)發(fā)育研究切實可行且極具意義；DNA條形碼的快速興起對這一研究發(fā)揮著重要作用。本文先列舉了群落生態(tài)與系統(tǒng)發(fā)育綜合分析能解決的群落系統(tǒng)發(fā)育結構、群落生態(tài)位結構、生物地理學和性狀進化等生態(tài)學問題；接著介紹了標準植物DNA條形碼以及利用片段組合（rbcL+matK+trnH-psbA）進行快速物種識別和近緣種區(qū)分、精確群落系統(tǒng)發(fā)育關系的構建以及群落生態(tài)學研究；隨后提出DNA條形碼研究在類群水平上需注意兩片段的條形碼組合（matK+rbcL）在同屬種鑒別能力上的不足，而在較大尺度群落水平上需對實驗設計進行優(yōu)化。DNA條形碼將為探討物種多樣性及其維持機理、系統(tǒng)發(fā)育beta多樣性以及群落水平上功能性狀進化研究提供新的思路。

群落系統(tǒng)發(fā)育重建；群落生態(tài)學；rbcL，matK，trnH-psbA；大型固定樣地；APG分類系統(tǒng)

來源出版物：生物多樣性， 2011， 19（3）: 284-294

入選年份：2014

《名古屋議定書》的主要內(nèi)容及其潛在影響

薛達元

《生物多樣性公約》第10次締約方大會（2010年10月，日本名古屋）通過了《名古屋議定書》，這為全面實現(xiàn)《生物多樣性公約》的三大目標，特別是第三項目標（公平公正地分享因利用遺傳資源所產(chǎn)生的惠益）邁出了關鍵一步。建立遺傳資源及相關傳統(tǒng)知識獲取與惠益分享（ABS）國際制度是《生物多樣性公約》過去10年來的一項主要任務，《公約》締約方大會于2000年專門建立了“ABS工作組”，致力于該ABS國際制度的談判。自2001年在德國波恩召開ABS工作組第1次會議到《名古屋議定書》達成，一共召開了9次工作組會議，其中第9次工作組會議召開了3次續(xù)會?！睹盼葑h定書》的主要內(nèi)容包括：議定書目標；適用范圍；獲取遺傳資源及相關傳統(tǒng)知識的要求（事先知情同意程序）；“共同商定條件”下公平分享因利用遺傳資源和相關傳統(tǒng)知識所產(chǎn)生的惠益；確保遵約的措施，包括披露遺傳資源來源與原產(chǎn)地，遺傳資源合法來源證書和監(jiān)測遵約的檢查點；能力建設等。談判中最為核心的問題是遺傳資源的定義是否包括衍生物，以及采取何種措施監(jiān)測遺傳資源的利用。因分歧太大，議定書文本未能規(guī)定在申請專利時強制性披露遺傳資源來源及原產(chǎn)地，對建立遵約的監(jiān)測檢查點也未嚴格要求，在處理收集保存庫中遺傳資源的獲取與惠益分享方面也不太明確。中國是全球生物多樣性最為豐富的國家之一，是遺傳資源重要提供國?！睹盼葑h定書》的通過和實施將對加強中國生物遺傳資源的保護及促進其公平惠益分享具有重要意義。中國需要加強國家層次的立法，以配合議定書的實施。

生物多樣性公約；獲取與惠益分享；遺傳資源；傳統(tǒng)知識；潛在影響；ABS；CBD

來源出版物：生物多樣性， 2011， 19（1）: 113-119

入選年份：2014

馬鞍列島巖礁生境魚類群落生態(tài)學.Ⅰ.種類組成和多樣性

汪振華，章守宇，陳清滿，等

為了解潮下帶巖礁生境的魚類區(qū)系特征，于2009年對馬鞍列島巖礁生境進行了12個月的多網(wǎng)目組合刺網(wǎng)采樣，從分類學和生態(tài)型組成等方面，結合多樣性和相對重要性指數(shù)，對該生境的魚類組成和多樣性特征進行了分析。全年共采集魚類87種，隸屬2綱14目50科73屬。其中鱸形目魚類51種，占58.6%；趨礁性魚類49種，占56.3%；放流魚類7種，占8%。所有魚類個體中，幼魚的總比例為67.4%。暖水種、暖溫種和冷溫種分別為50、36和1種；底層、近底層和中上層魚類各為 19、46和 22種，其中褐菖鲉（Sebastiscus marmoratus）、黃姑魚（Nibea albitflora）和赤鼻棱鯤（Thryssa kammalensis）分別為各水層的絕對優(yōu)勢種；定居種、季節(jié)性洄游種和偶見種各為32、55和11種。巖礁生境魚類多樣性呈現(xiàn)明顯的季節(jié)變化特征，2月份最低，9月份最高。研究結果表明，馬鞍列島巖礁生境是以趨礁魚類為特征群體、暖水性和暖溫性魚類共同主導、各個類型的幼魚在夏秋季集群出現(xiàn)、同時也分布了一定量放流種的高魚類多樣性棲息地，它為各種魚類提供了優(yōu)良的攝食、避敵和繁殖場所，是近岸海洋生態(tài)系統(tǒng)中相當重要的生境。然而相比過去，該生境的魚類多樣性已經(jīng)大大降低，因此需對其保護工作予以更多關注。

巖礁生境；魚類群落；放流種；生態(tài)類型；馬鞍列島

來源出版物：生物多樣性， 2012， 20（1）: 41-50

入選年份：2014

DNA條形碼技術在青海海東地區(qū)小型獸類鑒定中的應用

馬英，李海龍，魯亮，等

為彌補傳統(tǒng)形態(tài)分類方法的不足，探究應用DNA條形碼技術進行分子生物學鑒定的可行性，本研究用DNA條形碼技術檢測了青海省海東地區(qū)3目6科14屬18種110只小型獸類的COI基因部分序列。分析所測COI基因序列可知：種內(nèi)遺傳距離≤3%，種間遺傳距離5%～10%，屬間遺傳距離12%～19%，種間遺傳距離顯著大于種內(nèi)遺傳距離。NJ樹顯示同種個體聚為有很高支持度的單一分支。有6個個體（4只黃胸鼠、2只小家鼠）在現(xiàn)場鑒定中被誤定為其他種類。研究結果表明使用條形碼技術能糾正形態(tài)學鑒定中的錯誤，也說明動物線粒體COI基因是一個有效的DNA條形碼標準基因。

DNA條形碼；小獸；COI基因

來源出版物：生物多樣性， 2012， 20（2）: 193-198

入選年份：2014

近十年中國生物入侵研究進展

鞠瑞亭，李慧，石正人，等

生物入侵已對入侵區(qū)的生態(tài)環(huán)境、社會經(jīng)濟和人類健康造成了嚴重的威脅，成為了21世紀5大全球性環(huán)境問題之一。本文回顧了2000年以來，中國生物入侵研究領域尤其是入侵種的多樣性與格局、入侵機制及生態(tài)學效應、管理與控制等方面所取得的重要進展，討論了需進一步加強研究的領域，以期為進一步拓展該領域研究的廣度和深度、為我國的生物入侵預警預防和科學治理提供參考。據(jù)初步研究，中國的入侵種數(shù)量已達529種，其中陸生植物、陸生無脊椎動物和微生物為主要入侵類群；原產(chǎn)地以北美洲和南美洲為主；經(jīng)濟發(fā)達和氣候溫暖濕潤的東部和南部省份入侵態(tài)勢明顯較西部和北部省份嚴重；隨著中國經(jīng)濟的進一步發(fā)展，生物入侵問題將可能更加嚴峻。外來種的成功入侵是其內(nèi)稟優(yōu)勢、資源機遇和人為干擾共同作用的結果；其中，表型可塑性、適應性進化、天敵釋放、種間互利或偏利共生和新化感作用等因素對入侵起到了關鍵作用。生物入侵已對中國土著生態(tài)系統(tǒng)的生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)服務功能造成了嚴重影響，打破了生態(tài)系統(tǒng)的固有平衡，危害或威脅到中國的農(nóng)林牧漁業(yè)生產(chǎn)、交通航運、環(huán)境、人類健康和公共設施安全。針對生物入侵的管理與控制，中國加強了包括檢測監(jiān)測、風險分析、生物防治、擴散阻斷、根治滅除和生態(tài)恢復等技術體系的研究和實施，并初步控制了一些重要入侵種的擴張。中國生物入侵需要在全境性科學考察、生物入侵的遺傳學、基因組學、生態(tài)系統(tǒng)影響、全球變化和管理與控制技術創(chuàng)新等領域進一步加強跨領域的交叉合作和系統(tǒng)研究。

生物入侵；中國；管理與控制；多樣性；生態(tài)學效應；入侵機制

來源出版物：生物多樣性， 2012， 20（5）: 581-611

入選年份：2014

中國微生物物種多樣性研究進展

郭良棟

微生物是分布最為廣泛的生命形式，幾乎分布到地球上的所有生境，具有豐富的物種多樣性。我國地域遼闊，跨越熱帶至寒溫帶，氣候條件多樣，地理環(huán)境與生態(tài)系統(tǒng)類型復雜，是世界上生物多樣性最豐富的國家之一。我國已開展了大量微生物多樣性研究，并證實我國多樣的生境蘊藏著豐富的微生物物種多樣性。目前我國已報道真核微生物（菌物）約14700種，其中包括真菌約14060種、卵菌約300種、黏菌約340種，而真菌中有藥用菌473種、食用菌966個分類單元。特別是近年來通過免培養(yǎng)的分子生物學技術發(fā)現(xiàn)我國存在豐富的原核微生物多樣性。本文概述了傳統(tǒng)方法和現(xiàn)代分子生物學技術在我國原核微生物（古菌、細菌）和真核微生物（真菌、卵菌、黏菌）物種多樣性研究的最新進展。

真核微生物；原核微生物；物種多樣性；培養(yǎng)方法；分子技術

來源出版物：生物多樣性， 2012， 20（5）: 572-580

入選年份：2014

REDD+活動對生物多樣性保護的潛在影響

雪明，安麗丹，武曙紅，等

基于《聯(lián)合國氣候變化框架公約》（UNFCCC）對減少毀林和森林退化引起的碳排放活動類型（REDD+）的規(guī)定和《生物多樣性公約》（CBD）對生物多樣性保障措施的要求，分析了避免毀林和森林退化、可持續(xù)森林管理、森林保護以及造林等減少森林碳排放和增加森林碳儲量的 REDD+活動類型對生物多樣性可能產(chǎn)生的正面和負面影響，并就確保 REDD+各種活動對生物多樣性發(fā)揮積極影響提出了相應的方法和措施。REDD+活動對生物多樣性的影響將取決于REDD+活動的規(guī)模、類型以及生物多樣性安全保障措施的實施。設計 REDD+活動時應充分考慮其對生物多樣性及其他多重效益的利弊，執(zhí)行 REDD+活動時應采取適當?shù)恼吆痛胧﹣肀Ｗo和提高生物多樣性，國家政府和當?shù)厣鐓^(qū)等利益相關者共同協(xié)商和進行密切的合作是確保 REDD+活動成功實施的關鍵。為確保我國將來可能實施的 REDD+活動有利于生物多樣性的保護，國家在構建國家方案、政策措施、機構設置和監(jiān)測體系時，應從保護目標、機構責任、利益相關群體、實施方案和監(jiān)測計劃等方面制定相應的保障措施。

REDD；氣候變化；生物多樣性保障措施；國際公約

來源出版物：生物多樣性， 2013， 21（2）: 238-244

入選年份：2014

利用TALENs和手工克隆技術高效獲得GHR基因敲除巴馬豬

李飛達，李勇，劉歡，等

DNA編輯技術是基因靶向修飾技術的研究熱點，已廣泛應用于生物醫(yī)學和農(nóng)業(yè)研究。然而，傳統(tǒng)基因打靶技術存在效率低、成本高、工作量大等缺點，其應用受到了極大的限制。文章利用最近發(fā)展起來的新型人工核酸酶-轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應物核酸酶（transcription activator-like effector nuclease，TALENs）介導的基因組定點修飾技術，通過構建特異識別豬生長激素受體（GHR）基因的TALENs表達載體，共轉(zhuǎn)染巴馬胎豬成纖維細胞系，酶切鑒定G418抗性克隆細胞株的基因修飾效率為46.2%，其中2個為雙等位基因敲除的克隆細胞株。以雙等位基因敲除的克隆細胞株為核供體，利用手工克隆技術制備GHR-KO巴馬豬克隆胚，第6 d囊胚率為43.5%，654枚體外發(fā)育的囊胚移植6頭受體母豬，共獲得10頭存活的GHR-KO巴馬仔豬，其中7頭為雙等位基因敲除。體重檢測結果顯示，第 20周齡的GHR-KO巴馬豬體重僅為對照巴馬豬的50%。研究結果表明，TALENs和手工克隆技術能夠高效制備出基因敲除大動物。GHR-KO巴馬豬的成功制備為研究豬 GHR基因生理功能以及人類侏儒癥分子機理提供了重要模型，也證明該技術比傳統(tǒng)基因打靶和克隆技術具備更簡捷、快速、高效，更易于在生物醫(yī)學和農(nóng)業(yè)基因靶向修飾研究中推廣。

基因敲除；TALENs；手工克?。籊HR-KO

來源出版物：遺傳， 2014， 36（9）: 903-911

入選年份：2014

馬鈴薯Y病毒福建分離物P1基因的分子變異和結構特征

史鳳陽，高芳鑾，沈建國，等

為揭示馬鈴薯Y病毒（Potato virus Y，PVY）P1基因的分子變異及結構特征，并查明福建分離物 P1基因的變異來源。文章設計一對簡并引物從感染 PVY的馬鈴薯病葉擴增、克隆獲得福建分離物P1基因的cDNA全長序列，分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征，并采用貝葉斯法重建P1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹。結果顯示，12個福建分離物均成功擴增出預期大?。s915 bp）的特異性片段，P1基因的核苷酸序列與已報道的 PVY不同株系的核苷酸序列一致性為73%～99%；QK44，XT02，XT08，LH05分離物的309 nt位置均檢測到一個強烈的重組信號。12個PVY分離物中，P1蛋白有85個變異的氨基酸位點，表明其高度變異；P1蛋白的第41～275位是一個高度保守的結構功能域，含有3個保守的活性位點（H192、D201、V235）；系統(tǒng)發(fā)育分析顯示，福建分離物形聚為 3種不同的簇，其對應的卷曲結構（Coiled-coil domain）和空間結構也不相同，表明不同株系型的 P1基因在系統(tǒng)發(fā)育關系上分化較大。該研究結果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空間結構具有高度變異性，但行使 P1蛋白功能的活性位點所在的氨基酸（H192、D201和V235）均高度保守；福建分離物 P1基因的變異源主要來自堿基突變和基因重組。

馬鈴薯Y病毒；P1基因；變異；重組

來源出版物：遺傳， 2014， 36（7）: 713-722

入選年份：2014

用于目標序列染色體定位的鏡鯉BAC-FISH體系構建

鄧海霞，趙紫霞，徐鵬，等

為了構建用于鏡鯉（Cyprinus carpio var. specularis）特定基因組序列染色體定位的實驗體系，在細菌人工染色體（Bacterial Artificial Chromosome，BAC）文庫篩選池中對已知短序列基因組片段進行PCR擴增，篩選出包含目標序列的BAC克隆，提取BAC質(zhì)粒進行缺刻平移標記制備探針，開展熒光原位雜交（Fluorescence in situ hybridization，F(xiàn)ISH）實驗。通過對染色體片前處理、BAC質(zhì)粒探針制備、C0t-1 DNA封閉基因組重復序列、預雜交、熒光染料選擇、信號放大等一系列實驗條件和方法的探索優(yōu)化，成功實現(xiàn)了目標序列在鏡鯉有絲分裂中期染色體上的定位。定位對象既包括在染色體上有單一位點的序列，如斑馬魚微衛(wèi)星標記Z6884和Z4268，也包括在染色體上有多個位點的重復序列，如黃河鯉性別相關標記 CCmf1。來自斑馬魚同一條染色體上的兩個微衛(wèi)星標記被分別定位于鏡鯉不同染色體上，為鯉魚染色體數(shù)目加倍的進化假設提供了一項直接實驗證據(jù)，同時將現(xiàn)有遺傳連鎖圖譜與染色體對應起來，可作為染色體識別和細胞遺傳學圖譜構建的依據(jù)。黃河鯉性別相關重復序列被定位于不少于四條染色體上，為性別決定相關基因的篩查提供了研究線索。這一 BAC-FISH實驗體系將成為鯉細胞遺傳學圖譜構建、基因組進化和比較基因組學研究中的重要研究工具。

鏡鯉；細菌人工染色體；熒光原位雜交；染色體定位

來源出版物：水生生物學報， 2013， 37（3）: 467-472

入選年份：2013

擬南芥YUAN1基因調(diào)控器官形狀和大小

張海瑞，徐冉，高玉梅，等

器官形狀和大小的控制是一個基本的發(fā)育生物學過程，受細胞分裂和細胞擴展的影響。到目前為止，人們對植物器官形狀和大小的調(diào)控機制知之甚少。本實驗室前期研究發(fā)現(xiàn)了一個種子和器官大小的調(diào)控基因DA1，其編碼一個泛素受體。在擬南芥（Arabidopsis thaliana）中，DA1通過抑制細胞的分裂來限制種子和器官的大小。本研究通過激活標簽的方法在da1-1突變體背景下篩選到一個葉子形狀發(fā)生改變的半顯性突變體（yuan1-1D）。yuan1-1D形成短而圓的葉片和短的葉柄，細胞學分析顯示，葉片和葉柄變短的主要原因是細胞的長向擴展降低導致的。YUAN1編碼一個含有PHD鋅指結構域的蛋白。GFP-YUAN1融合蛋白定位在細胞核內(nèi)。過量表達 YUAN1基因?qū)е氯~片和葉柄變短。遺傳學分析顯示，YUAN1和DA1、ROT3以及ROT4在控制葉片形狀和大小方面作用于不同的遺傳途徑中。因此，本研究鑒定了一個新的控制器官形狀和大小的基因YUAN1，為闡明植物器官形狀和大小調(diào)控的分子機制提供了重要線索。

YUAN1；PHD鋅指結構域；器官形狀和大?。患毎扉L

來源出版物：遺傳， 2013， 35（9）: 1106―1116

入選年份：2013

1977—2008年中國森林生物量碳匯的時空變化

郭兆迪，胡會峰，李品，等

森林在區(qū)域和全球碳循環(huán)中起著關鍵作用。研究中國森林生物量碳源匯變化對于估算區(qū)域碳收支和制定應對氣候變化的森林管理政策有重要意義。利用1977—2008年間6期的森林資源清查資料，通過評估生物量碳庫變化來估算中國森林生物量碳匯大小及其變化。森林按其用途和形態(tài)特征，分為林分、經(jīng)濟林和竹林三大類別。采用連續(xù)生物量轉(zhuǎn)換因子法估算林分生物量碳庫，平均生物量法估算經(jīng)濟林和竹林生物量碳庫。結果顯示，在1977—2008年間，中國森林生物量碳庫累計增加（即生物量碳匯）1896 TgC（1 Tg=1012 g），其中，林分、經(jīng)濟林和竹林分別增加1710、108和78 TgC；年均生物量碳匯為70.2 TgC/a，相當于抵消中國同期化石燃料排放CO2的7.8%。研究還表明，中國人工林的生物量碳庫持續(xù)增加，生物量碳匯為818 TgC，占林分總碳匯的47.8%；各齡級林分的生物量碳匯都有不同程度的增加：老齡林、中齡林和幼齡林分別增加 930、391和388 TgC。由于現(xiàn)階段中國森林具有林齡小、平均碳密度低和人工林面積大的特點，因此未來中國森林生物量增匯潛力巨大。

森林；生物量碳庫；碳匯；森林資源清查；中國

來源出版物：中國科學：生命科學， 2013， 43（5）: 421-431

入選年份：2013

中國草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫及其變化

方精云，楊元合，馬文紅，等

準確評估草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫及其年際變化，對揭示草地在中國陸地生態(tài)系統(tǒng)碳循環(huán)中的作用以及合理利用有限的草地資源有著極為重要的意義。雖然中國學者在研究草地碳庫及其動態(tài)變化方面已開展了很多工作，但目前仍缺乏對中國草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫及其動態(tài)變化特征的全面認識。通過綜述當前中國草地碳循環(huán)研究的最新進展，結合本研究組的工作，試圖全面評價中國草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫（植被生物量碳庫和土壤有機碳庫）及其動態(tài)變化。結果顯示：1）不同研究得到的中國草地生物量碳密度（單位面積生物量）存在較大差異，為215.8～348.1 g C/m2，平均值為300.2 g C/m2。同樣，對中國草地土壤有機碳密度（單位面積土壤碳庫）的估算也存在顯著差異，在8.5～15.1 kg C/m2之間變動，但考慮到 8.5 kg/m2的估算值是基于近千個土壤剖面的實測數(shù)據(jù)計算得到，全國平均水平的土壤碳密度一般不會超過此值。因此，若采用目前最廣泛使用的草地面積（331×104 km2），那么中國草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫約為29.1 Pg C（1 Pg=1×1015g），其中96.6%的碳儲存于土壤有機質(zhì)中。2）文獻報道的近20 a中國草地生物量和土壤有機碳庫的變化方向和變化量均存在差異。按照最新的估算，中國草地生物量和土壤有機碳庫在過去20 a里沒有發(fā)生顯著變化，即中國草地生態(tài)系統(tǒng)處于中性碳匯狀態(tài)。3）中國草地生物量的時空變異與降水量的變化關系密切。土壤有機碳庫的空間變異主要受與降水量密切相關的土壤水分的影響，但土壤質(zhì)地等因素也起一定作用。此外，放牧與圍封等人類活動將對草地生物量和土壤碳庫及其動態(tài)變化產(chǎn)生強烈影響。

溫帶草地；高寒草地；生物量；土壤有機碳庫；氣候變化；碳匯；土壤質(zhì)地

來源出版物：中國科學：生命科學， 2010， 40（7）: 566-576

入選年份：2013

下一代測序技術：技術回顧與展望

周曉光，任魯風，李運濤，等

在過去的30年中，作為最重要的生物醫(yī)學研究手段之一，DNA測序技術的數(shù)據(jù)產(chǎn)出能力呈指數(shù)增長，而且這一技術本身也演變成為一個面向工程學和物理學的新技術領域。本文分析了下一代測序儀的技術特點，并對其未來的發(fā)展以及應用進行了前瞻性的展望。預期在剛剛出現(xiàn)的技術中，有些技術假以時日能夠發(fā)展成熟，實現(xiàn)1000美元基因組和100美元基因組的目標。同時建議中國科學家在這場對科學研究以及社會醫(yī)療保健體系都將產(chǎn)生深遠影響的運動中發(fā)揮積極的作用。

基因組學；DNA測序；下一代測序技術；測序儀

來源出版物：中國科學：生命科學， 2010， 40（1）: 23-37

入選年份：2013

斑點叉尾鮰和雜交鱘幼魚晝夜攝食節(jié)律和胃腸排空時間的研究

董桂芳，楊嚴鷗，陳路，等

采用一次飽食投喂（將一晝夜分為8個時間段，每個時間段作為一個處理組，每天每個處理組飽食投喂一次）和分段式連續(xù)投喂（將一晝夜分為8個時間段，每天每個實驗缸連續(xù)投喂8次）兩種方法研究斑點叉尾和雜交鱘幼魚的晝夜攝食節(jié)律，同時研究它們在攝食后24 h內(nèi)胃和全腸的排空時間。結果顯示，在兩種投喂方式下，斑點叉尾均表現(xiàn)出24 h一周期的攝食節(jié)律，兩個日攝食率高峰值均出現(xiàn)在06︰00和18︰00（P＜0.05）。雜交鱘在一次飽食投喂下表現(xiàn)出 24 h一周期的攝食節(jié)律，高峰值分別出現(xiàn)在11︰00、17︰00和05︰00，在分段式連續(xù)投喂時表現(xiàn)出48 h一周期的攝食節(jié)律，高峰值分別出現(xiàn)在11︰00、17︰00和36︰00。在攝食后1～9 h內(nèi)，斑點叉尾的胃內(nèi)含物比率急劇降低（P＜0.05），并在24 h時出現(xiàn)極低值（P＜0.05），而1～9 h內(nèi)全腸內(nèi)含物比率迅速升高（P＜0.05），在9 h時達到最大（P＜0.05），在24 h出現(xiàn)極低值（P＜0.05）。在攝食后1～7 h內(nèi)，雜交鱘的胃內(nèi)含物比率迅速下降（P＜0.05），在24 h時出現(xiàn)極低值（P＜0.05），1～7 h內(nèi)腸內(nèi)含物比率迅速升高（P＜0.05），24 h時呈現(xiàn)極低值（P＜0.05）。結果表明，兩種實驗魚表現(xiàn)出不同的晝夜攝食節(jié)律，該節(jié)律受各自胃腸排空時間的影響，也受投喂時間的影響。研究建議，在斑點叉尾和雜交鱘幼魚的養(yǎng)殖中宜在光線較弱的清晨（05︰00～06︰00）和黃昏（17︰00～18︰00）進行投喂。

晝夜攝食節(jié)律；胃腸排空時間；一次飽食投喂；分段式連續(xù)投喂；斑點叉尾；雜交鱘

來源出版物：水生生物學報， 2013， 37（5）: 876-884

入選年份：2013

成年斑馬魚脊髓損傷修復中腦gdnf和nos基因的表達

謝琳，房萍，林金飛，等

成年斑馬魚（Danio rerio）具有很強的脊髓損傷后自主修復的能力，但目前其機制不明。為了研究斑馬魚中腦組織對脊髓再生的影響，文章應用成年斑馬魚脊髓損傷模型，采用實時定量 PCR方法和原位雜交技術，檢測了斑馬魚腦中膠質(zhì)細胞源性神經(jīng)營養(yǎng)因子（gdnf）和一氧化氮合酶（nos）基因在脊髓損傷后4 h、12 h、6 d、11 d的表達情況，展示了這兩種基因在斑馬魚腦內(nèi)不同核團的動態(tài)表達變化。結果顯示，成年斑馬魚脊髓損傷后，神經(jīng)營養(yǎng)因子gdnf基因在損傷急性期（4 h、12 h）和神經(jīng)修復期（6 d、11 d）于斑馬魚腦內(nèi)呈現(xiàn)顯著性升高（P＜0.05），而一氧化氮合酶基因nos的表達于損傷急性期顯著性升高（P＜0.05），隨后下降，并在修復期（11 d）顯著降低（P＜0.05）。這表明，脊髓損傷后，高表達gdnf基因同時低表達nos基因的腦環(huán)境給脊髓損傷提供了良好的神經(jīng)再生微環(huán)境，從而可能促進軸突的再生長及運動能力的恢復。

脊髓損傷；神經(jīng)修復；斑馬魚；gdnf；nos

來源出版物：遺傳， 2013， 35（4）: 495―501

入選年份：2013

線粒體全基因組測序探尋高原環(huán)境對Artemia tibetiana和A. urmiana鹵蟲種線粒體基因的影響

張航曉，羅奇斌，孫婧，等

鹵蟲（Artemia）屬甲殼綱無背甲目，生活于高鹽環(huán)境中，低海拔和高海拔地區(qū)均有分布，在適應不同環(huán)境需求的過程中形成了遺傳的多樣性。為研究鹵蟲表型的可塑性，本研究對2個來自青藏高原的A. tibetiana和1個來自伊朗烏爾米耶湖的A. urmiana的線粒體進行了全基因組測序，將獲得的3個序列信息與另一低海拔平原上的鹵蟲種A. franciscana進行比較分析。在線粒體蛋白編碼基因的序列比對中發(fā)現(xiàn)：A. franciscana和 A. tibetiana/A. urmiana組間atp8基因的Ka/Ks值最高，而A. tibetiana和A. urmiana組間，atp6基因的Ka/Ks值最高。鑒于A. tibetiana和A. urmiana遺傳距離較近，但分別分布于高海拔和低海拔，環(huán)境差異顯著，提示在高原環(huán)境適應過程中 atp6基因可能受到強的選擇壓力。在D-loop區(qū)鑒別到2個延長終止相關的序列（ETASs）和3個保守序列塊（CSBs），猜測D-loop或者呼吸鏈亞基的序列變化，可單獨或共作用促進鹵蟲適應不同海拔環(huán)境。

線粒體基因組；Artemia tibetiana；序列變化；高原物種

來源出版物：中國科學：生命科學， 2013， 43（4）: 319-331

入選年份：2013