韓正祥 張夢瑾 徐 杰 王紅梅 杜秀平 陳 翀 徐開林(徐州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院腫瘤科,徐州221002)
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GST-NRP-1融合蛋白的原核表達及純化①
韓正祥張夢瑾徐杰王紅梅杜秀平陳翀徐開林②
(徐州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院腫瘤科,徐州221002)
[摘要]目的:構(gòu)建帶有GST標簽的人NRP-1融合蛋白原核表達載體,在大腸埃希菌(E.coli)中誘導(dǎo)其表達,并進行包涵體的復(fù)性及純化。方法:利用RT-PCR擴增人NRP-1基因,將其克隆至pCR-blunt載體,酶切制備NRP-1基因片段,插入表達載體pGEX-4T-1,生成pGEX-4T-1-NRP-1,轉(zhuǎn)入BL21感受態(tài)細胞以IPTG誘導(dǎo)其蛋白的表達。裂解細菌后行Western blot檢測GST-NRP-1融合蛋白的表達,表達的包涵體經(jīng)復(fù)性后用Glutathione Sepharose 4B純化。結(jié)果: RT-PCR擴增出NRP-1基因并連入pCR-blunt載體;經(jīng)亞克隆構(gòu)建了融合蛋白表達載體pGEX-4T-1-NRP-1。轉(zhuǎn)入BL21感受態(tài)細胞后考馬斯亮藍染色檢測到GST-NRP-1融合蛋白的表達,經(jīng)包涵體復(fù)性后得到純化的融合蛋白。結(jié)論:成功構(gòu)建帶有GST標簽的人NRP-1融合蛋白原核表達載體,為進一步研究NRP-1的結(jié)構(gòu)、功能及其與之相互作用的蛋白奠定了基礎(chǔ)。
[關(guān)鍵詞]NRP-1;原核表達;融合蛋白;純化
①本文受國家自然科學(xué)基金(No.30901753)和江蘇省“六大人才高峰”B類項目資助(No.2014-WSW-040)。
②徐州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院血液科,徐州221002。
Prokaryotic expression and purification of GST-NRP-1 fusion protein
HAN Zheng-Xiang,ZHANG Meng-Jin,XU Jie,WANG Hong-Mei,DU Xiu-Ping,CHEN Chong,XU Kai-Lin.Department of Oncology,the Affiliated Hospital of Xuzhou Medical College,Xuzhou 221002,China
[Abstract]Objective: To construct GST-tagged human NRP-1 fusion protein expression vector and induce its expression in Escherichia coli (E.coli),then carry on inclusion body refolding and purification so as to obtain GST-NRP-1 fusion protein.Methods: NRP-1 gene was amplified by RT-PCR and inserted into pCR-blunt vector.Then the reconstructed plasmid was inserted into prokaryotic expression vector pGEX-4T-1.The constructed pGEX-4T-1-NRP-1 expression vector was transformed into BL21 cells and induced by isopropyl-β-D-thiogalactoside (IPTG) .Bacterial bodies were disrupted by sonication.Then the soluble fraction of fusion proteins were verified by Western blot and purified by Glutathione Sepharose 4B after inclusion body refolding.Results: The NRP-1 gene fragment was amplified by RT-PCR and inserted into pCR-blunt vector.Fusion protein expression vector pGEX-4T-1-NRP-1 was constructed successfully.After transformation,GST-NRP-1 expression vector was detected in BL21 cells and obtained purifying protein after refolding.Conclusion: The plasmid GST-NRP-1 was constructed successfully and laid basis for subsequent studies.
[Key words]NRP-1; Prokaryotic expression; Fusion protein; Purification
Neuropilins(NRPs)是一種跨膜糖蛋白受體,由含860個氨基酸組成的細胞外結(jié)構(gòu)域、23個氨基酸組成的跨膜結(jié)構(gòu)域以及40個氨基酸組成的細胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域共同組成。NRPs最初被發(fā)現(xiàn)是作為semaphorin的受體,調(diào)節(jié)神經(jīng)細胞和軸突的生長[1]。后來研究證實,作為VEGF的共受體,NRPs可以和VEGFR通過NRP的PDZ結(jié)合域形成NRP1-VEGFR復(fù)合受體,進而強化VEGF的血管生成作用[2];因NRP-1的胞內(nèi)區(qū)短小,一般認為自身無信號轉(zhuǎn)導(dǎo)功能。但近來Wang等[3]通過對NRP-1的跨膜結(jié)構(gòu)域和胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域的研究,證實NRP-1能單獨介導(dǎo)VEGF誘導(dǎo)的內(nèi)皮細胞遷移,并且胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域中C末端的三個氨基酸在此功能中發(fā)揮重要作用。這提示NRP-1具有信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控功能,但NRP-1通過何種機制調(diào)控其下游信號仍有待進一步確定。蛋白質(zhì)組學(xué)手段是研究NRP-1與其偶聯(lián)的接頭蛋白相互作用,進而探索NRP-1作用機制的有效方法。GST-pulldown-質(zhì)譜分析是捕捉和鑒定蛋白質(zhì)間相互作用的高效手段。本研究探討和優(yōu)化了GST-NRP-1融合蛋白的制備流程,為蛋白質(zhì)組學(xué)水平上解析NRP-1的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供工具,后續(xù)的GST-pulldown和質(zhì)譜鑒定可進一步深入揭示NRP-1在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的信號網(wǎng)絡(luò)和作用機制,為腫瘤的治療提供新的思路。
1.1材料
1.1.1主要試劑總RNA提取試劑TRIZOL、MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶購自Invitrogen公司,PhusionDNA聚合酶、各種限制性內(nèi)切酶和T4 DNA連接酶均購自美國NEB公司; 1 kb DNA分子質(zhì)量標記物及蛋白分子量標準購自立陶宛Fermentas公司; GenClean柱式瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自上海捷瑞生物工程有限公司; IPTG購自Sigma公司; PMSF、丙烯酰胺及雙丙烯酰胺購自Amresco公司;其他化學(xué)試劑均為國產(chǎn)。
1.1.2質(zhì)粒及細胞株克隆載體pCR-blunt購自美國Invitrogen公司;表達載體pGEX-4T-1購自GE Healthcare公司;大腸桿菌TOP10、BL21均購自美國Invitrogen公司。
1.1.3引物設(shè)計根據(jù)Genbank公布的NRP-1的cDNA序列用Primer 5軟件設(shè)計PCR引物。不帶酶切位點的上游引物: CGGAGAAGGGAGAATGGAGAG,帶有酶切位點的上游引物: TggatccGAGAGGGGGCTGCCGC,下游引物: TTATTTGATACCTGATTGTATGGTGCTG。
1.2方法
1.2.1目的基因的克隆TRIZOL法從高表達NRP-1的MCF-7乳腺癌細胞株中提取細胞mRNA,使用M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,利用Phusion聚合酶擴增NRP-1的CDS區(qū),NRP-1的PCR擴增條件如下: 98℃2 min預(yù)變性,98℃30 s,68℃30 s,72℃2 min,共35個循環(huán),最后72℃延伸2 min。取5 μl PCR產(chǎn)物,用1.0%瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定并回收目的片段。使用T4 DNA連接酶將NRP-1基因片段連入克隆載體pCR-blunt,轉(zhuǎn)TOP10感受態(tài)細胞,挑選陽性克隆。EcoRⅠ單酶切初步鑒定重組質(zhì)粒,將鑒定正確的質(zhì)粒寄往Invitrogen公司上海測序部進行DNA測序,將鑒定正確的重組質(zhì)粒命名為pCR-blunt-NRP-1。
1.2.2 pGEX-4T-1-NRP-1表達載體的構(gòu)建及鑒定
重新設(shè)計有BamHⅠ酶切位點的上游引物,以測序正確菌液的小提質(zhì)粒為模板重新PCR后連接至pCR-blunt載體上,且測序結(jié)果正確。用BamHⅠ和EcoRⅠ雙酶切pCR-blunt-NRP-1及pGEX-4T-1質(zhì)粒后,用1.0%瓊脂糖凝膠電泳分離鑒定并回收目的片段NRP-1和線性化質(zhì)粒pGEX-4T-1。使用T4 DNA連接酶將NRP-1基因片段與線性化質(zhì)粒pGEX-4T-1連接,轉(zhuǎn)化BL21感受態(tài)細胞。
1.2.3融合蛋白GST-NRP-1的誘導(dǎo)表達將測序正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入BL21感受態(tài)細菌,在含有氨芐青霉素(Amp)的LB上37℃培養(yǎng)過夜后篩選并提取質(zhì)粒DNA,經(jīng)BamHⅠ和EcoRⅠ再次雙酶切后鑒定陽性克隆BL21菌種。在Ampr瓊脂平板上挑選單菌落接種于LB/Amp液體培養(yǎng)基中,37℃搖床振蕩培養(yǎng)過夜后,次日按1∶100轉(zhuǎn)接LB培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)至A600約為0.5時,加誘導(dǎo)劑IPTG 37℃振蕩培養(yǎng),誘導(dǎo)6 h,取超聲破碎后樣品收集上清及包涵體,經(jīng)SDS-PAGE電泳分析顯示表達產(chǎn)物主要以不溶性包涵體存在。
1.2.4目的蛋白誘導(dǎo)劑的選擇將表達菌pGEX-4T-1-NRP-1 37℃搖床過夜,次日以1∶100轉(zhuǎn)接,震蕩培養(yǎng)至A600為0.5左右時,取培養(yǎng)的菌液15 ml,加入IPTG濃度分別為0.1、0.2、0.4、0.8、1.0 mmol/L,37℃繼續(xù)培養(yǎng)6 h,4℃10 000 r/min離心5 min收集菌體,200 μl PBS重懸細菌,加入50 μl 5×上樣緩沖液,加熱煮沸5 min,取10 μl行10%SDSPAGE電泳,考馬斯亮藍染色并脫色。
1.2.5目的蛋白誘導(dǎo)時間的選擇將表達菌pGEX-4T-1-NRP-1 37℃搖床過夜,次日以1∶100轉(zhuǎn)接,震蕩培養(yǎng)至A600為0.5左右時,取培養(yǎng)的菌液12 ml,加入IPTG至終濃度為0.4 mmol/L繼續(xù)培養(yǎng),分別于2 h、4 h、6 h、8h吸取菌液3 ml,按1.2.4的方法進行樣品處理和分析。
1.2.6包涵體的復(fù)性及純化將表達菌以1∶1 000轉(zhuǎn)接1 L LB培養(yǎng)液,震蕩培養(yǎng)至A600值為0.5左右時,加入IPTG至終濃度為0.4 mmol/L,37℃誘導(dǎo)表達6 h,離心收集表達菌體,按20 ml/g加入超聲裂解液重懸,超聲破碎細菌(直徑2 mm變幅桿,工作3 s,停5 s,8 min一個循環(huán),冰浴裂解)后,收集上清和沉淀,10% SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍染色顯示融合蛋白以包涵體的形式進行表達。用包涵體洗滌液(1% TritonX-100,尿素1 mmol/L,EDTA 1 mmol/L,NaCl 0.3 mol/L)洗滌沉淀3次;然后以包涵體溶解液(ml)∶菌體濕重(g) = 15∶1的比例加包涵體溶解液(Tris-HCl 20 mmol/L,2%TritonX-100,NaCl 0.5 mol/L,DTT 0.2 mmol/L,尿素8 mol/L)重懸包涵體,4℃搖床緩慢震蕩溶解3~4 h后離心取上清采用透析復(fù)性法進行透析,分別以尿素濃度4、3、2.5、2、1.5、1.0、0.5 mol/L進行梯度透析,透析過程在4℃進行,每個濃度的透析時間為4 h,同時密切觀察有無渾濁或絮狀物析出,如有及時4℃20 000 r/min、30 min超速離心去除析出蛋白繼續(xù)復(fù)性。復(fù)性結(jié)束后將透析袋內(nèi)的液體10 ml與500 μl洗滌后的谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂勻漿混合成均勻懸液,4℃輕搖4 h; 4℃2 000 r/min離心5 min后棄上清;沉淀加入5倍床柱體積的PBS,顛倒混勻以洗去未結(jié)合的雜蛋白,4℃2 000 r/min離心5 min后棄上清,共進行3次。后加入等床柱體積的洗脫緩沖液(Reduced glutathione 10 mmol/L,Tris-HCL 50 mmol/L,NaCl 150 mmol/L)重懸勻漿,室溫孵育10 min; 2 000 r/min離心5 min,保留上清,共洗脫三次合并3次所得上清。取超聲裂解上清及不同濃度尿素洗滌、純化的上清行SDS-PAGE電泳,分析目的蛋白的表達形式及融合蛋白純化的最佳方案。
1.2.7 Western blot法檢測融合蛋白蛋白純化產(chǎn)物經(jīng)SDS-PAGE電泳分離后,將融合蛋白轉(zhuǎn)移至NC膜上,明膠室溫封閉1 h,加入抗GST抗體,4℃孵育過夜。PBST洗膜3次,每次10 min,再加入HRP標記的山羊抗兔IgG,室溫孵育1 h,PBST洗膜3次后,ECL化學(xué)發(fā)光顯色。
2.1人NRP-1基因的克隆和克隆載體的構(gòu)建PCR產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳,見一約1.8 kb的條帶,與目的基因的大小相符(圖1A)。使用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ單酶切初步鑒定構(gòu)建的重組質(zhì)粒pCR-blunt-NRP-1,1.0%瓊脂糖凝膠電泳可見大小約1.8 kb及3.5 kb兩條清晰條帶,與理論值相符(圖1B)。
2.2融合蛋白表達載體pGEX-4T-1-NRP-1構(gòu)建及鑒定使用BamHⅠ和EcoRⅠ酶切pCR-blunt-NRP-1及pGEX-4T-1質(zhì)粒后,用T4 DNA連接酶連接后酶切鑒定,1.0 %瓊脂糖凝膠電泳可見大小約4.9 kb及1.8 kb的兩條條帶,結(jié)果如下,與理論值相符(圖2)。
圖1 NRP-1基因片段的擴增及pCR-blunt-NRP-1重組質(zhì)粒的酶切Fig.1 Fragment NRP-1 amplified by PCR and recombinant plasmid digested with restriction enzyme
Note: M.1 kb DNA marker.Recombinant plasmid pGEX-4T-1-NRP-1digested by BamHⅠand EcoRⅠ.
圖3 GST-NRP-1融合蛋白的表達分析Fig.3 Analysis expression of GST-NRP-1 protein in E.coli
2.3融合蛋白GST-NRP-1的誘導(dǎo)表達收集IPTG誘導(dǎo)前、誘導(dǎo)后的菌液及超聲裂解后上清和沉淀,進行考馬斯亮藍染色檢測。結(jié)合GST及NRP-1的分子量大小,融合蛋白的分子量符合理論值大小。結(jié)果顯示經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后GST-NRP-1融合蛋白以包涵體的形式高表達(圖3)。
2.4不同誘導(dǎo)劑濃度對GST-NRP-1融合蛋白表達量的影響將表達菌pGEX-4T-1-NRP-1劃板培養(yǎng)并在Ampr瓊脂平板上挑選單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床振蕩至A600為0.6左右,誘導(dǎo)時間為6 h,誘導(dǎo)溫度為37℃的條件下,誘導(dǎo)劑IPTG濃度在0.1~1.0 mmol/L的范圍內(nèi),目的蛋白表達量在0.4 mmol/L IPTG濃度時表達量最高(圖4)。
2.5不同誘導(dǎo)時間對GST-NRP-1融合蛋白表達量的影響誘導(dǎo)劑濃度為0.4 mmol/L,誘導(dǎo)溫度為37℃的條件下,誘導(dǎo)時間在2、4、6、8 h時,目的蛋白表達量隨著時間的延長而增加,誘導(dǎo)時間在6 h時蛋白表達量達到最高,之后趨于穩(wěn)定(圖5)。
2.6包涵體的復(fù)性及純化包涵體洗滌、溶解及透析法復(fù)性后,與GST-beads結(jié)合,經(jīng)谷胱甘肽洗脫后行考馬斯亮藍染色,結(jié)果顯示有融合蛋白的表達且純度尚可(圖6)。
Note: M.Protein molecular weight marker; 1.The bacteria before induced by IPTG; 2-6.IPTG concentration were 0.1,0.2,0.4,0.8,1.0 mmol/L.
Note: M.Protein molecular weight marker; 1.The bacteria before induced by IPTG; 2-5.Induction time were 4 h,6 h,8h,10h.
圖6 包涵體的復(fù)性及純化Fig.6 Inclusion body refolding and purification
圖7 融合蛋白的western blot分析Fig.7 Western blot analysis of GST-NRP-1 fusion protein
2.7 GST-NRP-1融合蛋白的檢測收集經(jīng)純化后的蛋白,經(jīng)Western blot檢測,結(jié)果證實有GSTNRP-1融合蛋白的表達(圖7)。
NRP-1是位于染色體10p12基因編碼的Ⅰ型跨膜糖蛋白,為VEGF和SEMA家族受體。NRP-1在胚胎的骨骼肌和心血管系統(tǒng),成人的上皮細胞、成骨細胞、骨髓干細胞以及其他組織包括肺、心臟、肝臟、腎臟、胰腺、胎盤等均有表達,在血管生成和血管發(fā)展方面起到重要作用[4]。有研究顯示敲除NRP-1的老鼠因機能不全和血管形成滯后導(dǎo)致胚胎死亡[5]。對NRP-1的研究也涉及到許多腫瘤,包括前列腺癌、胰腺癌、乳腺癌、惡性黑色素瘤等。Gray等[6]發(fā)現(xiàn)在胰腺癌細胞系PANC-1中NRP-1過表達可抑制腫瘤生長,其機制與抑制AKT及Erk-1/2的磷酸化有關(guān)。通過其特異性siRNA下調(diào)NRP-1的表達,可導(dǎo)致腫瘤細胞的遷移及生長。但有研究卻發(fā)現(xiàn)NRP-1高表達可促進腫瘤的生長、內(nèi)皮細胞的增殖及血管的生成[7-10]??筕EGF的靶向藥物貝伐單抗可延長腫瘤的進展時間,在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中被廣泛使用。然而,近來許多研究已經(jīng)顯示,貝伐單抗和細胞毒性化療藥物聯(lián)合使用不增加病人的生存期,其具體機制不詳[11]。作為VEGF165受體的NRP-1,在NRP-1陽性、VEGFR2陰性的乳腺癌細胞株中,VEGF165通過激活PI3K通路阻止腫瘤細胞凋亡,而且NRP1的水平和細胞生存直接相關(guān)[12]。另外,在介導(dǎo)乳腺癌遷移和轉(zhuǎn)移中NRP1也起了非常重要的作用。有研究顯示NRP-1和VEGF是獨立的預(yù)后因素[13],因此NRP-1的具體作用機制仍有待研究。
本研究成功構(gòu)建了攜帶NRP-1基因的原核表達載體pGEX-4T-1-NRP-1,轉(zhuǎn)入BL21感受態(tài)細胞后表達了GST-NRP-1融合蛋白,該蛋白為后續(xù)進行GST-pull down實驗及質(zhì)譜分析深入研究NRP-1的作用機制及與其招募蛋白間的相互作用提供了有力工具。后續(xù)工作使用質(zhì)譜分析等蛋白質(zhì)組學(xué)手段結(jié)合免疫共沉淀和共定位等進一步驗證手段可望基本闡明NRP-1的功能,將有助于深入認識NRP-1對癌癥的調(diào)控機制,為后續(xù)的治療提供新的思路。
參考文獻:
[1]Fujisawa H,Takagi S,Hirata T.Growth-associated expression of a membrane Protein,neuropilin,in Xenopus optic nerve fibers[J].Dev Neurosci,1995,17(5-6) : 343-349.
[2]Murga M,F(xiàn)ernandez-Capetillo O,Tosato G.Neuropilin-1 regulates attachment in human endothelial cells independently of vascular endothelial growth factor receptor-2[J].Blood,2005,105 (5) : 1992-1999.
[3]Wang L,Zeng H,Wang P,et al.Neuropilin-1-mediated vascular permeability factor/vascular endothelial growth factor-dependent endothelial cell migration[J].J Biol Chem,2003,278 (49) : 48848-48860.
[4]Miao HQ,Lee P,Lin H,et al.Neuropilin-1 expression by tumor cells promotes tumor angiogenesis and progression[J].FASEB J,2000,14(15) : 2532-2539.
[5]Kitsukawa T,Shimizu M,Sanbo M,et al.Neuropilin-semaphorin III/D-mediated chemorepulsive signals play a crucial role in peripheral nerve projection in mice[J].Neuron,1997,19 (5) : 995-1005.
[6]Gray MJ,Wey JS,Belcheva A,et al.Neuropilin-1 suppresses tumorigenic properties in a human pancreatic adenocarcinoma cell line lacking neuropilin-1 coreceptors[J].Cancer Res,2005,65 (9) : 3664-3670.
[7]Duff SE,Saunders M,McCredie V,et al.Pre-operative plasma levels of vascular endothelial growth factor A,C and D in patients with colorectal cancer[J].Clin Oncol (R Coll Radiol),2005,17 (5) : 367-371.
[8]Xu T,Chen D.Serum vascular endothelial growth factor-C and vascular endothelial growth factor level in patients with colorectal carcinoma and clinical significance[J].J Huazhong Univ Sci Technolog Med Sci,2006,26(3) : 329-331,355.
[9]Alabi AA,Suppiah A,Madden LA,et al.Preoperative serum levels of serum VEGF-C is associated with distant metastasis in colorectal cancer Patients[J].Int J Colorectal Dis,2009,24(3) : 269-274.
[10]Abe A,F(xiàn)ukui H,F(xiàn)ujii S,et al.Involvement of cyclooxygenase-2 and vascular endothelial growth factor in vascularization and lymph node metastasis of colorectal cancers with submucosal invasion[J].J Gastroenterol Hepatol,2007,22(7) : 1071-1077.
[11]Miller K,Wang M,Gralow J,et al.Paclitaxel plus bevacizumab versus paclitaxel alone for metastatic breast cancer[J].N Engl J Med,2007,357(26) : 2666-2676.
[12]Bachelder RE,Crago A,Chung J,et al.Vascular endothelial growth factor is an autocrine survival factor for neuropilin-expressing breast carcinoma cells[J].Cancer Res,2001,61 (15) : 5736-5740.
[13]Ghosh S,Sullivan CA,Zerkowski MP,et al.High levels of vascular endothelial growth factor and its receptors (VEGFR-1,VEGFR-2,neuropilin-1) are associated with worse outcome in breast cancer[J].Hum Pathol,2008,39(12) : 1835-1843.
[收稿2014-12-20修回2015-08-21]
(編輯倪鵬)
doi:10.3969/j.issn.1000-484X.2015.10.016
作者簡介:韓正祥(1974年-),男,博士,教授,碩士生導(dǎo)師,主要從事腫瘤方面研究,E-mail: cnhzxyq@ 163.com。
文章編號1000-484X(2015) 10-1370-05
文獻標志碼A
中圖分類號R73