遺傳學(xué)

封面介紹：編編碼T細(xì)胞受體（T cell receptor，TCR）α、β、γ和δ鏈的基因定位于不同的染色體，分別由多個(gè)不同的高度同源的基因家族組成.雞的細(xì)菌人工染色體（BAC）文庫(kù)是用BAC載體構(gòu)建的含有雞的全部基因隨機(jī)片段的重組DNA克隆群體，是進(jìn)行雞物理圖譜構(gòu)建、染色體篩查、基因篩選和基因圖位克隆等生物學(xué)研究的基礎(chǔ).開展雞TCRγ鏈基因位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的BAC克隆的重新測(cè)序和組裝，可為進(jìn)一步研究雞TCRβ基因位點(diǎn)和TCRα/δ基因位點(diǎn)的基因組序列積累經(jīng)驗(yàn).設(shè)計(jì)說明：圖中卡通雞的兩只腳踩在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)上，雙翅形象化為手型，左手托起右上角的TCR結(jié)構(gòu)示意圖，右手拇指豎起指向文中獲得的雞TCRγ基因位點(diǎn)的組裝草圖，口中高呼“TCRγ”.圖案不僅體現(xiàn)了實(shí)驗(yàn)的研究重點(diǎn)，更寓意著利用靶向BAC文庫(kù)的TCR區(qū)段測(cè)序策略獲得雞TCR基因位點(diǎn)的完整序列的期望.

雞T細(xì)胞受體γ鏈基因位點(diǎn)重新測(cè)序和組裝

馬俊平，楊犀，律娜，等

動(dòng)物T細(xì)胞受體（T cell receptor，TCR）基因由多個(gè)不同的高度同源的基因家族組成，通過全基因組測(cè)序很難獲得準(zhǔn)確的基因序列和排列位置.文章通過在NCBI中發(fā)布的雞TCR的γ鏈（TCRγ或TRG）基因片段序列定位了雞TRG基因所在區(qū)域，并確定了與雞TRG基因位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的細(xì)菌人工染色體（BAC）克隆（CH261-174P24）.對(duì)該克隆進(jìn)行高通量的重新測(cè)序和組裝后，得到含有10個(gè)scaffolds的基因組草圖，較完整地覆蓋了雞TRG基因位點(diǎn)及兩側(cè)區(qū)域.通過PCR擴(kuò)增和測(cè)序證明了scaffold內(nèi)部結(jié)構(gòu)的正確性，校正了雞參考基因組TRG基因位點(diǎn)一個(gè)可變基因和一個(gè)缺口序列（gap）附近各一處錯(cuò)誤序列，以及可變基因區(qū)多處序列錯(cuò)誤.文章通過校正雞參考基因組TRG基因位點(diǎn)的序列，為雞TRA/D和TRB基因位點(diǎn)的基因組序列分析提供了新方法.

雞；T細(xì)胞受體（TCR）；伽馬鏈（TCRγ，或TRG）基因位點(diǎn)；測(cè)序；組裝

來源出版物：遺傳，2015，37（6）： 568-574聯(lián)系郵箱：朱寶利，zhubaoli@im.ac.cn