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        遺傳學(xué)

        2015-10-27 08:12:31
        中國學(xué)術(shù)期刊文摘 2015年2期
        關(guān)鍵詞:關(guān)聯(lián)研究

        遺傳學(xué)

        封面介紹:全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)是人類復(fù)雜疾病研究的重要組成部分之一,在群體水平檢測全基因組范圍的遺傳變異與可觀測性狀間的遺傳關(guān)聯(lián).傳統(tǒng)GWAS依靠芯片(Array)技術(shù)獲得了很多成果,但也遺留了不少問題,如所謂的“缺失的遺傳力”,在某些性狀上不同研究的結(jié)果一致性較弱,顯著關(guān)聯(lián)的遺傳變異位點(diǎn)的功能較難解釋等.這限制了其在現(xiàn)實(shí)生活中的應(yīng)用.高通量測序技術(shù),也稱第二代測序(Next-generation sequencing,NG5)技術(shù),可以快速準(zhǔn)確地產(chǎn)出高通量、多組學(xué)的遺傳變異或性狀表型,為解決以上問題提供了高精度的數(shù)據(jù)信息.基于NGS技術(shù)的GWAS著重于“復(fù)雜疾病一稀有變異”(GD-RV)假設(shè),可在一定程度上彌補(bǔ)傳統(tǒng)GWAS的不足、詳見本期周家蓬等的“基于高通量測序的全基因組關(guān)聯(lián)研究策略”一文(第1099-1111頁).

        基于高通量測序的全基因組關(guān)聯(lián)研究策略

        周家蓬,裴智勇,陳禹保,等

        全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)是人類復(fù)雜疾病研究的重要組成部分之一,在群體水平檢測全基因組范圍的遺傳變異與可觀測性狀間的遺傳關(guān)聯(lián).傳統(tǒng)的GWAS是以芯片(Array)技術(shù)獲得高密度的遺傳變異,盡管碩果累累,但也存在不少問題.如:所謂的“缺失的遺傳力”,即利用關(guān)聯(lián)分析檢測達(dá)到全基因組水平顯著的遺傳變異位點(diǎn)只能解釋小部分遺傳力;在某些性狀上不同研究的結(jié)果一致性較弱;顯著關(guān)聯(lián)的遺傳變異位點(diǎn)的功能較難解釋等.高通量測序技術(shù),也稱第二代測序(Next-generation sequencing,NGS)技術(shù),可以快速、準(zhǔn)確地產(chǎn)出高通量的變異位點(diǎn)數(shù)據(jù),為解決以上問題提供了可行的方案.基于NGS技術(shù)的GWAS方法(NGS-GWAS),可在一定程度上彌補(bǔ)傳統(tǒng)GWAS的不足.文章對NGS-GWAS策略和方法進(jìn)行了系統(tǒng)性調(diào)研,提出了目前較為可行的NGS-GWAS的實(shí)施策略和方法,并對NGS-GWAS如何應(yīng)用于個體化醫(yī)療(Personalized medicine,PM)進(jìn)行了展望.

        全基因組關(guān)聯(lián)研究;第二代測序;個體化醫(yī)療

        來源出版物:遺傳,2014,36(11): 1099-1111聯(lián)系郵箱:裴智勇,peizy@bcc.ac.cn

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