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        實時熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)偶聯(lián)高特異性核酸侵入反應(yīng)檢測單核苷酸多態(tài)性

        2015-07-30 07:16:47鄭夢琳等
        分析化學(xué) 2015年7期
        關(guān)鍵詞:突變型雜合探針

        鄭夢琳等

        摘 要 建立了實時熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)偶聯(lián)高特性核酸侵入反應(yīng)檢測單核苷酸多態(tài)性(SNP)的方法。優(yōu)化了體系中flap核酸內(nèi)切酶1(FEN1酶)和野生型檢測探針等用量,確定了最佳反應(yīng)條件,即FEN1酶用量為1.5 U,野生型檢測探針用量為0.125 μmol/L,0.5 μmol/L Invader突變型檢測探針,各0.25 μmol/L通用野生型(VIC)和突變型(FAM)熒光共振轉(zhuǎn)移發(fā)卡探針,顯著降低了野生型樣本和突變型樣本背景信號,避免了背景信號對檢測結(jié)果分型的干擾。采用本方法對編碼乙醛脫氫酶2(ALDH2)基因ALDH2*2位點21例樣本、細(xì)胞色素P450 2C19基因CYP2C19*2和CYP2C19*3位點各19例樣本進(jìn)行分型檢測,結(jié)果表明, ALDH2*2位點GG純合10例,GA雜合8例,AA純合3例;CYP2C19*2位點GG純合9例,GA雜合8例,AA純合2例;CYP2C19*3位點GG純合18例,GA雜合1例。使用焦磷酸測序進(jìn)行驗證,兩種方法檢測結(jié)果一致。本方法特異性好、操作簡便、耗時短、成本低,可實現(xiàn)對SNP單管閉管無污染的分型檢測。

        關(guān)鍵詞 實時熒光PCR; 核酸侵入反應(yīng); 單核苷酸多態(tài)性; 乙醛脫氫酶2基因; 細(xì)胞色素P450 2C19基因

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