王丹 ,姚曉東,李新鳳,王美琴,郝曉娟,王建明
(山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,山西 太谷 030801)
山西晉城馬鈴薯瘡痂病病原菌鑒定
王丹 ,姚曉東,李新鳳,王美琴,郝曉娟*,王建明
(山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,山西 太谷 030801)
為分離鑒定山西晉城馬鈴薯瘡痂病病原菌,對分離物進行致病性測定、形態(tài)學(xué)觀察、生理生化特性測定及16S rDNA序列分析。結(jié)果表明,該分離物在燕麥培養(yǎng)基上菌落呈灰白色,邊緣稍有褶皺突起,顯微觀察孢子呈灰色,孢子鏈呈螺旋狀,結(jié)合生理生化特性測定結(jié)果將其鑒定為Streptomycesscabies。該菌株與Streptomycesscabies(登錄號為HM018114)的16SrDNA序列同源性為100%。引起山西晉城馬鈴薯瘡痂病的病原菌為Streptomycesscabies。
馬鈴薯瘡痂病;病原菌鑒定;鏈霉菌;16SrDNA序列
作為全球四大糧食作物之一[1],馬鈴薯具有較高的營養(yǎng)及藥用價值,在人們消費結(jié)構(gòu)中的地位越來越重要[2]。但其易被多種病原菌感染,影響地上及地下組織器官正常生長。由鏈霉菌屬引起的馬鈴薯瘡痂?。╬otato scab)在各種植區(qū)發(fā)生普遍[3],對馬鈴薯品質(zhì)及市場經(jīng)濟價值造成了嚴重影響[4]。國內(nèi)外學(xué)者對引起該病害的病原菌種類進行研究,發(fā)現(xiàn)引起馬鈴薯瘡痂病病原菌種類因不同國家和地區(qū)而異,具有明顯的區(qū)域特性和遺傳多樣性[5~7]。法 國 已 報 道 病 原 菌 主 要 是Streptomyces.reticuliscabiei、S.steliiscabiei[7];在芬蘭發(fā)現(xiàn)的瘡痂病原菌有S.turgidiscabies、S.aureo-faciens、S.scabies等[8];在加拿大東部地區(qū),主要的瘡痂病病原為S.scabies、S.acidiscabies[9];S.luridiscabiei、S.niveiscabiei、S.puniciscabiei等在韓國被報道[10,11]。張 萌[6,12,13]等 對 來 自 中 國 不 同 地區(qū)的馬鈴薯瘡痂病菌進行了遺傳多樣性分析和區(qū)域分布特性研究,結(jié)果表明S.bobili和S.galilaeus主要分布于內(nèi)蒙古自治區(qū)、河北、山西等省,S.curopacisabiei和S.scabies主要分布于河北、黑龍江等省,在云南、四川等省發(fā)現(xiàn)了S.scabies,來自山東的瘡痂病原有S.diastato-chromogenes、S.acidiscabies、S.setonii等。目 前 對 山 西省馬鈴薯瘡痂病病原菌種類的報道較少。為明確山西晉城馬鈴薯瘡痂病原菌種類,本試驗對從該地區(qū)采集到的馬鈴薯瘡痂病病薯進行了病原菌的分離鑒定。
2014年5月從山西晉城馬鈴薯種植區(qū)采集馬鈴薯瘡痂病病薯,對其癥狀進行觀察。
將病薯塊莖帶回實驗室用蒸餾水清洗,經(jīng)3%的NaClO溶液進行表面消毒后用無菌水清洗,晾干。向無菌研缽中加20mL 1∶140的苯酚溶液,取小塊病健交界處組織于研缽中研碎,浸泡10min,取20μL涂在大豆葡萄糖瓊膠平板上(大豆粉5.0g,葡萄糖5.0g,CaCO30.4g,瓊脂粉17.0g,蒸餾水1 000mL,pH8.0),于30℃恒溫培養(yǎng)5d[14]。挑取單菌落于燕麥培養(yǎng)基(燕麥片20g,瓊脂粉18g,蒸餾水1 000mL,pH7.2)上進行劃線培養(yǎng),經(jīng)3次純化培養(yǎng)后刮取培養(yǎng)7d的孢子配成懸浮液,20%甘油-20℃保存。
采用 Tuber slice assays法[15],選取健康馬鈴薯,經(jīng)0.5%的NaClO溶液表面消毒和無菌水清洗后晾干,用15mm的打孔器從馬鈴薯的中心打取接種組織,將圓柱形接種組織切成厚度為3mm的圓片,置于含有三層無菌濾紙保濕的培養(yǎng)皿中,用6mm的打孔器打取經(jīng)OMA培養(yǎng)基培養(yǎng)7d的待測菌的菌餅,接種于馬鈴薯薄片中心,以空白菌餅作為對照。于30℃恒溫條件下培養(yǎng),分別于7d、14d時觀察病斑情況。
挑取在燕麥培養(yǎng)基平板生長7d的菌落于載玻片上,100倍光學(xué)顯微鏡下觀察孢子及孢子鏈特征[16]。
參照伯杰細菌鑒定手冊[17]和鏈霉菌鑒定手冊[18]中測定方法,對該菌株進行碳源利用、氮源利用、黑色素產(chǎn)生、硫化氫產(chǎn)生、淀粉利用和敏感性等方面測定。
1.5.1 基因組的提取
參考劉炳輝[19]等優(yōu)化SDS法來提取該菌株基因組DNA。
1.5.2 16SrDNA PCR擴增
選取16SrDNA通用擴增引物進行PCR擴增。引物(Primer)序列:
反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性4min;94℃變性30s;55℃退火30s;72℃延伸90s;共32個循環(huán)。72℃最后延伸10min,4℃保存。
將PCR擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,并送至上海生工進行測序。得到的拼接序列在NCBI作BLAST比對,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
病原菌侵染造成馬鈴薯塊莖病部表皮粗糙,有裂縫。病斑組織木栓化、壞死,表面呈棕褐色凸起瘡痂(圖1-A)。
采用小薯片法對代表菌株JC-1進行致病性測定,接種7d后,該菌株可在接種體上擴展生長,菌餅周圍可觀察到輕微褐變;14d后,可觀察到明顯褐變和壞死。
JC-1菌株在燕麥瓊脂培養(yǎng)基平板上菌落呈灰白色,邊緣稍有褶皺突起(圖1-B)。革蘭氏染色呈陽性,孢子呈灰色,孢子鏈呈螺旋狀(圖1-C)。
圖1 病害癥狀及病原菌形態(tài)觀察Fig.1 Symptoms of potato scab and morphological characteristic of isolated strain
JC-1菌株能夠以果糖、葡萄糖、蔗糖、甘露醇、木糖、阿拉伯糖、鼠李糖、棉籽糖、肌醇等碳源為單一碳源。能以甲硫氨酸、組氨酸為單一氮源。對鏈霉素、青霉素、結(jié)晶紫均敏感。能使ISP6培養(yǎng)基變黑,表明可產(chǎn)生黑色素。能使Tresner培養(yǎng)基變黑,證明可產(chǎn)生H2S??僧a(chǎn)生淀粉水解酶。符合Streptomycesscabies生理生化特性(表1)。
擴增得到分子量約1 500bp的16SrDNA片段(圖2)。在NCBI進行序列比對,在以Actinomycesnaturae(登錄號為FJ234421)為外群,使用MEGA5.05軟件構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中(圖3),待測菌株JC-1與Streptomycesscabies(登錄號為HM018114)同源性為100%。16SrDNA序列分析證明該菌株為Streptomycesscabies,與形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果一致。
表1 馬鈴薯瘡痂病菌JC-1生理生化特性Table 1 Physiological and biochemical characteristics of the pathogen of potato scab
馬鈴薯瘡痂病是馬鈴薯的重要病害之一,給馬鈴薯的品質(zhì)造成極大影響,通常使馬鈴薯減產(chǎn)10%~30%[20]。本研究從病原菌的培養(yǎng)物特征、顯微形態(tài)、生理生化特性等方面進行生物學(xué)研究,并結(jié)合16SrDNA序列分析,將山西晉城地區(qū)馬鈴薯瘡痂病病原菌鑒定為瘡痂鏈霉菌Streptomyces scabies。
圖2 PCR擴增檢測結(jié)果(M:Marker;1:JC-1菌株基因組擴增產(chǎn)物)Fig.2 The results of PCR amplification for 16SrDNA sequences(M:Marker;1:PCR products of the strain JC-1)
圖3 基于16SrDNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree based on 16SrDNA sequences of the scab-related strain
山西馬鈴薯產(chǎn)業(yè)在促進山西經(jīng)濟發(fā)展,農(nóng)民收入增加方面有重要意義,本研究采集的病薯來自于晉城,今后還應(yīng)進一步調(diào)查山西省不同馬鈴薯種植地區(qū)馬鈴薯瘡痂病的情況,采集并進行病原菌分離鑒定,為有效防治該病害以及探究馬鈴薯瘡痂病菌遺傳多樣性提供可靠依據(jù)。
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Identification of The Pathogen of Potato Scab in Jincheng of Shanxi Province
Wang Dan,Yao Xiaodong,Li Xinfeng,Wang Meiqin,Hao Xiaojuan*,Wang Jianming
(CollegeofAgriculture,ShanxiAgriculturalUniversity,TaiguShanxi030801,China)
The pathogen causing potato scab in Jincheng of Shanxi province was isolated and identified.The isolated strain from potato scab was analyzed and identified by pathogenicity identification,morphological observation,determination of physiological and biochemical characteristics and the analysis of 16SrDNA sequence.The colony of isolate was grey,which showing wrinkle and bulge on the edge of the colony.Conidium were grey and spore chains were spiral.According to morphological features and the charactersitics of physiology and biochemistry,the isolate was identified asStreptomycesscabies.The results of 16SrDNA sequences of the isolated strain showed 100%identity withStreptomycesscabies(HM018114).The results showed that the pathogen causing scab in Jincheng of Shanxi province wasStreptomycesscabies.
Potato scab;Pathogen identification;Streptomyces;16SrDNA sequence
S435.32
A
1671-8151(2015)05-0495-04
10.13842/j.cnki.issn1671-8151.2015.05.009
2015-03-30
2015-04-18
王丹(1988-),女(漢),山西運城人,碩士研究生,研究方向:生物農(nóng)藥與生物防治
*通訊作者:郝曉娟,副教授,碩士生導(dǎo)師。Tel:0354- 6286806;E-mail:xiaojuanhao@126.com
國家自然科學(xué)基金青年基金(31000873);山西農(nóng)業(yè)大學(xué)中青年學(xué)術(shù)骨干基金(XG201210);山西省科技攻關(guān)項目(20120311016-2)
(編輯:武英耀)
山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)2015年5期