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        一種使用最近鄰自體耐受的否定選擇算法

        2015-05-04 09:09:20楊韜鄧紅莉
        關(guān)鍵詞:檢測器

        楊韜++鄧紅莉

        摘要:本文提出一種采用最近鄰自體耐受的否定選擇算法(Nearest Neighbor Self Tolerance Negative selection algorithm, NST-NSA),該算法在通過數(shù)據(jù)預(yù)處理階段將所有樣本壓縮進(jìn)單位特征空間,并利用N維數(shù)組記錄自體位置;在訓(xùn)練階段根據(jù)候選檢測器坐標(biāo)在N維數(shù)組中搜索最近近鄰自體進(jìn)行計(jì)算。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,想對于傳統(tǒng)的否定選擇算法NST-NSA能以更短的時間達(dá)到更高的檢測率。

        關(guān)鍵詞:人工免疫 否定選擇算法 檢測器

        中圖分類號:TP274.5 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1007-9416(2014)12-0124-01

        1 引言

        受到生物免疫系統(tǒng)的啟發(fā),計(jì)算機(jī)人工免疫系統(tǒng)利用檢測器來代替抗體,在計(jì)算機(jī)系統(tǒng)內(nèi)來區(qū)分自體與非自體抗原。傳統(tǒng)的否定選擇算法在自體耐受階段(消除免疫自反應(yīng)),每一個新生成候選檢測器要進(jìn)化成為成熟檢測器必須要與所有自體進(jìn)行距離計(jì)算,這樣的距離計(jì)算耗費(fèi)了大量的時間代價(jià)極大地降低了算法的效率,限制了否定選擇算法的應(yīng)用。而事實(shí)上,候選檢測器只要沒有覆蓋距離自己空間距離最近。自體樣本就必然不會覆蓋更遠(yuǎn)距離的自體樣本,因此本文利用N維數(shù)組在預(yù)處理階段記錄下訓(xùn)練樣本的空間信息,當(dāng)候選檢測器生成時根據(jù)檢測器的空間信息直接在數(shù)組中查找最近鄰自體來進(jìn)行距離計(jì)算,這將有效地縮短計(jì)算時間提高算法效率。

        2 NST-NSA實(shí)現(xiàn)策略

        本文采用線性函數(shù)轉(zhuǎn)化將所有抗原(數(shù)據(jù)樣本)歸一化到[0,1]n特征空間在歸一化全部完成之后,根據(jù)最小歸一化精度與訓(xùn)練數(shù)據(jù)維度,生成N維數(shù)組A用于記錄訓(xùn)練樣本的空間信息。例如樣本有2維, 即N=2;在每一位上歸一化后小數(shù)取值均為小數(shù)點(diǎn)后1位,即精度為0.1,因此空間數(shù)組應(yīng)為10*10的2維數(shù)組。為了方便快速遍歷,數(shù)組A中有樣本點(diǎn)的位置將置“1”,其余位置將置“0”,當(dāng)空間數(shù)組A生成后,根據(jù)候選檢測器的實(shí)際位置就能夠快速檢索到最鄰近自體距離,假設(shè)有候選檢測器d(x,y),首先在根據(jù)檢測器的第一位坐標(biāo)在數(shù)據(jù)A中查找非零位置(可能最近鄰點(diǎn)), 如果沒有發(fā)現(xiàn)根據(jù)第二維繼續(xù)查找;均未發(fā)現(xiàn)的情況下開始近鄰區(qū)域查找。

        需要說明的是,雖然NST-NSA在計(jì)算前經(jīng)過了多次遍歷,然而這些遍歷操作僅僅是簡單的查找并不涵蓋復(fù)雜的數(shù)值計(jì)算。特別地,若采用歐式距離公式,當(dāng)樣本數(shù)量M巨大,樣本維度N偏高時,傳統(tǒng)的否定選擇算法將進(jìn)行M*N次乘方運(yùn)算,而NST-NSA最壞情況下只進(jìn)行(M+N)/2次0/1比較運(yùn)算,與M0*N次乘方運(yùn)算,其中M0為可能近鄰點(diǎn)數(shù)量,由于M0遠(yuǎn)小于M因此NST-NSA的時間復(fù)雜度迅速下降。同時使用NST-NSA,候選檢測器僅僅被限制在了局部范圍進(jìn)行比較,從而有效地減少了“孔洞“,在一定程度上提高算法檢測率。

        3 實(shí)驗(yàn)設(shè)置

        本節(jié)通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證NST-NSA算法性能。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集采用UCI標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集中廣泛應(yīng)用于模式識別與異常檢測等研究的BCW數(shù)據(jù)集。為說明算法性能,NST-NSA將與經(jīng)典的V-Detector算法在上述數(shù)據(jù)集上進(jìn)行對比實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)獨(dú)立重復(fù)20輪,每輪實(shí)驗(yàn)在兩種數(shù)據(jù)集上均隨機(jī)采用60%的自體樣本作為訓(xùn)練集,余下40%的自體樣本以及全部非自體樣本作為測試集,相關(guān)實(shí)驗(yàn)結(jié)果取均值,最后用檢測率DR與訓(xùn)練時間TR-T作為衡量算法性能的指標(biāo)。

        如圖1所示,與V-Detector算法相比NST-NSA在相同的期望覆蓋率下都能達(dá)到較高的檢測率。如圖2所示,當(dāng)期望覆蓋率上升時,否定選擇選擇算法需要產(chǎn)生更多的檢測器來覆蓋非自體空間,此時候選檢測器數(shù)量迅速上升,因此距離運(yùn)算的時間代價(jià)也隨之上升。可以看出V-Detector算法在期望覆蓋率增加的情況下,訓(xùn)練時間呈指數(shù)級增加;而NST-NSA由于事先記錄了樣本空間信息,每次只需要與最近鄰自體進(jìn)行距離運(yùn)算,從而訓(xùn)練時間受期望覆蓋率影響不大,擁有更高的計(jì)算效率。

        4 結(jié)語

        否定選擇算法是人工免疫理論中重要的檢測器生成算法,單傳統(tǒng)的否定選擇算法需要進(jìn)行大量的計(jì)算才能消除候選檢測器免疫自反應(yīng),巨大的時間代價(jià)限制了否定選擇算法的應(yīng)用。為此,本文提出了最近鄰自體耐受的否定選擇算法,在預(yù)處理階段利用N維數(shù)組來記錄訓(xùn)練樣本的空間信息,在訓(xùn)練階段可以幫助候選檢測器迅速搜索到最近鄰自體,從而極大地降低了消除免疫自反應(yīng)的計(jì)算代價(jià)。理論分析與實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明NST-NSA相較于經(jīng)典的V-detector算法能以較低的時間代價(jià)達(dá)到更高的檢測率。

        參考文獻(xiàn)

        [1]BRETSCHER P, COHN M.A, A theory of self-noself discrimination[J].Science, 1970,169:1042-1049.

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        [3]陳文,李濤,劉曉潔.一種基于自體集層次聚類的否定選擇算法[J].中國科學(xué):信息科學(xué),2013,43(5):611-625.

        [4]李濤.計(jì)算機(jī)免疫學(xué)[M].電子工業(yè)出版社,2004.endprint

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