國民政府審判日本戰(zhàn)犯的籌備工作，是在英美盟國的帶動下展開的。第二次世界大戰(zhàn)后期，英美等國就在謀劃戰(zhàn)后如何懲辦法西斯罪行。1943年10月，同盟國各國代表在倫敦成立“聯(lián)合國調(diào)查戰(zhàn)爭罪行委員會”，中國政府代表顧維鈞參加。1944年2月，敵人罪行調(diào)查委員會在重慶成立，開始了初期的日軍罪行調(diào)查工作。

1945年8月15日后，各地日軍相繼向國民政府投降，等待遣返。國民政府在接收過程中，得以開始實質(zhì)性的調(diào)查和懲處戰(zhàn)犯工作。

國民政府對日審判的最后一幕，是對岡村寧次的審判。

岡村寧次，1884年生。1913年陸軍大學(xué)畢業(yè)后，任參謀本部戰(zhàn)史課參謀。1915年2月第一次來中國，赴青島搜集資料。1924年到上海任日本領(lǐng)事館武官，后被孫傳芳聘為軍事顧問。1932年8月任關(guān)東軍副參謀長，指揮關(guān)東軍進攻熱河等地，并代表日方簽訂《塘沽協(xié)定》。1938年任日第11軍司令官，指揮進攻武漢作戰(zhàn)。1940年4月晉升陸軍大將。1941年7月任日華北方面軍司令官，指揮對華北各抗日根據(jù)地的“掃蕩”作戰(zhàn)。1944年11月就任日本“中國派遣軍”總司令官，指揮除東北和臺灣之外的全部侵華日軍。

岡村寧次在華北是共產(chǎn)黨、八路軍最強勁的對手。1941年，岡村寧次調(diào)集數(shù)萬日軍，對華北抗日根據(jù)地進行殘酷的大“掃蕩”，造成約270萬平民的死亡。八路軍喪失了一半根據(jù)地和人口，平原地帶全部變成游擊區(qū)。太行山深處的前方總部被日軍特種部隊突襲，參謀長左權(quán)犧牲。彭德懷1945年2月在延安華北工作座談會上曾深有感觸地說：“岡村寧次的這一套極其殘酷復(fù)雜的形式、方法，我們都是一直不熟悉的，這套辦法給我們造成的痛苦是很大的，也因此被動。華北根據(jù)地縮?。ㄎ迮_只有阜平，太行只剩涉縣、黎城、平順，冀魯豫只剩范縣、觀城，共剩六個縣城），根據(jù)地人口，1941年10月統(tǒng)計，只剩1300萬，為最低時期。根據(jù)地遭到了嚴(yán)重的損失、破壞，人民生活水平突然降低，敵特、K（國民黨）特大肆活動。人民中的積極分子更加仇恨敵人，而落后的更加悲觀，甚至有被騙向敵占區(qū)偷跑的，干部也有逃跑的。但也有另一方面，就是鐵路兩側(cè)附近人民在敵人統(tǒng)治下，真有活不下去的憤慨?！?/p>

彭德懷還說：“岡村寧次這個家伙，是很厲害的一個人，他有許多地方也是值得我們學(xué)習(xí)的。岡村有很多本事，能實事求是，細(xì)致周密。每次進攻，他都要調(diào)查半年之久，做準(zhǔn)備工作。他不進行‘蠶食’。他不出風(fēng)頭，不多講話，不粗暴，你從他的講話里看不出他的動向來。他經(jīng)常廣泛地收集我們的東西，研究我們的東西。他是朝鮮、東北的參謀長，老練得很，是歷來華北駐屯軍6個司令官里最厲害的一個?！迸淼聭褜σ粋€日軍將領(lǐng)評價如此之高，是很罕見的。

日本投降后，岡村執(zhí)行重慶國民政府的命令，指揮日本軍隊統(tǒng)一向國軍投降，不向八路軍投降，受到國民政府的欣賞和嘉許。1946年國共內(nèi)戰(zhàn)爆發(fā)。岡村充當(dāng)了國民黨的軍事顧問。岡村被捕之后，延遲到1947年8月23日，才首次出庭受審。國民黨高層醞釀為岡村開脫罪責(zé)，作無罪判決。為執(zhí)行命令，南京國防部軍事法庭費盡心機，起草判決書。1949年1月26日下午，石美瑜庭長宣讀判決書：

“本案被告于民國33年11月26日，受日軍統(tǒng)帥之命，充任中國派遣軍總司令官。所有長沙、徐州各大會戰(zhàn)日軍之暴行，以及酒井隆在港粵、松井石根、谷壽夫等在南京之大屠殺，均系發(fā)生在被告任期之前，原與被告無涉（酒井隆、谷壽夫業(yè)經(jīng)本庭判處死刑，先后執(zhí)行在案）。且當(dāng)時盟軍已在諾曼底及太平洋塞班島先后登陸，軸心既形瓦解，日軍陷于孤立。故自被告受命之日，以迄日本投降時止，閱時八月，所有散駐我國各地之日軍，多因斗志消沉，鮮有進展。迨日本政府正式宣告投降，該被告乃息戈就范，率百萬大軍，聽命納降。跡其所為既無上述之屠殺強奸搶劫，或計劃陰謀發(fā)動或支持侵略戰(zhàn)爭等罪行，自不能僅因其身份系敵軍總司令官，遽以戰(zhàn)罪相繩。綜上論述，被告既無觸犯戰(zhàn)規(guī)，或其他違反國際公法之行為，依法應(yīng)予論知無罪，以期平允?！?/p>

對岡村的判決，是非常牽強的。特別是把岡村的定案，僅僅局限在他1944年11月到1945年8月任中國派遣軍總司令這不足一年的時段內(nèi)。那么岡村此前在關(guān)東軍、華北派遣軍的經(jīng)歷，為什么連提都不提？在整個審判過程中，國民政府從來沒涉及日軍在共產(chǎn)黨抗日根據(jù)地范圍內(nèi)犯下的戰(zhàn)爭罪行。特別是岡村指揮的華北大掃蕩，其罪行是非常明顯、證據(jù)確鑿的，但法庭有意忽略不談，表現(xiàn)出明顯的袒護。這個判決書實際是為岡村提供的辯護書，其行文用詞，都帶有明顯的政治傾向，是站不住腳的。

岡村被判無罪，引起國內(nèi)輿論的強烈不滿。1949年1月28日《中共發(fā)言人關(guān)于命令南京政府重新逮捕前日本侵華軍總司令岡村寧次和逮捕國民黨內(nèi)戰(zhàn)罪犯的談話》和1949年2月5日《中共發(fā)言人關(guān)于和平條件必須包括懲辦日本戰(zhàn)犯和國民黨戰(zhàn)犯的聲明》，將國民政府軍事法庭宣判岡村寧次無罪釋放斥之為“出賣民族利益，勾結(jié)日本法西斯軍閥的犯罪行為”。這兩個聲明都是毛澤東撰寫的，上海《申報》2月1日轉(zhuǎn)載了中共1月28日聲明全文。在國民黨統(tǒng)治區(qū)敢于發(fā)表中共的言論，是很罕見的。表明上海新聞界對國民黨的判決敢怒不敢言，而借中共聲明表達自己的心聲。

對岡村的無罪判決，是國民政府審判日本戰(zhàn)犯最大的敗筆，因此也抹殺了其他法庭審判日本戰(zhàn)犯的成績。中共中央的聲明收入了《毛澤東選集》第四卷，所以新中國建立后，國民政府對日審判被否定，很少有人提及。國人幾乎已經(jīng)將它完全遺忘了。