特奧蒂瓦坎居民雖然屬于多民族人口，但他們都崇拜一個女神——塞羅戈多（意為“肥山”）。肥山是位于特奧蒂瓦坎附近的一座圣山，它可能正是當?shù)嘏窠毯蜕绨莸陌l(fā)源地。月亮金字塔的外形正是模仿了正好在它北面的肥山的輪廓。

位于特奧蒂瓦坎南端的羽蛇神廟下面和附近地下發(fā)現(xiàn)了多座墓葬，其中被埋的殉人超過200人。他們的雙手都被捆在背后，看來他們是在戰(zhàn)爭教儀式上被殺死的，這種宗教受金星在天宇中的位置影響。在圍繞太陽公轉(zhuǎn)的過程中，金星每584天就“超過”地球一次。在此過程中，從地球上看去，金星從日落后可見的“夜星”變成日出前可見的“晨星”。特奧蒂瓦坎人竟然有這樣的天文知識，不得不令人稱奇，也增添了這個古文明的神秘色彩。

許多殉人戴著由模仿的人類上頜骨（用貝殼雕刻成牙齒）、真正的上頜骨和下頜骨組成的項圈。墓坑里有超過2100件經(jīng)過制作的貝殼，以及多件黑曜石刀和箭頭，還有多件石片。這些石片很像是后來阿茲特克戰(zhàn)士所佩戴的鑲嵌了黃鐵礦的鏡子，這樣的石片常被裝飾在托爾特克等其他墨西哥高山部落的軍服上。這些戴著鏡子的殉人看來都背對月亮金字塔的中心，就好像是在保衛(wèi)金字塔里面的東西。

1998年，考古學家在月亮金字塔內(nèi)部發(fā)現(xiàn)一座墓穴，其中有一具成年男性的骨架。此人被捆綁，戴著黃鐵銅鏡，很可能是一名殉人，尸體被埋進邊長為3.4米、深度為1.5米的方形坑中。尸骸周圍有超過150件隨葬品，其中包括黑曜石和綠寶石雕像、黑曜石刀和箭頭、黃鐵礦鏡子、海螺及其他貝殼、八只鳥（鷹或禿鷲）和兩頭美洲虎的尸骸。這些隨葬品的品質(zhì)非凡，使得當時當?shù)匾呀?jīng)發(fā)現(xiàn)的1200多座墓葬都黯然失色。耐人尋味的是，這些隨葬品與發(fā)現(xiàn)于羽蛇神廟墓葬中的隨葬品很相似，而兩者都與發(fā)現(xiàn)于居民區(qū)的物品區(qū)別很大。

考古學家推測，這座墓穴里埋葬的是一個非常顯赫的人物。由于墓穴發(fā)現(xiàn)地點是在金字塔建造初期階段（大約是公元150年，即月亮金字塔第四建造階段；第五建造階段是在公元250年），墓主有可能是一名重要的大臣，王室墓就在附近，或許是在金字塔中心。還有一種可能性是，這名重臣就是金字塔獻祭儀式中的殉人。

最近，在對月亮金字塔（它一共包含七個建造階段）的發(fā)掘中，考古學家在第五階段堆土（也就是第五層）中發(fā)現(xiàn)了第五座墓。在這座穹形墓穴里，一共有12具遺骸（其中10人被砍頭），他們顯然都是殉人。此外，還發(fā)現(xiàn)了具有明顯象征意義的大量祭品和多種動物的遺骸。這暗示，月亮金字塔很有可能是一個血腥的祭祀場所。

這12人的手都被綁在背后，其中兩人佩戴大量裝飾物，其中包括綠寶石耳圈、串珠、項鏈等，這說明他們的地位高階。其他被砍頭的10人的尸體看來是被扔進墓穴中的一側的。在墓穴另一側是動物殘骸，其中包括5只狗（或者狼）、3只貓（或美洲獅或美洲虎）以及13只鳥（初步鑒定為鷹）。所有這些動物，都與特奧蒂瓦坎戰(zhàn)士圖騰上的動物吻合。不僅如此，墓穴中的許多動物看來也被捆綁，另外還有多具動物頭顱。此前在2002年的發(fā)掘中，考古學家在月亮金字塔第六階段堆土中發(fā)現(xiàn)了一座墓葬，其中3具被儀式性埋葬的遺體上裝飾著具有瑪雅風格的玉器，這表明特奧蒂瓦坎與瑪雅有來往。

這次發(fā)現(xiàn)的第五層中的第五座墓葬，與月亮金字塔第五層的初期建造階段有關。這座墓葬與之前發(fā)現(xiàn)的第五層中第二座墓葬頗為相似，后者也有一些具有象征性的動物的遺骸，但只埋葬了被捆綁的4個人（同位素檢測表明其中兩人是特奧蒂瓦坎人，另外兩人則是外鄉(xiāng)人）。第五座墓葬中有一些更驚人的線索，尤其是墓穴中心的一件祭品上有一個拼接的人像，其一些特征在中美洲藝術中非常獨特，但為什么獨特卻無人知曉。這件祭品包括不同的貝殼墜子、火山石刀刃、箭頭、石片首飾及許多有機材料的殘跡。那個人像被發(fā)現(xiàn)位于18把大石刀之上，與石刀一起構成輻射圖案。其中9把石刀的形狀彎曲，另外9把石刀呈羽蛇神形狀（這是最高權力的象征）。

開始時，月亮金字塔只是一座小廟，如今這座廟已淪為今天月亮金字塔前方一座五層平臺的地基組成部分。月亮金字塔的建造手法很可能考慮到了要防止盜墓，所以用于金字塔建造的巖石排列并不緊湊，這也造成考古學家開辟通道進入金字塔內(nèi)部的難度很大。但考古學家一直堅守月亮金字塔，因為他們相信金字塔中應該有王室墓葬，因為這才符合在中美洲其他已知遺址（例如洪都拉斯西部的瑪雅科潘城市和墨西哥恰帕斯的帕倫克）所展示的傳統(tǒng)。

考古學家推測，月亮金字塔有可能是特奧蒂瓦坎高層貴族甚至是最高統(tǒng)治者的陵墓，一些殉人在葬禮儀式上被殺死、陪葬。此外還有證據(jù)表明，特奧蒂瓦坎人還有兒童人殉行為。1906年，有人在太陽金字塔的四個角都發(fā)現(xiàn)了兒童墓葬。后來，考古學家還發(fā)現(xiàn)了與圣壇有關的新生兒骨架。