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        聚(3-羥基丁酸-co-4-羥基丁酸共聚酯)降解菌株的選育及其降解特性1)

        2015-04-03 11:33:34張虹郭子琦侯春妹李凡陳珊大慶師范學(xué)院大慶163712東北師范大學(xué)
        關(guān)鍵詞:分生孢子丁酸碳源

        張虹郭子琦侯春妹李凡陳珊( 大慶師范學(xué)院,大慶,163712) ( 東北師范大學(xué))

        以石油為基礎(chǔ)的化學(xué)合成塑料,如聚乙烯和聚氯乙烯等,已經(jīng)廣泛應(yīng)用到人類生活的各個領(lǐng)域。這種傳統(tǒng)的化學(xué)合成塑料難以降解,大量廢棄物對環(huán)境造成了嚴重的“白色污染”[1]。近年來,來源于生物并具有生物可降解性的綠色塑料受到人們的廣泛關(guān)注,其中聚(3-羥基丁酸酯-co-4-羥基丁酸酯)簡稱P3/4HB,為新生代(第四代)聚羥基烷酸酯類材料,被認為具有廣闊的應(yīng)用前景。

        相對于傳統(tǒng)的聚β-羥基丁酸酯(PHB),P3/4HB 有如下優(yōu)點:結(jié)晶度低、熔點低、韌性好、便于加工等[2]。而且P3/4HB 的性能可以通過調(diào)節(jié)聚合物中4HB 的含量來進行調(diào)節(jié),據(jù)報道當P3/4HB 聚合物中4HB 的含量小于5%,其性能接近聚丙烯(PP);調(diào)節(jié)4HB 含量至9%時,其性能與高密度乙烯(HDPE)相近;而調(diào)節(jié)4HB 含量至12%時,其性能與低密度的聚乙烯(LDPE)相似[3]。目前,對于P3/4HB 的研究多集中在其合成和改性上,對其胞外生物降解的報道較少,但完善的生物降解性能評價及可控降解模式的建立,對于聚酯材料的應(yīng)用和產(chǎn)業(yè)化至關(guān)重要。本文對P3/4HB 降解菌株進行了篩選、鑒定,并測定了其對P3/4HB 的降解特性,為進一步研究P3/4HB 的降解機理及可控轉(zhuǎn)化奠定了基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        樣品采集自吉林市化工廠的工業(yè)廢水。

        試劑:P3/4HB 購自天津國韻生物材料有限公司,分子生物學(xué)相關(guān)試劑購自Takara 生物公司,其它生化試劑均為國產(chǎn)分析純。

        基本培養(yǎng)基:P3/4HB 為0.15 g、MgSO4.7H2O 為0.5 g、NH4Cl 為1 g、CaCl2.2H2O 為0.005 g、KH2PO4為4.54 g、Na2HPO4.12H2O 為11.94 g[4]。

        馬鈴薯培養(yǎng)基(PDA):馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂15 g。馬鈴薯去皮,切成塊煮沸30 min,然后用紗布過濾,再加糖及瓊脂,溶化后補水至1 000 mL。

        察氏培養(yǎng)基:NaNO3為3 g、KH2PO4為1 g、Mg-SO4.7H2O 為0.5 g、KCl 為0.5 g、FeSO4為0.05 g、蔗糖為30 g、瓊脂為15 g。

        菌種的篩選:將工業(yè)廢水水樣5 mL 接入基本培養(yǎng)基中,置于30 ℃,150 r/min 的恒溫震蕩培養(yǎng)箱中進行富集。7 d 后取上清液100 μL 涂布于以P3/4HB 為唯一碳源的乳化平板上,置于培養(yǎng)箱中30 ℃培養(yǎng),觀察菌株的生長及透明圈形成情況,選取透明圈與菌落直徑最大的菌株為目的菌株。

        菌株形態(tài)學(xué)鑒定:采用點植培養(yǎng)法觀察菌株的菌落形態(tài)和顏色,扦片法觀察菌絲、分生孢子梗、分生孢子穗、孢子等形態(tài)特征。檢索真菌鑒定手冊,進行菌種的初步鑒定[5]。

        系統(tǒng)發(fā)育學(xué)鑒定:CTAB 法提取菌株的基因組DNA 做為模板,ITS 通用引物為ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′和ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′,進行PCR 反應(yīng)擴增菌株基因組中保守的ITS 片段,擴增后的目的片段送生工生物公司測序,所得序列在NCBI 數(shù)據(jù)庫進行同源性比對后,選取代表性菌株利用Mega4.1 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        菌株對P3/4HB 膜的降解:將P3/4HB 粉末置于180 ℃熱壓機上預(yù)熱2 min,熱壓約5 min 之后轉(zhuǎn)移到冷壓機上,室溫自然冷卻,獲得厚度為0.1 cm的P3/4HB 薄膜。將P3/4HB 膜片(1.0 cm×1.0 cm×0.1 cm)70%酒精消毒并經(jīng)紫外燈照射后加入到滅菌的不含P3/4HB 的基本培養(yǎng)基中,接入孢子懸液,28 ℃,150 r/min 振蕩培養(yǎng),間隔24 h 取樣,計算薄膜失重率,并將薄膜噴金后進行掃描電子顯微鏡(SEM)觀察。

        菌株底物特異性分析:分別以P3/4HB、聚3-羥基丁酸酯(PHB)、聚羥基丁酸羥基戊酸酯(PHBV)、聚ε-己內(nèi)酯(PCL)、聚乳酸(PLA)、聚丁二酸丁二醇酯(PBS)為底物制備乳化固體平板,將分生孢子點植到平板中央,28 ℃倒置培養(yǎng)5 d,觀察菌落的直徑大小及其透明圈的形成情況。

        解聚酶活力的測定:將P3/4HB 粉末溶于氯仿中,所得溶液與十二烷基磺酸鈉(SDS)混合,混合液經(jīng)超聲波破碎5 min,制得P3/4HB 乳化液,75 ℃加熱90 min 除去氯仿,得到P3/4HB 懸浮液。取3 mL P3/4HB 懸浮液加入酶液1 mL,反應(yīng)一定時間后,于650 nm 波長下測其吸收值(降低值)。一個酶活單位定義為每分鐘引起光吸收降低0.001(A650 nm)單位所需的酶量[6]。每個測試樣品設(shè)置3 個平行,以滅活酶液做空白對照。

        粗酶液的制備:配制以P3/4HB 粉末為唯一碳源的液體培養(yǎng)基5 L,分裝至三角瓶中,滅菌后接入分生孢子懸液,28 ℃150 r/min 振蕩培養(yǎng)120 h,所得的發(fā)酵液經(jīng)紗布過濾,4 ℃,12 000 r/min 離心制得粗酶液。

        最適反應(yīng)溫度的測定:將P3/4HB 乳化液分別于10、20、30、40、50、60、70、80 ℃的水浴中保溫10 min,然后分別加入同樣經(jīng)過預(yù)熱的酶液,保溫30 min,測定酶在不同溫度下的酶活力。

        溫度穩(wěn)定性的測定:將酶液分別置于4、10、20、30、40、50、60、70 ℃下保溫1 h 后,在酶的最適反應(yīng)溫度下檢測酶活力,繪制相對酶活力—溫度曲線。

        最適反應(yīng)pH 測定:將粗酶液加入到不同pH 值的3 mL P3/4HB 乳化底物中(pH=4.0 ~6.0 為檸檬酸鹽緩沖體系,pH=6.0~8.0 為磷酸鹽緩沖體系,pH=8.0~9.0 為Tri-HCl 緩沖體系,pH=9.0 ~10.0 為甘氨酸—氫氧化鈉緩沖體系),在酶的最適反應(yīng)溫度下測定其酶活力,繪制粗酶液的最適反應(yīng)pH 曲線。

        pH 穩(wěn)定性的測定:將凍干的粗酶粉在不同pH的緩沖體系中4 ℃放置24 h 后,按照標準酶活測定方法在酶的最適反應(yīng)溫度和pH 條件下測定酶活力,繪制pH 穩(wěn)定性曲線。

        粗酶降解產(chǎn)物的測定:將發(fā)酵液裝入透析袋中,在蒸餾水中4 ℃過夜,以除掉酶液中的無機鹽。將透析后的酶液與P3/4HB 底物按體積比1 ∶3 的比例混合,60 ℃水浴保溫30 min,以加熱滅活的酶液做對照。產(chǎn)物離心后使用高效液相色譜四級桿串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀得到質(zhì)譜圖譜。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 P3/4HB 降解菌株的篩選

        將經(jīng)過富集培養(yǎng)的污水樣品稀釋涂布在P3/4HB 乳化平板上,30 ℃培養(yǎng)7 d 后,可觀察到形成明顯透明圈的細菌及真菌菌落,將菌株純化后重新點種于乳化平板上,挑取透明圈與菌落直徑比值最大的一株真菌進行后續(xù)研究,命名為菌株DS0906(圖1)。

        圖1 菌株在P3/4HB 乳化平板上生長且形成透明圈

        2.2 菌種鑒定

        該菌株在PDA 及察氏培養(yǎng)基上生長良好,菌落表面平坦,成同心環(huán)狀,四周分布白色毛氈狀菌絲,隨培養(yǎng)時間的延長,菌絲的顏色由白轉(zhuǎn)綠,最后變成褐色;菌絲體成絲狀、有隔膜,分生孢子梗光滑,從壁厚而膨大的菌絲細胞上垂直生出;分生孢子頭豐富,散生,分生孢子梗頂端稍膨大形成燒瓶狀的頂囊,頂囊僅上半部產(chǎn)生孢子,分生孢子穗圓筒形,直徑約40 μm,分生孢子橢圓形,綠色。結(jié)合菌株的形態(tài)特征,檢索真菌鑒定手冊可初步判斷該菌種為曲霉屬真菌[7]。

        圖2 菌株菌絲體及分生孢子的顯微形態(tài)

        菌株ITS 序列片段擴增后進行瓊脂糖凝膠電泳,ITS 片段大小約為750 bp,對其進行核苷酸測序,得到的序列在NCBI 數(shù)據(jù)庫中與Aspergillus fumigatus strain N29 的ITS 序列同源性高達99%,在系統(tǒng)進化上非常接近(圖3),判定該菌屬于煙曲霉(Aspergillus fumigatus)。

        2.3 Aspergillus sp. DS0906 對P3/4HB 及其它聚酯的降解

        菌株DS0906 對P3/4HB 具有高效降解能力,以乳化的P3/4HB 為碳源,培養(yǎng)過程中可觀察到培養(yǎng)液逐漸變清;以P3/4HB 粉末為碳源,可觀察到隨著菌體的生長和產(chǎn)酶,培養(yǎng)5 d 后粉末完全消失;以P3/4HB 薄膜為碳源,由于固相材料比表面積的減少,降解速率降低,培養(yǎng)的前6 d,薄膜降解速率較慢,從第7 天開始,降解速率顯著加快,14 d 后,薄膜被徹底降解成細小的碎片。利用掃描電子顯微鏡觀察P3/4HB 膜降解前后的表面形態(tài),結(jié)果顯示,未降解的膜表面光滑;隨著降解的進行,膜表面的孔洞增加,孔徑增大,孔洞分布逐漸深入膜的內(nèi)部,呈現(xiàn)由表及里的降解趨勢(圖4)。

        圖3 基于菌株ITS 序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖4 P3/4HB 膜被菌株DS0906 降解前后的表面SEM 照片(×2000)

        將少量的Aspergillus sp. DS0906 孢子分別接種于P3/4HB、PHB、PHBV、PBS、PCL、PLA 為唯一碳源的固體平板上,28 ℃倒置培養(yǎng)5 d,觀察菌落的生長以及是否形成透明圈。表1 表明,菌株DS0906除了具有P3/4HB 降解能力外,還可以降解PHB、PHBV 和PBS;當以PLA 和PCL 為唯一碳源時,雖然菌株可以生長,但生長能力較弱且沒有明顯的透明圈生成,因此認為該菌株并不能有效降解高分子量的PLA 及PCL,其微弱生長可能是菌株對培養(yǎng)基中少量寡聚物利用的結(jié)果。

        表1 Aspergillus sp. DS0906 在不同碳源培養(yǎng)基中的菌落直徑及透明圈產(chǎn)生情況

        2.4 菌株產(chǎn)P3/4HB 解聚酶的催化特性

        2.4.1 溫度對解聚酶的影響

        按“粗酶液制備”方法制備粗酶液,測定酶的最適反應(yīng)溫度及溫度穩(wěn)定性,結(jié)果顯示粗酶的最適反應(yīng)溫度為60 ℃,在50 ℃和70 ℃時酶活力也相對較高,達到最高酶活力的80%以上,當反應(yīng)溫度為80 ℃時,酶活力仍能達到最適反應(yīng)溫度下酶活力的78%,但在溫度40 ℃以下時,解聚酶活力較低(圖5A)。

        溫度穩(wěn)定性的試驗結(jié)果顯示,PCL 解聚酶粗酶在50 ℃以下穩(wěn)定性良好,可以保留80%以上的酶活力,但隨著溫度的升高,酶活力迅速下降,60 ℃保溫1 h 后酶活力僅能殘留30%左右,而當溫度達到70℃時,保溫1 h 后酶活幾乎完全喪失(圖5B)。

        2.4.2 pH 對酶活力的影響

        測定PCL 解聚酶粗酶在不同pH 條件下的酶活力,結(jié)果如圖5C 所示,該酶在酸性和中性環(huán)境下具有較高的酶活力;而在堿性條件下,酶活力較低,最適反應(yīng)pH 值為6.0(檸檬酸緩沖體系)。

        將等量的粗酶粉分別加入不同pH(4.0 ~10.0)的緩沖液中,4 ℃保溫24 h 后測定酶的殘余活力,結(jié)果顯示,在酸性和中性體系中,酶的穩(wěn)定性較高,在pH=4.0~8.0 范圍內(nèi)粗酶的殘余活力能夠達到最高酶活力的70%以上,當pH 大于8.0 時,酶的穩(wěn)定性迅速下降(圖5D)。

        圖5 溫度和pH 對粗酶液降解P3/4HB 活力的影響

        2.4.3 粗酶降解P3/4HB 的產(chǎn)物測定

        使用高效液相色譜四級桿串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀繪制粗酶液降解P3/4HB 產(chǎn)物的質(zhì)譜圖,結(jié)果如圖6 所示,結(jié)合分子量計算結(jié)果,可以判斷產(chǎn)物中存在羥基丁酸單體(peak 102.9),但并沒有發(fā)現(xiàn)二聚體、三聚體及其它寡聚體,推測該P3/4HB 解聚酶是一種外切酶,每次以剪切鏈端一個羥基丁酸單元的模式發(fā)揮水解作用。

        圖6 粗酶液降解P3/4HB 產(chǎn)物的質(zhì)譜圖

        3 結(jié)論與討論

        本研究采用富集培養(yǎng)、稀釋涂布等方法從工業(yè)污水中篩選出一株可高效降解聚(3-羥基丁酸-co-4-羥基丁酸共聚酯)(P3/4HB)的真菌菌株,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析,判定該菌株屬半知菌類,叢梗孢目,叢梗孢科,單胞亞科,曲霉族,曲霉屬的煙曲霉,該菌株與Aspergillus fumigatus strain N29 的ITS 序列同源性高達99%,命名為Aspergillus sp.DS0906。

        Aspergillus sp. DS0906 菌株對P3/4HB 及其它聚酯的降解特性研究表明,Aspergillus sp. DS0906 除高效降解聚(3-羥基丁酸-co-4-羥基丁酸共聚酯)外,還能夠特異性降解高分子聚酯聚3-羥基丁酸酯、聚(3-羥基丁酸酯-co-4-羥基戊酸共聚酯)和聚丁二酸丁二醇酯,但是不能降解聚乳酸和聚ε-己內(nèi)酯。菌株發(fā)酵粗酶液的最適反應(yīng)溫度為60 ℃,在10~50 ℃之間酶的溫度穩(wěn)定性較好,最適反應(yīng)pH值為6.0,在pH=6.0~8.0 的范圍內(nèi)穩(wěn)定性較高。

        Aspergillus sp. DS0906 粗酶液降解P3/4HB 的產(chǎn)物為羥基丁酸單體,推測降解酶以每次剪切一個羥基丁酸單元的外切酶模式發(fā)揮降解作用;同時,這也表明該酶為一種外切酶,但不同的單體單元(3HB或者4HB)是否對酶的識別和催化具有影響作用還需要進一步的研究。

        現(xiàn)階段,對P3/4HB 生物降解的研究主要是利用生物堆肥或者利用PHB 解聚酶進行降解[8-9],而關(guān)于P3/4HB 降解菌株篩選的研究很少。因此,本文從工業(yè)廢水中篩選出的高效降解P3/4HB 的真菌菌株,是P3/4HB 的降解機制研究的重要補充。為P3/4HB 解聚酶的分離純化,以及該類降解酶與PHB 解聚酶結(jié)構(gòu)和功能的比較,從而全面的闡明P3/4HB 的降解機制等工作做好準備。

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