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        基于bdPubMed的糖尿病腎病文獻計量分析

        2015-03-22 01:59:12,,,,
        關(guān)鍵詞:共詞主題詞檢索

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        隨著信息化的不斷發(fā)展,圖書館在為科研人員提供知識化、深層次服務(wù)過程中可使用的科研分析工具越來越多。PubMed在醫(yī)藥領(lǐng)域具有權(quán)威性,但僅支持對檢索結(jié)果的簡單篩選,缺乏系統(tǒng)歸類和分析功能;其檢索結(jié)果默認(rèn)按時間排序,缺少相關(guān)度排序方式等,給檢索和篩選文獻帶來一定困難,特別是檢索命中的結(jié)果較多時問題尤為突出。

        由于PubMed提供了應(yīng)用程序接口服務(wù),允許外部開發(fā)人員利用其資源開發(fā)檢索分析工具。近幾年已有30多種基于PubMed數(shù)據(jù)源的檢索工具應(yīng)運而生,一定程度上彌補了PubMed的不足[1],包括德國的GoPubMed、中國的bdPubMed、美國的Anne O'Tate和PubFocus,以及歐洲的CiteXplore等。筆者通過bdPubMed檢索平臺為用戶提供了深層次的糖尿病腎病課題咨詢服務(wù)。

        1 檢索對象與工具

        糖尿病腎病(diabetic nephropathy,DN)是糖尿病最嚴(yán)重的并發(fā)癥,表現(xiàn)為腎小球高濾過、濾出清蛋白、腎小球基底膜增厚、系膜細胞增生及細胞外基質(zhì)增多,導(dǎo)致腎小管及間質(zhì)的纖維化,最終引起腎臟功能衰竭。近年來全球患病人數(shù)不斷增長,已成為導(dǎo)致終末期腎臟病的主要原因之一。DN發(fā)病機制涉及多種因素,目前已知的有高血糖狀態(tài)、血流動力學(xué)改變、腎素-血管緊張素Ⅱ-醛固酮系統(tǒng)激活、炎癥信號通路等,但具體發(fā)病機制仍未闡明[2]。

        bdPubMed檢索平臺是2012年華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院與濟南泉方科技有限公司合作開發(fā)的本地化數(shù)據(jù)庫產(chǎn)品。其檢索結(jié)果與PubMed一致,但在檢索結(jié)果界面增加了知識演進圖譜、指紋共詞分析、高影響論文分析、高被引論文分析等功能。這些功能模塊可實現(xiàn)類似Bicomb系統(tǒng)提取高頻主題詞、SPSS軟件分析研究現(xiàn)狀和熱點等[3],并可實現(xiàn)如文獻可視化分析軟件Vosviewer、Ucinet[4]及CiteSpace軟件繪制的學(xué)科分布的科學(xué)知識圖譜等[5]。該平臺從文獻檢索到數(shù)據(jù)分析實現(xiàn)了一站式,不需要反復(fù)導(dǎo)入數(shù)據(jù)和使用多個數(shù)據(jù)分析軟件。

        2 檢索結(jié)果與分析

        登錄bdPubMed,以“Diabetic Nephropathies”為主題詞進行檢索,檢索不作任何限定,檢索時間為2014年11月23日,共檢出19 502條文獻,檢索結(jié)果界面見圖1。

        圖1 本地PubMed檢索結(jié)果界面

        2.1 主題分析

        點擊檢索結(jié)果界面右側(cè)的“知識圖譜”,可見各研究方向(主題詞)在不同年份的文獻量。系統(tǒng)默認(rèn)推薦20個主題詞,也可以點擊“更多主題詞”以了解更多主題詞信息。根據(jù)研究領(lǐng)域的不同,將“更多主題詞”分為多個大類。關(guān)于此檢索主題,系統(tǒng)推薦的第一個類是“Amino Acids,Peptides,and Proteins”(氨基酸,肽類和蛋白質(zhì))。

        統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,目前研究較多的是Hemoglobin A,Glycosylated(糖基化血紅蛋白A);Glycosylation End Products,Advanced(晚期糖基化終末產(chǎn)物),Cholesterol,HDL(高密度脂蛋白膽固醇),及Serum Albumin(血清白蛋白),C-Reactive Protein(C反應(yīng)蛋白)等。這些主題詞都是關(guān)于DN發(fā)病機制方面的研究,尤其與炎癥相關(guān),是目前DN研究的重點領(lǐng)域之一。

        近年研究表明,炎癥通路在DN的發(fā)病和進展中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,DN被看作是一種由代謝紊亂引起的炎癥性疾病[6]。其中C反應(yīng)蛋白(C-Reactive Protein,CRP)在1930年由Tillet和Francis發(fā)現(xiàn),目前在臨床中應(yīng)用相當(dāng)廣泛,是重要的炎癥檢測指標(biāo)[7]。通過bdPubMed可了解C反應(yīng)蛋白在DN中的研究情況(圖2)。

        從圖2可看出,關(guān)于C反應(yīng)蛋白最早的一篇文獻為國際著名醫(yī)療機構(gòu)丹麥Steno糖尿病研究中心的Myrup B等1996年發(fā)表于Thrombosis research的文獻,該刊影響因子為3.13。2000年又有2篇相關(guān)文獻發(fā)表,其中一篇發(fā)表于Journal of theAmerican Society of Nephrology,該刊影響因子為8.99。此后關(guān)于此方向的研究逐漸增多。如果想進一步了解有關(guān)C反應(yīng)蛋白的高影響因子(impact factor,IF)論文或者高被引(times of cited,TC)論文,可在bdPubMed的檢索結(jié)果界面(圖1)點擊“高IF論文”和“高TC論文”按鈕。

        圖2 C反應(yīng)蛋白在DN中的研究情況

        2.2 高影響論文

        從“高IF論文”分析中可看出,影響因子最高的一篇文獻為2000年發(fā)表于Journal of the American Society of Nephrology,該刊影響因子為9.466?!案逿C論文”分析顯示,DN領(lǐng)域中C反應(yīng)蛋白在谷歌學(xué)術(shù)中被引次數(shù)較高的文獻是發(fā)表于American Journal of Kidney Diseases,目前該文在谷歌學(xué)術(shù)中被引用261次(表1)。

        表1 谷歌學(xué)術(shù)中DN領(lǐng)域中C反應(yīng)蛋白被引次數(shù)較高的文獻

        這5篇文獻是該領(lǐng)域內(nèi)經(jīng)典的、不可不看的文獻。而了解目前有哪些藥物用于DN的治療,可使用知識演進圖譜中的“設(shè)置”功能。在知識圖譜的“設(shè)置”界面,勾選“副主題詞過濾”中的“therapeutic use”,然后點擊“確定”就可看到讀者需要了解的相關(guān)藥物。分析結(jié)果顯示,目前治療DN的藥物主要為Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitors(血管緊張素轉(zhuǎn)換酶抑制劑,ACEI),Antihypertensive Agents(抗高血壓藥),Insulin(胰島素),Angiotensin II Type 1 Receptor Blockers(血管緊張素Ⅱ1型受體拮抗劑,ARB),Immunosuppressive Agents(免疫抑制劑)以及Hypoglycemic Agents(降糖藥)等。具體的藥物有Losartan(洛沙坦),Captopril(卡托普利),Enalapril(依那普利)等。

        從發(fā)文量來看,1965年就有了關(guān)于Insulin的報道,截至目前發(fā)文量為508篇;1987年出現(xiàn)了第一篇關(guān)于ACEI的文獻,截至目前發(fā)文量為1 014篇;2002年出現(xiàn)了第一篇關(guān)于ARB的文獻,截至目前發(fā)文量為333篇;從時間上來看,Insulin一直受到關(guān)注,而ACEI發(fā)文量在2005年大幅下降之時,正是在ARB發(fā)文量大幅增長之時。

        有學(xué)者特別指出:“KDIGO指南以及ADA指南均建議對于高血壓合并蛋白尿患者給予ARB/ACEI治療,一種不能耐受給予另一種治療。ACEI或ARB雖然均屬于RAS阻斷劑,但作用機制不盡完全相同,這些機制上的差異或許對臨床心腦腎治療終點有不同的影響。目前越來越多的學(xué)者開始重視這些差異帶來的長遠不同的臨床結(jié)局”[8]。

        2.3 指紋共詞分析

        作為一種新藥(相對于ACEI),ARB可能有一些獨特之處。如果需進一步了解ARB治療DN的文獻,可在檢索結(jié)果界面中點擊“指紋共詞”?!爸讣y共詞”是指兩個關(guān)鍵詞或者主題詞共同出現(xiàn)在一組文獻中的篇數(shù),并將隨時間的演進路徑顯示出來的一種方法。

        點擊“指紋共詞”后,可看到系統(tǒng)推薦的64組兩兩共詞,點擊“更多主題詞”來選擇我們需要分析的具體的主題詞Angiotensin II Type 1 Receptor Blockers與Diabetic Nephropathies(圖3)。

        圖3 ARB與DN的共詞分析

        從圖3可看出,ARB與DN同時出現(xiàn)在一篇文獻中的時間最早為2002年,截至2014年11月共同出現(xiàn)在11篇文獻中(表2)。

        表2 2014年ARB與DN共同出現(xiàn)的11篇文獻

        11篇文獻中有5篇均來源于The New England Journal of Medicine(新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志)。其中有文獻指出,ACEI和ARB聯(lián)合治療可能會導(dǎo)致DN患者急性腎損傷和高鉀血癥[9]。中南大學(xué)藥學(xué)院的劉良裕也指出,僅僅是簡單地控制高血糖、高血壓、高血脂以及限制蛋白的攝入等基礎(chǔ)治療已經(jīng)不足以控制DN的發(fā)生和發(fā)展,包括ACEI和ARB類藥物在治療晚期DN方面也并無優(yōu)勢,而且ACEI和ARB類藥物對DN損傷的直接保護作用尚不明確,長期應(yīng)用這兩類藥物還可能出現(xiàn)程度不等的血肌酐升高現(xiàn)象,有引起腎功能不全的風(fēng)險[10]。因此,針對DN的發(fā)病機制研發(fā)新藥是另一個研究熱點。

        3 結(jié)論

        糖尿病腎病是一個較大的研究領(lǐng)域。DN的發(fā)生、發(fā)展涉及多種發(fā)病機制的參與,各個機制所起到的作用眾說紛紜,發(fā)病機制尚不明確。[11],這是目前DN研究的熱點之一。ACEI和ARB是目前國際公認(rèn)的防治DN的一線藥物,但長期應(yīng)用有引起腎功能不全的風(fēng)險。因此針對DN病理過程的藥物開發(fā)將是DN研究的另一個熱點,如針對炎癥反應(yīng)研發(fā)的吡哆胺等。2014年,Alicic RZ等發(fā)現(xiàn),吡哆胺(Pyridoxamine)能夠通過抑制人糖基化終末產(chǎn)物(AGEs)的形成,清除ROS和自由基,從而能夠有效地幫助糖尿病患者抑制或預(yù)防中度腎疾病的進展[12]。這是針對炎癥反應(yīng)研發(fā)的新藥,目前還未在臨床中大規(guī)模應(yīng)用。

        4 結(jié)語

        針對我館用戶需求,筆者通過bdPubMed平臺進行檢索、分析,確定糖尿病腎病研究方向??傮w上講,該平臺使用方便、操作簡單,是圖書館學(xué)科館員的得力助手。但也存在一些問題,如不能分析CNKI等中文文獻,論文被引次數(shù)來自于谷歌學(xué)術(shù)而不是權(quán)威的Web of Science,而且不能導(dǎo)入Web of Science的數(shù)據(jù)。這為數(shù)據(jù)分析的準(zhǔn)確性帶來不利影響。該平臺與SPSS等專業(yè)分析軟件相比較,沒有SPSS軟件中的回歸分析、曲線估計、多重響應(yīng)等[13]功能。

        期望該平臺在今后發(fā)展中,會更加專業(yè),功能更加強大,更好地為用戶提供針對性、知識化、個性化的深層次服務(wù)。

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