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        耐喹諾酮類藥物銅綠假單胞菌的質(zhì)粒基因研究*

        2015-03-15 10:14:42劉鮮花羅史科祝玲玲呂東月廣東省深圳市鹽田區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科5808廣州醫(yī)科大學(xué)附屬深圳沙井醫(yī)院檢驗(yàn)科廣東深圳5804
        檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)與臨床 2015年11期
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        劉鮮花,羅史科,祝玲玲,呂東月(.廣東省深圳市鹽田區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 5808;.廣州醫(yī)科大學(xué)附屬深圳沙井醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東深圳 5804)

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        耐喹諾酮類藥物銅綠假單胞菌的質(zhì)?;蜓芯?

        劉鮮花1,羅史科1,祝玲玲1,呂東月2(1.廣東省深圳市鹽田區(qū)人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 518081;2.廣州醫(yī)科大學(xué)附屬深圳沙井醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東深圳 518104)

        目的 研究耐喹諾酮類藥物銅綠假單胞菌(PA)的質(zhì)?;?,并分析其耐藥機(jī)制。方法 臨床分離的耐喹諾酮類藥物的PA 100株,采用PCR法檢測質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮類耐藥基因qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、qepA、aac(6′)-Ib-cr,并對陽性結(jié)果進(jìn)行測序分析。結(jié)果 100株P(guān)A中檢測出含有qnrA基因的菌株34株(34%);qnrB基因79株(79%);qnrD基因14株(14%);qnrS基因8株(8%);aac(6′)-Ib-cr基因55株(55%);未檢測出qnrC和qepA基因的菌株。結(jié)論 質(zhì)粒攜帶的qnrA、qnrB/aac(6′)-Ib-cr耐藥基因是PA耐喹諾酮類藥物的主要機(jī)制。

        喹諾酮類藥物; 銅綠假單胞菌; 質(zhì)粒; 基因

        喹諾酮類藥物是臨床上常用的抑制細(xì)菌DNA旋轉(zhuǎn)酶的抗菌藥物,銅綠假單胞菌(PA)是一種最常見的引起醫(yī)院感染的革蘭陰性桿菌[1]。隨著喹諾酮類藥物在臨床上的廣泛應(yīng)用,PA耐藥株不斷增加,造成臨床對其感染治療和控制變得困難[2]。PA對喹諾酮類藥物的耐藥機(jī)制復(fù)雜,其中質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮類耐藥(PMQR)包括qnr、qepA、oqxAB、aac(6′)-Ib-cr,其耐藥新機(jī)制近年來倍受關(guān)注[3-5]?,F(xiàn)對100株P(guān)A進(jìn)行檢測,探討耐藥機(jī)制。報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 該院自2012年2月至2014年6月門診及住院患者的100株耐喹諾酮類藥物的PA,-80 ℃凍存?zhèn)溆?。菌株分離自痰液、分泌物、血液、胸水和膿液等,剔除同一患者來源的重復(fù)菌株。質(zhì)控菌株為銅綠假單胞菌ATCC 27853和大腸埃希菌ATCC 25922,均購自衛(wèi)生部臨床檢驗(yàn)中心。

        1.2 儀器與試劑 EPS3501XL電泳儀,美國Pharmacia公司;5810R型高速離心機(jī),德國Eppendorf公司;PCR擴(kuò)增儀,美國MJ Research公司;310基因分析儀,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司;FUSION Fx7凝膠成像系統(tǒng),法國VILBER公司;細(xì)菌DNA提取試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒均購自上海英駿生物技術(shù)有限公司。

        1.3 檢測方法

        1.3.1 DNA提取 從血瓊脂平板上選取單個菌落,接種于LB液體培養(yǎng)基中,置37 ℃,190 r/min,振蕩孵育過夜。吸取1 mL菌液于離心管內(nèi),12 000 r/min,離心5 min,去除上清液。加入PBS 1 mL,吹打沉淀細(xì)菌后,12 000 r/min,離心5 min,棄上清液。再加入超純水500 μL,吹打混勻后置于100 ℃沸水浴5 min,12 000 r/min,離心5 min,獲取上清液即DNA提取液分裝于離心管中,于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.2 PCR引物的設(shè)計與合成 采用PCR檢測的qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、qepA、aac(6′)-Ib-cr基因引物均由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。見表1。

        1.3.3 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物電泳 引物各0.5 μmol/L,dNTPs各200 μmol/L,加入Taq DNA聚合酶2.5 U,MgCl22 mmol/L,模板液5 μL,總體積20 μL。PCR反應(yīng)熱循環(huán)參數(shù):(1)qnrB、qnrD、qnrS、qepA基因:95 ℃預(yù)變性2 min;95 ℃ 50 s,53 ℃ 45 s,72 ℃ 60 s,共35個循環(huán),72 ℃延長至2 min。(2)qnrA、qnrC、aac(6′)-Ib-cr基因:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃ 45 s,55 ℃ 45 s,72 ℃ 45 s,35個循環(huán);72 ℃延長至5 min。PCR產(chǎn)物10 μL與2 μL上樣緩沖液混勻加入2%瓊脂糖凝膠,110 V電泳30 min后置入凝膠成像儀中觀察并記錄結(jié)果。

        1.3.4 核酸序列分析 擴(kuò)增后的基因PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,送深圳華大基因生物技術(shù)有限公司進(jìn)行序列測定,檢測結(jié)果使用DNAStar軟件進(jìn)行校正并與GenBank核酸(www.ncbi.nlm.nih.gov)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 質(zhì)粒介導(dǎo)的PMQR基因擴(kuò)增產(chǎn)物 利用PCR方法檢測質(zhì)粒介導(dǎo)的PMQR基因qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、qepA、aac(6′)-Ib-cr,擴(kuò)增產(chǎn)物大小分別為516 bp、469 bp、447 bp、664 bp、417 bp、596 bp、482 bp。見圖1。

        表1 PCR引物序列

        注:M表示標(biāo)記物;1表示qnrS;2表示qnrB;3表示aac(6′)-Ib-cr;4表示qnrC;5表示qnrA;6表示qepA;7表示qnrD。

        2.2 質(zhì)粒介導(dǎo)的PMQR基因檢測結(jié)果 100株耐喹諾酮類藥物(環(huán)丙沙星)的PA中檢測出含有qnrA基因的菌株34株(34%);qnrB基因79株(79%);qnrD基因14株(14%);qnrS基因8株(8%);aac(6′)-Ib-cr基因55株(55%);未檢測出含qnrC和qepA基因的菌株。見表2。

        表2 100株質(zhì)粒介導(dǎo)的PMQR基因檢測結(jié)果

        注:-表示無數(shù)據(jù)。

        3 討 論

        抗菌藥物大量、長期使用,致使細(xì)菌耐藥性增強(qiáng),已經(jīng)成為感染性疾病治療的一大難題。PA廣泛存在于機(jī)體的皮膚和呼吸道等,是臨床上最常見的條件致病菌,引起肺炎、泌尿感染、敗血癥等疾病[6]。喹諾酮類藥物通過抑制細(xì)菌的拓?fù)洚悩?gòu)酶,阻斷DNA復(fù)制從而達(dá)到抗菌作用,環(huán)丙沙星是臨床治療PA最有效的藥物之一,但隨著其廣泛使用,耐環(huán)丙沙星的PA已經(jīng)達(dá)到40%以上,嚴(yán)重影響臨床治療效果[7-8]。

        PA對喹諾酮類藥物產(chǎn)生耐藥性的主要途徑:(1)主動外排和膜屏障,導(dǎo)致藥物無法達(dá)到作用靶點(diǎn),使得其對多種抗菌藥物獲得耐藥。(2)細(xì)菌編碼的喹諾酮類藥物的Ⅳ類拓?fù)洚悩?gòu)酶和DNA旋轉(zhuǎn)酶的基因突變,致使藥物不能與酶-DNA復(fù)合物穩(wěn)定結(jié)合導(dǎo)致抗菌作用無效。(3)細(xì)菌生物膜的形成,其有極強(qiáng)的抵抗作用和耐藥性,感染了細(xì)菌生物膜的組織即使治療藥物的劑量加倍也難以治愈[9]。染色體介導(dǎo)和質(zhì)粒介導(dǎo)是PA對喹諾酮類藥物耐藥的主要機(jī)制。pMG252是最早報道的質(zhì)粒,可使細(xì)菌對喹諾酮類藥物的耐藥水平提高,Martinez等將該質(zhì)粒命名為qar(quinolone resistance),后改為qnrA1。此后又發(fā)現(xiàn)了qnrB、qnrC、qnrD、qnrS 4種基因亞基。aac(6′)-Ib-cr最早分離于大腸埃希菌中,是一類編碼氨基糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶而使得細(xì)菌對氨基糖苷類抗菌藥物耐藥的基因。aac(6′)-Ib-crr其編碼蛋白發(fā)生Trp 102-Arg、Asp179-Tyr突變而產(chǎn)生介導(dǎo)環(huán)丙沙星耐藥的新特性而命名,其主要對環(huán)丙沙星哌嗪環(huán)上氨基乙?;饔枚閷?dǎo)低水平耐藥[10]。

        目前有關(guān)喹諾酮類抗菌藥物的機(jī)制研究,大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為是拓?fù)洚悩?gòu)酶的基因退變而導(dǎo)致細(xì)菌耐藥,對質(zhì)粒的作用僅表現(xiàn)低水平耐藥。PMQR基因的研究大部分是腸桿菌(如肺炎克雷伯菌、大腸埃希菌),有PA的研究非常少。本研究從100株耐喹諾酮類藥物(環(huán)丙沙星)的PA中未檢測出qnrC和qepA基因,檢出含有qnrA、qnrB、qnrD、qnrS/aac(6′)-Ib-cr基因的菌株,陽性率分別為34%、79%、14%、8%、55%,其中qnrA、qnrB、aac(6′)-Ib-cr具有較高的攜帶率,表明其在耐藥機(jī)制中發(fā)揮重要的作用。

        [1]明德松,鄧勇.國內(nèi)銅綠假單胞茵對喹諾酮類藥物耐藥機(jī)制的Meta分析[J].中國循證醫(yī)學(xué)雜志,2013,13(10):1215-1218.

        [2]Willcox MD.Review of resistance of ocular isolates of Pseudomonas aeruginosa and staphylococci from keratitis to eiprofloxacin,gentanficin and cephalosporins[J].Clin Exp Optom,2011,94(2):161-168.

        [3]陳樹林,陳利達(dá),陳茶,等.銅綠假單胞菌對喹諾酮類藥物耐藥的分子機(jī)制研究[J].中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志,2012,24(8):899-904.

        [4]郭小慧,張莉萍.銅綠假單胞菌耐藥機(jī)制的最新研究進(jìn)展[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,32(9):968-971.

        [5]賀婷,江濤.銅綠假單胞菌耐藥相關(guān)基因研究進(jìn)展[J].國際呼吸雜志,2013,33(5):393-396.

        [6]Stove CK,Pham QX,Erwin AL,et al.Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1 an opportumistic pathogen[J].Nature,2000,11(4):406-409.

        [7]邱紅,胡禮儀,彭濤,等.grrA和Parc介導(dǎo)的銅綠假單胞菌對環(huán)丙沙星耐藥機(jī)制研究[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2011,32(8):831-833.

        [8]Dubois V,Arpin C.Nosocoomial outbreak due to a multiresistant strain of Psuedomonas aeruginosa:efficacy of cefepime-amikacin theraoy and analysis of β-lactamase resistance[J].Clin Microbiol,2002,39(11):2072-2074.

        [9]Cavaco LM,Hasman H,Xia S,et al.A novel gene conferring transferable quinolone resistance in Salmonella enterica serovar Kentacky and Bovismorbificans strains of human origin[J].Antimicrob Agents Chemother,2009,53(12):603-608.

        [10]蔣崗,徐霖,關(guān)琳琳,等.銅綠假單胞菌中質(zhì)粒介導(dǎo)喹諾酮類耐藥基因的研究[J].熱帶醫(yī)學(xué)雜志,2013,13(7):813-816.

        Study of plasmid-mediated quinolones antibacterial in pseudomonas aeruginosa*

        LIUXian-hua1,LUOShi-ke1,ZHULing-ling1,LUDong-yue2

        (1.DepartmentofClinicalLaboratory,YantianHospital,Shenzhen,Guangdong518081,China;2.DepartmentofClinicalLaboratory,ShajingAffiliatedHospitalofGuangzhouMedical,Shenzhen,Guangdong518104,China)

        Objective To study the quinolones resistance plasmid genes in pseudomonas aeruginosa and analyze its mechanism.Methods pseudomonas aeruginosa samples were collected for the detection of qnrA,qnrB,qnrC,qnrD,qnrS,qepA and aac(6′)-Ib-cr gene using PCR,then the positive samples were detected by sequence analysis.Results qnrC and qepA gene were not detected in strains resistance to Ciprofloxacin.the positive rate of qnrA,qnrB,qnrD,qnrS,aac(6′)-Ib-cr gene is 34%,79%,14%,8%,55% respectively.Conclusion plasmid with qnrA,qnrB,aac(6′)-Ib-cr gene is the main mechanism in pseudomonas aeruginosa to quinolones antibacterial.

        quinolones antibacterial; pseudomonas aeruginosa; plasmid; gene

        深圳市鹽田區(qū)科技計劃資助項(xiàng)目(201211)。

        劉鮮花,女,本科,主管技師,主要從事微生物檢驗(yàn)研究。

        10.3969/j.issn.1672-9455.2015.11.014

        A

        1672-9455(2015)11-1530-02

        2014-12-25

        2015-02-12)

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