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        青島兩所醫(yī)院鮑曼不動桿菌碳青霉烯酶基因及同源性分析

        2015-03-13 06:51:34李慶淑
        中國感染控制雜志 2015年7期
        關(guān)鍵詞:烯酶鮑曼青霉

        李 茜,李慶淑,李 智,曲 彥,胡 丹

        (青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬青島市立醫(yī)院,山東 青島 266071)

        鮑曼不動桿菌(Acinetobacterbaumannii,AB)是一種非發(fā)酵的革蘭陰性條件致病菌,可引起各組織和器官感染,包括肺炎、腦膜炎、菌血癥、尿路感染和傷口感染等[1]。碳青霉烯類抗生素具有廣譜抗菌活性,是目前臨床上治療重癥感染的主要抗菌藥物。但近年來,隨著碳青霉烯類抗生素的廣泛應(yīng)用,對碳青霉烯藥物耐藥的AB已在全球流行,其治療已成為世界性難題,對其耐藥機(jī)制的研究具有重要意義。產(chǎn)碳青霉烯酶是AB對碳青霉烯耐藥的重要原因,水解藥物的碳青霉烯酶主要有B類金屬酶和D類OXA型酶。為了解青島市兩所醫(yī)院AB耐藥情況及碳青霉烯酶基因攜帶情況,筆者對臨床收集的145株AB進(jìn)行耐藥分析,檢測其碳青霉烯酶基因攜帶情況,并進(jìn)行同源性分析,了解菌株耐藥性的演變和耐藥基因分布,為臨床抗菌藥物的合理使用,預(yù)防和控制醫(yī)院感染流行提供可靠依據(jù)。

        1 資料與方法

        1.1 菌株來源 收集青島市兩所醫(yī)院2013年7月—2014年7月住院患者臨床標(biāo)本分離的AB,共145株,其中A院78株,B院67株,剔除同一患者相同部位重復(fù)分離株。質(zhì)控菌株為銅綠假單胞菌ATCC27853、大腸埃希菌ATCC25922。

        1.2 藥敏試驗 采用紙片擴(kuò)散法測定細(xì)菌對抗菌藥物的敏感性,試驗結(jié)果判斷參照美國臨床實(shí)驗室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(CLSI)2012年標(biāo)準(zhǔn)。

        1.3 細(xì)菌DNA模板制備 取菌環(huán)挑取單一菌落置于LB液體培養(yǎng)液中,在搖箱中過夜培養(yǎng)(37℃,180 r/min),取 渾濁的菌液于1.5 mL EP 管 內(nèi),6 000 r/min離心10 min,棄上清,向EP管內(nèi)加入200μL高壓超純水,吹打混勻后100℃水浴10 min,隨后4℃冷卻5 min;4℃,12 000 r/min離心3 min;吸取上清液移入另一新的0.5 mL EP管內(nèi),即為聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)檢測模板,-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?.4 基因檢測 PCR反應(yīng)體系為25μL,含3μL DNA模板,0.2μL Taq酶,2.5μL10×Taq緩沖液(含15 mmol/L MgCl2),2μL2.5 mmol/L dNTP,10μmol/L上下游引物各1μL,15.3μL水。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,退火30 s(溫度51~58℃),72℃延伸60s,共35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。腸桿菌基因間一致重復(fù)序列(ERIC)-PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性1 min,45℃退火1 min,72℃延伸2 min,35個循環(huán)后,72℃延伸10 min。產(chǎn)物長度<500 bp,采用2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳;產(chǎn)物長度>500 bp,采用1.2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,紫外投射儀觀察結(jié)果。各靶基因引物序列見表1。

        表1 PCR引物序列及產(chǎn)物長度Table 1 The sequences of PCR primers and length of products

        1.5 統(tǒng)計分析 應(yīng)用SPSS 19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析,采用秩和檢驗對兩院AB耐藥情況進(jìn)行比較,χ2檢驗對兩院耐藥基因攜帶率進(jìn)行比較,P≤0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 標(biāo)本類型及科室分布 兩所醫(yī)院標(biāo)本主要分離自痰(A院75.64%,B院85.07%)、分泌物(A 院11.54%)、組織、引流液、尿、導(dǎo)管末端、胸腔積液等。A院標(biāo)本主要分離自重癥監(jiān)護(hù)室(ICU,37.18%)、高壓氧病區(qū)(15.38%)、干部病房(12.82%)和手外科(8.97%);B院標(biāo)本主要分離自ICU(79.10%)和呼吸科(8.96%)。

        2.2 藥敏結(jié)果 A院碳青霉烯耐藥AB68株,敏感10株;B院碳青霉烯耐藥AB60株,敏感7株。A院AB對頭孢哌酮/舒巴坦耐藥率最低(3.85%),其次是米諾環(huán)素(16.67%);對其他抗菌藥物耐藥率均>73%。B院AB對米諾環(huán)素和替加環(huán)素均不耐藥,對阿米卡星和左氧氟沙星的耐藥率分別為23.88%、38.81%,對其他抗菌藥物的耐藥率均>64%。兩院菌株對哌拉西林/他唑巴坦、頭孢吡肟、亞胺培南、美羅培南、慶大霉素的耐藥率比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義;其他抗菌藥物耐藥率比較,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義。見表2。

        表2 兩院AB耐藥情況比較(株)Table 2 Comparison in antimicrobial resistance of AB between two hospitals(No.of isolates)

        2.3 PCR擴(kuò)增結(jié)果 兩院所有菌株均攜帶OXA-51基因,均未檢出SIM-1、IMP-1、IMP-2、VIM-1、VIM-2、OXA-24基因。A、B兩院碳青霉烯耐藥組OXA-23基因的攜帶率分別為 86.76%(59/68),56.67%(34/60),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=14.53,P<0.001);兩院碳青霉烯敏感組OXA-23基因均為陰性。A院3株菌攜帶OXA-58基因,B院未檢出OXA-58基因。電泳結(jié)果見圖1。

        2.4OXA-23基因陽性與陰性株耐藥率 除頭孢哌酮/舒巴坦、米諾環(huán)素、頭孢呋辛外,A院OXA-23基因陽性株和陰性株對其他抗菌藥物的耐藥率差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(均P<0.05);除亞胺培南、美羅培南、左氧氟沙星、頭孢哌酮/舒巴坦及哌拉西林/他唑巴坦外,B院OXA-23基因陽性株和陰性株對其他11種抗菌藥物的耐藥率比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。見表3。

        圖1 AB碳青霉烯酶基因檢測PCR產(chǎn)物電泳圖Figure 1 Electrophoresis results of PCR products of AB carbapenemase genes

        表3 兩院AB對常用抗菌藥物的耐藥率(%)Table 3 Antimicrobial resistant rates of AB from two hospitals(%)

        2.5 同源性分析 根據(jù)ERIC-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳帶型(見圖2),運(yùn)用BIO-1D軟件分析各菌株所有條帶分子量大小進(jìn)行聚類分析。兩院所有菌株共分為8個基因型(分別用 A、B、C、D、E、F、G、H 表示),其中A型71株和E型37株,為主要流行株。A型又分為4個亞型,E型分為3個亞型。聚類分析見圖3。A院菌株共分為6種類型(除D、F型)主要是 A 型(46.15%)和E型(41.03%);B院共分為8種類型,主要是 A 型 (52.24%)和 C 型(17.91%)。見表4。

        表4 兩院AB基因分型構(gòu)成Table 4 Constituent ratios of genotypes of AB from two hospitals

        圖2 AB ERIC-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Figure 2 Electrophoresis results of ERIC-PCR in AB strains

        圖3 基于ERIC-PCR譜型的兩院AB聚類分析結(jié)果Figure 3 Hierarchical clustering of AB strains from two hospitals based on ERIC-PCR electrophoresis patterns

        3 討論

        AB是醫(yī)院感染的重要病原菌,隨著抗菌藥物的廣泛運(yùn)用,其耐藥株逐年增加,并且開始由低耐藥向高耐藥,單一藥耐藥向多藥耐藥方向發(fā)展,世界各地也陸續(xù)出現(xiàn)有關(guān)多重耐藥 AB(multidrugresistantAcinetobacterbaumannii,MDR-AB)或泛耐藥 AB(extensively drug-resistantAcinetobacter baumannii,XDR-AB)的報道[2]。本研究顯示,兩院分離的AB主要來源于痰標(biāo)本,表明AB在兩所醫(yī)院主要為下呼吸道感染;其在ICU分離率較高,可能與患者自身多有嚴(yán)重疾病、免疫能力較差,且長期使用廣譜抗菌藥物及侵入性操作(如氣管插管、氣管切開、吸痰、靜脈置管)等有關(guān)。池細(xì)俤等[3]采用多因素回歸分析結(jié)果顯示,氣管切開和使用呼吸機(jī)是MDRAB感染的獨(dú)立危險因素。另外A院的高壓氧病區(qū)和干部病區(qū)的AB分離率也較高,可能與手衛(wèi)生差、抗菌藥物使用不合理、侵入性操作、年齡等有關(guān)。

        兩院AB耐藥性分析顯示,耐藥情況嚴(yán)重,呈現(xiàn)多重耐藥和泛耐藥。對氨基青霉素、第一代和第二代頭孢菌素、第一代喹諾酮類抗菌藥物幾乎完全耐藥;對舒巴坦復(fù)方制劑仍有較高的敏感性,可能與舒巴坦能直接作用于青霉素結(jié)合蛋白,并可以抑制細(xì)菌產(chǎn)生多種β-內(nèi)酰胺酶有關(guān)[4]。兩院菌株耐藥情況比較對亞胺培南、美羅培南、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、頭孢吡肟、慶大霉素差異無統(tǒng)計學(xué)意義,對其他抗菌藥物差異均有統(tǒng)計學(xué)意義,可能與兩院環(huán)境及抗菌藥物選擇不同有關(guān)。

        目前,關(guān)于AB對碳青霉烯類藥物耐藥機(jī)制中產(chǎn)碳青霉烯酶的相關(guān)報道[5-7]最多。碳青霉烯酶是指能夠水解碳青霉烯類藥物的1類β-內(nèi)酰胺酶,在我國主要是B類酶和D類酶。國際上,該菌所產(chǎn)的B類金屬酶主要有IMP型、VIM型及SIM-1型,D類 OXA 型酶主要為OXA-23、OXA-24、OXA-51、OXA-58。報道[8]稱OXA-51/66是AB天然固有的碳青霉烯酶基因。本實(shí)驗中所有菌株均攜帶OXA-51基因,再次證明所有菌株均為AB。OXA-23基因在碳青霉烯敏感組中均為陰性,而耐藥組中OXA-23基因攜帶率兩院相比差異有統(tǒng)計學(xué)意義。此外OXA-23基因與某些抗菌藥物的耐藥情況有一定關(guān)聯(lián)性,陽性菌株耐藥率高于陰性株;且兩院存在一定的差異,可能尚存其他多種耐藥機(jī)制,有待進(jìn)一步研究。B類金屬酶基因SIM-1、IMP-1、IMP-2、VIM-1、VIM-2及OXA-24基因在兩院中均為陰性,與國內(nèi)其他地區(qū)報道[9-10]一致。A院3株 AB攜帶OXA-58基因,B院菌株OXA-58基因均為陰性。以上結(jié)果提示,兩院AB對碳青霉烯類抗生素的耐藥機(jī)制與產(chǎn)D類碳青霉烯酶有關(guān),且主要產(chǎn)OXA-23與OXA-51型酶,尚未發(fā)現(xiàn)B類金屬酶基因。

        耐碳青霉烯AB的出現(xiàn),使臨床治療和預(yù)防感染面臨很大挑戰(zhàn),監(jiān)測其耐藥率和流行型別十分重要。ERIC-PCR是目前常用的簡便、快速的基因分型技術(shù),其分辨率較強(qiáng),結(jié)果可靠,與細(xì)菌分子生物學(xué)分型技術(shù)的“金標(biāo)準(zhǔn)”脈沖場凝膠電泳(PFGE)分型有一定相關(guān)性[11]。ERIC-PCR的擴(kuò)增產(chǎn)物多為一端有ERIC序列,而另一端為隨機(jī)序列,小部分產(chǎn)物兩端均為隨機(jī)序列,可根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物條帶位置分析基因的同源性。本研究中,兩院所有菌株共分為8個基因型,其中A型71株和E型37株,為主要流行株。A院主要流行A型和E型,主要分布在ICU、呼吸內(nèi)科、高壓氧病區(qū);B院主要流行A型和C型,主要分布在ICU、呼吸內(nèi)科;其余型別以散發(fā)形式存在。A院3株OXA-58基因陽性株分屬不同類型,說明A院未出現(xiàn)攜帶OXA-58基因的AB水平傳播。其中A、B、C、D四個克隆型的譜帶有較高程度的相似性,它們間的親緣關(guān)系緊密。對于這些親緣關(guān)系較近的菌株,可能來自于同一感染源或為某克隆系在外界環(huán)境條件的影響下分化形成的不同克隆型及亞型,具有追溯感染源的意義。A型菌株在兩所醫(yī)院均存在暴發(fā)流行,應(yīng)深入研究這些攜帶A型菌株患者的臨床資料,探討是否因為相同或相似的臨床感染、用藥模式、傳播途徑等而分離出相同的細(xì)菌菌型。此外,ERIC分型的每一種型別均分散著OXA-23基因陽性株與陰性株,故認(rèn)為攜帶此耐藥基因與ERIC分型不一致,可能與細(xì)菌合并多種耐藥機(jī)制,并可通過整合子等移動元件進(jìn)行水平傳播有關(guān)。以上結(jié)果提示在這一時期內(nèi),兩所醫(yī)院存在某種MDRAB的暴發(fā)流行,可能以克隆株的形式在病房內(nèi)和病房間,甚至醫(yī)院間進(jìn)行傳播,這可能是造成兩院MDRAB分離率及耐藥率逐年升高的重要原因。

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