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        籠養(yǎng)條件下花尾榛雞的遺傳多樣性分析

        2015-01-28 09:06:18田萬(wàn)年長(zhǎng)白山動(dòng)植物資源利用與保護(hù)吉林省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室吉林吉林132101
        安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年11期
        關(guān)鍵詞:松雞吉林遺傳

        田萬(wàn)年,鐘 寶 (長(zhǎng)白山動(dòng)植物資源利用與保護(hù)吉林省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林吉林132101)

        花尾榛雞(Bonasa bonasia)是雞形目雉科鳥(niǎo)類,俗稱飛龍,是東北地區(qū)典型的森林留鳥(niǎo)[1]。其在東北曾有大規(guī)模的分布,長(zhǎng)期以來(lái),因狩獵致使數(shù)量下降而成為國(guó)家Ⅱ級(jí)保護(hù)鳥(niǎo)類。目前國(guó)內(nèi)對(duì)其飼養(yǎng)繁育及疾病等方面進(jìn)行了較為深入的研究,但有關(guān)花尾榛雞的分子生態(tài)學(xué)方面研究尚未見(jiàn)報(bào)道。線粒體DNA(mtDNA)具有母性遺傳、進(jìn)化速率快、拷貝數(shù)多的特點(diǎn),是目前生物體研究中應(yīng)用最廣泛的遺傳標(biāo)記之一。細(xì)胞色素b(Cyt b)是mtDNA編碼的呼吸鏈上重要的酶之一,作為一種高效的母系遺傳標(biāo)記,已被廣泛應(yīng)用于系統(tǒng)發(fā)育研究[2]。筆者以分子生態(tài)學(xué)研究中使用最為普遍的mtDNA的控制區(qū)和細(xì)胞色素b(Cyt b)作為分子標(biāo)記,對(duì)花尾榛雞的遺傳多樣性進(jìn)行分析,以期為制定科學(xué)的繁育計(jì)劃、對(duì)花尾榛雞進(jìn)行遺傳保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品的采集 吉林花尾榛雞來(lái)自吉林市左家珍禽養(yǎng)殖場(chǎng),采集不同個(gè)體花尾榛雞抗凝血15份,置于冰瓶帶回實(shí)驗(yàn)室,-20℃保存?zhèn)溆?。用全血基因組提取試劑盒提取基因組DNA。

        1.2 Cyt b基因的擴(kuò)增和序列測(cè)定 根據(jù)GeneBank中已發(fā)表的松雞基因序列(AB120132),利用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)一對(duì)引物。上游引物P1:5'-ATG GCA CCC AAC ATC CGA AAA T-3',下游引物 P2:5'-TTA GTG GTT GAG TAT TTT GTT T-3',預(yù)期擴(kuò)增大小為1 143 bp。引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性45 s,52℃退火1 min,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物的純化、回收和測(cè)序由上海英俊生物技術(shù)有限公司完成。

        1.3 統(tǒng)計(jì)分析 應(yīng)用Clustal W(1.82)軟件進(jìn)行多序列比對(duì),通過(guò)MEGA4.0軟件計(jì)算不同序列間的核苷酸代替、變異位點(diǎn)、轉(zhuǎn)換顛換比率及遺傳距離等。用DNAsp4.10軟件計(jì)算單倍型、單倍型多樣性、核苷酸多樣性。利用MEGA軟件計(jì)算品種間距離,利用UPGMA法構(gòu)建品種的分子系統(tǒng)樹(shù)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 花尾榛雞Cyt b基因PCR擴(kuò)增結(jié)果 通過(guò)DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和測(cè)序結(jié)果得知,Cyt b基因PCR產(chǎn)物大小為1 143 bp,與預(yù)期結(jié)果一致。

        2.2 花尾榛雞Cyt b基因的核苷酸多態(tài)位點(diǎn)的突變類型 通過(guò)對(duì)15條花尾榛雞Cyt b基因序列(15條序列由該試驗(yàn)測(cè)定,其余11條序列來(lái)源于GenBank)分析結(jié)果表明,所有序列全長(zhǎng)均為1 143 bp,無(wú)插入和缺失,共發(fā)現(xiàn)12個(gè)變異位點(diǎn),包括9個(gè)轉(zhuǎn)換和3個(gè)顛換。核苷酸的替換位點(diǎn)主要以轉(zhuǎn)換為主,表現(xiàn)出較高的轉(zhuǎn)換偏倚。12個(gè)變異位點(diǎn)定義了6種單倍型。

        2.3 花尾榛雞Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化分析 利用Clustal W(1.82)軟件對(duì)花尾榛雞mtDNA Cyt b序列進(jìn)行同源序列對(duì)比,結(jié)果發(fā)現(xiàn),15只花尾榛雞Cyt b基因全序列由6種單倍型組成。結(jié)合所有的群體單倍型序列,并引用GenBank中的部分松雞科Cyt b基因序列,采用UPGMA法,以Kimura雙參數(shù)模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。從圖2可以看出,基于Cyt b基因吉林花尾榛雞與榛雞屬Tetrastes bonasia(NC-020591)親緣關(guān)系最近,與斑尾榛雞(AF230166)處于一個(gè)分支,而北美榛雞屬(AF230167)單獨(dú)處于一個(gè)分支。黑琴雞(AF230166)、松雞(AF230179)和巖雷鳥(niǎo)(AY156346)共在一個(gè)分支上。

        3 討論

        花尾榛雞的肉質(zhì)口感細(xì)嫩,肉味極其鮮美且具有良好的滋補(bǔ)作用和扶正固本的藥效,具有非常高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值[3]。近年來(lái)由于對(duì)花尾榛雞棲息地環(huán)境破壞及大量捕獵,花尾榛雞的野生數(shù)量急劇減少。目前,我國(guó)關(guān)于花尾榛雞的研究主要集中在人工馴養(yǎng)和養(yǎng)殖、疾病防治、飼料及營(yíng)養(yǎng)、人工孵化及育雛等方面[4-8]。研究手段較單一,研究深度不夠,繁殖率低、幼雛成活率低等問(wèn)題尚未能解決。因此,對(duì)花尾榛雞的遺傳、生理及進(jìn)化等方面進(jìn)行系統(tǒng)的研究為花尾榛雞的保護(hù)及生產(chǎn)利用提供有效的保證。目前,對(duì)于花尾榛雞種群遺傳多樣性分析研究較少。楊秀芹等[9]對(duì)花尾榛雞MC4R基因進(jìn)行了克隆和序列分析。蔡曉淇[3]對(duì)花尾榛雞的系統(tǒng)地位與BLB基因多態(tài)性進(jìn)行了研究。該試驗(yàn)測(cè)定和分析了吉林地區(qū)花尾榛雞15只樣本的mtDNA Cyt b基因序列,共檢測(cè)到12個(gè)多態(tài)位點(diǎn),定義了6種單倍型。

        目前我國(guó)對(duì)松雞科鳥(niǎo)類的種屬分類存在爭(zhēng)議,最早認(rèn)為劃分為9屬。國(guó)內(nèi)學(xué)者通過(guò)形態(tài)、分子系統(tǒng)學(xué)等方法認(rèn)為應(yīng)將劃分為7屬或6屬。對(duì)于花尾榛雞的分類地位主要集中北美榛雞屬Bonasia和榛雞屬Tetrastes。該試驗(yàn)通過(guò)測(cè)定花尾榛雞mtDNA Cyt b基因序列,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)結(jié)果表明,籠養(yǎng)吉林花尾榛雞與榛雞屬Tetrastes bonasia(NC-020591)親緣關(guān)系最近,與斑尾榛雞(AF230166)處于一個(gè)分支,而北美榛雞屬(AF230167)單獨(dú)處于一個(gè)分支。該研究支持花尾榛雞屬于松雞科榛雞屬,不應(yīng)并入北美榛雞屬,與包新康等[4]、蔡曉淇等[10]的觀點(diǎn)一致。

        [1]朱井麗.長(zhǎng)白山東部山區(qū)越冬期花尾榛雞種群密度及分布[J].黑龍江生態(tài)工程職業(yè)學(xué)院學(xué)報(bào),2011,24(3):24-25.

        [2]劉向華,王義權(quán),劉忠權(quán),等.從Cytb基因序列探討鹿亞科動(dòng)物的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系[J].動(dòng)物學(xué)研究,2003,24(1):27 -33.

        [3]蔡曉淇.花尾榛雞的系統(tǒng)地位與BLB基因多態(tài)性研究[D].哈爾濱:東北林業(yè)大學(xué),2013.

        [4]包新康,劉發(fā),顧海軍,等.雞形目鳥(niǎo)類系統(tǒng)發(fā)生研究現(xiàn)狀[J].動(dòng)物分類學(xué)報(bào),2008,33(4):720 -732.

        [5]趙匠,易國(guó)棟,郝錫聯(lián),等.珍禽花尾榛雞的研究現(xiàn)狀及展望[J].吉林師范大學(xué)學(xué)報(bào),2006(2):60-61.

        [6]李愛(ài)國(guó),李國(guó)君.花尾榛雞野生馴養(yǎng)方法[J].特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)植物,2009(10):8-9.

        [7]杜繼紅,周玉秋.花尾榛雞的養(yǎng)殖[J].中國(guó)禽業(yè)導(dǎo)刊,2006,23(18):31-32.

        [8]孫淑霞,薛茗元,張克勤.花尾榛雞人工飼養(yǎng)技術(shù)[J].中國(guó)家禽,2014,36(6):55-58.

        [9]楊秀芹,張冬杰,劉娣.環(huán)頸雉和花尾榛雞MC4R基因的克隆和序列分析[J].中國(guó)畜牧雜志,2010,46(17):16 -18.

        [10]蔡曉淇,白素英,金煜.松雞科13種鳥(niǎo)類COⅠ序列變異及系統(tǒng)發(fā)育分析[J].動(dòng)物分類學(xué)報(bào),2012,37(2):269-273.

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