張秀磊,王志宇,朱 濤,汪香婷△(中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,安徽合肥3007;河北大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科,河北保定0700)
長(zhǎng)鏈非編碼RNA在2種乳腺癌耐藥性細(xì)胞中的表達(dá)分析和功能預(yù)測(cè)*
張秀磊1,王志宇2,朱濤1,汪香婷1△
(1中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,安徽合肥230027;2河北大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科,河北保定071002)
目的:發(fā)掘在乳腺癌耐藥性細(xì)胞中表達(dá)錯(cuò)調(diào)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)。方法:對(duì)敏感和耐藥性乳腺癌細(xì)胞中的lncRNA表達(dá)分別進(jìn)行芯片檢測(cè)。檢測(cè)后結(jié)果經(jīng)生物信息統(tǒng)計(jì)學(xué)分析對(duì)lncRNA進(jìn)行歸類(lèi)和功能網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)。結(jié)果:與敏感細(xì)胞相比,他莫昔芬和曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)和下調(diào)的lncRNA分別為2 107、611、1 154和2 141種,其中在2種耐藥細(xì)胞株中共同表達(dá)錯(cuò)調(diào)的有93種。對(duì)共同表達(dá)上調(diào)的69種lncRNA的功能預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)2種與在乳腺癌耐藥性中發(fā)揮作用的蛋白編碼基因或microRNA相關(guān),2種參與有絲分裂節(jié)點(diǎn)或DNA損傷引發(fā)的細(xì)胞死亡。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)大量在他莫昔芬與曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞中異常表達(dá)的lncRNAs,但同時(shí)在2種細(xì)胞中異常表達(dá)的數(shù)量極少,提示lncRNAs在腫瘤藥物耐藥性中具有較強(qiáng)特異性。本研究還通過(guò)生物信息學(xué)分析,建立了一種新型的基于功能預(yù)測(cè)的靶基因篩選方法。
國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.31471226; No.91440108) ;中國(guó)科學(xué)院基金資助項(xiàng)目(No.KJ2070000031)
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