1945年8月15日日本帝國主義投降后不久，蔣介石悍然發(fā)動(dòng)全面內(nèi)戰(zhàn)，解放戰(zhàn)爭由此拉開序幕。1945年8月3日，毛澤東發(fā)表《抗日戰(zhàn)爭勝利后的時(shí)局和我們的方針》一文，強(qiáng)調(diào)對蔣介石發(fā)動(dòng)內(nèi)戰(zhàn)必須有充分準(zhǔn)備，必須進(jìn)行針鋒相對的斗爭。隨后，新四軍第四師副師長韋國清率九旅北上魯南，配合兄弟部隊(duì)執(zhí)行阻止國民黨軍隊(duì)沿津浦路北犯的任務(wù)。韋國清和九旅的首長率全體指戰(zhàn)員上書陳毅軍長，表示：“在首長指揮下，我們將不顧一切困難，不怕一切犧牲，為保衛(wèi)華北的大門，支應(yīng)華中，給向北犯的頑軍以堅(jiān)決干脆徹底的打擊……我們一定為創(chuàng)造我黨我軍光榮戰(zhàn)績而拼命努力?！蓖?0月，北上山東之新四軍第二師四、五旅及第四師九旅于山東嶧縣附近組成山東野戰(zhàn)軍第二縱隊(duì)。

1946年7月26日至28日，第二縱隊(duì)九旅首戰(zhàn)朝陽集，圓滿完成了縱隊(duì)賦予的穿插、打援，協(xié)同四旅殲滅向淮北解放區(qū)進(jìn)犯之?dāng)车娜蝿?wù)，共殲敵六十九師九十二旅全部及六十旅一部，生俘九十二旅副旅長冼盛楷以下5000余人。陳毅司令員為此揮毫寫下“人民震怒山河動(dòng)，背水奇功敵盡降”的詩句，頌揚(yáng)了九旅官兵英勇善戰(zhàn)的大無畏英雄氣概。

1947年1月下旬，山東野戰(zhàn)軍和華中野戰(zhàn)軍合編為華東野戰(zhàn)軍，山東野戰(zhàn)軍第二縱隊(duì)九旅二十五、二十六、二十七團(tuán)依次改為華東野戰(zhàn)軍第二縱隊(duì)第六師十六、十七、十八團(tuán)。1947年2月7日，六師與四、五師共同發(fā)起討郝（鵬舉）戰(zhàn)役，在隴海路東白塔埠地區(qū)殲滅敵第四十二集團(tuán)軍軍部及二、四師，俘虜郝鵬舉，共殲敵6000余人。

1947年5月，孟良崮戰(zhàn)役中，六師在縱隊(duì)的統(tǒng)一指揮下，執(zhí)行戰(zhàn)役打援任務(wù)，進(jìn)行了第一次臨蒙公路運(yùn)動(dòng)防御，有力地鉗制了敵人，為主攻部隊(duì)全殲敵整編第七十四師創(chuàng)造了有利條件。

1947年夏季，為進(jìn)一步發(fā)展華東戰(zhàn)局，中央軍委對華東作戰(zhàn)任務(wù)作了新的調(diào)整，抽調(diào)二縱隊(duì)南下華中，會合十一、十二縱隊(duì)組成蘇北兵團(tuán)，擔(dān)負(fù)華中戰(zhàn)場的作戰(zhàn)任務(wù)，變蘇北敵后為戰(zhàn)略進(jìn)攻的側(cè)翼戰(zhàn)場，策應(yīng)中原作戰(zhàn)，直接威脅國民黨京滬杭統(tǒng)治區(qū)。六師在膠南地區(qū)經(jīng)過休整，于1948年2月17日自膠南出發(fā)，沿沭河以東，經(jīng)桑園九佛山莒南向華中開進(jìn)，越隴海東段敵占區(qū)，于3月14日進(jìn)到蘇北阜寧以西、老黃河以南羊寨地區(qū)集結(jié)待命。

淮海戰(zhàn)役首戰(zhàn)王塘 1948年11月15日，六師十六團(tuán)首戰(zhàn)王塘，戰(zhàn)斗打響不久，三營營長魯銳率領(lǐng)全營在兄弟部隊(duì)的配合下，經(jīng)一整夜激戰(zhàn)，殲敵一個(gè)加強(qiáng)營，他卻不幸在此次激戰(zhàn)中犧牲。在擔(dān)任主攻的二營因搜索村西動(dòng)作遲緩，未能按時(shí)發(fā)起沖擊的情況下，教導(dǎo)員劉建德及時(shí)調(diào)整兵力部署，冒死指揮作戰(zhàn)，全營官兵英勇作戰(zhàn)、不怕犧牲，在兄弟部隊(duì)配合下，全殲敵一個(gè)加強(qiáng)營。十六團(tuán)八連被師、縱隊(duì)逐級評為“英雄連”，蘇北兵團(tuán)正式授予八連“英雄連”榮譽(yù)稱號。王塘戰(zhàn)斗是該師在淮海戰(zhàn)役中打的第一仗，這場戰(zhàn)斗中，八連連長張春禮渾身多處負(fù)傷仍堅(jiān)持完成戰(zhàn)斗任務(wù)，被譽(yù)為“鐵人張春禮”。1950年，第三野戰(zhàn)軍授予張春禮“一級人民英雄”稱號，并出席全國首屆英模大會，第三野戰(zhàn)軍追授魯銳“一級人民英雄”稱號。

突破長江天險(xiǎn) 1949年元旦，毛澤東發(fā)表新年獻(xiàn)詞，提出向長江以南進(jìn)軍的任務(wù)。中央軍委關(guān)于同意總前委渡江作戰(zhàn)部署的電報(bào)，其中同意4月16日起提前攻占江北及江心據(jù)點(diǎn)的任務(wù)。該師根據(jù)二十一軍命令，擔(dān)任渡江突擊師，在總攻前一日發(fā)起攻擊，奪取江心洲，突破主航道，從而拉開了渡江戰(zhàn)役的序幕。

之后，該師在二十一軍編成內(nèi)主要執(zhí)行和完成了渡江作戰(zhàn)，5月6日，該師攻克杭州蕭山。8月12日部隊(duì)渡海解放重要軍港三都岙。南下閩東北以后，協(xié)同地方政府和武裝，建立政權(quán)，建設(shè)浙南，殲滅閩東北殘敵，開辟閩東北糧源，解決浙南糧食供應(yīng)問題。

解放戰(zhàn)爭時(shí)期，這個(gè)部隊(duì)積極響應(yīng)黨的號召，北上魯南保衛(wèi)抗戰(zhàn)勝利果實(shí)，配合戰(zhàn)略進(jìn)攻，南下華中，策應(yīng)我軍中原作戰(zhàn)，轉(zhuǎn)戰(zhàn)淮海戰(zhàn)場，進(jìn)軍浙南閩北等，為中國人民解放事業(yè)立下了汗馬功勞。四年中，共殲敵4萬余人，繳獲火炮200余門，涌現(xiàn)出許多英雄模范這期間部隊(duì)共傷亡6400余人，其中犧牲2000余人。