張晶晶,李建貴,郭藝鵬,韓 超,秦韻婷
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 林業(yè)研究所,新疆 烏魯木齊 830052)
新疆核桃根際土壤中解磷菌的分離篩選及鑒定
張晶晶,李建貴,郭藝鵬,韓 超,秦韻婷
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 林業(yè)研究所,新疆 烏魯木齊 830052)
為給核桃專用微生物肥的研制提供菌株材料,通過對(duì)新疆核桃根際土壤中解磷菌的分離純化,篩選出對(duì)核桃樹具有促生作用且能在其根際穩(wěn)定定殖的優(yōu)質(zhì)高效解磷菌株。從阿克蘇、和田、喀什等新疆核桃主產(chǎn)區(qū)的根際土壤中分離出解磷菌54株,采用溶磷圈初篩法和液體搖瓶復(fù)篩法對(duì)其解磷能力進(jìn)行測(cè)定,篩選出解磷能力強(qiáng)的菌株14株。經(jīng)耐利福平誘導(dǎo)后剩余13株,再進(jìn)行大田定殖試驗(yàn),最終篩選出11株解磷菌。經(jīng)16S rDNA鑒定,得出這11株解磷菌歸屬于5個(gè)屬,分別為假單胞菌屬Pseudomonas,葡萄球菌屬Staphylococcus,動(dòng)性桿菌屬Planomicrobium,微桿菌屬M(fèi)icrobacterium,不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter,其中,假單胞菌屬為優(yōu)勢(shì)種群且解磷效果最好。
新疆核桃;解磷菌;篩選;鑒定
磷是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的重要限制因素之一,在土壤缺乏磷素的狀態(tài)下,作物的產(chǎn)量將大大降低。土壤中全磷含量一般都比較充足,但植物可吸收的有效磷含量很低[1],主要是因?yàn)閷?duì)土壤施用大量的磷肥后,這些可溶性磷肥大部分很快會(huì)被轉(zhuǎn)變成植物難以吸收利用的磷酸鹽形式,主要以磷酸鈣為主[2]。研究表明,解磷菌可以將土壤中的難溶態(tài)磷通過溶解或礦化作用轉(zhuǎn)化為可溶性磷。核桃Juglans regiaL.是世界著名的四大堅(jiān)果之一,具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和保健功能[3],它作為新疆特色林果的主要樹種,同樣面臨著嚴(yán)重缺磷的問題。因此,有必要從核桃土壤中篩選出高效的解磷菌株制成生物菌劑,再回接到土壤中以促進(jìn)植物生長(zhǎng)[4]。這樣不僅可以有效地減少化學(xué)磷肥的使用,還對(duì)提高作物產(chǎn)量具有重要意義。
目前,國(guó)內(nèi)外已有大量關(guān)于解磷菌的研究。在國(guó)內(nèi)方面,2006年,Chen等分離得到多株具有解磷能力的細(xì)菌,發(fā)現(xiàn)其解磷作用與有機(jī)酸的產(chǎn)生和培養(yǎng)基pH值的降低有關(guān)[5]。2007年,呂學(xué)斌等將分離得到的4株解磷菌株和2株對(duì)照菌株進(jìn)行了解磷效果的對(duì)比試驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同菌株有著不同的磷源偏好,解磷效果差異較大[6]。2008年,呂德國(guó)等探討了解磷細(xì)菌定殖規(guī)律及其與本溪山櫻地上部和地下部生長(zhǎng)發(fā)育的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)解磷細(xì)菌的定殖數(shù)量隨外來微生物侵入數(shù)量的增多而減少[7]。國(guó)外方面,2005年,Chung等從韓國(guó)不同農(nóng)作物根際土壤中分離得到13株解磷細(xì)菌,并進(jìn)行了全細(xì)胞脂肪酸甲酯(FAME)和16S rDNA序列分析[8]。2006年,Hameeda等研究發(fā)現(xiàn),微生物解磷的能力與其產(chǎn)生葡萄糖酸的量有很大關(guān)系,解磷能力強(qiáng),其相應(yīng)的產(chǎn)生葡萄糖酸的量也多[9]。2008年,Delvasto等從巴西地區(qū)一種含磷量較高的鐵礦石中分離得到4株解磷細(xì)菌,并研究了菌株的多樣性、解磷活力及解磷機(jī)制[10]。
如今,解磷微生物肥的應(yīng)用已很廣泛,但對(duì)核桃專用解磷菌劑的研究還比較少。筆者從核桃根際土壤中篩選出具有解磷作用且能在根際穩(wěn)定定殖的優(yōu)質(zhì)菌株,并對(duì)其進(jìn)行鑒定,旨在為核桃專用微生物肥的研制提供菌株材料。
試驗(yàn)于2013~2014年在新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,試驗(yàn)區(qū)設(shè)于阿克蘇紅旗坡農(nóng)場(chǎng)某核桃園(N39°30′~ 41°27′,E79°39′~ 82°01′)。 試驗(yàn)區(qū)地處歐亞大陸深處,遠(yuǎn)離海洋,具有典型的暖溫帶大陸性干旱氣候特征。降水稀少,蒸發(fā)量大,主要靠灌溉水,蓄水量穩(wěn)定。光照充足,熱量豐富,晝夜溫差大,無霜期較長(zhǎng)。地面平均溫度12.0~15.1 ℃,年平均降水量為80.4 mm,年平均蒸發(fā)量為1 948 mm,年平均日照時(shí)數(shù)2 809 h,一般年份最低氣溫-15 ℃左右,極端最低氣溫-21 ℃。
試驗(yàn)材料為阿克蘇、和田、喀什等地的核桃根際土壤。土樣帶回實(shí)驗(yàn)室后,取根系及黏附其上的土壤用于解磷菌的分離篩選,將篩選好的解磷菌進(jìn)行抗生素標(biāo)記后,定殖于試驗(yàn)區(qū),并于加入菌劑后的0、10、25、45 d進(jìn)行根際土壤的回收,再次進(jìn)行解磷能力測(cè)定及菌落計(jì)數(shù)。最后,將篩選出的優(yōu)質(zhì)解磷菌進(jìn)行菌種鑒定。
對(duì)土壤中解有機(jī)磷菌和解無機(jī)磷菌的分離分別采用的是卵磷脂與磷酸三鈣解磷培養(yǎng)基[11-12];解磷能力測(cè)定采用的是溶磷圈初篩法[13]和液體搖瓶復(fù)篩法[14];定殖能力測(cè)定采用的是含利福平肉湯梯度培養(yǎng)法,從而獲得耐利福平350 μg/mL的標(biāo)記菌株并進(jìn)行灌根及回收試驗(yàn);菌種鑒定采用的是16S rDNA鑒定[15]。
通過對(duì)采集的核桃根際土壤進(jìn)行解磷菌的分離,共得到54株解磷菌株并對(duì)其進(jìn)行了編號(hào),具體編號(hào)見表1。
表 1 新疆核桃解磷菌株Table 1 The phosphate-solubilizing bacteria of Xinjiang walnut
將分離得到的54株解磷菌進(jìn)行溶磷圈法試驗(yàn),初步選出以下14株解磷效果較好的解磷菌,并重新進(jìn)行編號(hào)。測(cè)定其培養(yǎng)1 d和3 d后,在磷灰石板和卵黃板上形成的透明圈和渾濁圈的半徑,如圖1、圖2所示。
從圖1可以看出,除PH-4外,培養(yǎng)1 d后,解無機(jī)磷菌在磷灰石板上形成了透明圈,其半徑為1.71~4.02 mm;培養(yǎng)3 d后,各菌株均形成了明顯的透明圈,其半徑為2.15~6.17 mm。其中,PH-6、PH-7、PH-11、PH-12的解無機(jī)磷能力相對(duì)較高。
從圖2可以看出,培養(yǎng)1 d后,解有機(jī)磷菌在卵黃板上均形成渾濁圈,半徑為2.00~7.82 mm;培養(yǎng)3 d后,各菌株均形成了明顯的渾濁圈,其半徑為3.91~11.83 mm。解有機(jī)磷效果好的有:PH-1、PH-4、PH-7、PH-8、PH-11。綜合圖1和2可以得出,在初篩中,PH-1、PH-7、PH-8、PH-11的解無機(jī)磷和解有機(jī)磷效果均較好。
圖1 新疆核桃解磷菌在磷灰石板上形成的透明圈半徑Fig. 1 Transparent circle radii forming on the apatite board of xinjiang walnut phosphate-solubilizing bacteria
圖2 新疆核桃解磷菌在卵黃板上形成的渾濁圈半徑Fig. 2 Turbidity circle radii forming on the yolk board of xinjiang walnut phosphate-solubilizing bacteria
圖3 解無機(jī)磷菌液含磷量Fig. 3 Phosphorus contents of inorganic phosphorus solubilizing bacteria solutions
將初篩得到的14株解磷菌與CK(加入等量滅活培養(yǎng)液)一起進(jìn)行液體搖瓶復(fù)篩,其發(fā)酵液1、3、6 d后的可溶性磷含量測(cè)定結(jié)果見圖3和圖4。
從圖3和圖4可以看出,接種后,隨著天數(shù)的增加發(fā)酵液中可溶性磷(解有機(jī)磷P+和解無機(jī)磷P-)含量也基本上呈增長(zhǎng)趨勢(shì),僅有極少數(shù)出現(xiàn)下降,如解無機(jī)磷中的PH-3、PH-13和解有機(jī)磷的PH-2、PH-4在6 d后濃度有所下降,但其含量與CK相比均有所提高,故將其保留。其中解無機(jī)磷效果好的有:PH-7、PH-11、PH-12;解有機(jī)磷效果好的有:PH-1、PH-8、PH-11、PH-12。綜合以上結(jié)果來看,這14株解磷菌均可進(jìn)行下一步試驗(yàn)。
圖4 解有機(jī)磷菌液含磷量Fig. 4 Phosphorus contents of organic phosphorus solubilizing bacteria solutions
將篩選后的14株解磷菌經(jīng)利福平標(biāo)記后,再次進(jìn)行溶磷圈測(cè)定,其結(jié)果如圖5所示。
圖5 利福平標(biāo)記后解磷菌的解磷能力Fig. 5 Phosphate-solubilizing ability of phosphate-solubilizing bacteria after inducted by rifampicin resistance
從圖5可以看出,經(jīng)利福平標(biāo)記后,PH-7、PH-8、PH-11仍能保持相對(duì)較高的解磷能力,但大多數(shù)解磷菌的解磷能力變?nèi)?,PH-4、PH-10和PH-13甚至喪失了解無機(jī)磷能力,PH-6失去了解有機(jī)磷能力。其中,PH-10的解有機(jī)磷能力又相對(duì)較低,將其去除,采用其它13株解磷菌進(jìn)行下一步試驗(yàn)。
將利福平標(biāo)記過的解磷菌培養(yǎng)液經(jīng)計(jì)數(shù)達(dá)108cfu/mL后,將其稀釋液與CK(設(shè)等量滅活的細(xì)菌培養(yǎng)基為對(duì)照)一起施入核桃根際,并在加入菌劑后的0、10、25、45 d進(jìn)行根際土壤的回收計(jì)數(shù),試驗(yàn)結(jié)果如表2所示。
表 2 定殖后解磷菌菌落計(jì)數(shù)Table 2 Colony count of phosphate-solubilizing bacteria after colonization cfu/mL
從表2可以看出,施入核桃根際的解磷菌株在定殖過程中數(shù)量呈快速下降的趨勢(shì),這主要是由于初始接種量較大,超出了土壤的承載量,隨著時(shí)間的推移,接種進(jìn)去的解磷菌慢慢適應(yīng)了當(dāng)?shù)赝寥拉h(huán)境,菌株數(shù)量也逐漸穩(wěn)定下來,45 d后保持在107cfu/mL。其中PH-1、PH-7、PH-8、PH-11、PH-12的菌株數(shù)量較多,達(dá)到2×107cfu/mL以上,說明其具有較強(qiáng)的適應(yīng)性。
將定殖45 d后的解磷菌進(jìn)行回收,純化后進(jìn)行溶磷圈試驗(yàn),所得結(jié)果見圖6。
圖6 定殖后解磷菌解磷能力Fig. 6 Phosphate-solubilizing ability of phosphate-solubilizing bacteria after colonization
從圖6可以得出以下結(jié)論,篩選出的13株解磷菌在定殖后基本上仍能保持其解磷能力。其中,PH-1、PH-7、PH-8、PH-11、PH-12的解磷效果相對(duì)較好;PH-2、PH-4與PH-13失去了解無機(jī)磷能力,且PH-2、PH-13的解有機(jī)磷能力效果也不好,將其去除,而PH-4的解有機(jī)磷能力相對(duì)較好,將其保留。故最終篩選出11株解磷能力較好的菌株。
采用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒對(duì)核桃解磷菌進(jìn)行DNA提取后,對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),所得電泳圖譜如圖7所示。
圖7 解磷菌16S rDNA 的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)結(jié)果Fig. 7 Electrophoresis test results of PCR ampli fi cation products of phosphate-solubilizing bacteria 16S rDNA
從圖7中可以看出擴(kuò)增出的16S rDNA片段序列長(zhǎng)度在1 000~2 000 bp,符合常規(guī)的16S rDNA序列長(zhǎng)度。
將回收的片段送至上海生工生物工程服務(wù)有限公司進(jìn)行測(cè)序,共獲得11條DNA序列,采用ClustalX1.8軟件進(jìn)行拼接,使用NCBI的BLAST功能,與GenBank中已有序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果如表3所示。
經(jīng)拼接對(duì)比鑒定,發(fā)現(xiàn)這11株解磷菌歸屬于 5個(gè) 屬。 其 中,PH-1、PH-4、PH-5、PH-7、PH-9、PH-11為 假 單 胞 菌 屬Pseudomonas,PH-6和PH-14為葡萄球菌屬Staphylococcus,PH-3為動(dòng)性桿菌屬Planomicrobium,PH-8為微桿菌屬M(fèi)icrobacterium,PH-12為不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter。
從新疆核桃根際土壤中分離出54株解磷菌,采用溶磷圈初篩和液體搖瓶復(fù)篩法,選出解磷菌14株。經(jīng)耐利福平誘導(dǎo)后,淘汰1株。然后將這13株菌株數(shù)量在108cfu/mL水平的解磷菌菌劑進(jìn)行大田定殖45 d后,13株菌株的數(shù)量均保持在107cfu/mL水平(對(duì)照為106cfu/mL水平),再用溶磷圈法測(cè)定其解磷能力,最終篩選出11株解磷效果較好的菌株。
表 3 解磷菌16S rDNA序列BLAST結(jié)果Table 3 BLAST results of 16S rDNA sequence in phosphate-solubilizing bacteria
經(jīng)16S rDNA進(jìn)行鑒定,得出這11株解磷菌歸屬于5個(gè)屬,其中6株菌株屬于假單胞菌屬Pseudomonas,1株為微桿菌屬M(fèi)icrobacterium,1株為不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter,2株為葡萄球菌屬Staphylococcus,1株為動(dòng)性桿菌屬Planomicrobium。
綜合以上結(jié)果得出,假單胞菌屬為解磷菌的優(yōu)勢(shì)種群,而且是解磷能力最好的。本試驗(yàn)再次證實(shí)了解磷微生物的資源種類繁多,可供人們的開發(fā)和利用,特別是假單胞菌屬。但是,由于解磷菌的解磷能力具有不穩(wěn)定性,在菌株保存過程中,有些菌株會(huì)失去解磷能力。因此,深入研究解磷能力的穩(wěn)定性和解磷機(jī)制是今后的研究目標(biāo)。
[1]王金路,陳永忠,張黨權(quán),等.不同磷源對(duì)油茶幼苗生長(zhǎng)的影響[J].中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2014,34(5):47-50.
[2]伊 鋆.高效解磷細(xì)菌的篩選及解磷機(jī)理的研究[D].大連:大連理工大學(xué),2011.
[3]武 靜.早實(shí)核桃堅(jiān)果品質(zhì)與葉片營(yíng)養(yǎng)相關(guān)性淺析[J].中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2013,33(8):24-27.
[4]Jose Mariano. Phosphate-solubilizing bacteria as inoculants for agriculture: use of updated molecular techniques in their study[J].Agronomie, 2001, 21: 561-568.
[5]Chen Y P, Rekha P D, Arun A B,et al.Phosphate solubilizing bacteria from subtropical soil and their tricalcium Phosphate solubilizing abilities[J]. Applied soil Ecology,2006,34:33-41.
[6]呂學(xué)斌,孫亞凱,張毅民.幾株高效溶磷菌株對(duì)不同磷源溶磷活力的比較[J].農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào),2007,23(5):195-197.
[7]呂德國(guó),于 翠,秦嗣軍,等.本溪山櫻根部解磷細(xì)菌的定殖規(guī)律及其對(duì)植株生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2008,41(2): 508-515.
[8]Chung H Y, Park M, Madhaiyan M,et al. Isolation and characterization of phosphate solubilizing bacteria from the rhizosphere of crop plants of Korea[J]. Soil Biology &Biochemistry, 2005, 37: 1970-1974.
[9]Hameeda B, Harish K RY, Rupela O P,et al.Effect of carbon substrates on rock phosphate solubilization by bacteria from composts and macrofauna[J]. Current Microbiology, 2006, 53:298-302.
[10]Delvasto P, Valverde A, Ballester A,et al.Diversity and activity of phosphate bioleaching bacteria from a high-phosphorus iron ore[J]. Hydrometallurgy, 2008,92:124-129.
[11]中國(guó)科學(xué)院南京土壤研究所微生物室.土壤微生物研究法[M].北京:科學(xué)出版社,1985.
[12]徐光輝,鄭洪元.土壤微生物分析方法手冊(cè)[M].北京:農(nóng)業(yè)出版社,1986.
[13]吳 凡,崔 萍,夏尚遠(yuǎn),等.桑樹根際解磷細(xì)菌的分離鑒定及解磷能力測(cè)定[J].蠶業(yè)科學(xué),2007,33(44):521-527.
[14]張祥勝.發(fā)酵液有效磷含量測(cè)定方法研究[J].湖州職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào),2008,(3):1-3.
[15]孫林琦,郭藝鵬,王海儒,等.新疆棗園土壤解鉀微生物菌株篩選及鑒定[J].經(jīng)濟(jì)林研究,2014,32(4):58-62.
Screening and identi fi cation of phosphate-solubilizing bacteria in rhizosphere soil of Xinjiang walnut
ZHANG Jing-jing, LI Jian-gui, GUO Yi-peng, HAN Chao, QIN Yun-ting
(Institute of Forestry, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, Xinjiang, China)
In order to provide strain material for development of speci fi c walnut microbial fertilizer, through separation and purification of the phosphate-solubilizing bacteria in rhizosphere soil of Xinjiang walnut, some high quality and efficient phosphate-solubilizing strains were screened, which had growth-promoting effect for walnut tree and could colonize stably in its rhizosphere. 54 strains of phosphate-solubilizing bacteria were isolated from the rhizosphere soil of Aksu, Hotan and Kashgar walnut-producing areas in Xinjiang, ability of its phosphate-solubilizing were measured by using the methods of dissolved phosphorus ring screening and liquid shake fl ask screening, and 14 strains of bacteria with strong phosphate-solubilizing ability were screened out. 13 strains of phosphate-solubilizing bacteria were reserved after inducted by rifampicin resistance, and eventually 11 strains of phosphate-solubilizing bacteria were selected out after the field colonization experiments. The 11 strains of phosphate-solubilizing bacteria were identified by 16S rDNA, they belonged to 5 genera, and they werePseudomonas,Staphylococcus,Planomicrobium,Microbacterium, andAcinetobacter.Among them,Pseudomonaswas the dominant population and its phosphate-solubilizing effect was best.
Xinjiang walnut; phosphate-solubilizing bacteria; screening; identi fi cation
S664.1
A
1003—8981(2015)02—0057—06
2015-01-04
國(guó)家林業(yè)公益性項(xiàng)目重大專項(xiàng)課題“新疆紅棗、核桃專用微生物肥料研制與應(yīng)用示范”(201304701);新疆自治區(qū)重點(diǎn)學(xué)科森林培育。
張晶晶,碩士研究生。
李建貴,教授,博士生導(dǎo)師。E-mail:lijiangui1971@163.com
張晶晶,李建貴,郭藝鵬,等.新疆核桃根際土壤中解磷菌的分離篩選及鑒定[J].經(jīng)濟(jì)林研究,2015,33(2):57-62.
10.14067/j.cnki.1003-8981.2015.02.010
http: //qks.csuft.edu.cn
[本文編校:聞 麗]