劉 飛, 楊春艷, 謝建新
(1.玉溪師范學(xué)院物理系,云南 玉溪 653100;2.玉溪師范學(xué)院化學(xué)系,云南 玉溪 653100)
蠶豆是中國重要的冷季作物,具有蛋白質(zhì)含量高、易消化吸收、用途廣以及深加工增值的特點(diǎn),是典型的糧、菜、飼兼用型作物,具有較高經(jīng)濟(jì)價值[1-2]。蠶豆的產(chǎn)量和品質(zhì)受生產(chǎn)過程中生物和非生物脅迫因素的影響。生物脅迫因素包括真菌、細(xì)菌、病毒等病原物引起的病害以及農(nóng)業(yè)害蟲造成的蟲害[3]。在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,作物病蟲害防治措施不恰當(dāng)與隨意使用農(nóng)藥現(xiàn)象普遍存在,這影響了作物產(chǎn)品質(zhì)量,與國家發(fā)展綠色農(nóng)業(yè)、高效農(nóng)業(yè)、精細(xì)農(nóng)業(yè)的目標(biāo)不相符。其主要原因在于不能正確鑒別病蟲害和判斷病蟲害的危害程度。及時診斷病蟲害,判斷病蟲害的危害程度,采取必要措施,進(jìn)行有效防治,對提高蠶豆的產(chǎn)量和質(zhì)量具有重要意義。
目前對于作物病蟲害的研究,主要包括通過農(nóng)作物育種和田間管理減少病蟲害以及加強(qiáng)病蟲害監(jiān)測兩方面[4]。農(nóng)作物病蟲害監(jiān)測主要通過田間采樣、生物學(xué)檢測和顯微鏡觀察等方法進(jìn)行[5-6]。生物學(xué)檢測包括病原體分離、培養(yǎng)、接種鑒定等一系列過程;顯微鏡觀察需經(jīng)過固定、染色等較為復(fù)雜的過程,且主觀性強(qiáng),不能給出樣品的化學(xué)信息[5]。用于作物病蟲害鑒定的方法還有生理生化測定技術(shù)、免疫血清檢測技術(shù)、分子生物學(xué)手段等,這些方法同樣需要分離提取,且操作繁瑣,成本較高[6-7]。近紅外光譜、高光譜、多光譜成像技術(shù)已用于農(nóng)作物病蟲害的田間診斷研究[8-9],但易受天氣、作物覆蓋程度、田間土壤、雜草等影響,不同測量條件與環(huán)境獲得的檢測模型不同,需要提高模型的通用性和穩(wěn)定性[10]。傅里葉變換紅外光譜(FTIR)具有方便、快速、重復(fù)性好、取樣量少等特點(diǎn),已經(jīng)用于真菌與細(xì)菌菌株[11]、作物品種與產(chǎn)地[12]等方面的鑒別。在蠶豆病蟲害的研究方面,李志永等[13]通過FTIR光譜結(jié)合主成分分析研究鑒別了蠶豆不同病害。主成分分析中通過主成分得分圖進(jìn)行分類鑒別,在病蟲害種類較多、樣品數(shù)量較大的情況下難于操作,需要在FTIR光譜的基礎(chǔ)上結(jié)合其他方法繼續(xù)研究。判別分析是多元統(tǒng)計分析中判斷個體所屬類型的應(yīng)用性很強(qiáng)的統(tǒng)計方法[14]。FTIR光譜結(jié)合判別分析用于農(nóng)產(chǎn)品分類鑒別已有報道[15-16],但用于植物病蟲害診斷鑒別的研究未見報道。本研究用蠶豆病蟲害葉片樣品的FTIR光譜及其一階導(dǎo)數(shù)光譜和二階導(dǎo)數(shù)光譜,結(jié)合判別分析對蠶豆病蟲害種類和病原物類別進(jìn)行診斷研究,同時比較挑選變量建立判別函數(shù)時不同方法的診斷效果,期望為蠶豆病蟲害的診斷提供新的簡便快捷方法。
測試樣品采自云南省陸良縣、宜良縣、富民縣、通??h、新平縣和玉溪市等地,包括結(jié)莢期正常蠶豆葉片和結(jié)莢期11種蠶豆病蟲害葉片,共110個樣品;11種蠶豆病蟲害的病原物涉及真菌、細(xì)菌、病毒和蟲害等4種(表1)。樣品在自然條件下晾干待測。
表1 試驗樣品名稱及病原物類別Table 1 Name and category of pathogen of each sample
紅外光譜儀為PE公司生產(chǎn)的Frontier型傅里葉變換紅外光譜儀。采用 DTGS檢測器,光譜分辨率為4 cm-1,測量范圍為4 000~400 cm-1,掃描次數(shù)為16次。試驗試劑溴化鉀,純度99.9%。
取各樣品葉片的病斑部分放入瑪瑙研缽研磨成均勻細(xì)粉,再按1︰60的比例加入溴化鉀粉末攪磨均勻,然后壓片測試。每個葉片樣品壓制1個掃描片,測試紅外光譜,所有光譜都扣除背景,并在光譜軟件Omnic8.0中進(jìn)行自動基線校正、九點(diǎn)平滑和歸一化等預(yù)處理。各樣品紅外光譜的一階導(dǎo)數(shù)光譜和二階導(dǎo)數(shù)光譜在Omnic8.0中計算。
判別分析使用SPSS V20.0軟件。以已知病蟲害類別樣品紅外光譜數(shù)據(jù)為判別指標(biāo),采用逐步判別法,選擇判別指標(biāo)挑選方法,依據(jù)Fisher線性判別準(zhǔn)則建立病蟲害類別的判別函數(shù),進(jìn)行樣品病蟲害的預(yù)測診斷。在SPSS V20.0的判別分析模塊中,判別指標(biāo)挑選方法共設(shè)置有5種,即 Wilks’Lambda、Unexplained variance、Mahalanobis distance、Smallest F ratio和 Rao’s V。本研究中,事先將樣品分為訓(xùn)練樣本和測試樣本,從病蟲害樣品中各抽取5個組成訓(xùn)練樣本,共60個樣品。測試樣本由各種病蟲害樣品中余下的組成,共50個樣品。
圖1為蠶豆正常葉片和病蟲害葉片樣品的紅外光譜圖。根據(jù)文獻(xiàn)[12]、[13]將光譜中主要的光譜峰歸納如下:光譜在波數(shù)3 400 cm-1附近的強(qiáng)寬峰為O-H和N-H的伸縮振動吸收;2 958 cm-1和2 876 cm-1附近的弱吸收峰是甲基的C-H反對稱和對稱伸縮振動;2 930 cm-1和2 853 cm-1附近的弱吸收峰是亞甲基的C-H反對稱和對稱伸縮振動;1 740 cm-1附近的弱吸收峰是脂類C=O的伸縮振動;1 644 cm-1附近的強(qiáng)吸收峰是酰胺Ⅰ帶C=O的伸縮振動;1 550 cm-1附近中等強(qiáng)度的吸收峰是酰胺Ⅱ帶N-H和C-N的吸收峰;1 440~1 330 cm-1主要為蛋白質(zhì)、纖維素、木質(zhì)素等受氧、氮原子影響的甲基和亞甲基對稱彎曲振動以及甲基的C-H剪式振動;1 280 cm-1附近出現(xiàn)的吸收峰是酰胺Ⅲ帶C-N的伸縮振動和N-H彎曲振動以及木質(zhì)素中C-O伸縮振動的疊加;位于1 148 cm-1、1 102 cm-1和1 053 cm-1附近的階梯峰,主要?dú)w屬為纖維素、木質(zhì)素等多糖類物質(zhì)C-O和CO-C 的伸縮振動;922 cm-1、670 cm-1、622 cm-1等弱峰為糖環(huán)或長鏈亞甲基中C-C的伸縮振動;836 cm-1附近的弱吸收峰為木質(zhì)素中 C-H平面彎曲振動。上述光譜特征表明蠶豆葉片中主要含蛋白質(zhì)類物質(zhì)、纖維素和木質(zhì)素等多糖類物質(zhì)。
圖1 蠶豆正常葉片和病蟲害葉片樣品的紅外光譜圖Fig.1 FTⅠR spectra for healthy leaves and diseases and pestsinfected broad bean leaves
分別選擇1 800~950 cm-1、1 800~1 200 cm-1、1 800~ 1 500 cm-1、1 500~ 1 200 cm-1和1 200~950 cm-15個不同范圍的測試樣品紅外光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo),按照逐步判別法,選用Wilks’Lambda方法挑選變量,依據(jù)Fisher線性判別準(zhǔn)則建立病蟲害類別的判別函數(shù),對樣品進(jìn)行判別診斷。5個不同范圍的紅外光譜數(shù)據(jù)對蠶豆病蟲害種類的判別分析結(jié)果見表2。由表2可知,1 800~1 200 cm-1光譜范圍的數(shù)據(jù)所建立的判別函數(shù)對測試樣品的診斷效果相對較好,訓(xùn)練樣本回判的正確率為98.3%,測試樣本預(yù)測的正確率為82.0%,總體判別正確率為90.9%。
表2 不同范圍的紅外光譜對蠶豆病蟲害種類的判別分析結(jié)果Table 2 Discriminant analysis of the category of diseases and pests of broad bean based on different range spectrum
分別以各樣品在1 800~1 200 cm-1的紅外光譜、一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜和二階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo),按照逐步判別法,選用Wilks’Lambda方法挑選變量,依據(jù)Fisher線性判別準(zhǔn)則建立病蟲害類別的判別函數(shù)對樣品進(jìn)行判別診斷。3種級別的紅外光譜對蠶豆病蟲害種類的判別分析結(jié)果見表3。在表3中,一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)所建立的判別函數(shù)對訓(xùn)練樣本回判的正確率和對測試樣本預(yù)測的正確率以及總體判別正確率都最高,紅外光譜的次之,且判別正確率與一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜的較接近,表明紅外光譜數(shù)據(jù)和一階導(dǎo)數(shù)光譜數(shù)據(jù)都適合作為蠶豆病蟲害診斷的判別指標(biāo)。導(dǎo)數(shù)光譜能放大光譜特征,同時也會降低光譜的信噪比。不同病蟲害的蠶豆葉片中主要物質(zhì)成分差異不大,光譜信息中反映不同病蟲害的信息相對較弱,導(dǎo)數(shù)光譜放大光譜特征的同時,也會降低甚至掩蓋不同病蟲害的光譜信息。因此,二階導(dǎo)數(shù)光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo)所建立的判別函數(shù),診斷效果較差。相對而言,3種級別的光譜數(shù)據(jù)中,一階導(dǎo)數(shù)光譜數(shù)據(jù)更適合于用作判別指標(biāo)診斷蠶豆病蟲害。
表3 不同級別的紅外光譜對蠶豆病蟲害種類的判別分析結(jié)果Table 3 Discriminant analysis of the category of broad bean diseases and pests based on different level spectrum
以1 800~1 200 cm-1的一階導(dǎo)數(shù)光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo),采用逐步判別法,用不同方法挑選變量,按照Fisher線性判別準(zhǔn)則分別建立判別函數(shù),對樣品進(jìn)行診斷比較。同時采用五折交叉驗證法檢驗不同方法所建立的判別函數(shù)的穩(wěn)定性[17]。由表4可知,5種方法所建立的判別函數(shù)在5種訓(xùn)練樣本情況下對訓(xùn)練樣本的回判正確率都是100%,但對測試樣本的預(yù)測正確率差異明顯。選擇Unexplained variance方法時,預(yù)測正確率最高,為84.8%;選擇Wilks’lambda方法時,預(yù)測正確率次高,為80.0%;選擇Mahalanobis distance方法時,預(yù)測正確率最低,為73.2%。同種方法在五折交叉驗證的不同訓(xùn)練樣本情況下,對測試樣本的預(yù)測正確率差異,反映了這種方法所建立的判別函數(shù)的穩(wěn)定性。選擇Wilks’lambda方法時,5種訓(xùn)練樣本情況下對測試樣本的預(yù)測正確率差異相對最小,說明 Wilks’lambda方法所建立的判別函數(shù)相對最穩(wěn)定。綜合不同方法在5種訓(xùn)練樣本情況下對測試樣本預(yù)測的平均正確率、最高正確率和最低正確率考慮,在用基于一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)的判別分析方法對蠶豆病蟲害進(jìn)行診斷時,選用Unexplained variance逐步判 別法最合適,其次為Wilks’lambda逐步判別法。
表4 挑選判別指標(biāo)不同方法對蠶豆病蟲害種類的判別分析結(jié)果Table 4 Discriminant analysis of the category of broad bean diseases and pests based on ways to choose discriminant indexes
以樣品在1 800~1 200 cm-1的一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo),每種病蟲害選擇5個樣品作為訓(xùn)練樣本,其余樣品作為測試樣本,采用逐步判別法,判別指標(biāo)挑選方法分別選擇Unexplained variance和 Wilks’lambda,按照Fisher線性判別準(zhǔn)則建立病蟲害病原物類別判別函數(shù),對樣品病蟲害病原物類別進(jìn)行診斷,結(jié)果見表5。采用Unexplained variance方法時,訓(xùn)練樣本回判正確率為100%,測試樣本預(yù)測正確率為70.0%,總正確率為86.4%;采用Wilks’lambda方法時,訓(xùn)練樣本回判正確率為98.3%,測試樣本預(yù)測正確率為84.0%,總正確率為91.8%。說明通過樣品的一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)結(jié)合判別分析方法能鑒別蠶豆病蟲害的病原物類別,Wilks’lambda逐步判別法診斷效果相對較好。
表5 一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜對蠶豆病蟲害病原物類別的判別分析結(jié)果Table 5 Discriminant analysis of the category the of pathogen of broad bean diseases and pests based on first derivative spectrum
利用FTIR光譜技術(shù)測試了結(jié)莢期蠶豆正常葉片和11種蠶豆病蟲害葉片共110個樣品的紅外光譜,通過光譜軟件Omnic8.0計算了各樣品的一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜和二階導(dǎo)數(shù)紅外光譜。以紅外光譜數(shù)據(jù)為判別指標(biāo),按照逐步判別法,依據(jù)Fisher線性判別準(zhǔn)則對蠶豆病蟲害種類進(jìn)行診斷研究,比較了5個不同光譜范圍、3種級別光譜、5種判別指標(biāo)挑選方法所建立的判別函數(shù)的鑒別診斷效果,同時按照5折交叉驗證法檢驗了5種判別指標(biāo)挑選方法的穩(wěn)定性。結(jié)果表明,基于蠶豆病蟲害葉片的一階導(dǎo)數(shù)紅外光譜數(shù)據(jù)結(jié)合逐步判別分析法能較好診斷樣品的病蟲害種類和病原物類別,以1 800~1 200 cm-1的光譜數(shù)據(jù)為判別指標(biāo),采用Unexplained variance逐步判別法對病蟲害種類診斷時,正確率相對最高,為93.1%;采用Wilks’lambda逐步判別法對病原物類別診斷時,正確率為91.8%。FTIR光譜技術(shù)具有方便快捷的特點(diǎn),與判別分析方法相結(jié)合,可為蠶豆病蟲害診斷提供一種簡便易行的方法。
逐步判別法是一種有監(jiān)督的模糊識別統(tǒng)計方法,需要根據(jù)已經(jīng)掌握的事物分類情況,對每個類別的若干樣本的特征指標(biāo),按照某種挑選指標(biāo)的方法將樣本的變量信息逐一進(jìn)行檢驗,篩選出對樣本分類影響較大的指標(biāo)建立判別函數(shù),進(jìn)行分類鑒別。因此,使用逐步判別法來對事物進(jìn)行分類鑒別時,必須事先掌握一批按事物特征分類的樣本。蠶豆病蟲害葉片的FTIR光譜是葉片物質(zhì)組分信息的綜合反映,包含著品種、產(chǎn)地、栽培方式、病蟲害等信息。這些信息隱藏在樣品光譜中,相互交織,通過對大量樣品光譜的統(tǒng)計分析,可以挖掘出相關(guān)特征信息用以相關(guān)的識別。基于病蟲害危害葉片F(xiàn)TIR光譜進(jìn)行病蟲害類別判別分析時,為了能建立好的判別模型,準(zhǔn)確區(qū)分病蟲害類別,采集樣本量必須大,且同種病蟲害樣品覆蓋的品種和產(chǎn)地要多,用以建立判別函數(shù)的訓(xùn)練樣本應(yīng)盡量包含各品種和各產(chǎn)地的樣品。在SPSS V20.0判別分析模塊的判別輸出結(jié)果中,對待判樣品的分類判別輸出了2個結(jié)果,即最大可能判別結(jié)果和次大可能判別結(jié)果。本試驗的判別分析結(jié)果,都是按最大可能判別結(jié)果計算的。但我們注意到最大可能判別結(jié)果和次大可能判別結(jié)果相結(jié)合,能幫助提高待判樣品判別結(jié)果的相對準(zhǔn)確性,縮小待判樣品分類所屬范圍。例如在本研究中以1 800~950 cm-1光譜數(shù)據(jù)作為判別指標(biāo),按照Wilks’lambda逐步判別法,依據(jù)Fisher線性判別準(zhǔn)則建立病蟲害種類的判別函數(shù)對樣品進(jìn)行診斷鑒別時,對測試樣本預(yù)測的最大可能判別結(jié)果中判別錯誤的有11個,預(yù)測正確率為78.0%,而在最大可能判別結(jié)果和次大可能判別結(jié)果中都判別錯誤的減少到3個,預(yù)測的相對正確率增加到96.0%。
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