王慶國, 黃 敏*, 朱啟兵, 孫 群
(1.江南大學(xué) 輕工過程先進(jìn)控制教育部重點實驗室,江蘇 無錫214122;2.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院,北京 100193)
玉米(Zea mays L.)是世界總產(chǎn)量最高的糧食作物和主要的畜牧業(yè)飼料來源,也是糧食作物中用途最廣、可開發(fā)產(chǎn)品最多和用量最大的工業(yè)原料,因此確保玉米的質(zhì)量安全顯得尤為重要[1]。在玉米等農(nóng)產(chǎn)品的質(zhì)量與安全監(jiān)督方面,包括中國在內(nèi)的許多國家和國際組織要求對進(jìn)口的玉米等農(nóng)產(chǎn)品必須標(biāo)明原產(chǎn)地,并相繼間建立了完整的質(zhì)量追溯體系及相關(guān)立法。例如,歐盟自1997的瘋牛病事件起便開始建立食品質(zhì)量安全追溯體系,世界衛(wèi)生組織與聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織在2004年合作建立了國際食品安全當(dāng)局網(wǎng)絡(luò),美國也要求所有與食品生產(chǎn)有關(guān)的企業(yè)在2006年必須建立食品質(zhì)量安全可追溯制度[2-3],以便在發(fā)生食品安全事故時迅速確定事故源頭并及時進(jìn)行召回。因此,對農(nóng)產(chǎn)品源產(chǎn)地的鑒別研究具有重要的實際意義。同時,為了保障糧食消費需求、維護(hù)糧食市場穩(wěn)定以及應(yīng)對重大自然災(zāi)害等突發(fā)事件,世界各國也都制定了健全的糧食儲備計劃。我國要求每年按儲備規(guī)模的1/3進(jìn)行輪換,即市場上流通的糧食是來自于不同年份的,因此,對農(nóng)產(chǎn)品年份的鑒別研究也具有重要的意義。
在產(chǎn)地鑒別領(lǐng)域中,礦物元素分析和同位素指紋圖譜技術(shù)是兩種比較傳統(tǒng)的技術(shù)[4-5],它們在鑒別過程需要結(jié)合化學(xué)計量學(xué)方法,準(zhǔn)確性和靈敏度較高,但費用高且鑒別速度慢;近紅外光譜技術(shù)是近幾年發(fā)展起來的一種快速、無損、應(yīng)用廣泛的鑒別技術(shù)[6-8],但用來進(jìn)行產(chǎn)地鑒別研究時,其鑒別結(jié)果易受樣本狀態(tài)和測定條件的影響,靈敏度較低。高光譜圖像技術(shù)融合了圖像技術(shù)和光譜技術(shù)的優(yōu)勢,能夠同時獲取反映待測樣本外部特征、內(nèi)部物理結(jié)構(gòu)及化學(xué)成分的圖像信息和光譜信息,已經(jīng)被廣泛應(yīng)用到農(nóng)產(chǎn)品無損檢測領(lǐng)域,在農(nóng)藥殘留檢測[9]、內(nèi)外部品質(zhì)預(yù)測[10-13]、農(nóng)產(chǎn)品信息診斷[14]等應(yīng)用領(lǐng)域涌現(xiàn)了大量研究成果,但利用高光譜圖像技術(shù)對農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)行產(chǎn)地及年份鑒別的研究卻鮮有報道。作者以玉米種子為研究對象,利用高光譜圖像技術(shù)結(jié)合偏最小二乘判別分析,采用不同的光譜特征及預(yù)處理方式建立了玉米種子的產(chǎn)地與年份鑒別模型,探究了高光譜圖像技術(shù)在產(chǎn)地鑒別中可行性,為農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)地鑒別提供了一種新的技術(shù)參考。
玉米種子樣本:由中國農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院植物遺傳育種學(xué)系提供,分別來自3個不同產(chǎn)地和年份,包括先玉335甘肅2010年(XYGS2010)、先玉 335 甘肅 2011 年(XYGS2011)、先玉335海南2012年(XYHN2012)、鄭單958北京2011年 (ZDBJ2011)、 鄭 單 958北 京 2012年(ZDBJ2012)、 鄭單 958 甘肅 2010 年(ZDGS2010)、鄭單958甘肅2011年 (ZDGS2011)。其中每類80粒,共560粒玉米種子樣本。
實驗所用高光譜成像系統(tǒng)由硬件和軟件兩部分組成。硬件部分由光源模塊、樣本輸送平臺、圖像采集模塊和計算機(jī)構(gòu)成,系統(tǒng)結(jié)構(gòu)見圖1。其中光源模塊包括150 W可調(diào)功率光纖鹵素?zé)?(150 W EKE,3250K(#20094145),Techniquip,USA)、光纖和線光裝置;圖像采集模塊包括鏡頭(10004A-21226 Lens,F(xiàn)/1.4 FL23mm,Standard Barrel,C -Mount,USA)、光譜儀(1003A-10140 HyperspcTM VNIR CSeries,Headwall Photonics Inc.,USA)、CCD 相 機(jī)(pixelfly qe IC*285AL,Cooke,USA)和 CCD 控制器,其中光譜儀的狹縫寬度為25 um,光譜范圍為400~1 000 nm,光譜分辨率為1.29 nm,采樣波段間隔為0.64 nm/pixel,空間分辨率為0.15mm。圖像采集軟件為Hyperspectral Scanning and Image Rendering Software,Rev A.2.1.3 (Headwall Photonics Inc.,USA),曝光時間、掃描步長、掃描寬帶和光譜壓縮倍數(shù)(binning)由采集軟件控制。
圖1 高光譜成像系統(tǒng)Fig.1 Hyperspectral imaging system
為了在圖像不失真的前提下獲得最佳的圖像采集效果,在圖像采集之前需要對高光譜成像系統(tǒng)進(jìn)行校正和調(diào)試,確定出最佳系統(tǒng)參數(shù)如下:曝光時間250 ms,物距25 cm,線掃描步長80 um,掃描寬度30 mm,binning設(shè)置為4,即實際波段間隔為2.56 nm,在400~1 000 nm波長范圍內(nèi)共獲得233個波段。采集結(jié)束時得到大小為375×1 392×233的圖像立方體。圖像采集時將玉米樣本放置在黑色載物板上,整個采集過程在密閉黑箱中進(jìn)行以減弱外部光源的干擾。為降低光源變化及系統(tǒng)噪聲的影響,每隔4幅圖像采集一次標(biāo)準(zhǔn)白板和全黑標(biāo)定圖像對原始圖像進(jìn)行校正,校正公式為
式中,Rc為校正圖像;Rs為原始圖像;Rw和Rb分別為標(biāo)準(zhǔn)白板和黑板圖像。后續(xù)圖像處理與分析均在Rc上進(jìn)行。
高光譜圖像中包含了二維的空間信息(x×y)和一維的光譜信息(λ),通常包含數(shù)百個波段的光譜信息,直接對如此龐大的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理是非常繁瑣和費時的,因此作者通過特征提取的方式來降低數(shù)據(jù)維度及處理復(fù)雜度。首先利用主動輪廓模型(Active Contour Model,ACM)對高光譜圖像進(jìn)行分割,確定玉米種子目標(biāo)區(qū)域,然后對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行特征提取。
1.4.1 ACM圖像分割 ACM是Kass等提出的一種經(jīng)典圖像分割算法,Caselles等將水平集方法應(yīng)用到主動輪廓描述和模型求解中[15-17]。結(jié)合水平集方法的ACM圖像分割算法,具有較強(qiáng)的抗噪性能,對弱邊界條件下的多目標(biāo)輪廓提取效果顯著[18-19],該模型的能量泛函為:
式中,c1和c2分別為輪廓線C內(nèi)部區(qū)域和外部區(qū)域的平均灰度;μ,v≥0,λ1、λ2為正的權(quán)重因子。長度項Length(C)用于控制輪廓線的光滑度,面積項Area(C)用于控制輪廓線的規(guī)則度。
對玉米種子高光譜圖像進(jìn)行輪廓提取時,首先在待分割玉米種子圖像上定義初始演化曲線,通過最小化能量泛函的方式,驅(qū)動演化曲線不斷向玉米種子輪廓邊緣逼近,直到演化曲線收斂到玉米種子輪廓邊緣或者達(dá)到預(yù)先設(shè)定的迭代次數(shù),并以最終演化曲線內(nèi)部區(qū)域為玉米種子目標(biāo)區(qū)域。圖2為對XYGS2011在707 nm波段下的分割結(jié)果,演化曲線最終精確的收斂到玉米種子輪廓邊緣上。
圖2 XYGS2011在707 nm波段下的分割結(jié)果Fig.2 Results of XYGS2011 in wavelength 707 nm
1.4.2 特征提取 在農(nóng)產(chǎn)品無損檢測和品質(zhì)預(yù)測中,特征的選擇是影響最終檢測或預(yù)測結(jié)果的關(guān)鍵因素之一[20-21]。基于統(tǒng)計學(xué)的均值和標(biāo)準(zhǔn)差是對原始光譜信息的最直觀反映,在變化趨勢上與原始信息具有較好的一致性?;诨叶戎狈綀D的熵和能量特征主要反映了被測目標(biāo)的紋理變化,與顏色和大小特征相比,紋理特征中關(guān)于被測物體的化學(xué)和物理屬性信息更為豐富[20]。熵E和能量P的定義分別為:
式中,M、N分別為玉米種子在水平和垂直方向上的像素數(shù)目。在400~1 000 nm波長范圍內(nèi)共233個波段下,共提取了玉米種子目標(biāo)區(qū)域的均值、標(biāo)準(zhǔn)差、熵和能量4個特征,對不同特征在產(chǎn)地和年份的鑒別能力上做了比較研究,并從實際應(yīng)用的角度出發(fā),選出了更適合實際應(yīng)用的特征用于最優(yōu)模型的建立。
光譜預(yù)處理的目的是降低原始光譜中基線漂移、光線散射及樣本不均勻等環(huán)境和儀器噪聲的影響,以增強(qiáng)模型的預(yù)測能力,在用于對農(nóng)產(chǎn)品和食品化學(xué)成分含量及品質(zhì)預(yù)測的偏最小二乘回歸(Partial Least Squares Regression,PLSR)、 多元線性回歸(Multiple Linear Regression,MLR)、偏最小二乘支持向量機(jī) (Partial Least Squares Support Vector Machine,LSSVM)中應(yīng)用廣泛[22-23]。探究了不同的預(yù)處理方式對偏最小二乘判別分析 (Partial Least Squares Discriminant Analysis,PLSDA)模型的影響,分別使用了基線補(bǔ)償(Baseline Offset,BOS)、去趨勢(Detrending,DET)、 多 元 散 射 校 正 (Multiplicative Scatter Correction,MSC)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量(Standard Normal Variate,SNV)、SG 導(dǎo) 數(shù) (Savitzky-Golay Derivative,SG Der)對光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。
PLSDA是一種基于PLSR的多變量鑒別分析方法,在光譜數(shù)據(jù)的分類和判別問題中有廣泛的應(yīng)用。作為一種有監(jiān)督分類方法,PLSDA利用PLSR建立自變量(樣本光譜特征)和因變量(類別屬性)間的關(guān)系模型,通過比較預(yù)測值的大小來確定樣本的所屬類別。在先前的多類別分類研究中,PLSDA模型表現(xiàn)出了優(yōu)異的鑒別性能[18-19]。在建立PLSDA模型之前,使用四選一隨機(jī)劃分方式將所有樣本分為訓(xùn)練集和測試集兩部分,其中全部樣本的3/4為訓(xùn)練集樣本,剩余的1/4為測試集樣本。為了降低樣本集劃分對鑒別結(jié)果的影響,分別使用4次不同的四選一樣本劃分集建立模型,并取4次結(jié)果的平均值作為最終鑒別結(jié)果。
由圖3可以看出,經(jīng)過ACM圖像分割之后,每一粒玉米種子被精確的從背景中分離出來,相比手動選取感興趣區(qū)域的方式,很大程度上避免了人為因素對實驗結(jié)果的影響。在分割出的玉米種子目標(biāo)區(qū)域上分別提取均值、標(biāo)準(zhǔn)差、熵和能量特征,不同產(chǎn)地和年份的玉米種子在各特征下的類內(nèi)均值曲線見圖3a~d所示。可以看出,熵特征的類間離散度最為明顯,即熵特征能更好的表征玉米種子的產(chǎn)地和年份差異。而均值、標(biāo)準(zhǔn)差和能量特征曲線中,個別幾類的分布較為集中,從視覺上無法直接看出它們對玉米種子表達(dá)能力的不同,因此,需要通過進(jìn)一步的建模分析來確定不同特征鑒別能力的差別。
圖3 光譜特征曲線Fig.3 Spectral characteristic curves
分別將4個特征做為模型的輸入建立PLSDA模型,鑒別結(jié)果見表1。分析表1可知,不同特征對玉米籽粒的描述能力存在差異性。在本研究中,基于均值和熵特征的模型精度要高于能量特征,方差模型的鑒別精度最低(90.36%)。熵模型的訓(xùn)練精度最高(99.82%),但對未知樣本的預(yù)測能力卻低于均值模型。原因可能在于熵特征反映的是玉米種子紋理的變化,而紋理變化是玉米種子內(nèi)部物理化學(xué)成分變化的間接體現(xiàn),與對原始光譜信息的直接統(tǒng)計平均相比,在對不同類別間玉米種子物理化學(xué)差異的敏感性上熵要低于均值特征[20]。綜合以上分析,同時考慮到在實際應(yīng)用中的計算復(fù)雜度,作者選取均值為最佳鑒別特征。
表1 不同特征的PLSDA模型精度Table 1 PLSDA model accuracy of different features
圖 4(a)~(f)為從預(yù)測集中隨機(jī)選取的 20 粒玉米種子的原始光譜(RAW)和不同預(yù)處理方式下的光譜曲線。可以看出,DET、MSC、SG導(dǎo)數(shù)和SNV有效減弱了散射的影響,同時,經(jīng)過MSC和SNV處理后的數(shù)據(jù)與RAW在變化趨勢上保持了較好的一致性,而經(jīng)過非線性趨勢消除(DET)和二階SG導(dǎo)數(shù)處理后的光譜與RAW差異性較大?;€補(bǔ)償是對樣本光譜值做減去最小值處理,因此,這種預(yù)處理方式的光譜在曲線變化趨勢及分布上都與原始光譜較為接近。為了探究不同預(yù)處理方式對模型的影響,利用不同預(yù)處理后的光譜數(shù)據(jù),分別建立PLSDA模型,最終結(jié)果見表2。
圖4 原始光譜與不同預(yù)處理方式的光譜曲線Fig.4 Curve for RAW and different preprocessing methods
從表2可以看出,對于不同的特征,不同的預(yù)處理方式對模型的影響也存在差異。在最佳鑒別特征均值模型中,除了基線補(bǔ)償外,其他預(yù)處理方式的模型精度都等于或高于未做預(yù)處理的模型,但只有基于SNV模型的預(yù)測能力有所提高。在其他特征模型中,只有基于SNV處理的熵特征模型和基線補(bǔ)償處理的能量特征模型的預(yù)測能力高于原始特征模型。原因可能是不同的預(yù)處理方式對不同的特征在消除隨機(jī)噪聲和儀器影響的同時,一部分有用信息也被濾除了[22]。因此綜合考慮將SNV做為最佳預(yù)處理方式。
表2 不同預(yù)處理方式的模型精度Table 2 Model accuracy of different preprocessing method
將經(jīng)過SNV處理的最佳鑒別特征作為PLSDA模型的輸入,建立產(chǎn)地與年份鑒別模型,訓(xùn)練集和測試集精度分別達(dá)到了99.11%和98.39%,各類的判別結(jié)果見表3。其中ZDBJ2012等5類的鑒別精度接近或達(dá)到了100%,只有XYGS2010和XYGS2011的精度相對較低。通過對表3的進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),錯誤判別集中出現(xiàn)在XYGS2010和XYGS2011兩類之間。這兩類只有在年份上存在差異,造成誤判的主要原因可能是同一產(chǎn)地的土壤和氣候條件相同,不同年份間的光照、積溫及降水等條件較為接近,反映到玉米種子高光譜圖像中的特征差異性較小,在鑒別過程中兩者相互干擾從而發(fā)生誤判[24]。這說明年份信息在一定程度上會對總體鑒別結(jié)果產(chǎn)生干擾,為了探究年份信息對模型的影響,作者又對在不考慮年份特征下的玉米種子產(chǎn)地鑒別做了研究。
表3 產(chǎn)地與年份鑒別模型判別結(jié)果Table 3 Discriminant result for geographical origin and years identification
首先將相同產(chǎn)地不同年份的同種玉米種子歸為一類,即XYGS2010和XYGS2011、ZDGS2010和ZDGS2011、ZDBJ2011和 ZDBJ2012組合為一類,XYHN2012看作一類,同樣利用經(jīng)過SNV預(yù)處理的最佳特征建立PLSDA模型。結(jié)果顯示,訓(xùn)練集和測試集精度分別達(dá)到了100.00%和99.64%,高于產(chǎn)地與年份鑒別模型。因此,忽略年份特征時,在一定程度上有助于提高產(chǎn)地鑒別的模型精度。
不同生態(tài)區(qū)的玉米種子因土壤、地形、光照和積溫等條件的不同,其內(nèi)部有機(jī)組成和礦質(zhì)元素含量等存在一定的差異性。作者利用這種差異性特征信息,結(jié)合高光譜圖像技術(shù)建立了玉米種子的產(chǎn)地和年份鑒別模型,并對不同的特征和光譜預(yù)處理方式做了研究。結(jié)果表明,產(chǎn)地和年份鑒別的訓(xùn)練集和測試集精度分別達(dá)到了99.11%和98.39%,在忽略年份信息時鑒別效果更佳。但限于樣本種類及數(shù)量,模型的有效性和穩(wěn)健性還有待驗證。同時為了適應(yīng)工業(yè)化應(yīng)用需求,在特征提取方法、數(shù)據(jù)處理與分析及波段選擇等方面還需要做進(jìn)一步的研究。
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