此書(shū)是WILEY從書(shū)“生物信息學(xué):計(jì)算技術(shù)與應(yīng)用”中的一本。蛋白質(zhì)生物信息學(xué)在生物醫(yī)藥研發(fā)中具有廣泛的應(yīng)用,比如先導(dǎo)化合物設(shè)計(jì)、分子對(duì)接、藥理活性預(yù)測(cè)等等。本書(shū)匯集了蛋白質(zhì)生物信息學(xué)領(lǐng)域最為前沿的主題,既有對(duì)技術(shù)演變的解析,也有很多具體的應(yīng)用實(shí)例。
本書(shū)共有5大部分26章。第1部分 從蛋白質(zhì)序列到結(jié)構(gòu),含第1-5章:1.蛋白質(zhì)技術(shù)成為研究植物發(fā)育遺傳的重要工具;2.蛋白質(zhì)序列主題信息的搜尋;3.識(shí)別蛋白質(zhì)的鈣結(jié)合位點(diǎn);4.綜述:利用非平衡數(shù)據(jù)學(xué)習(xí)方法進(jìn)行蛋白質(zhì)甲基化預(yù)測(cè);5.蛋白質(zhì)翻譯后修飾位點(diǎn)的分析和預(yù)測(cè)。第2部分 蛋白質(zhì)化學(xué)分析和測(cè)試,含第6-12章:6.蛋白質(zhì)局部結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè);7.預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的邊界;8.預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的RNA結(jié)合位點(diǎn);9.檢測(cè)蛋白質(zhì)二硫鍵連接方式的算法框架;10.蛋白質(zhì)接觸序的預(yù)測(cè)技術(shù)進(jìn)展;11.預(yù)測(cè)半胱氨酸氧化狀態(tài)的計(jì)算策略;12.冷凍電鏡三維結(jié)構(gòu)重構(gòu)的計(jì)算方法。第3部分 蛋白質(zhì)序列比對(duì)及其評(píng)估,含第13-17章:13.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對(duì)的基礎(chǔ)知識(shí);14.發(fā)掘蛋白質(zhì)3D結(jié)構(gòu)來(lái)優(yōu)化結(jié)構(gòu)比對(duì);15.搜尋非序列性蛋白結(jié)構(gòu)相似性的算法方法論;16.利用分形方法來(lái)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)類屬和功能;17.蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)評(píng)估。第4部分 生物網(wǎng)絡(luò)中的蛋白質(zhì)相互作用,含第18-22章:18.蛋白質(zhì)相互作用的網(wǎng)絡(luò)算法;19.識(shí)別蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中的蛋白復(fù)合物;20.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中的功能模塊分析;21.代謝網(wǎng)絡(luò)的高效比對(duì);22.蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的比對(duì):算法和工具。第5部分 蛋白質(zhì)生物信息學(xué)的應(yīng)用,含第23-26章:23.用支持向量機(jī)進(jìn)行蛋白質(zhì)分子與藥物的活性匹配;24.尋找生物網(wǎng)絡(luò)中的重復(fù)區(qū):挑戰(zhàn)、趨勢(shì)與應(yīng)用;25.MeTaDoR: 生物膜外周靶向蛋白的網(wǎng)絡(luò)資源和預(yù)測(cè)服務(wù);26.基于生物網(wǎng)絡(luò)的基因表達(dá)特征分析。
潘毅是美國(guó)喬治亞州立大學(xué)計(jì)算機(jī)系的教授和系主任,中國(guó)長(zhǎng)沙中南大學(xué)客座教授。他的研究興趣是云計(jì)算、無(wú)線網(wǎng)絡(luò)和生物信息學(xué)。目前發(fā)表了200余篇研究論文。
本書(shū)兼具系統(tǒng)性和深入性,每章都是由數(shù)位專家精心撰寫(xiě),適合生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)領(lǐng)域人員參考。
魏玉保,博士生
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