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        pp3501抑制肝癌細胞生長的初步研究

        2014-12-02 03:15:24劉慧明張海濤
        醫(yī)學研究生學報 2014年3期
        關鍵詞:蛋白激酶殘基磷酸化

        劉慧明,丁 航,張海濤

        0 引 言

        化療是肝細胞癌 (hepatocellular carcinoma cells,HCC)最常用的治療手段,但化療毒性限制其應用。腫瘤治療的突破很可能依賴于新型藥物的開發(fā)和基因治療技術的成熟,尋找新的適合基因作為靶基因?qū)⑹腔蛑委煹囊粋€重要方向。

        pp3501最早是Wan等[1]報道,他們利用大規(guī)模cDNA轉(zhuǎn)染法,在基因組水平上對影響肝癌細胞生長的基因進行功能掃描,搜索了大量對細胞生長有影響的相關基因,共獲得3806個基因,并將這些基因分別標記,其中1個序列標記為pp3501,并在Genbank登記了pp3501 mRNA的序列。目前pp3501的功能尚不明確,本研究探討pp3501對肝癌細胞生長的影響。

        1 材料與方法

        1.1 細胞培養(yǎng) 3株肝癌細胞系(HepG2、Hep3B和PLC/PRF/5)購自American type culture collection(Rockville,MD,USA),保存在廣東醫(yī)學院生物化學與分子生物學研究所。所用細胞系均用含10%胎牛血清(杭州四季青)的Dulbecco's modified Eagle培養(yǎng)基(Gibco BRL,Grand Island,NY,USA)并加入青霉素(100 U/mL)和鏈霉素(100 μg/mL)于37℃、5%CO2環(huán)境培養(yǎng)。3株肝癌細胞系分別設空白組、對照組(轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒pEGFPN1入HCC細胞)、pp3501組(將 pEGFPN1-pp3501轉(zhuǎn)染入HCC細胞)。

        1.2 試劑 MTT,propidium iodide購自 Sigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)。兔抗或羊抗等一抗和相應二抗購自Santa Cruz Biotechnology(Santa Cruz Biotechnology,CA,USA),EcoR I、Sal I內(nèi)切酶。

        1.3 pEGFPN1-pp3501重組質(zhì)粒的構建 PCR擴增pp3501開放閱讀框序列,并在上下游引物中分別加上EcoR I,Sal I酶切位點。上游引物:5'-GATCCGAATTCACCATGGTTTTAGCAGATGC-3',下 游 引物:5'-TGTCGACGGGTCTTGCACGTGTCAC-3'。反應條件:94℃變性3 min,進入循環(huán),94℃ 30 s,56℃30 s,72℃ 30s,30 個循環(huán),72℃ 5min。普通瓊脂糖電泳鑒定,并用 QIAquick?Gel Extraction Kit試劑盒切膠回收。雙酶切pp3501回收產(chǎn)物(EcoR I,Sal I),酚/氯仿法進行純化。同時對pEGFPN1質(zhì)粒行雙酶切(EcoR I,Sal I)和純化。將酶切回收的pp3501和pEGFPN1質(zhì)粒進行連接。DNA重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸埃希菌DH5а,篩選陽性克隆,提取質(zhì)粒DNA,重組質(zhì)粒測序鑒定送北京奧科生物工程公司測序。

        1.4 MTT檢測細胞生長曲線 HCC細胞(1.0×103)接種在96孔板培養(yǎng)板,連續(xù)培養(yǎng)5 d。每隔1 d取樣,加入10 μL 5 mg/mL MTT溶液。37℃培養(yǎng)4 h后,用100μL含20%SDS的50%二甲基酰胺溶液溶解細胞。用Varioskan Flash Reader spectrophotometer(THERMO,MA,USA)于570 nm 檢測 A值[2-4]。

        1.5 平板克隆形成實驗 取對數(shù)生長期的肝癌細胞,用0.25%胰蛋白酶消化并吹打成單個細胞,把細胞懸浮在10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液中備。按每孔100個細胞接種于6孔培養(yǎng)板中,并輕輕轉(zhuǎn)動,使細胞分散均勻。置37℃、5%CO2及飽和濕度的環(huán)境下,靜置培養(yǎng)2周。當培養(yǎng)皿中出現(xiàn)肉眼可見的克隆時,終止培養(yǎng)。棄上清液,用PBS浸洗2次。加純甲醇或1∶3醋酸/甲醇5 mL,固定15 min。然后去固定液,加適量0.4%結晶紫應用染色液染10~30 min,然后用流水緩慢洗去染色液,空氣干燥。將平皿倒置并疊加一張帶網(wǎng)格的透明膠片,用肉眼直接計數(shù)克隆或在顯微鏡(低倍鏡)計數(shù)大于10個細胞的克隆數(shù)。最后計算克隆形成率。

        克隆形成率=(克隆數(shù)/接種細胞數(shù))×100%

        1.6 Western blot檢測DAPK磷酸化變化 細胞用裂解緩沖液[50 mmol/L Tris-HCl,150 mmol/L NaCl,5mmol/L EDTA,1%NP40,0.05%(PMSF),2μg/mL aprotinin(Sigma,USA),2μg/mL leupeptin(Sigma,USA),pH 8.0)]處理。按前述方法進行 Western blot檢測[5-6],發(fā)光試劑用Amersham Biosciences公司產(chǎn)品。

        1.7 統(tǒng)計學分析 數(shù)據(jù)采用SPSS17.0軟件進行統(tǒng)計分析。定量檢測結果用均數(shù)±標準差(±s)表示。方差齊性分析后用多重比較檢測,以P≤0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結 果

        2.1 pEGFPN1-pp3501重組表達質(zhì)粒的PCR鑒定pp3501重組表達質(zhì)粒經(jīng)特異性引物的初步鑒定成功擴增出pp3501基因的開放閱讀框片段,大小為432 bp,測序公司檢測的序列是互補鏈,互補鏈的堿基序列見圖1。測序結果經(jīng)比對(GeneBank Accession:EU375738.1,GI:165 975 384;http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU375 738.1),與預期的pp3501開放閱讀框序列完全一致,大小為432 bp,無移碼突變,載體構建成功。

        圖1 pEGFPN1-pp3501重組質(zhì)粒PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖Figure 1 Agarose gel electrophoresis of the PCR products of pEGFPN1-pp3501 plasmid

        2.2 pp3501抑制HCC細胞增殖 轉(zhuǎn)染了pp3501的肝癌細胞生長曲線明顯遲緩于對照組??寺⌒纬蓪嶒灡砻鬓D(zhuǎn)染pp3501的肝癌細胞克隆數(shù)(HepG2、Hep3B、PLC/PRF/5 分別為 48.0%、40.3%、42.2%)較對照組細胞(91.8%、80.1%、80.5%)顯著下降 ,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見圖2、圖3。

        圖2 pp3501對不同肝癌細胞生長的影響Figure 2 Effect of pp3501 on the growth of hepatocellular carcinoma cells

        圖3 pp3501抑制肝癌細胞克隆形成(n=4)Figure 3 Inhibitory clone formation of hepatocellular carcinoma cells(n=4)

        2.3 pp3501對肝癌細胞表達死亡相關蛋白激酶(death-assocoated protein kinase,DAPK)的影響轉(zhuǎn)染pp3501基因的細胞的DAPK磷酸化水平降低,總的DAPK水平不變,提示DAPK被激活。結果見圖4-圖6。

        圖4 pp3501對肝癌細胞DAPK表達水平的影響Figure 4 Effect of pp3501 on the DAPK expression levels in hepatocellular carcinoma cells

        圖5 灰度值分析DAPK磷酸化水平Figure 5 Gray value analysis of DAPK phosphorylation levels

        圖6 灰度值分析DAPK表達水平Figure 6 Gray value analysis of DAPK expression levels

        3 討 論

        我們用限制性顯示PCR技術分析丁酸鈉處理Raji細胞前后基因表達變化時,發(fā)現(xiàn)其中一條來自19號染色體的表達序列與預測蛋白pp3501的基因序列相同[7]。根據(jù)我們的研究結果申請登錄了該基因序列,Genbank登錄號:EU375 738(GeneBank Accession:EU375 738.1,GI:165 975 384;http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU375738.1)。

        pp3501基因的開放閱碼框有432 bp,編碼的蛋白質(zhì)由143氨基酸殘基組成。ProtParam軟件分析顯示pp3501蛋白的理論相對分子質(zhì)量為15739.7,理論等電點為11.60,是堿性蛋白。用Hopfield神經(jīng)網(wǎng)絡預測蛋白質(zhì)二級結構,提示pp3501蛋白具有3個螺旋區(qū)域和6個 β折疊區(qū)域,無跨膜結構。ProtScale程序分析給出pp3501蛋白疏水區(qū)域最大值是1.489,位于90~100氨基酸殘基區(qū)域,最小值為-2.911,提示pp3501應是親水性蛋白。

        NetPhos 2.0 Server軟件分析pp3501蛋白序列提示,第11、87、129位絲氨酸殘基和第41、135位蘇氨酸殘基是潛在的被絲氨酸/蘇氨酸激酶磷酸化位點。NetPhosK 1.0軟件分析進一步提示pp3501是多種蛋白激酶潛在的磷酸化底物。其中11位絲氨酸殘基是潛在的p38MAPK、周期素依賴性蛋白激酶5、糖原合酶激酶3磷酸化位點;24、117位蘇氨酸殘基和68、107、129位絲氨酸殘基是潛在的蛋白激酶C磷酸化位點;此外,68位絲氨酸殘基也是潛在的DNA依賴的蛋白激酶磷酸化位點;129位絲氨酸殘基也是潛在的蛋白激酶A磷酸化位點;41位蘇氨酸殘基是潛在的蛋白激酶G磷酸化位點。87位絲氨酸殘基和135位蘇氨酸殘基是潛在的Ca2+/CaM依賴性蛋白激酶Ⅱ的磷酸化位點。生物信息學預測pp3501具有多個蛋白激酶的磷酸化位點,提示pp3501可能具有不同的生物學功能,這均需要進一步實驗驗證。過表達pp3501的肝癌細胞生長曲線明顯遲緩于對照組。相應的肝癌細胞克隆數(shù)比對照組細胞顯著下降。這提示,pp3501能抑制肝癌細胞增殖,并同時觀察到DAPK磷酸化水平下降。DAPK磷酸化降低意味DAPK活性增強[8]。

        以往的研究證實,DAPK的表達水平變化與腫瘤的發(fā)生發(fā)展、腫瘤轉(zhuǎn)移密切相關[9-11]。這提示轉(zhuǎn)染pp3501的肝癌細胞,雖然不影響DAPK表達水平,但激活DAPK抑制肝癌細胞增殖。

        DAPK是由Kimchi等發(fā)現(xiàn)的凋亡促進因子[12-13]。DAPK 轉(zhuǎn)錄成熟的 mRNA 為 5900 kb,編碼蛋白相對分子質(zhì)量為160 000。DAPK含多個功能區(qū)域,包括一個核心的催化區(qū)域,一個緊鄰的鈣調(diào)蛋白結合區(qū)域,一個由8個重復的錨定蛋白組成的區(qū)域[由33個氨基酸殘基組成的重復序列,參與蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用)、一個P-loops環(huán)(一種單核苷酸結合基序)、一個細胞骨架結合區(qū)域和一個死亡結構區(qū)域(DD區(qū)域)]。目前研究發(fā)現(xiàn),DAPK可通過2種方式調(diào)控其活性。一種是鈣調(diào)區(qū)域的自身磷酸化的自我抑制調(diào)節(jié)作用。磷酸化不僅調(diào)節(jié)酶的催化活性,也調(diào)節(jié)酶在體內(nèi)的功能,這一點在細胞作用中是很關鍵的。另一種自身抑制機制與C末端的17個氨基酸殘基有關,雖然目前對它活動的分子機制知之甚少,但它可能為特定藥物的研發(fā)提供一個基礎[14-16]。

        過表達pp3501抑制肝癌細胞增殖同時能激活DAPK,但pp3501如何激活DAPK,其抑制肝癌細胞增殖是否依賴于DAPK激活尚待進一步實驗證實。

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