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        基于磷脂脂肪酸提取方法的微生物群落結(jié)構(gòu)研究

        2014-11-15 02:04:08李范
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年9期
        關(guān)鍵詞:土壤

        摘要:選取川西高原土壤和凋落物作為研究對(duì)象,分別取1、3、5、8、10 g土壤和0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g凋落物用于PLFA(磷脂脂肪酸)的提取。經(jīng)試驗(yàn)確定,土壤和凋落物用于PLFA提取的最佳提取量分別為8 g和1.0 g,用超聲波提取替代振蕩提取,縮短了PLFA方法的提取時(shí)間。進(jìn)一步分析土壤和凋落物中微生物群落結(jié)構(gòu)信息,結(jié)果表明,相同環(huán)境下土壤和凋落物中大部分微生物類(lèi)群的種類(lèi)和含量都十分接近,革蘭氏陽(yáng)性菌比革蘭氏陰性菌更有優(yōu)勢(shì),厭氧菌比好養(yǎng)菌更加活躍。

        關(guān)鍵詞:土壤;凋落物;PLFA(磷脂脂肪酸);微生物群落結(jié)構(gòu)

        中圖分類(lèi)號(hào): S154.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)09-0323-03

        收稿日期:2013-10-30

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金 (編號(hào):31170916 );中國(guó)科學(xué)院儀器設(shè)備功能開(kāi)發(fā)技術(shù)創(chuàng)新項(xiàng)目(編號(hào):yg20110708)。

        作者簡(jiǎn)介:李范(1988—),男,四川自貢人,碩士研究生,主要研究方向?yàn)橥寥牢⑸铩-mail:554063409@qq.com。

        通信作者:李萍,博士,教授,碩士生導(dǎo)師。E-mail:wuping4535@sina.com。 土壤和凋落物中存在極其豐富的微生物,它們直接影響著土壤的結(jié)構(gòu)、肥力以及養(yǎng)分轉(zhuǎn)化等,通過(guò)磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)方法可以對(duì)微生物群落進(jìn)行定量分析。本研究首次采用超聲波方法提取森林土壤及凋落物中PLFA,探討各提取條件得到的PLFA含量差異,并分析森林土壤和凋落物間微生物群落結(jié)構(gòu)及其相互作用。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)土壤與凋落物均取自中國(guó)科學(xué)院茂縣山地生態(tài)系統(tǒng)定位研究站,地理坐標(biāo)(31°41′N(xiāo),103°53′ E),屬暖溫帶亞高山季風(fēng)氣候,冬季寒冷干燥、夏季多雨,土壤pH值為5.8~60,年平均溫度為8.9 ℃,年降水量919.5 mm。取表層0~20 cm 土壤并混勻,過(guò)2 mm篩,去掉石塊植物殘根等雜物,裝入塑封袋后置于放有冰袋的泡沫箱運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,于-70 ℃保存,7 d內(nèi)完成PLFA測(cè)定。

        凋落物收集于分解試驗(yàn)開(kāi)始前半年進(jìn)行,樣方內(nèi)均勻設(shè)置凋落物收集框,框的大小為2 m(長(zhǎng))×2 m(寬)×20 cm(高),底部安裝有孔徑為8 mm的尼龍網(wǎng)。收集時(shí)間為1個(gè)季度,將收集到的凋落物樣品去除網(wǎng)內(nèi)雜物,將枝葉以枝與葉的重量比為1 ∶1的比例混合均勻,將收集到的凋落物放入分解袋,再將分解袋放置在采樣地表周?chē)?,本次試?yàn)采用的塑料網(wǎng)袋為20(長(zhǎng)) cm×20(寬) cm、網(wǎng)眼為1 mm,并在下一季度取回,低溫保存帶回實(shí)驗(yàn)室,測(cè)重后將凋落物碾碎進(jìn)行磷脂脂肪酸分析。

        1.2試驗(yàn)方法

        為了確定土壤跟凋落物中PLFA的最適提取量,土壤分別取1、3、5、8、10 g,凋落物分別取0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g用于PLFA的提取,加入足量的提取劑 (25 mL),保證不同樣品量的凋落物和土壤都能得到充分的提取,進(jìn)而確定各自最佳取樣量。

        為了確定提取方法對(duì)提取效率的影響,同時(shí)為了驗(yàn)證超聲波提取樣品中的PLFA能否在傳統(tǒng)振蕩提取的基礎(chǔ)上用更短的時(shí)間提出PLFA,本試驗(yàn)采用有機(jī)質(zhì)含量較高的黑土作為研究對(duì)象,具體方法為:第1次提取,振蕩時(shí)間設(shè)120 min,超聲時(shí)間分別設(shè)20、30、40、50、60 min,第2次提取方法與第1次提取方法相同,提取時(shí)間分別減半。用2次提取的PLFA總含量來(lái)衡量提取效率。

        從-70 ℃的冰箱中取出經(jīng)冷凍干燥的土壤及掉落物,用氯仿-甲醇-檸檬酸緩沖液( 體積比為1:2:0.8)作提取劑振蕩提取脂類(lèi)[1],再用100 μL 25 mg/L的C19做內(nèi)標(biāo)溶解氮吹干的脂肪酸甲酯,通過(guò)帶有MIDI峰識(shí)別軟件的Agilent N6850氣相色譜進(jìn)行分析。

        2試驗(yàn)結(jié)果

        2.1土壤中PLFA含量的分析

        在3 g土壤中檢測(cè)得到的單體PLFA數(shù)為24個(gè),而在8 g土壤中則增加到了29個(gè),10 g土壤中單體PLFA的數(shù)量比 3 g 土壤中多6個(gè),在土壤小于8 g時(shí),檢測(cè)到的PLFA數(shù)量隨著土壤量的增加而增加(表1)endprint

        摘要:選取川西高原土壤和凋落物作為研究對(duì)象,分別取1、3、5、8、10 g土壤和0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g凋落物用于PLFA(磷脂脂肪酸)的提取。經(jīng)試驗(yàn)確定,土壤和凋落物用于PLFA提取的最佳提取量分別為8 g和1.0 g,用超聲波提取替代振蕩提取,縮短了PLFA方法的提取時(shí)間。進(jìn)一步分析土壤和凋落物中微生物群落結(jié)構(gòu)信息,結(jié)果表明,相同環(huán)境下土壤和凋落物中大部分微生物類(lèi)群的種類(lèi)和含量都十分接近,革蘭氏陽(yáng)性菌比革蘭氏陰性菌更有優(yōu)勢(shì),厭氧菌比好養(yǎng)菌更加活躍。

        關(guān)鍵詞:土壤;凋落物;PLFA(磷脂脂肪酸);微生物群落結(jié)構(gòu)

        中圖分類(lèi)號(hào): S154.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)09-0323-03

        收稿日期:2013-10-30

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金 (編號(hào):31170916 );中國(guó)科學(xué)院儀器設(shè)備功能開(kāi)發(fā)技術(shù)創(chuàng)新項(xiàng)目(編號(hào):yg20110708)。

        作者簡(jiǎn)介:李范(1988—),男,四川自貢人,碩士研究生,主要研究方向?yàn)橥寥牢⑸?。E-mail:554063409@qq.com。

        通信作者:李萍,博士,教授,碩士生導(dǎo)師。E-mail:wuping4535@sina.com。 土壤和凋落物中存在極其豐富的微生物,它們直接影響著土壤的結(jié)構(gòu)、肥力以及養(yǎng)分轉(zhuǎn)化等,通過(guò)磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)方法可以對(duì)微生物群落進(jìn)行定量分析。本研究首次采用超聲波方法提取森林土壤及凋落物中PLFA,探討各提取條件得到的PLFA含量差異,并分析森林土壤和凋落物間微生物群落結(jié)構(gòu)及其相互作用。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)土壤與凋落物均取自中國(guó)科學(xué)院茂縣山地生態(tài)系統(tǒng)定位研究站,地理坐標(biāo)(31°41′N(xiāo),103°53′ E),屬暖溫帶亞高山季風(fēng)氣候,冬季寒冷干燥、夏季多雨,土壤pH值為5.8~60,年平均溫度為8.9 ℃,年降水量919.5 mm。取表層0~20 cm 土壤并混勻,過(guò)2 mm篩,去掉石塊植物殘根等雜物,裝入塑封袋后置于放有冰袋的泡沫箱運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,于-70 ℃保存,7 d內(nèi)完成PLFA測(cè)定。

        凋落物收集于分解試驗(yàn)開(kāi)始前半年進(jìn)行,樣方內(nèi)均勻設(shè)置凋落物收集框,框的大小為2 m(長(zhǎng))×2 m(寬)×20 cm(高),底部安裝有孔徑為8 mm的尼龍網(wǎng)。收集時(shí)間為1個(gè)季度,將收集到的凋落物樣品去除網(wǎng)內(nèi)雜物,將枝葉以枝與葉的重量比為1 ∶1的比例混合均勻,將收集到的凋落物放入分解袋,再將分解袋放置在采樣地表周?chē)?,本次試?yàn)采用的塑料網(wǎng)袋為20(長(zhǎng)) cm×20(寬) cm、網(wǎng)眼為1 mm,并在下一季度取回,低溫保存帶回實(shí)驗(yàn)室,測(cè)重后將凋落物碾碎進(jìn)行磷脂脂肪酸分析。

        1.2試驗(yàn)方法

        為了確定土壤跟凋落物中PLFA的最適提取量,土壤分別取1、3、5、8、10 g,凋落物分別取0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g用于PLFA的提取,加入足量的提取劑 (25 mL),保證不同樣品量的凋落物和土壤都能得到充分的提取,進(jìn)而確定各自最佳取樣量。

        為了確定提取方法對(duì)提取效率的影響,同時(shí)為了驗(yàn)證超聲波提取樣品中的PLFA能否在傳統(tǒng)振蕩提取的基礎(chǔ)上用更短的時(shí)間提出PLFA,本試驗(yàn)采用有機(jī)質(zhì)含量較高的黑土作為研究對(duì)象,具體方法為:第1次提取,振蕩時(shí)間設(shè)120 min,超聲時(shí)間分別設(shè)20、30、40、50、60 min,第2次提取方法與第1次提取方法相同,提取時(shí)間分別減半。用2次提取的PLFA總含量來(lái)衡量提取效率。

        從-70 ℃的冰箱中取出經(jīng)冷凍干燥的土壤及掉落物,用氯仿-甲醇-檸檬酸緩沖液( 體積比為1:2:0.8)作提取劑振蕩提取脂類(lèi)[1],再用100 μL 25 mg/L的C19做內(nèi)標(biāo)溶解氮吹干的脂肪酸甲酯,通過(guò)帶有MIDI峰識(shí)別軟件的Agilent N6850氣相色譜進(jìn)行分析。

        2試驗(yàn)結(jié)果

        2.1土壤中PLFA含量的分析

        在3 g土壤中檢測(cè)得到的單體PLFA數(shù)為24個(gè),而在8 g土壤中則增加到了29個(gè),10 g土壤中單體PLFA的數(shù)量比 3 g 土壤中多6個(gè),在土壤小于8 g時(shí),檢測(cè)到的PLFA數(shù)量隨著土壤量的增加而增加(表1)endprint

        摘要:選取川西高原土壤和凋落物作為研究對(duì)象,分別取1、3、5、8、10 g土壤和0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g凋落物用于PLFA(磷脂脂肪酸)的提取。經(jīng)試驗(yàn)確定,土壤和凋落物用于PLFA提取的最佳提取量分別為8 g和1.0 g,用超聲波提取替代振蕩提取,縮短了PLFA方法的提取時(shí)間。進(jìn)一步分析土壤和凋落物中微生物群落結(jié)構(gòu)信息,結(jié)果表明,相同環(huán)境下土壤和凋落物中大部分微生物類(lèi)群的種類(lèi)和含量都十分接近,革蘭氏陽(yáng)性菌比革蘭氏陰性菌更有優(yōu)勢(shì),厭氧菌比好養(yǎng)菌更加活躍。

        關(guān)鍵詞:土壤;凋落物;PLFA(磷脂脂肪酸);微生物群落結(jié)構(gòu)

        中圖分類(lèi)號(hào): S154.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)09-0323-03

        收稿日期:2013-10-30

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金 (編號(hào):31170916 );中國(guó)科學(xué)院儀器設(shè)備功能開(kāi)發(fā)技術(shù)創(chuàng)新項(xiàng)目(編號(hào):yg20110708)。

        作者簡(jiǎn)介:李范(1988—),男,四川自貢人,碩士研究生,主要研究方向?yàn)橥寥牢⑸?。E-mail:554063409@qq.com。

        通信作者:李萍,博士,教授,碩士生導(dǎo)師。E-mail:wuping4535@sina.com。 土壤和凋落物中存在極其豐富的微生物,它們直接影響著土壤的結(jié)構(gòu)、肥力以及養(yǎng)分轉(zhuǎn)化等,通過(guò)磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)方法可以對(duì)微生物群落進(jìn)行定量分析。本研究首次采用超聲波方法提取森林土壤及凋落物中PLFA,探討各提取條件得到的PLFA含量差異,并分析森林土壤和凋落物間微生物群落結(jié)構(gòu)及其相互作用。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)土壤與凋落物均取自中國(guó)科學(xué)院茂縣山地生態(tài)系統(tǒng)定位研究站,地理坐標(biāo)(31°41′N(xiāo),103°53′ E),屬暖溫帶亞高山季風(fēng)氣候,冬季寒冷干燥、夏季多雨,土壤pH值為5.8~60,年平均溫度為8.9 ℃,年降水量919.5 mm。取表層0~20 cm 土壤并混勻,過(guò)2 mm篩,去掉石塊植物殘根等雜物,裝入塑封袋后置于放有冰袋的泡沫箱運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,于-70 ℃保存,7 d內(nèi)完成PLFA測(cè)定。

        凋落物收集于分解試驗(yàn)開(kāi)始前半年進(jìn)行,樣方內(nèi)均勻設(shè)置凋落物收集框,框的大小為2 m(長(zhǎng))×2 m(寬)×20 cm(高),底部安裝有孔徑為8 mm的尼龍網(wǎng)。收集時(shí)間為1個(gè)季度,將收集到的凋落物樣品去除網(wǎng)內(nèi)雜物,將枝葉以枝與葉的重量比為1 ∶1的比例混合均勻,將收集到的凋落物放入分解袋,再將分解袋放置在采樣地表周?chē)敬卧囼?yàn)采用的塑料網(wǎng)袋為20(長(zhǎng)) cm×20(寬) cm、網(wǎng)眼為1 mm,并在下一季度取回,低溫保存帶回實(shí)驗(yàn)室,測(cè)重后將凋落物碾碎進(jìn)行磷脂脂肪酸分析。

        1.2試驗(yàn)方法

        為了確定土壤跟凋落物中PLFA的最適提取量,土壤分別取1、3、5、8、10 g,凋落物分別取0.5、0.7、0.9、1.0、1.2 g用于PLFA的提取,加入足量的提取劑 (25 mL),保證不同樣品量的凋落物和土壤都能得到充分的提取,進(jìn)而確定各自最佳取樣量。

        為了確定提取方法對(duì)提取效率的影響,同時(shí)為了驗(yàn)證超聲波提取樣品中的PLFA能否在傳統(tǒng)振蕩提取的基礎(chǔ)上用更短的時(shí)間提出PLFA,本試驗(yàn)采用有機(jī)質(zhì)含量較高的黑土作為研究對(duì)象,具體方法為:第1次提取,振蕩時(shí)間設(shè)120 min,超聲時(shí)間分別設(shè)20、30、40、50、60 min,第2次提取方法與第1次提取方法相同,提取時(shí)間分別減半。用2次提取的PLFA總含量來(lái)衡量提取效率。

        從-70 ℃的冰箱中取出經(jīng)冷凍干燥的土壤及掉落物,用氯仿-甲醇-檸檬酸緩沖液( 體積比為1:2:0.8)作提取劑振蕩提取脂類(lèi)[1],再用100 μL 25 mg/L的C19做內(nèi)標(biāo)溶解氮吹干的脂肪酸甲酯,通過(guò)帶有MIDI峰識(shí)別軟件的Agilent N6850氣相色譜進(jìn)行分析。

        2試驗(yàn)結(jié)果

        2.1土壤中PLFA含量的分析

        在3 g土壤中檢測(cè)得到的單體PLFA數(shù)為24個(gè),而在8 g土壤中則增加到了29個(gè),10 g土壤中單體PLFA的數(shù)量比 3 g 土壤中多6個(gè),在土壤小于8 g時(shí),檢測(cè)到的PLFA數(shù)量隨著土壤量的增加而增加(表1)endprint

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