王述蓮,鄧中平,呼建民,鐘禮立,黃 河
腸道病毒屬于RNA病毒,是引起手足口病的主要病原體。該病毒感染性強(qiáng)、致病率高[1-3]??焖贆z測(cè)腸道病毒是治療手足口病的重要基礎(chǔ)。目前,國(guó)內(nèi)外常規(guī)檢測(cè)腸道病毒的核酸提取方法是Trizol法,該方法需多次離心、洗滌、吸棄廢液等開(kāi)放操作,過(guò)程中易造成污染和核酸丟失,也易導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果重復(fù)性和穩(wěn)定性不理想;而磁珠法是近年來(lái)研發(fā)的一種較為先進(jìn)的腸道病毒核酸提取方法,該方法為常溫裂解釋放核酸,無(wú)需使用水浴或干浴設(shè)備,不必反復(fù)高速離心,操作方便,且節(jié)約成本。本文將腸道病毒核酸的磁珠法提取試劑與常規(guī)Trizol法提取試劑進(jìn)行對(duì)比觀察,即以“新型的”磁珠法腸道病毒核酸提取試劑為觀察試劑,以“常規(guī)的”Trizol法提取試劑為對(duì)照試劑,旨在探討磁珠法試劑的臨床檢測(cè)效果。
1.1 一般資料 收集臨床診斷為手足口病患者的咽拭子標(biāo)本412例,其中男240例,女172例;年齡1~12歲,平均4.5歲。所有病例確診均嚴(yán)格按照國(guó)家衛(wèi)生部頒布的《手足口病診療指南》(2010年版)執(zhí)行[4]。以“新型的”磁珠法腸道病毒核酸提取試劑為觀察試劑,以“常規(guī)的”Trizol法提取試劑為對(duì)照試劑。
1.2 主要試劑和儀器 “新型”腸道病毒核酸檢測(cè)試劑購(gòu)自湖南圣湘生物科技有限公司,采用磁珠法提取腸道病毒核酸,最低檢測(cè)限為400 copies/mL;對(duì)照試劑購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司,采用Trizol法提取腸道病毒核酸,采用已上市的檢測(cè)試劑盒進(jìn)行檢測(cè)。按照試劑盒說(shuō)明書(shū),提取試劑和反應(yīng)試劑均在檢測(cè)過(guò)程中配套使用。磁珠法和Trizol法提取的腸道病毒核酸,均采用美國(guó)Stratagene公司的Mx3000P實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行檢測(cè)。
1.3 方法
1.3.1 磁珠法操作步驟 ①在1.5 mL滅菌離心管中依次加入600μL RNA提取“溶液1”、200μL待測(cè)樣本、100 μL RNA提取“溶液2”,震蕩混勻10 s后,室溫靜置10 min;②瞬時(shí)離心后,將離心管置于分離器上,3 min后吸棄廢液;③向離心管中加入600 μL RNA提取“溶液3”,加入200 μL RNA提取“溶液4”,震蕩混勻5 s,瞬時(shí)離心后將離心管再次置于分離器上,3 min后,將廢液全部吸棄;④向離心管中加入30 μL RNA洗脫液,將離心管壁上磁珠洗脫到管底,室溫靜置10 min后,將離心管再次置于分離器上,靜置3 min,然后將RNA洗脫液移入新的1.5 mL滅菌離心管中。
1.3.2 Trizol法操作步驟 ①在1.5 mL的滅菌離心管中依次加入樣本 500 μL、Trizol試劑 500 μL,充分混勻,室溫放置10 min;②加入200 μL氯仿,擰緊蓋,用力震蕩,直至溶液充分乳化、成乳白狀、無(wú)分相現(xiàn)象,室溫靜置10 min;③于4℃、13 000 r/min離心15 min,吸取上層液相移入另一離心管;④加入等體積異丙醇,輕輕顛倒離心管,充分混勻液體,室溫放置10 min;⑤于4℃、13 000 r/min離心15 min,棄上清;⑥向離心管內(nèi)加入75%乙醇1 mL,震蕩混勻,于4℃、13000 r/min離心10 min,棄上清,在超凈臺(tái)中干燥5 min;⑦向離心管內(nèi)加入試劑盒中的DEPC水 50 μL,充分混勻。
1.3.3 臨床樣本檢測(cè) 分別采用磁珠法試劑和Trizol法試劑,對(duì)412例咽拭子標(biāo)本進(jìn)行臨床樣本核酸提取。①磁珠法提取樣本,是經(jīng)樣本裂解、核酸吸附、雜質(zhì)洗脫后獲得核酸。②Trizol法提取樣本,是經(jīng)樣本裂解,氯仿去雜質(zhì),離心獲得液相后,采用異丙醇析出核酸,乙醇漂洗,室溫干燥,加水復(fù)溶后獲得核酸。本組412例標(biāo)本均按照上述2種方法的操作步驟,分別提取核酸。爾后,再分別采用各自的檢測(cè)試劑,采用美國(guó)Stratagene公司的Mx3000P實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行核酸檢測(cè)。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 15.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,應(yīng)用Kappa評(píng)價(jià)方法對(duì)磁珠法試劑和Trizol法試劑及復(fù)核檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行診斷的一致性分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)為 α=0.05。Kappa值參考評(píng)價(jià)原則:0.75 < κ≤1,診斷一致性好;0.4 < κ≤0.75,診斷一致性一般;0≤κ≤0.4時(shí),診斷一致性差。以 P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
本研究共檢測(cè)咽栻子臨床樣本412例,分別采用磁珠法和Trizol法的腸道病毒檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū),提取樣本的腸道病毒核酸后,再采用各自的檢測(cè)試劑進(jìn)行檢測(cè)。2種方法檢測(cè)得到的陽(yáng)性和陰例數(shù),經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。
表1 磁珠法試劑與Trizol法試劑檢測(cè)結(jié)果比較[n(%)]
Kappa檢驗(yàn)的輸出結(jié)果為:κ =0.983,P <0.05。磁珠法試劑和Trizol法試劑及復(fù)核檢測(cè)結(jié)果的一致性有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示診斷一致性好。
手足口病患者腸道病毒的核酸檢測(cè)步驟,一般是先要提取腸道病毒核酸,爾后再采用熒光定量PCR方法進(jìn)行核酸檢測(cè)。由于熒光定量PCR方法具有高敏感性、高精確性等特點(diǎn),所以,該方法可用于腸道病毒感染的早期診斷和無(wú)癥狀病毒攜帶者的檢測(cè)[5-7]。但腸道病毒核酸提取方法不同,可導(dǎo)致病毒核酸提取效果的差異,進(jìn)而會(huì)影響該病毒檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。本研究采用磁珠法和Trizol法檢測(cè)同一批412例樣本,雖然磁珠法試劑盒檢測(cè)結(jié)果的陽(yáng)性率(33.7%)高于 Trizol試劑盒陽(yáng)性率(33.0%),但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。提示,磁珠法試劑盒與市面常見(jiàn)試劑盒的檢測(cè)結(jié)果一致性較高。
在樣本核酸的提取過(guò)程中,Trizol法需反復(fù)高速離心,提取步驟比較繁瑣;需使用氯仿、異丙醇等有毒副作用的試劑;需轉(zhuǎn)移液相到新的離心管,該步驟是提取成敗的關(guān)鍵,受到操作人員手法和經(jīng)驗(yàn)等因素的影響,易吸取到中間層和下層的雜質(zhì),影響到提取效率;在轉(zhuǎn)移樣本的過(guò)程中還易出現(xiàn)樣本間的交叉污染,影響到檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。而磁珠法通過(guò)核酸的釋放、磁珠吸附核酸、一步洗滌雜質(zhì),去除了雜質(zhì)的干擾,可獲得高質(zhì)量的核酸;同時(shí),磁珠法無(wú)需加熱、轉(zhuǎn)移上清等操作,較易將核酸完整地提取出來(lái),操作簡(jiǎn)便;提取過(guò)程在一個(gè)封閉的離心管內(nèi)完成,無(wú)需轉(zhuǎn)移液體,可有效防止樣本間的交叉污染,使該方法的準(zhǔn)確性、靈敏度大大提高,降低了對(duì)操作人員的技術(shù)要求,節(jié)省了檢驗(yàn)時(shí)間,可更好地指導(dǎo)醫(yī)師進(jìn)行臨床診斷和治療,在臨床上具有較高的應(yīng)用價(jià)值。
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