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        基于MPI+OpenMP的紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)并行計(jì)算

        2014-07-03 08:15:48賀維維曾瑤源
        關(guān)鍵詞:弱小進(jìn)程波段

        賀維維,吳 京,曾瑤源

        (國(guó)防科學(xué)技術(shù)大學(xué)電子科學(xué)與工程學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410072)

        0 引言

        紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)技術(shù)是精確制導(dǎo)系統(tǒng)、目標(biāo)監(jiān)視系統(tǒng)的一項(xiàng)關(guān)鍵技術(shù),一直以來(lái)是研究的熱點(diǎn)。由于成像距離遠(yuǎn),紅外弱小目標(biāo)在圖像中只有一個(gè)到幾個(gè)像素的大小,加上強(qiáng)雜波干擾和紅外傳感器像元噪聲干擾,圖像的信噪比很低[1-2],通過(guò)對(duì)弱小目標(biāo)運(yùn)動(dòng)全過(guò)程中紅外輻射特性的分析,發(fā)現(xiàn)采用單一波段已無(wú)法有效地實(shí)現(xiàn)目標(biāo)檢測(cè),只有綜合利用多個(gè)波段[3-6]的信息才能滿足對(duì)目標(biāo)運(yùn)動(dòng)全過(guò)程的探測(cè)需求。紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)計(jì)算復(fù)雜,且對(duì)實(shí)時(shí)性要求較高。多波段融合的紅外弱小目標(biāo)串行檢測(cè)時(shí)間是3個(gè)波段檢測(cè)與融合時(shí)間的疊加,無(wú)法滿足實(shí)際應(yīng)用中實(shí)時(shí)性的要求。本文提出一種基于MPI+OpenMP的并行處理方法。并發(fā)執(zhí)行4個(gè)進(jìn)程,3個(gè)從進(jìn)程分別執(zhí)行3個(gè)波段的目標(biāo)檢測(cè)計(jì)算部分并將處理結(jié)果發(fā)送給主進(jìn)程,主進(jìn)程從3個(gè)從進(jìn)程接收數(shù)據(jù)并進(jìn)行波段間融合。各計(jì)算進(jìn)程內(nèi)部,采用OpenMP線程并行。經(jīng)仿真驗(yàn)證,這種MPI位于頂層OpenMP位于底層的層次化并行模型適用于紅外弱小目標(biāo)多波段融合檢測(cè)算法,能取得較好的檢測(cè)效果。

        1 MPI+OpenMP混合并行編程模型

        并行編程模型一直是并行計(jì)算研究領(lǐng)域中的重點(diǎn)內(nèi)容,目前2種最重要的并行編程模型是共享存儲(chǔ)編程模型和消息傳遞編程模型。共享存儲(chǔ)編程模型具有單地址空間、編程容易、可移植性差等特點(diǎn),其實(shí)現(xiàn)有OpenMP和Pthreads等。消息傳遞編程模型的特點(diǎn)是多地址空間、編程困難、可移植性好,其實(shí)現(xiàn)有MPI和PVM等。

        1.1 MPI簡(jiǎn)介

        MPI[7]用于開發(fā)基于消息傳遞的并行程序,為用戶提供一個(gè)實(shí)際可用的、可移植的、高效和靈活的消息傳遞接口庫(kù),它提供了與Fortran和C/C++語(yǔ)言的綁定,是目前最重要的基于消息傳遞的并行編程工具。各個(gè)并行執(zhí)行的部分通過(guò)消息傳遞來(lái)協(xié)調(diào)步伐[8],控制執(zhí)行。應(yīng)用的分解、開發(fā)和調(diào)試相對(duì)困難,通信可能造成大的開銷,為了最小化延遲,通常需要大的代碼粒度[9]。

        1.2 OpenMP 簡(jiǎn)介

        OpenMP是基于fork-join的并行編程模型[10],它將程序劃分為并行區(qū)和串行區(qū),串行區(qū)由主線程執(zhí)行,到并行區(qū)主線程派生出多個(gè)線程,并行執(zhí)行該區(qū)域的代碼。直到并行區(qū)域中所有子線程負(fù)責(zé)的任務(wù)都執(zhí)行完畢后,主線程才繼續(xù)執(zhí)行。使用者無(wú)需關(guān)心復(fù)雜的線程創(chuàng)建、同步、銷毀等工作。OpenMP完全依賴用戶保證制導(dǎo)的正確性[11]。用戶通過(guò)構(gòu)造并行區(qū)域來(lái)編寫可擴(kuò)展的并行程序,可以使計(jì)算密集的程序部分得以有效并行。OpenMP基于共享內(nèi)存的機(jī)器,因此它的可擴(kuò)展性比較差,受系統(tǒng)可用的計(jì)算單元的限制,當(dāng)問(wèn)題規(guī)模增加,很難添加新的資源來(lái)加速計(jì)算。

        1.3 MPI+OpenMP混合編程模型

        MPI是集群計(jì)算中應(yīng)用較廣泛的編程平臺(tái),但是單一的MPI消息傳遞并行編程模型在多處理器節(jié)點(diǎn)集群上并不能實(shí)現(xiàn)理想的并行效果。MPI+OpenMP這種層次化的并行模型[12],能夠結(jié)合分布式內(nèi)存結(jié)構(gòu)和共享內(nèi)存結(jié)構(gòu)的優(yōu)勢(shì),提供節(jié)點(diǎn)間和節(jié)點(diǎn)內(nèi)的2級(jí)并行,模型結(jié)構(gòu)如圖1所示。

        圖1 MPI+OpenMP混合編程模型

        MPI+OpenMP并行編程模型容易實(shí)現(xiàn)。如圖1所示,MPI的初始化和結(jié)束仍然調(diào)用MPI_Init()和MPI_Finalize()。每個(gè)MPI進(jìn)程可以在#pragma omp parallel編譯制導(dǎo)語(yǔ)句所標(biāo)識(shí)的區(qū)域內(nèi)產(chǎn)生線程級(jí)并行而在區(qū)域外仍為單進(jìn)程?;旌夏P椭?,MPI提供多處理器節(jié)點(diǎn)之間的粗粒度并行,OpenMP提供單個(gè)處理器內(nèi)多核之間的數(shù)據(jù)交互。這種MPI位于頂層OpenMP位于底層的混合編程模型很好地映射了多處理節(jié)點(diǎn)集群體系結(jié)構(gòu)。

        混合編程模型提供了節(jié)點(diǎn)間和節(jié)點(diǎn)內(nèi)的2級(jí)并行機(jī)制,它的優(yōu)勢(shì)在于結(jié)合了進(jìn)程級(jí)的粗粒度并行(例如區(qū)域分解)和線程級(jí)的細(xì)粒度并行(如循環(huán)并行),在很多情況下,其執(zhí)行效率高于純 MPI或OpenMP程序[13-14]。混合編程模型中 OpenMP能夠很好地彌補(bǔ)在MPI并行程序中可能出現(xiàn)負(fù)載不平衡的問(wèn)題;混合編程模型首先執(zhí)行MPI分解策略,啟動(dòng)理想數(shù)目的進(jìn)程,再用OpenMP進(jìn)一步分解子任務(wù),則可以使所有處理機(jī)得到高效利用;混合模型的程序?qū)p少通信的次數(shù),并且OpenMP的線程級(jí)并行具有較小的延遲,可緩解純MPI程序進(jìn)程間的通信帶寬和延遲的問(wèn)題。

        2 基于混合并行的多波段目標(biāo)檢測(cè)算法設(shè)計(jì)與優(yōu)化

        2.1 紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)算法

        2.1.1 目標(biāo)紅外輻射特性分析

        根據(jù)維恩位移定律,黑體電磁輻射能流密度的峰值波長(zhǎng)λm與自身溫度T成反比,即:

        其中,λm的單位是 μm,T 的單位是 K,a=2897.95μm·K,為一常數(shù)。紅外弱小目標(biāo)在運(yùn)動(dòng)的全過(guò)程中,由于自身推進(jìn)器工作、與大氣摩擦等原因具有不同的溫度,由上述公式可知,其在不同運(yùn)動(dòng)階段具有不同的紅外輻射特性[15],采用單一的波段無(wú)法對(duì)運(yùn)動(dòng)全程實(shí)現(xiàn)有效探測(cè),需采用不同的波段進(jìn)行探測(cè)。不同的傳感器工作在不同的電磁波段,探測(cè)到的目標(biāo)在對(duì)比度、信噪比、強(qiáng)度等方面有很大的差別。在遠(yuǎn)距離、強(qiáng)雜波干擾的情況下,利用多個(gè)波段的探測(cè)信息的互補(bǔ)性能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)運(yùn)動(dòng)全過(guò)程的有效監(jiān)控。

        2.1.2 多波段紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)

        包含目標(biāo)的紅外圖像可表示為:

        其中,s(x,y)表示目標(biāo)信號(hào),在包含目標(biāo)的紅外圖像中,目標(biāo)除了受到背景雜波信號(hào)b(x,y)的干擾外,還受到成像和傳輸過(guò)程中的噪聲的影響,統(tǒng)稱為n(x,y)。背景抑制和閾值分割[16]主要作用是盡可能排除背景雜波和噪聲對(duì)目標(biāo)的干擾,并盡可能降低虛警點(diǎn)的個(gè)數(shù)。紅外弱小目標(biāo)在圖像中表現(xiàn)為信噪比很低,僅依靠單幀圖像實(shí)現(xiàn)檢測(cè)比較困難,還必須利用目標(biāo)的運(yùn)動(dòng)特性進(jìn)行多幀關(guān)聯(lián),以進(jìn)一步剔除虛警點(diǎn)。紅外檢測(cè)的流程如圖2所示。

        圖2 目標(biāo)檢測(cè)算法流程

        2.2 串行檢測(cè)性能分析

        圖2(b)給出了單個(gè)波段檢測(cè)算法的流程,圖2(a)給出了多個(gè)波段串行檢測(cè)的流程。由圖2可知,串行檢測(cè)時(shí)間是各個(gè)波段的檢測(cè)時(shí)間與融合時(shí)間之和。針對(duì)1200×1200規(guī)格的圖像,在高性能計(jì)算服務(wù)器上進(jìn)行測(cè)試(運(yùn)行環(huán)境見3.1節(jié)),測(cè)試時(shí)間如表1所示。

        表1 單幀多波段串行檢測(cè)時(shí)間(ms)

        上述多波段串行算法單幀檢測(cè)的時(shí)間為3835.7 ms,無(wú)法滿足實(shí)際應(yīng)用中單幀檢測(cè)時(shí)間小于500 ms的要求。因此,必須對(duì)多波段檢測(cè)算法進(jìn)行并行計(jì)算研究,將計(jì)算任務(wù)進(jìn)行分解才能充分利用硬件的計(jì)算資源,從而獲得性能的提升。

        2.3 并行設(shè)計(jì)及優(yōu)化

        2.3.1 算法并行可行性分析

        多波段檢測(cè)算法中,單個(gè)波段的檢測(cè)比較耗時(shí),而融合處理時(shí)間較短,3個(gè)波段之間只有在融合處理過(guò)程中才有數(shù)據(jù)的交互。因此,可以開啟多個(gè)進(jìn)程并發(fā)執(zhí)行各個(gè)波段的檢測(cè)任務(wù),進(jìn)程之間采用MPI指令進(jìn)行消息傳遞。單個(gè)波段檢測(cè)算法中,背景抑制和閾值分割都是針對(duì)全局圖像像素點(diǎn)進(jìn)行處理,這種循環(huán)遍歷像素點(diǎn)的算法比較適合采用OpenMP的for制導(dǎo)指令進(jìn)行并行任務(wù)分擔(dān)。

        通過(guò)以上分析可以看出,這種多波段的串行檢測(cè)算法比較適合采用基于MPI+OpenMP的混合并行模型進(jìn)行加速處理,并發(fā)執(zhí)行4個(gè)進(jìn)程,3個(gè)從進(jìn)程分別處理3個(gè)波段的檢測(cè)任務(wù),然后將處理結(jié)果發(fā)送給主進(jìn)程進(jìn)行融合處理;各個(gè)進(jìn)程內(nèi)部采用OpenMP的多線程技術(shù)對(duì)背景抑制和閾值分割等相關(guān)算法進(jìn)行加速處理。后續(xù)的仿真結(jié)果也驗(yàn)證了該模型對(duì)多波段串行檢測(cè)算法的適用性。

        2.3.2 算法并行設(shè)計(jì)及優(yōu)化

        多波段紅外弱小目標(biāo)融合檢測(cè)中,3個(gè)波段的檢測(cè)計(jì)算部分采用相同的算法,耗時(shí)基本相同,用3個(gè)進(jìn)程來(lái)并行計(jì)算不會(huì)造成負(fù)載不均衡的問(wèn)題。

        檢測(cè)過(guò)程要處理多幀圖像,3個(gè)從進(jìn)程和主進(jìn)程之間的通信在循環(huán)體內(nèi)部調(diào)用。針對(duì)多波段融合檢測(cè)算法特點(diǎn),在并行設(shè)計(jì)時(shí)采取以下幾種優(yōu)化策略:

        1)進(jìn)程之間采用重復(fù)非阻塞的通信方式,將通信參數(shù)與MPI內(nèi)部對(duì)象建立固定的聯(lián)系,并通過(guò)該對(duì)象完成重復(fù)通信,降低不必要的通信開銷。

        2)各從進(jìn)程發(fā)送給主進(jìn)程用于融合檢測(cè)的數(shù)據(jù)是不同類型的數(shù)據(jù)塊,在算法實(shí)現(xiàn)過(guò)程中,自定義新的數(shù)據(jù)類型,將所需傳輸?shù)臄?shù)據(jù)以新的數(shù)據(jù)類型打包[17],以減少通信個(gè)數(shù)。

        3)節(jié)點(diǎn)內(nèi)采用OpenMP并行設(shè)計(jì)時(shí),綜合考慮并行粒度和系統(tǒng)開銷,選擇檢測(cè)流程中合適的的算法并行化。例如:背景抑制和閾值分割是對(duì)全局圖像的像素點(diǎn)進(jìn)行處理,計(jì)算比較耗時(shí),而多幀軌跡關(guān)聯(lián)是對(duì)閾值分割產(chǎn)生的備選點(diǎn)處理,計(jì)算時(shí)間較短,所以只針對(duì)背景抑制和閾值分割算法采取OpenMP多線程并行。

        檢測(cè)算法在混合編程模型上的實(shí)現(xiàn)架構(gòu)如圖3所示。

        圖3 多波段目標(biāo)檢測(cè)在混合編程模型上的架構(gòu)實(shí)現(xiàn)

        3個(gè)從進(jìn)程的處理流程相同,圖3中只給出了單個(gè)從進(jìn)程和主進(jìn)程之間的通信模式。

        3 測(cè)試環(huán)境及結(jié)果分析

        3.1 測(cè)試環(huán)境

        硬件環(huán)境為IBM Flex System x240中的4個(gè)節(jié)點(diǎn),每個(gè)節(jié)點(diǎn)包含2顆E5-266 CPU(2.9 GHz/6-core)共12 core,采用Infiniband網(wǎng)絡(luò)。其軟件環(huán)境包括Red Hat Enterprise Linux 6.0的操作系統(tǒng),支持OpenMP和MPI的Intel Composer XE 2013并行環(huán)境。程序采用C語(yǔ)言編寫,MPI+OpenMP混合程序需使用帶有-openmp選項(xiàng)的編譯命令編譯,該選項(xiàng)激活、解釋程序中的OpenMP編譯制導(dǎo)。

        3.2 測(cè)試結(jié)果及分析

        選擇1200×1200規(guī)格的3個(gè)波段的序列圖像各100幀進(jìn)行測(cè)試,統(tǒng)計(jì)單幀平均處理時(shí)間如表2所示。

        表2 不同方法程序測(cè)試時(shí)間表

        本文通過(guò)計(jì)算各種并行方法的加速比來(lái)衡量加速效果,加速比定義如下:

        其中,Tparallel為并行方法的計(jì)算時(shí)間,Tserial為串行檢測(cè)的時(shí)間。方法1為3個(gè)波段串行檢測(cè),其計(jì)算時(shí)間為3835.7 ms,本文以該時(shí)間為基準(zhǔn)計(jì)算加速比,從而分析加速性能。通過(guò)上述公式,計(jì)算得到4種不同并行方法的加速比如圖4所示。

        圖4 不同并行實(shí)現(xiàn)方法的加速比

        圖4中,方法2,3,4都是針對(duì)集群系統(tǒng)的單個(gè)節(jié)點(diǎn)測(cè)試。方法2,在多波段串行檢測(cè)算法中,只針對(duì)單個(gè)波段檢測(cè)中的背景抑制和閾值分割進(jìn)行OpenMP多線程加速處理,加速比能達(dá)到2.56。方法3,在單個(gè)節(jié)點(diǎn)開啟4個(gè)進(jìn)程,分別執(zhí)行3個(gè)波段的檢測(cè)和融合任務(wù),加速比能達(dá)到2.79。方法4,在單個(gè)節(jié)點(diǎn)開啟4個(gè)MPI進(jìn)程,3個(gè)從進(jìn)程內(nèi)部分別采用OpenMP并行,加速比為5.29,其加速效果優(yōu)于純OpenMP并行和純MPI并行。方法5,在4個(gè)節(jié)點(diǎn)各啟動(dòng)一個(gè)MPI進(jìn)程,各節(jié)點(diǎn)內(nèi)部采用OpenMP并行,加速比為 8.61。

        測(cè)試所用的集群系統(tǒng),單個(gè)節(jié)點(diǎn)有12個(gè)core,方法5每個(gè)進(jìn)程內(nèi)部分配12個(gè)OpenMP線程,而方法4每個(gè)進(jìn)程分配4個(gè)線程。方法5利用了多處理器節(jié)點(diǎn)內(nèi)部的多核計(jì)算資源,加速效果優(yōu)于方法4。如果單從開啟的OpenMP線程數(shù)來(lái)看,方法5理論上的加速比應(yīng)該是方法4的3倍,但實(shí)際為1.63(724.2/445.3)倍。分析其原因在于,單個(gè)進(jìn)程內(nèi)部雖然采用OpenMP多線程技術(shù),但是只是針對(duì)背景抑制和閾值分割等算法,其中還有輸入圖像數(shù)據(jù)、軌跡關(guān)聯(lián)、輸出處理結(jié)果等算法不適合采用OpenMP并行,從而影響了整體的加速效果。下一步可以考慮對(duì)這些算法做進(jìn)一步的優(yōu)化。

        對(duì)于多波段紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)算法,單純的MPI并行和OpenMP并行實(shí)現(xiàn)都不能達(dá)到很好的加速效果,基于MPI+OpenMP的層次化并行充分利用分布式存儲(chǔ)和共享存儲(chǔ)的優(yōu)勢(shì),加速比能達(dá)到8.61,單幀處理時(shí)間為455.3 ms,滿足實(shí)際應(yīng)用中實(shí)時(shí)性的要求(單幀處理時(shí)間小于500 ms)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,這種層次化的并行模型適用于多波段檢測(cè)算法,能夠達(dá)到很好的加速效果,實(shí)驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證了第2節(jié)中的理論分析。

        4 結(jié)束語(yǔ)

        紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)對(duì)于導(dǎo)彈攻防、實(shí)時(shí)監(jiān)控具有重要的意義,對(duì)實(shí)時(shí)性要求比較高,高性能計(jì)算在這個(gè)領(lǐng)域一直是研究的熱點(diǎn)?;贛PI+OpenMP的混合編程模型結(jié)合分布式內(nèi)存結(jié)構(gòu)和共享內(nèi)存結(jié)構(gòu)的優(yōu)勢(shì),在多波段紅外弱小目標(biāo)檢測(cè)的實(shí)現(xiàn)上能夠達(dá)到較好的加速效果。這種層次化的并行結(jié)構(gòu)也存在一些問(wèn)題,例如:MPI進(jìn)程數(shù)目受限、MPI進(jìn)程間的通信帶寬和延遲、OpenMP線程產(chǎn)生的系統(tǒng)開銷[18]等問(wèn)題。在實(shí)際應(yīng)用上,一定要考慮二者的結(jié)合能否提供一個(gè)更加優(yōu)化的平臺(tái)以及如何結(jié)合能夠達(dá)到更高的計(jì)算效率。最新發(fā)布的Intel? Xeon PhiTM基于MIC(Many Integrated Core)架構(gòu)的芯片集成了60個(gè)精簡(jiǎn)的x86核心,能夠并發(fā)執(zhí)行200多個(gè)線程[19]。下一步,可以將檢測(cè)任務(wù)進(jìn)行分解,將密集計(jì)算的部分移植到MIC上,邏輯判斷的部分放在CPU端,充分利用CPU和MIC的計(jì)算資源,以達(dá)到更好的加速效果。

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