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        量子化學(xué)方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)的研究

        2014-07-02 09:50:24吳楠楠歐陽順利
        科技視界 2014年10期
        關(guān)鍵詞:分子化學(xué)軟件

        吳楠楠 歐陽順利

        (1.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 材料與冶金學(xué)院,內(nèi)蒙古 包頭 014010;2.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 內(nèi)蒙古自治區(qū)白云鄂博礦多金屬資源綜合利用重點實驗室〈省部共建國家重點實驗室培育基地〉,內(nèi)蒙古 包頭014010)

        0 引言

        結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)目前存在兩個方面的難題[1]。首先,結(jié)構(gòu)化學(xué)中的內(nèi)容比較抽象,具有極強理論性、實驗性和應(yīng)用性,要求學(xué)生具有較強的空間思維能力,學(xué)生因此難于理解和掌握,極大影響了學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性和教學(xué)效果。其次,結(jié)構(gòu)化學(xué)涉及面廣,隨著當(dāng)代結(jié)構(gòu)化學(xué)學(xué)科本身的迅猛發(fā)展和與相關(guān)學(xué)科的交叉, 使得結(jié)構(gòu)化學(xué)的教學(xué)量快速增加,而相應(yīng)的教學(xué)課時量不但沒有增加甚至有所減量,這就勢必形成了任務(wù)多,時間不足的困難。為了解決上述兩方面的問題,提高該課程教學(xué)效果,國內(nèi)有一些學(xué)者開展不同程度的探索與研究。 例如:整合結(jié)構(gòu)化學(xué)中相關(guān)知識點,利用多媒體的方法教學(xué)的等教學(xué)改革。 這些學(xué)者的探索都或多或少地影響了結(jié)構(gòu)化學(xué)的教學(xué),也取得了不少教學(xué)效果。不過,這些教學(xué)改革和方法沒能根本性地解決這兩方面的問題。因此,針對如何更好地解決這兩方面問題,我們提出量子化學(xué)方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)的思路。

        1 量子化學(xué)與結(jié)構(gòu)化學(xué)的關(guān)系

        結(jié)構(gòu)化學(xué)作為高等學(xué)?;瘜W(xué)各分支學(xué)科及其它與化學(xué)交叉的各學(xué)科的一門重要專業(yè)基礎(chǔ)課程,是利用量子力學(xué)理論及現(xiàn)代數(shù)學(xué)工具和現(xiàn)代實驗方法來研究化學(xué)問題的一門學(xué)科[2]。它是理論化學(xué)的核心,從微觀的角度來研究不同層面的微觀結(jié)構(gòu)以及其結(jié)構(gòu)與物理化學(xué)等性能之間關(guān)聯(lián)關(guān)系。

        量子化學(xué)是化學(xué)的一個重要的分支學(xué)科。當(dāng)代量子化學(xué)是隨著計算機科學(xué)的快速發(fā)展利用量子力學(xué)的相關(guān)理論來研究化學(xué)問題的一門學(xué)科。量子化學(xué)發(fā)展至今, 可以根據(jù)解Schr?dinger 方程而引入近似程度的不同分為以下幾種方法:從頭計算方法(ab initio calculation) 、簡單分子軌道法如HMO(休克爾分子軌道法)、EHMO(擴展HMO)法等、半經(jīng)驗分子軌道方法、密度泛函理論、量子力學(xué)-分子力學(xué)的QM/MM組合方法等。 它們在從無機小分子到生物大分子,從靜態(tài)結(jié)構(gòu)到動態(tài)分子動力學(xué)反應(yīng),從分子內(nèi)的強弱相互作用到分子間強弱相互作用等各方面都有應(yīng)用。 量子化學(xué)已經(jīng)涉及到化學(xué)、材料學(xué)、物理學(xué)、生命科學(xué)、醫(yī)藥學(xué)等眾多學(xué)科。

        隨著計算技術(shù)的快速發(fā)展和理論上的重大突破, 量子化學(xué)軟件也越來越發(fā)達,得到了廣泛的應(yīng)用。 如Gaussian 作為一款功能強大的量子化學(xué)綜合軟件包,是做半經(jīng)驗計算和從頭計算使用最廣泛的量子化學(xué)軟件,可以研究:分子能量和結(jié)構(gòu),過渡態(tài)的能量和結(jié)構(gòu)化學(xué)鍵以及反應(yīng)能量,分子軌道,反應(yīng)路徑,偶極矩和多極矩,振動頻率,紅外和拉曼光譜,原子電荷和電勢,核磁共振,極化率和超極化率,熱力學(xué)性質(zhì),用于研究諸多領(lǐng)域的課題。

        從上述所述,我們了解了結(jié)構(gòu)化學(xué)、量子化學(xué)以及量子化學(xué)相關(guān)方法和軟件。 因此,結(jié)構(gòu)化學(xué)這門課程可以很好地利用量子化學(xué)相關(guān)方法和軟件進行分析和詮釋。

        2 量子化學(xué)方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)的策略

        本文主要研究的是將現(xiàn)代量子化學(xué)科研方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)的問題, 研究的過程將本著遵循理論與實踐相結(jié)合,從典型研究問題出發(fā),探索并形成研究成果,指導(dǎo)結(jié)構(gòu)化學(xué)學(xué)科的教學(xué)。本文采用如下幾方面實現(xiàn)量子化學(xué)方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué):第一方面是文獻研究,通過分析文獻資料,收集國內(nèi)外結(jié)構(gòu)化學(xué)及相關(guān)的成果資料,總結(jié)出可行的技術(shù)路線;第二方面是實驗教學(xué),讓學(xué)生親自進行一些簡單地分子設(shè)計等量子化學(xué)計算方面的嘗試;第三方面是調(diào)查研究,調(diào)研的主要目的是想了解學(xué)生對結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)改革教學(xué)研究與設(shè)計的滿意程度;第四方面是多媒體的教學(xué)方法與自主學(xué)習(xí)方法相結(jié)合,使較為抽象的知識具體化,提高學(xué)生對結(jié)構(gòu)化學(xué)知識的掌握。 第五方面是主題式教學(xué)和參與式學(xué)習(xí)討論結(jié)合,使學(xué)生分析與解決問題的能力能得到相應(yīng)的提高。

        從量子化學(xué)科研結(jié)合結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)入手的具體教改思路是通過用Gaussian 等量子化學(xué)軟件計算,使用GaussianView 等可視化的量子化學(xué)軟件,將抽象的概念變?yōu)橹庇^的圖形,激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)興趣和培養(yǎng)學(xué)生科研意識的有效方法。

        3 量子化學(xué)方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于結(jié)構(gòu)化學(xué)的實例

        針對學(xué)生通過傳統(tǒng)教學(xué)學(xué)習(xí)結(jié)構(gòu)化學(xué)難以較好理解和掌握這一情況, 我們嘗試在結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)中采用量子化學(xué)計算方法與軟件來配合教學(xué)。 例如:研究水分子(H2O)與二甲基亞砜(DMSO)分子間氫鍵作用[3],首先用GaussView 搭建H2O 分子與DMSO 分子模型,然后用Gaussian 軟件進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率計算, 接下來用GaussView 打開結(jié)果文件,得到優(yōu)化后H2O 分子與DMSO 分子結(jié)構(gòu)。 這是可以做一些可視化的教學(xué):點擊展示振動(Display Vibratons)文本框中的開始(start)按鈕,就可以顯示所選振動模式的振動動畫,點擊停止(stop)按鈕,可以停止分子的振動,也可以點擊光譜圖(spectrum)按鈕,生成H2O 分子和DMSO 分子的拉曼以及紅外光譜圖。 最后,我們將優(yōu)化后的H2O分子和DMSO 分子放在一起進一步優(yōu)化, 得到H2O 分子和DMSO 分子間氫鍵的結(jié)構(gòu)圖。 在結(jié)構(gòu)化學(xué)的課堂上,我們這樣用量子化學(xué)軟件呈現(xiàn)動畫圖像可使難于理解與掌握的知識變得生動有趣,大大增強結(jié)構(gòu)化學(xué)的教學(xué)效果。 此外,像水分子(H2O)與二甲基亞砜(DMSO)分子間氫鍵作用也是學(xué)科前沿研究熱點,培養(yǎng)學(xué)生從現(xiàn)有課堂知識應(yīng)用并解決前沿的能力。

        總之, 我們結(jié)合先輩在結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)改革探索過程中的經(jīng)驗,對結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)進行深入改革。采用當(dāng)代先進的量子化學(xué)計算方法及軟件來配合教學(xué),并在教學(xué)內(nèi)容中加入前言科學(xué)問題,加強教學(xué)與科研相結(jié)合,在傳授基礎(chǔ)知識的同時,注重培養(yǎng)學(xué)生的物理學(xué)和化學(xué)思想與方法,著力培養(yǎng)學(xué)生的科學(xué)素養(yǎng)。 將現(xiàn)代量子化學(xué)科研方法及相關(guān)軟件應(yīng)用于大學(xué)結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)中是解決這門學(xué)科知識點多雜與難理解的一條有效途徑。

        [1]王麗.可視化量子計算軟件在結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)中應(yīng)用的實踐[J].新課程,2012,67.

        [2]曾榮英,唐文清,馮永蘭,陳志敏.結(jié)構(gòu)化學(xué)教學(xué)改革的實踐與探索[J].化學(xué)高等教育,2007,97:21-24.

        [3]歐陽順利,吳楠楠.拉曼光譜技術(shù)與理論化學(xué)計算對分子結(jié)構(gòu)與性質(zhì)的研究[M].長春:吉林大學(xué)出版社,2013.

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