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        一步重組法構(gòu)建產(chǎn)龍膽苦苷酵母重組菌的研究

        2014-06-27 03:51:42錢衛(wèi)東趙德志付云芳陳雪峰毛培宏周穎欣謝海艷
        關(guān)鍵詞:離子注入秦艽龍膽

        錢衛(wèi)東, 趙德志, 付云芳,陳雪峰, 毛培宏,周穎欣, 常 凱, 謝海艷

        (1.陜西科技大學(xué) 生命科學(xué)與工程學(xué)院, 陜西 西安 710021; 2.新疆大學(xué) 物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 離子束生物技術(shù)中心, 新疆 烏魯木齊 830046)

        0 引言

        龍膽苦苷(Gentiopicroside),別名龍膽苦甙,分子式為C16H20O9,分子量為356.11,為裂環(huán)環(huán)烯萜苷類化合物,屬于倍半萜類物質(zhì),是藥用植物秦艽(Gentianamacrophylla)的主要藥用成分[1].近年來的研究表明,龍膽苦苷具有鎮(zhèn)痛、抗炎、抗菌、抗病毒、抗氧化、保肝利膽、健胃抗?jié)兊茸饔?,如作為國家一類新藥注射用秦龍苦素,為秦艽提取物龍膽苦苷的凍干粉針,用于黃疸型病毒性肝炎的治療[2-4].隨著人們對龍膽苦苷藥用價(jià)值的肯定,開發(fā)和生產(chǎn)以龍膽苦苷為原料的藥品越來越多,使得臨床上對龍膽苦苷的需求量日益增加.

        龍膽苦苷多來源于龍膽科多年生草本植物秦艽.值得注意的是,秦艽藥材由于使用范圍不斷擴(kuò)大,市場需求量逐年增加,致使野生資源急劇下降,已被列入國家三級保護(hù)野生藥材[5].又因?yàn)榍剀创嬖谶m生地窄、栽培困難、生長周期長等問題,造成目前市場上秦艽資源短缺,供需矛盾非常突出.

        與國外相比而言,國內(nèi)近年來對龍膽苦苷來源的研究相對較多.Tiwari和Zhang 等運(yùn)用發(fā)根農(nóng)桿菌(Agrobaeteriumrhizogenes)誘導(dǎo)出秦艽毛狀根,但未篩選出產(chǎn)龍膽苦苷的毛狀根[6-7].齊香君等運(yùn)用秦艽懸浮細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)龍膽苦苷,產(chǎn)量僅為0.242 mg/g[8].上述結(jié)果表明,利用毛狀根或懸浮細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)生產(chǎn)龍膽苦苷目前都未能獲得理想的結(jié)果.

        因此,研究和開發(fā)秦艽新資源、解決龍膽苦苷來源短缺問題亟需尋求其它藥源途徑和新的研究方法.近年來,代謝工程因其在尋求新型藥源和藥源種質(zhì)改良方面具有獨(dú)特優(yōu)勢,已經(jīng)逐漸成為當(dāng)今國際生藥學(xué)界的研究熱點(diǎn)之一[9-12].

        目前,關(guān)于秦艽藥用成分龍膽苦苷的生物合成相關(guān)基因的研究報(bào)道較少.趙鵬等分離克隆了3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A 還原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoAreductase,HMGR)基因家族的兩條基因和G10H 基因家族的一條基因,但其僅對HMGR和G10H 基因進(jìn)行了序列分析,而沒有利用基因敲除/遺傳互補(bǔ)方法在體內(nèi)進(jìn)行功能鑒定.在龍膽苦苷生物合成基因尚未闡明前,亟需尋求新思路構(gòu)建產(chǎn)天然產(chǎn)物工程菌.近年來,由我國學(xué)者自主開發(fā)的離子束介導(dǎo)藥用植物基因組總DNA轉(zhuǎn)化微生物、構(gòu)建產(chǎn)藥用植物天然藥用成分重組菌株的技術(shù),為利用微生物合成龍膽苦苷提供了技術(shù)支持[13,14].

        1 材料和方法

        1.1 菌種

        多形漢遜酵母(HansenulapolymorphaH.polymorpha) DL-1菌株(來源為ATCC No.26012).

        1.2 培養(yǎng)基

        (1)YPD固體培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖20 g,酵母膏10 g,蛋白胨20 g,瓊脂粉15 g,pH 6.5.

        (2)種子液培養(yǎng)基(g/L) :葡萄糖20 g,蛋白胨20 g,酵母膏10 g,pH 6.5.

        (3)發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L): 丙三醇15 g,(NH4)2SO415 g,K2HPO40.24 g,MgSO4·7H2O 1.8 g,CaCl20.28 g,NaCl 0.6 g,NaNO30.58 g,F(xiàn)eCl3SO4·6H2O 0.006 g,硫胺素鹽酸鹽0.004 g,微量元素母液1 mL.

        其中,微量元素母液(mg/L):Na2MoO4·2H2O 484 mg,MnSO4·H2O 176 mg,KI 207.5,CuSO4·5H2O 40 mg,ZnSO4·7H2O 40 mg,pH為6.5.

        1.3 主要試劑和儀器

        龍膽苦苷標(biāo)準(zhǔn)品(美國Sigma公司);酵母浸粉、蛋白胨、葡萄糖、瓊脂粉、CMC-Na、硅膠GF254、香草醛、醋酸鋰等(天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司);Tris-Hcl、十二烷基硫酸鈉(SDS) 、EDTA 、Tris飽和酚等(拜爾迪公司).

        臺式冷凍離心機(jī)(Sigma);高效液相色譜儀(美國Waters);Ddevic 1多功能離子注入機(jī)(IBB).

        1.4 試驗(yàn)方法

        1.4.1 秦艽的基因組DNA的提取

        秦艽新鮮葉片采自陜西省太白縣秦艽種植基地.取其新鮮葉片約5 g置于研缽中,用液氮冷凍研磨至粉末,加入3.5 mL、2%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))、65 ℃預(yù)熱的CTAB抽提緩沖液,輕輕搖勻后分裝在1.5 mL EP管中(約1 mL/管),置于65 ℃的水浴鍋中溫育,每隔10 min輕搖一次,溫育40 min.取出后,冷卻2 min,加入0.5 mL氯仿-異戊醇(24∶1,v/v),漩渦振蕩2 min,然后,10,000 r/min離心10 min,將上清液轉(zhuǎn)移至裝有600μL異丙醇的EP管中,將離心管上下輕輕搖動30 s,使異丙醇與水層充分混合.

        10,000 r/min離心2 min后,去掉上清液,自然風(fēng)干,然后加入720μL的75%乙醇及80μL 5 mol/L的醋酸鈉,輕輕搖勻;10,000 r/min離心1 min后,倒掉上清液,加入800μL 75%(體積分?jǐn)?shù))的乙醇,輕輕搖勻后,10,000 r/min離心30 s后,倒掉上清液,將離心管自然風(fēng)干;再加入50μL 0.5×TE(含RNase)緩沖液,使DNA溶解,置于37 ℃恒溫箱約15 h.置于-20 ℃保存、備用.

        1.4.2 酵母菌膜的制備

        取酵母菌母液100μL轉(zhuǎn)接到裝有2 mL YPD液體培養(yǎng)基的試管中,37 ℃,110 r/min培養(yǎng)16~18 h,取菌體用保護(hù)液(葡萄糖0.5%+可溶性淀粉0.5%)稀釋,采用血球計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)法確定稀釋倍數(shù),稀釋至細(xì)胞濃度為1.0×106CFU/mL,并取0.1 mL菌體稀釋液將其均勻涂布于直徑90 mm的無菌平皿中央,用無菌風(fēng)吹干制成菌膜.

        1.4.3 最佳離子注入能量和劑量的探索

        根據(jù)試驗(yàn)需要,設(shè)置不同的離子注入能量與劑量的組合,進(jìn)行多次重復(fù)試驗(yàn),探索最佳的離子注入?yún)?shù),參數(shù)設(shè)計(jì)為:能量分別是a:30 keV;b:25 keV;c:20 keV,注入劑量(ions/cm2)如表1所示.

        表1 試驗(yàn)中N+注入劑量

        將菌膜平皿置于離子注入機(jī)真空靶室中央進(jìn)行N+注入,按照a、b、c的能量和表1中的低能離子注入劑量注入.注入結(jié)束后,立即將2 mL不含基因組的TE溶液迅速倒入注入過的菌膜平皿中,置于 37 ℃恒溫箱中溫育2 h;然后用無菌刮鏟將菌全部刮下,取0.1 mL菌液均勻涂布于YPD固體培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h.對照菌株做同樣處理,計(jì)算存活率.以低能注入劑量為橫坐標(biāo),存活率為縱坐標(biāo),制備注入曲線,獲得最佳的離子注入能量和劑量.

        1.4.4 構(gòu)建產(chǎn)龍膽苦苷工程菌株

        (1)低能離子注入酵母

        利用上述獲得的最佳低能離子注入能量和劑量進(jìn)行注入.注入完畢后,立即將2 mL含有秦艽基因組的TE溶液迅速加入經(jīng)低能離子注入過的菌膜平皿中,經(jīng)TE浸泡、溫育、涂固體培養(yǎng)基,在 37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h.取出放入4 ℃冰箱,以備初篩.

        (2)重組菌株的初篩

        將YPD培養(yǎng)基上生長的單菌落接入裝有5 mL YPD液體培養(yǎng)基的試管中,放入37 ℃,160 r/min搖床上培養(yǎng)90 h得發(fā)酵液,將發(fā)酵液7,000 r/min離心15 min,收集上清液用于發(fā)酵產(chǎn)物檢測.由于龍膽苦苷是環(huán)烯醚萜苷類物質(zhì),因此,主要采用Molish反應(yīng)、香草醛反應(yīng).其操作步驟如下:

        ①M(fèi)olish反應(yīng).100 ℃下濃縮發(fā)酵液后,加入甲醇10 mL,過濾.取濾液3 mL放入干凈試管中,加入兩滴Molish試劑(10%的α-萘酚醇溶液)搖勻,然后沿試管壁緩慢加入約1 mL濃硫酸,靜置,觀察兩層液面交界處的顏色變化.

        ②香草醛反應(yīng).取樣品濃縮液1 mL加入試管中,再加入0.5 mL、5%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))的香草醛濃硫酸溶液,65 ℃水浴2 min,觀察溶液顏色變化.

        (3)重組菌株的復(fù)篩

        將初篩所得菌株接種于裝有200 mL YPD液體培養(yǎng)基的500 mL三角瓶中,37 ℃,160 r/min,恒溫培養(yǎng)90 h后,7,000 r/min離心15 min,收集上清液80 ℃濃縮至40 mL,加入20 mL預(yù)冷丙酮萃取,萃取3次,將收集的萃取液用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀在40 ℃下蒸干,然后加入5 mL甲醇溶解,獲得樣品溶液,用薄層層析法和高效液相色譜法對產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析.

        ①薄層層析法(TLC)定性檢測.將薄層層析用GF254硅膠板放入干燥箱,105 ℃活化30 min.用微量進(jìn)樣器點(diǎn)樣,在展開劑氯仿-甲醇(4∶1v/v)中展開,結(jié)束后揮發(fā)干展開劑,在紫外燈下觀察,記錄斑點(diǎn),并計(jì)算其Rf值.

        ②高效液相色譜法(HPLC)定量檢測.色譜條件:色譜柱,Diamonsil C18柱(4.6 ×250 mm,5μm);流動相,乙腈:水(40∶60,V/V);紫外檢測器,Waters 2487;檢測波長,274 nm;進(jìn)樣量,20μL;流速,1.0 mL/min;柱溫,25 ℃.

        1.4.5 遺傳穩(wěn)定性試驗(yàn)

        將重組菌株依次劃線傳代培養(yǎng)8代,將各代菌株活化后,接種于裝有200 mL YPD培養(yǎng)基的500 mL三角瓶中進(jìn)行搖瓶培養(yǎng),160 r/min ,37 ℃,恒溫培養(yǎng)90 h后,經(jīng)離心、濃縮、萃取、蒸發(fā)、溶解,制備樣品溶液.對樣品溶液經(jīng)過HPLC進(jìn)行定量檢測,比較產(chǎn)量.

        2 結(jié)果與討論

        2.1 最佳低能離子注入能量和劑量

        分別在a、b、c三種能量下,按照表1中的N+注入劑量進(jìn)行注入.注入后,立即在每個平皿中加入2 mL不含秦艽DNA的TE溶液,37 ℃溫育2 h,用無菌刮鏟刮下薄膜后,經(jīng)平板培養(yǎng)18 h計(jì)算存活率,其結(jié)果如表2所示.

        試驗(yàn)a各組經(jīng)平板培養(yǎng)后,除空白對照組外,都未長出菌落;試驗(yàn)b平面培養(yǎng)后,除對照組菌落過多之外,其余各組菌落數(shù)均有不同程度地減少,且出現(xiàn)隨著劑量的增加菌落數(shù)呈現(xiàn)先增加后減少的現(xiàn)象;試驗(yàn)c經(jīng)平面培養(yǎng)后,出現(xiàn)各組菌落數(shù)均有一定程度減少,但減少幅度較小.

        產(chǎn)生上述結(jié)果的主要原因是:試驗(yàn)a是由于能量過大在對DNA產(chǎn)生更大傷害的同時(shí),對細(xì)胞壁及細(xì)胞質(zhì)的刻蝕過于嚴(yán)重,產(chǎn)生不可逆的損傷,導(dǎo)致細(xì)胞死亡.

        試驗(yàn)b當(dāng)以能量為25 keV劑量較低時(shí),注入N+只對細(xì)胞表面進(jìn)行損傷和刻蝕,損傷程度低,易于修復(fù),因此,存活率較高.隨著注入劑量的增加,細(xì)胞表面刻蝕嚴(yán)重,離子損傷及細(xì)胞內(nèi)部產(chǎn)生大量自由基和軟射線等,致使存活率急劇下降;當(dāng)注入劑量達(dá)到20×1015ions/cm2時(shí),存活率下降到最低.隨著注入劑量的增加,可能激活細(xì)胞內(nèi)某個修復(fù)機(jī)制,導(dǎo)致存活率有小幅度回升,之后隨著離子注入劑量的增加存活率再一次下降(如圖1所示),這一結(jié)論與毛培宏提出的離子注入與生物體的相互作用機(jī)理[15]一致.

        試驗(yàn)c由于能量低,離子對細(xì)胞表面損傷和刻蝕程度較輕,經(jīng)過細(xì)胞的自我修復(fù),存活率隨著劑量的增加雖有一定程度地降低,但幅度較小.

        表2 菌落存活數(shù)

        經(jīng)過上述試驗(yàn)確定,N+注入技術(shù)轉(zhuǎn)化H.polymorphaDL-1的最佳條件為:低能離子注入能量,25 keV;劑量,25×1015ions/cm2.10-3真空條件下,脈沖注入10 s,間隔10 s.

        圖1 低能N+注入多形漢遜酵母的存活率曲線

        2.2 初篩結(jié)果分析

        在能量25 keV、注入劑量25×1015ions/cm2、10-3Pa真空條件下,注入后,加入2 mL含秦艽基因組的TE溶液浸泡.37 ℃溫育2 h,將刮下來的菌液接種到Y(jié)PD固體培養(yǎng)基中,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h,取單菌落活化后接種到100 mL YPD液體培養(yǎng)基中進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),對發(fā)酵產(chǎn)物采用Molish反應(yīng)、香草醛反應(yīng).

        結(jié)果顯示:在2,000多株備選菌株中,有313株的發(fā)酵液在Molish反應(yīng)中有紫環(huán)產(chǎn)生;有173株的發(fā)酵液在香草醛反應(yīng)中試管底部出現(xiàn)棕色或紅色;同時(shí)在兩種顏色反應(yīng)中均有相應(yīng)顏色出現(xiàn)的僅有54株.在真空條件下未經(jīng)離子注入的酵母菌在導(dǎo)入秦艽基因組DNA的處理中,未獲得糖苷類或環(huán)烯醚萜類物質(zhì)陽性反應(yīng)的菌株.由此可說明,用低能N+介導(dǎo)將秦艽基因組導(dǎo)入酵母的方法初步認(rèn)為是可行的,同時(shí)也說明了導(dǎo)入外源DNA大分子轉(zhuǎn)化的隨機(jī)性和重組菌株的遺傳多樣性.

        2.3 復(fù)篩結(jié)果分析

        經(jīng)過初篩獲得了54株備選菌株,通過發(fā)酵培養(yǎng)、濃縮等,制備樣品溶液.取20 μL各樣品溶液在薄層層析展板上點(diǎn)樣、風(fēng)干.在展開劑氯仿-甲醇(4∶1,V/V)中展開,結(jié)束后揮發(fā)干展開劑,在紫外燈下觀察,結(jié)果發(fā)現(xiàn)一株的發(fā)酵液斑點(diǎn)與龍膽苦苷的標(biāo)準(zhǔn)品在同一直線上,其Rf值完全相同,均為0.30(如圖2所示),由此可以初步斷定,該菌株為目標(biāo)重組菌.

        取Rf值一致的樣品溶液0.5 mL,用0.45μm微孔濾膜過濾,以20μL的進(jìn)樣量,25 ℃柱溫,270 nm波長,1 mL/min流速,進(jìn)行高效液相色譜(HPLC)分析檢測.對出峰時(shí)間和峰面積進(jìn)行記錄分析,其結(jié)果如圖3所示.重組菌株的發(fā)酵液在高效液相色譜中的出峰時(shí)間為12.377 min,與龍膽苦苷標(biāo)準(zhǔn)品的出峰時(shí)間12.370 min基本一致,而出發(fā)菌株的發(fā)酵液在該位置未出現(xiàn)峰.

        由上述試驗(yàn)結(jié)果分析,可以確定該重組菌株為目標(biāo)菌株,即可以發(fā)酵生產(chǎn)龍膽苦苷的酵母重組菌株.

        1:出發(fā)菌株的發(fā)酵液;2:龍膽苦苷標(biāo)準(zhǔn)品;3:重組菌株的發(fā)酵液圖2 菌株發(fā)酵液的薄層層析圖譜

        (a) 龍膽苦苷標(biāo)準(zhǔn)品HPLC圖譜

        (b) 重組菌株發(fā)酵液HPLC圖譜

        (c) 出發(fā)菌株發(fā)酵液HPLC圖譜圖3 菌株發(fā)酵液的HPLC圖譜

        2.4 產(chǎn)龍膽苦苷的重組菌株的傳代穩(wěn)定性試驗(yàn)

        將復(fù)篩篩選出的重組菌株活化后接入5 mL YPD培養(yǎng)基中,培養(yǎng)18 h,用甘油保藏菌種,同時(shí)傳代培養(yǎng),斜面?zhèn)髦?代,分別對8代菌株進(jìn)行活化、發(fā)酵培養(yǎng),對發(fā)酵產(chǎn)物進(jìn)行高效液相色譜分析,比較產(chǎn)量.其結(jié)果如表3所示,各代產(chǎn)量略有變化,但整體基本保持不變.這說明該菌株傳代穩(wěn)定性較好.

        表3 重組菌株的遺傳穩(wěn)定性試驗(yàn)

        3 結(jié)論

        本試驗(yàn)利用低能N+注入對多形漢遜酵母進(jìn)行直接注入誘變,通過存活率繪制出劑量-效應(yīng)曲線,即“馬鞍型”曲線,獲得最佳低能離子注入能量和劑量.利用最佳的低能離子注入能量和劑量注入介導(dǎo)秦艽基因組隨機(jī)轉(zhuǎn)化酵母,經(jīng)Molish反應(yīng)和香草醛反應(yīng)對轉(zhuǎn)化子進(jìn)行初篩,接著利用薄層層析法和高效液相色譜法等對初篩獲得的候選菌株進(jìn)行復(fù)篩,再結(jié)合遺傳穩(wěn)定性試驗(yàn),獲得了1株遺傳穩(wěn)定能生物合成龍膽苦苷的酵母重組菌.

        本試驗(yàn)結(jié)果表明,利用低能離子注入技術(shù)構(gòu)建產(chǎn)天然產(chǎn)物重組酵母菌株,具有如下優(yōu)點(diǎn):即在事先不清楚天然產(chǎn)物生物合成途徑及其相關(guān)基因或無需克隆相關(guān)基因構(gòu)建重組質(zhì)粒的情況下,可以實(shí)現(xiàn)“一步”構(gòu)建產(chǎn)天然產(chǎn)物的重組酵母菌,為天然產(chǎn)物新藥源的開發(fā)提供了新思路、新方法.另外,人們還可以利用“逆向思維”,將獲得的產(chǎn)天然產(chǎn)物酵母重組菌作為研究對象,依托操作簡便的酵母遺傳操作平臺,深入研究天然產(chǎn)物的生物合成途徑及其相關(guān)基因的功能.

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