溫會玲,陳玉燕
(青島科技大學 化學與分子工程學院,山東 青島 266042)
近年來,金屬配合物作為DNA分子識別的研究取得了長足的進展,發(fā)現(xiàn)了一批具有DNA特異識別屬性的小分子配合物,為新型基因選擇性藥物的篩選提供了重要信息。金屬配合物已經(jīng)廣泛用于DNA結(jié)構(gòu)探針、DNA分子開關(guān)、DNA足跡試劑以及DNA斷裂試劑等研究領(lǐng)域[1,2]。苯并咪唑類化合物與金屬配合物的研究一直是生物無機化學、醫(yī)藥及材料科學等領(lǐng)域十分活躍的研究課題[3]。本文用紫外光譜、電化學方法研究了2-(喹啉-8-氧甲基)苯并咪唑鎘配合物與DNA的相互作用,結(jié)果表明,該配合物可以作為ssDNA和dsDNA的結(jié)構(gòu)識別探針。
石墨粉(上海膠體化工廠);高效切片石蠟(上海華靈康復器械廠);pH值為4鄰苯二甲酸氫鉀標準液(上海雷磁儀器廠)。鯡魚精DNA(dsDNA,Sigma產(chǎn)品),使用前未進一步提純,測得A260/A280>1.80,表示其純度符合要求。dsDNA濃度以堿基對表示,通過 260nm(ε260=6600L·mol-1·cm-1)處吸光度確定。變性單鏈DNA(ssDNA)根據(jù)文獻制備[4]。所有溶液都用二次蒸餾水制備。2-(喹啉-8-氧甲基)苯并咪唑(L)鎘配合物[Cd(L)Cl2(H2O)]晶體按文獻方法合成[5],其它試劑均為分析純。
CHI832電化學分析儀;pHS-25型酸度計;三電極系統(tǒng):飽和甘汞電極(SCE)為參比電極,鉑片電極為對電極,碳糊電極為工作電極;DZF-150型真空干燥箱;TU-1810紫外-可見分光光度計。
用 0.1mol·L-1HOAc-NaOAc(pH值為 4.0)緩沖液稀釋儲備液,得到4.60×10-5mol·L-1配合物溶液,在含4.60×10-5mol·L-1配合物溶液中加入相同量的dsDNA(ssDNA),搖勻,充分反應,在200~900nm進行紫外光譜測定。
紫外滴定實驗:配制4.60×10-5mol·L-1配合物溶液,準確量取3mL于石英比色皿中,測定配合物的紫外光譜,逐次向配合物溶液中加入一定量dsDNA或ssDNA溶液,搖勻充分反應后,分別測定其紫外譜圖。
在含 5.67×10-5mol·L-1Cd配合物的 0.1mol·L-1HOAc-NaOAc緩沖液(pH值為4.0)中,加入相同濃度的dsDNA或ssDNA,充分反應,以碳糊電極為工作電極進行電化學測定。在5.62×10-5mol·L-1配合物中加入不同濃度的dsDNA,充分反應后,測定其微分脈沖伏安曲線。
圖1為配合物與DNA相互作用的循環(huán)伏安圖。
圖1 配合物與dsDNA、ssDNA相互作用的循環(huán)伏安圖Fig.1 Cyclic voltammograms of complex in the absence(a)and presence of dsDNA(b)and ssDNA(c)
配合物于0.178V出現(xiàn)一個氧化峰,其峰電流為5.724×10-7A,0.106V出現(xiàn)一個還原峰,峰電流為1.861×10-7A,氧化還原峰峰形良好。ΔEp=Epc-Epa=72mV,Ipa/Ipc=3.07,由此可見,該氧化還原過程屬于不可逆過程。
與dsDNA或ssDNA充分反應后,氧化峰電流明顯減小,加入ssDNA后峰電流更小,說明其與DNA發(fā)生了相互作用,且與ssDNA的作用更強;配合物的式電位從0.142V負移至0.133V和0.128V(見表1),根據(jù)文獻知,當電活性小分子與DNA發(fā)生靜電作用時,電化學電位向負移動;產(chǎn)生嵌插作用時,向正方向移動。由此說明Cd配合物與DNA間主要是靜電作用,此外,ssDNA暴露于外部的堿基也可能與配合物發(fā)生了相互作用,使得ssDNA與配合物作用更強。配合物與dsDNA和ssDNA不同的作用模式和作用強度,使Cd配合物有可能用于DNA二級結(jié)構(gòu)的識別。
表1 Cd配合物結(jié)合DNA前后的電化學參數(shù)Tab.1 Electrochemical data of Cd complex in the absence and presence of DNA
研究了加入DNA前后,電位掃描速度對配合物循環(huán)伏安曲線的影響,結(jié)果表明,無論DNA是否存在,配合物的氧化峰電流都與掃速(v)成良好的線性關(guān)系,說明配合物在電極上的電化學行為主要受吸附控制。
對于一個吸附控制的不可逆過程,根據(jù)Laviron公式,氧化峰電位(Ep)與掃速(v)之間存在如下關(guān)系:
E0′是式電位,α是電子轉(zhuǎn)移系數(shù),n是電化學過程中轉(zhuǎn)移的電子數(shù),k0是電化學速率常數(shù)。以Ep對ln v作圖(圖 2),得到 Ep=0.0262ln v+0.2354(γ=0.999),計算得到αn=0.9637,則n=1.93,說明該氧化過程是一個2電子過程,對應于Cd→Cd2+的過程。
圖2 峰電位E p與L nv關(guān)系圖Fig.2 Plot of peak potential E p versus L nv
在5.62×10-5mol·L-1的Cd配合物中加入不同濃度的dsDNA后,測定其微分脈沖伏安曲線(圖3),隨著dsDNA濃度的增加,樣品的峰電流逐漸減小,當 dsDNA濃度為5.589×10-5mol·L-1時,樣品的氧化峰電流趨于穩(wěn)定,說明配合物與dsDNA間的反應達到飽和狀態(tài)。
圖3 配合物微分脈沖伏安圖Fig.3 Differential pulse voltammograms of the complex
將加入dsDNA后配合物的氧化峰電流(I pa)對dsDNA的濃度做圖,見圖4。
圖4 配合物的氧化峰電流與DNA濃度的關(guān)系Fig.4 Plotof peak current Ipa versus CDNA
由圖4可見,配合物的峰電流與dsDNA濃度在兩個濃度區(qū)間呈良好的線性關(guān)系,線性關(guān)系式分別為Ipa/(10-7A)=2.4094C+9.94(γ=0.9999)。Ipa/(10-7A)=-0.3412C+4.1067(γ=0.983)。因此,該配合物有望用于DNA的定量分析。
圖5 配合物與DNA相互作用的紫外吸收光譜Fig.5 UV-vis spectra of complex in the absence and presence of DNA
由圖5可見,在配合物溶液中加入dsDNA或ssDNA后,所有的吸收峰都未出現(xiàn)紅移,說明配合物與DNA間不存在嵌插作用,而是以靜電作用為主。所有吸收峰均產(chǎn)生減色效應,加入ssDNA后減色效應更明顯。即配合物與ssDNA的作用更強,該結(jié)論與電化學研究結(jié)果一致。
利用紫外滴定法測定了配合物與dsDNA、ssDNA的結(jié)合能力,圖6為配合物與dsDNA紫外滴定譜圖。
圖6 配合物與dsDNA的紫外滴定譜圖Fig.6 UV-vis titration spectra of complex
依據(jù)方程式CDNA/(εa-εf)=CDNA/(εb-εf)+1/Kb(εa-εf),以CDNA/(εa-εf)對CDNA作圖為一直線,直線方程為 y=5.0254x+2.5966(γ2=0.9755),斜率與截距的比值即為結(jié)合常數(shù)Kb(dsDNA)=1.935×104L·mol-1。同理得到Kb(ssDNA)=4.462×104L·mol-1。結(jié)合常數(shù)的測定從實驗數(shù)據(jù)上進一步證明配合物與ssDNA作用更強。
應用紫外光譜和電化學方法研究了2-(喹啉-8-氧甲基)苯并咪唑鎘配合物與DNA的相互作用,結(jié)果表明,該配合物可以作為ssDNA和dsDNA二級結(jié)構(gòu)識別探針。微分脈沖伏安實驗結(jié)果證明,該配合物有望用于DNA的定量分析,可能共存的干擾物質(zhì)對DNA定量檢測的影響將在后續(xù)實驗中進行。
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