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        海洋紅細(xì)菌Lentibacter algarum胞外多糖的分離純化及結(jié)構(gòu)解析

        2014-06-19 06:58:30李佩佩陳雪昌張玉榮張小軍梅光明郭遠(yuǎn)明
        生物工程學(xué)報(bào) 2014年3期
        關(guān)鍵詞:信號分析

        李佩佩,陳雪昌,張玉榮,張小軍, 梅光明,郭遠(yuǎn)明

        浙江省海洋水產(chǎn)研究所 浙江省海水增養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 舟山 316021

        多糖作為除核酸、蛋白以外的另一類大分子物質(zhì),以其豐富的結(jié)構(gòu)和獨(dú)特的理化性質(zhì)日益受到關(guān)注并得到廣泛的應(yīng)用。多糖按照來源分為植物多糖、動物多糖和微生物多糖。不同來源的多糖在結(jié)構(gòu)上有很大的差異。微生物多糖相比其余兩種而言,組成更加復(fù)雜多樣,結(jié)構(gòu)更加豐富,并且微生物由于其發(fā)酵條件可控,不受地域、天氣季節(jié)、病蟲害等因素的影響,可大規(guī)模發(fā)酵,應(yīng)用前景更加廣闊。凝乳糖、菌核葡聚糖、吉蘭多糖、黃原膠多糖等微生物多糖在食品和工業(yè)方面已經(jīng)得到廣泛的應(yīng)用[1-2]。

        隨著對海洋微生物活性物質(zhì)研究的深入,研究者發(fā)現(xiàn)海洋微生物是獲得多糖的有效資源[3-5]。研究表明,絕大部分細(xì)菌都處于活的非可培養(yǎng)狀態(tài),常規(guī)條件下在培養(yǎng)基上不生長繁殖,所以能獲得和利用的微生物資源相比而言還非常有限。但是在一些理化因素及生物因素發(fā)生改變時,一些細(xì)菌可以復(fù)蘇并可在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)出來,這一些微生物將成為重要的微生物及微生物資源[6-7]。我們從潮間帶海水中分離培養(yǎng)得到的一株海洋紅細(xì)菌發(fā)酵液中,分離純化其胞外多糖,并對其理化性質(zhì)和初步結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行了測定。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        D-葡萄糖、D-半乳糖、D-甘露糖、L-巖藻糖、D-鼠李糖、D-阿拉伯糖、D-葡萄糖醛酸、1-苯基-3-甲基-5-吡唑啉酮 (PMP,99%) 均為Sigma公司產(chǎn)品;不同分子量葡聚糖標(biāo)準(zhǔn)品Dextran (Ultra Pure, 美國Fluka公司);標(biāo)準(zhǔn)牛血清蛋白 (Ultra Pure,美國Sigma公司),F(xiàn)olin酚試劑乙以及重蒸酚 (北京鼎國生物工程公司);95%乙醇、丙酮、濃硫酸、無水乙醇、咔唑、硼砂、乙酰丙酮、對二苯氨基苯甲醛、二甲亞砜、吡啶、醋酸酐、氫化鈉、硼氫化鈉、二氯甲烷、肌醇六乙酸酯、酒石酸鉀鈉、碳酸鈉、硫酸銅、三氟乙酸等均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 儀器

        紫外可見分光光度計(jì) (Cary 50,美國瓦里安公司);高效液相色譜儀 (Waters 2695, 美國Waters公司);快速蛋白質(zhì)液相色譜儀 (AKTA FPLC Pharmacia Biotech, Sweden);在線紫外檢測器 (Uvicord SII Pharmacia Biotech, Sweden);旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀 (R-215 BüCHI, Switzerland);便攜式pH計(jì)(Five FG2, METTLER TOLEDO,Switzerland);高速離心機(jī) (Centrifuge 5810,Eppendorf);電熱恒溫真空干燥箱 (DHG-9123A型,上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備儀器有限公司);超級恒溫槽 (SC-15,寧波新芝生物科技);真空冷凍干燥機(jī) (美國LABCONCO,美國);G1362A型示差折光檢測器;氣相色譜儀 (450GC,美國瓦里安公司);Shodex OHpak SB-804 HQ (8.0 mm×300 mm) (Shodex,Japan);Eclipse XDB-C18 (4.6 μm×250 mm),(Agilent Technologies, USA);Jeol JNM-ECP超導(dǎo)核磁共振波譜儀 (600 MHz) (日本電子)。

        1.3 菌株鑒定及胞外多糖提取

        菌株經(jīng)實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)發(fā)酵后鑒定為好氧型革蘭氏陰性菌,菌體為不規(guī)則卵圓形,無鞭毛?;?6S rRNA進(jìn)化分析表明細(xì)菌屬于變形菌綱(Alphaproteobacteria),玫瑰桿菌支系 (Roseobacter clade)。表型及系統(tǒng)發(fā)生分析最終確定屬紅色細(xì)菌科 (Rhodobacteraceae),命名為Lentibacter algarum[8]。

        細(xì)菌發(fā)酵液經(jīng)布氏漏斗雙層濾紙抽濾分離除去菌體及其中的粗雜質(zhì),并用乙酸乙酯萃取分離小分子脂溶性物。將水相旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)濃縮至約為原體積的1/10。再將預(yù)冷2 h的95%的乙醇緩慢加入到濃縮液中 (體積比4∶1),邊加邊攪拌,有沉淀析出,把醇沉后的溶液放入冰箱中靜置過夜。傾出上層清液,沉淀部分用布氏漏斗三層濾紙抽濾,并依次用無水乙醇、丙酮數(shù)次脫水后于40 ℃烘干,將其溶于適量蒸餾水后的上清液置于截留分子量為3 500的透析袋中對蒸餾水透析2 d,電導(dǎo)率儀測試透析外液至恒定值時停止透析,將透析液濃縮冷凍干燥即得到胞外多糖粗品。

        1.4 胞外多糖的分離純化

        [9]進(jìn)行:將胞外多糖粗品采用離子交換色譜 (IEC) 純化,在AKTA FPLC快速蛋白純化系統(tǒng)上用 Q S.epharose FF柱進(jìn)行純化,用0–2 mol/L NaCl溶液線性洗脫,根據(jù)線性洗脫結(jié)果,確定NaCl梯度洗脫濃度并分別以0、0.1、0.5和1.0 mol/L NaCl洗脫,部分收集器收集各組分,硫酸-苯酚法測定多糖含量,490 nm檢測。

        1.5 多糖的凝膠純化

        參考文獻(xiàn)[10]進(jìn)行:選取樣品La0.1以Superdex 75凝膠柱進(jìn)一步純化,以0.2 mol/L NH4HCO3為流動相,自動部分收集,同時作樣品的凝膠純化曲線,為保證多糖純度,我們只取峰尖部分,得到純度較高的多糖樣品命名為La0.1-1。

        1.6 分子量分析

        參考文獻(xiàn)[11]進(jìn)行:采用Shodex SB804柱,流動相為0.2 mol/L Na2SO4溶液,柱溫35 ℃,流速0.5 mL/min。進(jìn)樣量為20 μL,RI在線檢測。

        1.7 多糖完全酸水解及PMP柱前衍生高效液相色譜分析 (HPLC)

        參考文獻(xiàn)[12]進(jìn)行:將多糖樣品1 mg加2 mol/L TFA,在安瓿瓶中105 ℃密封降解6 h后,氮吹除去TFA。干燥后采用PMP衍生法對多糖水解得到的單糖樣品衍生后進(jìn)行高效液相色譜分析。液相以HPLC Column ZORBAX Eclipse XDB-C18柱進(jìn)行測定,流動相為磷酸鹽緩沖液∶乙腈=83∶17,柱溫25 ℃,流速1.0 mL/min,紫外檢測器檢測。根據(jù)出峰時間和峰面積比可知樣品的單糖組成和摩爾比。

        1.8 含量測定

        參考文獻(xiàn)[13-17]進(jìn)行:采用硫酸-苯酚法,以甘露糖為標(biāo)準(zhǔn)品測定樣品的總糖含量。采用硫酸-咔唑法,以葡萄糖醛酸為標(biāo)準(zhǔn)測定糖醛酸的含量。Elson-Morgan法測氨基糖含量。采用Follin酚法,以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)測定蛋白質(zhì)含量。

        1.9 甲基化分析

        參考文獻(xiàn)[18]進(jìn)行:采用改良的 Hakomori法對得到的多糖 La0.1-1進(jìn)行甲基化分析。稱取1.0 mg減壓干燥后的多糖純品,加入1.0 mL二甲基亞砜,磁力攪拌至樣品完全溶解,快速加入100.0 mg干燥的NaH,充入N2密封后于室溫下反應(yīng)1 h,緩慢加入碘甲烷1.0 mL,繼續(xù)反應(yīng)1 h,最后加入1.0 mL水終止反應(yīng)。反應(yīng)液以氯仿萃取多次,合并萃取液,并以水洗滌氯仿層3次。甲基化后多糖經(jīng)減壓干燥,進(jìn)行紅外光譜分析以確定甲基化是否完全。

        將甲基化后樣品完全酸水解,硼氫化鈉還原,醋酸酐乙?;玫揭阴;苌?,進(jìn)行氣質(zhì)分析 (GC-MS)。

        1.10 核磁分析 (NMR)

        參考文獻(xiàn)[19]進(jìn)行:取40.0 mg La0.1-1以0.5 mL D2O溶解,反復(fù)交換2次。最后以0.7 mL D2O將樣品溶于核磁管,加入一滴氘代丙酮作為內(nèi)標(biāo),在23 ℃下,利用1H-NMR、13C-NMR等核磁技術(shù)對La0.1-1進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析。

        2 結(jié)果

        2.1 胞外粗多糖的提取及分離純化

        胞外粗多糖的產(chǎn)量約為0.15 g/L,為純白色粉末,經(jīng)Q-Sepharose Fast Flow陰離子色譜柱分離純化后主要得到水洗和 0.1、0.5、1.0 mol/L NaCl洗脫4個組分,分別命名為La0、La0.1、La0.5和La1.0 (圖1和圖2)。

        圖1 胞外粗多糖Q-Sepharose Fast Flow 離子交換梯度洗脫圖Fig. 1 Segment elution graph of crude polycaccharide in Q-Sepharose fast-flow column.

        圖2 La0.1 Superdex 75 凝膠滲透洗脫圖Fig. 2 Permeation elution graph of the La0.1 in Superdex 75 column.

        由于含量及純度等原因,選取含量最高的組分La0.1進(jìn)行下一步凝膠滲透色譜純化,收集主峰,命名為La0.1-1。純化后經(jīng)shodex SB804凝膠滲透色譜顯示峰形較為對稱,純度較高,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程計(jì)算,其分子量為12.0 kDa。

        2.2 單糖組成分析

        由單糖組成液相色譜圖 (圖3) 所示,La0.1-1的單糖組成較為簡單,主要含有甘露糖,氨基葡萄糖和半乳糖。三者的摩爾比約為Man∶GlcN∶Gal=1.1∶1.0∶1.35。該組分單糖組成不含有酸性糖,而和很多細(xì)菌來源多糖相似,富含GlcN這類堿性糖,但在單糖組成上主要由甘露糖、氨基葡萄糖和半乳糖組成,且三者比例相似,在細(xì)菌來源多糖中較為少見。

        2.3 含量分析

        對多糖La0.1-1進(jìn)行理化性質(zhì)分析結(jié)果表明,La0.1-1總糖含量為66.3%,氨基糖含量為25%,未檢測出糖醛酸。和中性多糖相比,La0.1-1總糖含量偏低,可能是由于樣品中氨基糖的含量過高,導(dǎo)致苯酚硫酸法比色時顏色偏淺,造成誤差較大。樣品中還含有8.1%的蛋白,對含量測定和結(jié)構(gòu)分析也造成一定的影響,蛋白是否為多糖結(jié)合蛋白仍需進(jìn)一步分析確定。

        圖3 La0.1-1單糖組成的液相色譜圖Fig. 3 Monosaccharides of La0.1-1 in HPLC chromatography.

        2.4 甲基化分析

        為研究多糖中單糖之間的連接方式,采用改良的 Hakmoori法對 La0.1-1多糖進(jìn)行甲基化分析。甲基化后的樣品經(jīng)完全酸水解并經(jīng)過還原后制備成乙?;苌铮捎脷赓|(zhì)聯(lián)用儀(GC-MS) 進(jìn)行檢測 (圖4)。

        圖4 La0.1-1的氣質(zhì)聯(lián)用總離子流色譜圖Fig. 4 Total ion chromatogram of La0.1-1 on GC-MS.

        結(jié)果表明,La0.1-1的連接方式較為復(fù)雜,存在Manp(1→,Galp(1→,→2)Manp(1→,→3)Galp(1→,→4)Manp(1→,→4)Galp(1→,→3,4)Galp(1→,→2,6)Manp(1→,→3,6)Galp(1→連接方式。各單糖具體連接方式和比例如表1所示。La0.1-1的連接方式主要以→2)Manp(1→,→3)Galp(1→為主,占總連接方式的40%以上,還含有少量的→4)Manp(1→,→4)Galp(1→連接方式。根據(jù)比例判斷,大約每五個糖存在一個分支,分支在→2)Manp(1→的O-6位和→3)Galp(1→的O-4或O-6位。該分析條件無法得到氨基糖相關(guān)的連接方式的信息。

        2.5 核磁分析

        為進(jìn)一步確定多糖的結(jié)構(gòu),對La0.1-1 進(jìn)行了1H和13C NMR波譜分析。通過對氫譜分析 (圖5A所示發(fā)現(xiàn),異頭質(zhì)子信號主要集中在4.4–4.7 ppm處。因此推測該多糖的構(gòu)型主要以 β構(gòu)型為主[20-21,12]。氫譜在2.0 ppm 處,出現(xiàn)了甲基的信號,碳譜 (圖5B 所示) 在175 ppm 處出現(xiàn)了大量的羰基信號,推測多糖中存在乙?;〈?。通過和文獻(xiàn)比對,我們推測乙酰基取代主要發(fā)生在氨基葡萄糖上,為乙酰氨基葡萄糖[22],甘露糖和半乳糖上應(yīng)該也有一定的乙?;〈?,取代位置可能為甲基化分析中的分支位點(diǎn)處,因?yàn)橐阴;稽c(diǎn)不能甲基化,最終結(jié)果和多糖分支處的甲基化結(jié)果一致。

        通過和已知多糖核磁數(shù)據(jù)相互比對[23-24],我們推斷104.3 ppm處的信號為→3)-β-D-Galp(1→的異頭碳信號。103.8 ppm處為→4)-β-D-Galp(1→的異頭碳信號。102.9 ppm處推測為→4)-β-D-GlcNAcp(1→的信號,101.5 ppm 處為→4)-β-D-Manp(1→的信號,100.6 ppm處 為→2)-D-Manp(1→的信號。99.0 ppm處可能為非還原末端GlcNAc或Gal的異頭碳信號。82.9 ppm處為→3)-β-D-Galp(1→的C3位信號。80.6 ppm處的兩 個 信 號 分 別 為 →4)-β-D-Galp(1→ 和→4)-β-D-GlcNAcp(1→的C4信號。78.0 ppm處可能為2位被取代的C2信號。62.0 ppm為未被取代C6位信號,而在67.0處的信號表明有部分C6被取代[25],與甲基化結(jié)果相符合。56.0 ppm左右為氨基葡萄糖的C2位信號。

        表1 細(xì)菌胞外多糖組分La0.1-1甲基化水解產(chǎn)物GC-MS分析結(jié)果Table 1 GC-MS results of the fraction La0.1-1 after methylation

        圖5 La0.1-1的 1H譜(A)和 13C譜(B)Fig. 5 1H NMR (A) and 13C NMR (B) of La0.1-1.

        雖然通過一維核磁的分析和比對能歸屬出大部分信號,但該多糖的結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,具體連接順序的信息還需要進(jìn)步通過二維核磁來進(jìn)一步確定。

        3 討論

        對青島潮間帶海水中分離得到的一株海洋紅細(xì)菌Lentibacter algarumZXM100T 所產(chǎn)胞外多糖進(jìn)行了分離純化,對含量較高的組分 La0.1進(jìn)一步純化得到組分 La0.1-1,并對其化學(xué)組成和結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究。結(jié)果表明,La0.1-1主要由半乳糖、甘露糖和氨基葡萄糖組成,其摩爾比約為1.35∶1.1∶1.0,分子量約為12.0 kDa。通過甲基化分析和核磁分析表明,該多糖為存在少量分支的直鏈結(jié)構(gòu)。多糖連接方式主要為β構(gòu)型,其中半乳糖主要為→3)Galp(1→和少量的→4)Galp(1→連接,甘露糖主要為→2)Manp(1→和少量→4)Manp(1→連接,氨基葡萄糖主要為→4)GlcNAc(1→和末端連接方式。分支發(fā)生在→2)Manp(1→的 C6位或→3)Galp(1→C6和 C4位。核磁分析還發(fā)現(xiàn)該多糖存在一定的乙?;〈?,主要取代在氨基葡萄糖的C2位,可能還有一定取代發(fā)生在→3)Galp(1→的C4或C6位。雖然未確定La0.1-1的最終結(jié)構(gòu),但初步分析表明該多糖的結(jié)構(gòu)具有一定的新穎性,因?yàn)橐园肴樘菫橹?,并同時含有大量甘露糖和氨基葡萄糖的多糖鮮有報(bào)道。該研究為海洋微生物胞外多糖的開發(fā)利用提供了重要資料,也確定了海洋微生物是獲取結(jié)構(gòu)豐富多糖的重要資源。該多糖具體的結(jié)構(gòu)信息還有待進(jìn)一步研究,純度還需提高,減少蛋白對結(jié)構(gòu)和活性測定的影響,并進(jìn)行可能的生物活性篩選。

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