呂吉爾/編譯

新技術(shù)產(chǎn)生癌細(xì)胞（背景部分）的詳細(xì)蛋白表達(dá)圖譜（嵌入部分）

在2014年1月15日出版的《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》期刊上，美國(guó)馬薩諸塞州總醫(yī)院的研究人員描述了一種采用少量細(xì)胞樣本表征深度蛋白質(zhì)的新方法：一種攜帶光致裂DNA的抗體條形碼（ABCD）平臺(tái)，首次涉及讓收集到的細(xì)胞通過(guò)一種微流體裝置，結(jié)合抗體分離出感興趣的（癌）細(xì)胞。

在確認(rèn)ABCD平臺(tái)作為癌細(xì)胞圖譜分析工具之前，該平臺(tái)甚至能對(duì)單個(gè)細(xì)胞中的蛋白表達(dá)進(jìn)行精確圖譜分析，無(wú)論病人在接受治療之前還是之后。該論文通信作者、馬薩諸塞州總醫(yī)院系統(tǒng)生物學(xué)中心負(fù)責(zé)人拉爾夫·韋斯萊達(dá)（Ralph Weissleder）說(shuō)：“這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)在于用較少量的細(xì)胞做更全面的分析。”

傳統(tǒng)的從癌癥樣品中分析蛋白表達(dá)水平不僅耗時(shí)，而且需要大量的組織樣本，有時(shí)甚至需要補(bǔ)充采樣。相比之下，ABCD平臺(tái)可以在幾個(gè)小時(shí)的時(shí)間里完成分析，而且無(wú)需補(bǔ)充采樣（傳統(tǒng)的分析方法則需要幾天的時(shí)間）。

紐約長(zhǎng)老會(huì)醫(yī)院的馬克·魯賓 （Mark Rubi n）說(shuō)：“在這項(xiàng)研究中，人們可以非常靈敏地篩選或組合使用多種供選擇的抗體。同時(shí)，這種無(wú)需擴(kuò)增樣品的技術(shù)還能減少有時(shí)不得不人為增強(qiáng)信號(hào)的工作?！?/p>

研究人員選擇了90多種抗體進(jìn)行組合，即那些既能涵蓋與腫瘤相關(guān)聯(lián)的或在診斷中經(jīng)常被使用的蛋白質(zhì)，同時(shí)又能涵蓋對(duì)照組的蛋白質(zhì)。論文共同作者、馬薩諸塞州總醫(yī)院系統(tǒng)生物學(xué)中心癌癥項(xiàng)目負(fù)責(zé)人塞薩爾·卡斯特羅（Cesar Castro）認(rèn)為，抗癌藥物往往會(huì)導(dǎo)致大量的連鎖反應(yīng)，有時(shí)意想不到的通道是最有可能受藥物治療的影響?！霸?0個(gè)左右的免疫組織化學(xué)標(biāo)記物里，你是看不到這種反應(yīng)的，由此會(huì)失去許多信息?！倍鳤BCD平臺(tái)可以顯著地增加標(biāo)記物的數(shù)量?！拔覀?cè)谘芯窟@些通道上的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)的同時(shí)，還能夠研究其他相關(guān)的通道?！笨ㄋ固亓_說(shuō)。

在分析樣品RNA、DNA和蛋白質(zhì)水平過(guò)程中，傳統(tǒng)的方法把樣品分為兩半，一半用于RNA和DNA研究，另一半用于蛋白質(zhì)研究。由于分割后的樣品可能不完全同質(zhì)，科學(xué)家所看到的表達(dá)圖譜不一定精準(zhǔn)。通過(guò)ABCD平臺(tái)，就可以在同一細(xì)胞樣品中檢驗(yàn)DNA、RNA和蛋白質(zhì)。韋斯萊達(dá)說(shuō)：“這種技術(shù)讓你能夠在同一時(shí)間框架內(nèi)進(jìn)行癌細(xì)胞整體圖譜分析?！?/p>

對(duì)病人而言，ABCD平臺(tái)的特征就是用少量細(xì)胞觀(guān)測(cè)蛋白表達(dá)水平，以此降低穿刺——提取大量的細(xì)胞——引發(fā)感染的風(fēng)險(xiǎn)?！霸谌粘５木珳?zhǔn)施藥操作中，我們有一些不得不面對(duì)的困難，”魯賓說(shuō)，“我們對(duì)病人腫瘤細(xì)胞中的基因變化必須判斷準(zhǔn)確，同時(shí)我們還應(yīng)該盡可能以創(chuàng)傷最小的方式做到這一切。而這種技術(shù)恰恰可以應(yīng)對(duì)這些挑戰(zhàn)。”

ABCD平臺(tái)雖然已經(jīng)獲得概念上的驗(yàn)證，但專(zhuān)家們一致認(rèn)為，這種技術(shù)還需進(jìn)一步檢驗(yàn)?！俺醪接^(guān)察結(jié)果只能說(shuō)明該技術(shù)是有用的，”魯賓說(shuō)，“它需要接受進(jìn)一步的嚴(yán)格測(cè)試，需要被證實(shí)在其他實(shí)驗(yàn)室也同樣有效?！?/p>

美國(guó)克利夫蘭診所勒納研究所的杰里米·里奇（Jeremy Rich）警告說(shuō)，由于A(yíng)BCD平臺(tái)的大部分工作是細(xì)胞源性的或只做過(guò)為數(shù)不多的臨床試驗(yàn)，如果該技術(shù)在更大規(guī)模上進(jìn)行測(cè)試的話(huà)，也許不會(huì)那么一帆風(fēng)順。