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        中國云南地區(qū)恒河猴群MHC-DRB部分等位基因的調(diào)查

        2014-01-29 10:06:02和占龍禹文海楊鳳梅魯帥堯王俊斌陳麗雄乞素冬李艷艷劉龍丁
        醫(yī)學(xué)研究雜志 2014年5期
        關(guān)鍵詞:猴群恒河云南

        和占龍 禹文海 楊鳳梅 趙 遠(yuǎn) 魯帥堯 王俊斌 陳麗雄 乞素冬 李艷艷 劉龍丁

        恒河猴(Rhesus monkey,Macaca mulatta),屬靈長目(Primates)、類人猿亞目(Anthropoidea)、猴科(Cercopithecidae)、獼猴屬(Macaca),屬于國家二級保護(hù)動物。其適應(yīng)性強(qiáng),容易馴養(yǎng)繁殖,生理上與人類較接近,因此是人類醫(yī)學(xué)科研究工作中比較理想的實(shí)驗(yàn)動物,主要應(yīng)用于傳染病學(xué)、藥理學(xué)、毒理學(xué)、行為學(xué)、老年病、器官移植、內(nèi)分泌病、腫瘤學(xué)等方面研究。恒河猴MHC又稱為RhLA(rhesus macque leukocyteantigen),其MHC基因命名時加前綴Mamu(Macaca mulatta),習(xí)慣上直接使用為Mamu。根據(jù)Mamu基因產(chǎn)物功能和結(jié)構(gòu)的不同,又將其分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ類基因。恒河猴的Mamu-Ⅱ類分子與人類一樣,也有3個典型的亞區(qū) DR、DQ、DP[1,2]。與 DQ、DP 相比,DR在細(xì)胞表面有較高的濃度,在免疫反應(yīng)中具有重要作用。恒河猴DRB位點(diǎn)的多態(tài)性之高,是人類和其他靈長類動物中所沒有的,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的恒河猴DRB位點(diǎn)的等位基因有126個[3~6]。本研究以來源清晰的云南地區(qū)恒河猴為研究對象,應(yīng)用PCR技術(shù)對部分MHC-DRB等位基因進(jìn)行分析,為今后開展恒河猴群遺傳資源保護(hù)及相關(guān)動物實(shí)驗(yàn)提供基礎(chǔ)。

        材料與方法

        1.樣品采集和DNA提取:實(shí)驗(yàn)采集云南地區(qū)普通級恒河猴全血共195份,其中昆明自繁猴123份、寧蒗縣26份、景東縣27份和鎮(zhèn)沅縣19份。均來源于中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所全國醫(yī)學(xué)靈長類研究中心[實(shí)驗(yàn)動物許可證號:SCXK(滇)2010-0006]。靜脈抽取全血2ml,EDTA抗凝。采用AXYGEN DNA提取試劑盒提取基因組DNA,詳細(xì)操作步驟見說明書。

        2.PCR擴(kuò)增及測序:參考相關(guān)文獻(xiàn)[7]選取引物對,引物序列見表1。由生工生物工程(上海)有限公司合成。在PCR儀(Bio-Rad C1000)中進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體積為10μl,上游引物和下游引物各(20μmol/L)0.5μl,模板 DNA 0.5μl,2 ×PCR Master Mix 5μl,ddH2O 3.5μl。反應(yīng)條件為 94℃ 4min,然后 94℃ 1min,64 ~66℃ 45s,72℃ 1min,35 個循環(huán),最后 72℃延伸7min。用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,參照DNA marker DL2000確定陽性樣品。陽性樣品PCR產(chǎn)物送上海杰李生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序。

        表1 MHC-DRB各等位基因引物序列

        3.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:數(shù)據(jù)利用Excel和SPSS 13.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用卡方檢驗(yàn)進(jìn)行顯著性分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        1.PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果:對 DRB1*0303、DRB1*0309、DRB1*0305/06、DRB1*0403、DRB1*1005/07、DRB3*0403、DRB5*0301/02、DRB6*0101、DRB6*0103、DRB6*0104/05、DRB*W101 和 DRB*W201 等12個基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,根據(jù)電泳圖及結(jié)合分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)DL2000判斷結(jié)果。本研究以DRB3*0403基因電泳圖來說明,DRB3*0403基因PCR產(chǎn)物大小為243bp,與預(yù)期結(jié)果一致(圖1)。由圖1可以看出,第1、5、9、10號樣品為陽性。

        圖1 恒河猴MHC-DRB3*0403基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果

        2.DRB基因的序列分析結(jié)果:將 DRB各基因PCR擴(kuò)增的部分陽性樣品進(jìn)行測序,經(jīng)BLAST比對發(fā)現(xiàn)本研究中測定的序列與GenBank中對應(yīng)序列同源性在92%以上。本研究以DRB3*0403基因測定的序列為例進(jìn)行說明。DRB3*0403基因在GenBank中BLAST比對結(jié)果見圖2,兩者同源性為99%。對比發(fā)現(xiàn)本實(shí)驗(yàn)測定的序列在GenBank中對應(yīng)序列(FJ544411)的227位堿基A突變成T、337位堿基C突變成G。

        圖2 DRB3*0403基因的對比結(jié)果

        3.云南地區(qū)4個恒河猴群各基因的分布情況:云南地區(qū)4個恒河猴群各MHC-DRB基因分布情況見表2。

        表2 云南地區(qū)4個恒河猴群MHC-DRB部分基因檢測結(jié)果[n(%)]

        由表2可知,寧蒗恒河猴群檢測出了所有的12個基因,檢出率為 3.85% ~57.69%,其中 DRB5*0301/02、DRB6*0104/05、DRB*W101 檢出率最低(3.85%),DRB6*0103 檢出率最高(57.69%)。來自昆明的自繁猴群除了未檢測出DRB*W201外,均檢測出了其余所有的11個基因,檢出率為1.63% ~42.28%,其中 DRB1*0303 檢出率最低(1.63%),DRB6*0101檢出率最高(42.28%)。景東群未檢測出DRB1*0403和DRB5*0301/02基因,其他基因的檢出率為3.70% ~33.33%,其中 DRB*W101檢出率最低(3.70%),DRB3*0403、DRB6*0101、DRB6*0103檢出率最高(42.28%)。鎮(zhèn)沅群未檢出DRB*W201、DRB1*0309和 DRB5*0301/02基因,其他基因檢出率為5.26% ~63.16%,其中 DRB1*0303和DRB1*0403檢出率最低(5.26%),DRB6*0103 檢出率最高(63.16%)。

        卡方檢驗(yàn)結(jié)果表明,DRB*W201在寧蒗群和昆明自繁猴群之間存在顯著性差異(χ2=4.66,P<0.05),景東群與昆明自繁猴群之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.85,P <0.01),其余各基因在 4 個恒河猴群之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2<3.84,P >0.05)。

        討 論

        主要組織相容性復(fù)合體與機(jī)體免疫功能和機(jī)體對免疫相關(guān)疾病的抵抗力密切相關(guān)[8,9]。在抗原遞呈過程中,MHCⅡ類分子參與胞外抗原向CD4+T細(xì)胞的遞呈,大量研究表明許多疾病的進(jìn)展過程與宿主的MHC基因型密切相關(guān),許多有關(guān)MHCⅡ類分子在HIV-1病毒感染中的作用的報道說明其在控制病毒感染中具有重要作用[10]。

        本研究利用PCR-SSP方法對195只云南地區(qū)恒河猴的外周血樣品進(jìn)行了檢測,12個MHC-DRB基因在云南地區(qū)恒河猴群中均有檢出,說明云南地區(qū)恒河猴遺傳多樣性較豐富。在本研究中檢測出的12個基因PCR陽性樣品測序比對與目標(biāo)序列完全一致,說明PCR-SSP方法能較好的用于DRB各基因的分析,這有利于下一步開展大規(guī)模樣品DRB基因攜帶情況分析,從而獲得具有特定基因的恒河猴群篩選和選育提供了基礎(chǔ),為生物醫(yī)學(xué)相關(guān)研究提供合適的具有特定遺傳背景的實(shí)驗(yàn)動物提供依據(jù)。

        1 Kenter M,Otting N,Anholts J,et al.Evolutionary relationships among the primate MHC-DQA1 and DQA2 alleles[J].Immunogenetic,1992,36(2):71-78

        2 Slierendregt BL,Otting N,Anholts J,et al.Gel electrophoretic analysis of rhesus macaque major histocompatibility complexⅡDR molecules[J].Hum Immunol,1994:4033-4040

        3 Doxiadis GG,Otting N,de Groot NG,et al.Unprecedented polymorphism of MHC-DRB region cofigurations in rhesus configurations in rhesus macaque[J].J Immun,2000,164(4):3193-3199

        4 Slierendregt BL,van Noort JT,Bakas RM,et al.Evolutionary stability of transpecies major histocompatibility complex classⅡDRB lineages in human and rhesus monkeys[J].Hum Immunol,1992,35(1):29-39

        5 Slierendregt BL,Otting N,Van Besouw N,et al.Expansion and contraction of rhesus macaque DRB region by duplication and deletion[J].J Immunol,1994,52(5):2298-2307

        6 Lekutis C,Letvin NL.Biochemical and molecular characterization of rhesus monkey major histocompatibility complex classⅡ DR[J].Hum Immunol,1995,43(1):72-80

        7 Lobashevsky A,Smith JP,Kasten-Jolly J,et al.Idengtification of DRB alleles in rhesus mokeys using polymerase chain reactionsequence-specific primers(PCR-SSP)amplification[J].Tissue Antigens,1999,54:254-263

        8 Bontrop RE,Watkins DI.MHC polymorphism:AIDS susceptibility in non-human primates[J].Trends Immunol,2005,26(4):227-233

        9 Benichou G,Kant CD,Madsen J,et al.Modulation of alloreactivity to MHC-derived peptides and transplantation tolerance[J].Front Biosci,2007,12:4239-4247

        10 邱趁麗,楊桂波.用PCR-SSP方法檢測中國恒河猴Mamu-DRB*W101和 Mamu-DRB*W201基因[J].動物學(xué)研究,2007,28(6):664-669

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