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        應(yīng)用RACE 技術(shù)擴(kuò)增柞蠶Lectin基因及原核表達(dá)載體構(gòu)建

        2014-01-28 12:41:14林坤章邱建烽尹志亮劉朝良朱保建
        蠶桑茶葉通訊 2014年2期

        林坤章 邱建烽 尹志亮 劉朝良 朱保建

        (1.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 223096;2.江西省蠶桑茶葉研究所)

        昆蟲在適應(yīng)外界環(huán)境的過(guò)程中,已經(jīng)形成一套自身的免疫系統(tǒng),包括體液免疫和細(xì)胞免疫,而這些免疫反應(yīng)是由模式識(shí)別受體調(diào)節(jié)的先天免疫識(shí)別所引發(fā)的[1~2]。體液免疫系統(tǒng)能產(chǎn)生包括凝集素、抗菌肽等一系列的抗菌多肽[3]。凝集素是一種重要的模式識(shí)別受體,在宿主抵御和識(shí)別外界病原物方面扮演著重要的角色,已成為近幾年來(lái)的研究熱題之一。C-型凝集素(C -type lectins)是一種鈣依賴的糖結(jié)合蛋白,屬于凝集素的重要成員之一,在機(jī)體的免疫防御、控制糖蛋白的生物合成等方面具有重要的功能[4~5]。它們一般含有1 個(gè)或多個(gè)由約130氨基酸殘基組成的糖基識(shí)別域[6]。近幾年來(lái),一些新的凝集素基因陸續(xù)被報(bào)道,它們具有參與細(xì)菌的識(shí)別與清除、調(diào)節(jié)血液封裝和黑化等多方面的功能也一度成為研究的熱點(diǎn)[7~10]。柞蠶(Antheraea pernyi)是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲之一,關(guān)于柞蠶抗病能力和防御系統(tǒng)相關(guān)功能基因的關(guān)系是值得研究的課題。克隆獲得柞蠶凝集素基因?qū)窈笱芯孔跣Q的免疫反應(yīng)機(jī)制,提高柞蠶的抗病能力具有一定的意義。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        柞蠶五齡幼蟲由河南農(nóng)業(yè)廳贈(zèng)送;大腸桿菌和Top10 感受態(tài)細(xì)胞由本實(shí)驗(yàn)室所保存。

        RNA 提取試劑盒Total RNA kit、質(zhì)粒抽提試劑盒、DNA 純化回收試劑盒購(gòu)于OMEGA 公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒Transcriptor First strand cDNA synthesis kit 購(gòu)于全式金公司,SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit 購(gòu)于BD Clontech 公司,Bam HI 和XhoI 核酸內(nèi)切酶、T4 DNA Ligase 、pMD19 -T 載體試劑盒購(gòu)于TaKaRa 公司,pET-28a 載體購(gòu)于Promega 公司,其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成

        根據(jù)核酸和氨基酸序列比對(duì),用Primer premier 5.0 軟件設(shè)計(jì)用于擴(kuò)增柞蠶模式識(shí)別受體Lectin 部分片段的引物為:176F:5’- CTTCGCCCAGCAACTCCAATA - 3’ 和 176R:5’ - TTGACCCGTCGCCCAACTAAC - 3’,擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為176bp。用于RACE - PCR 的引物RC3:5’- CTTCGCCCAGCAACTCCAATA-3’和RC5 :5’- TTGACCCGTCGCCCAACTAAC -3’,根據(jù)擴(kuò)增獲得的上述基因片段設(shè)計(jì)用于擴(kuò)增ORF 框的引物為:fw:5’- GGCGGATCC- ATGTATAAGACATTCTTTTGTG - 3’和 rev:5’- CGCCTCGAGTCAATAGATATTTGGCGAA-3’(下劃線部分分別為BamHI和XhoI 酶切位點(diǎn))。以上引物均由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成。

        1.2.2 柞蠶總RNA 的提取和反轉(zhuǎn)錄

        柞蠶五齡幼蟲經(jīng)滅活的大腸桿菌注射12 小時(shí)后按RNA 提取試劑盒Total RNA kit 提取總RNA,然后根據(jù)反轉(zhuǎn)錄試劑盒Transcriptor First strand cDNA synthesis kit 方法進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,定量檢測(cè)后保存于-20°C 冰箱備用。

        1.2.3 PCR 擴(kuò)增

        以上步合成的cDNA 第一鏈為模板進(jìn)行Lectin基因cDNA 的PCR 擴(kuò)增。PCR 反應(yīng)體系為:5 μL 10×Buffer、2 μL 引物176F、2 μL 引物176R、4 μL dNTPmix、1. 5 μL cDNA、0. 5 μL Taq 酶、35 μL ddH2O;PCR 反應(yīng)條件為:預(yù)變性:94 ℃、4min;變性:94 ℃、0.5 min;退火:55 ℃、0. 5 min;延伸:72℃、0.5 min;從第2 步開始30 個(gè)循環(huán);延伸:72 ℃、5 min。

        1.2.4 RACE 技術(shù)獲得全長(zhǎng)cDNA 序列

        參照SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit(Clontech 公司)的使用說(shuō)明書,將所提取高質(zhì)量的RNA 反轉(zhuǎn)錄成RACE cDNA。利用BD AdvantageTM 2 PCR Enzyme System 和試劑盒中提供的10 ×Universal Primer A Mix (UPM)引物,以及所設(shè)計(jì)的特異引物分別以5’RACE cDNA 和3’RACE cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增程序?yàn)?預(yù)變性:94 ℃、5 min;5 個(gè)循環(huán)(變性:94 ℃、1 min;退火:65 ℃、2min);30 個(gè)循環(huán)(變性:94 ℃、1 min;退火:60 ℃、30 s;延伸:72 ℃、1 min)。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

        1.2.5 開放閱讀框的序列擴(kuò)增

        通過(guò)序列分析比對(duì)和NCBI 上的ORF Finder 確定lectin 的開放閱讀框序列,對(duì)ORF 框進(jìn)行引物設(shè)計(jì)并引入酶切位點(diǎn)后進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增程序?yàn)?預(yù)變性:94 ℃、5 min;30 個(gè)循環(huán)(變性:94 ℃、30 s;退火:58 ℃、30 s;延伸:72 ℃、1 min);總延伸:72℃、5 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),將大小一致條帶膠回收后連入pMD19 -T 載體中,挑選陽(yáng)性克隆菌落進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)和質(zhì)粒抽提,并送至上海英駿生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

        1.2.6 原核表達(dá)載體的構(gòu)建

        從前面構(gòu)建的測(cè)序鑒定正確的Lectin 的T 載體質(zhì)粒上用BamHI 和XhoI 雙酶切,切下目的片段,原核表達(dá)載體pET28a 經(jīng)限制性內(nèi)切酶BamHI 和XhoI雙酶切,酶切反應(yīng)體系共50 μL:質(zhì)粒10 μL,10 ×K Buffer 5 μL,BamHI 和XhoI 酶各1 μL,ddH2O 33 μL。37 ℃酶切4h 后產(chǎn)物分別膠回收,然后經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)并測(cè)濃度,再用T4DNA 連接酶將Lectin 片段連入原核表達(dá)載體pET28a 的BamHI和XhoI 酶切位點(diǎn)間。連接反應(yīng)體系為10 μL:酶切Lectin 5 μL,酶切pET28a 1 μL,10 ×T4 Buffer 1 μL,T4 DNA Ligase 1 μL,ddH2O 2 μL,4 ℃連接過(guò)夜。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入E. coli DH5α 中.挑取陽(yáng)性單菌落培養(yǎng),并用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,用BamHI和XhoI 雙酶切后,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳來(lái)鑒定是否有外源片段插入,并送至上海英駿生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

        2 結(jié)果

        2.1 凝集素基因部分片段的獲得

        以柞蠶幼蟲cDNA 為模板進(jìn)行RT-PCR。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后的結(jié)果如圖1,在分子量約176 bp 左右大小的位置存在一條清晰的條帶,該條帶的大小與實(shí)驗(yàn)預(yù)期的大小相近。

        圖1 PCR 擴(kuò)增獲得的Lectin 部分片段泳道1、2 為目的片段;M 為分子量標(biāo)準(zhǔn)

        圖2 3’-和5’-RACE PCR 產(chǎn)物的電泳分析

        2.2 RACE 技術(shù)獲得基因全長(zhǎng)cDNA

        根據(jù)已獲得的Lectin 基因的部分cDNA 序列,使用Primer premier 5.0 設(shè)計(jì)用于擴(kuò)增全長(zhǎng)cDNA 的RACE 引物。以合成的相對(duì)應(yīng)的RACE cDNA 為模板,通用引物進(jìn)行RACE PCR 反應(yīng)。結(jié)果表明,3'-RACE 和5'-RACE 分別獲得了分子量大小為825 bp 和368 bp 的片段,分別見圖2(a)和圖2(b)。通過(guò)DNAMAN 軟件進(jìn)行序列拼接,獲得lectin 基因全序列(圖3)。

        圖3 柞蠶凝集素全長(zhǎng)cDNA 序列

        起始密碼子用方框標(biāo)出,終止密碼子用雙下劃線標(biāo)出。

        2.3 開放閱讀框的確定和擴(kuò)增

        通過(guò)序列分析比對(duì)和NCBI 上的ORF Finder 確定lectin 的開放閱讀框,對(duì)ORF 框引入酶切位點(diǎn)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,方法如前所述,片段與預(yù)期大小一致,如圖4。

        圖4 PCR 擴(kuò)增獲得的Lectin 目的片段1 為目的片段;M 為分子量標(biāo)準(zhǔn)

        圖5 重組質(zhì)粒的酶切鑒定

        2.4 重組質(zhì)粒PET-28a-Lectin 的構(gòu)建和鑒定

        Lectin 基因經(jīng)BamHI 和XhoI 雙酶切克隆入經(jīng)同樣酶切的原核表達(dá)載體pET28a,挑選陽(yáng)性重組質(zhì)粒進(jìn)行酶切及電泳,方法如前,可見大小約為927 bp的目的條帶,經(jīng)測(cè)序表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,見圖5。將其命名為PET-28a-Lectin。

        3 討論

        先天免疫系統(tǒng)是脊椎和無(wú)脊椎的第一道免疫防御陣線,其發(fā)生過(guò)程借助于模式識(shí)別受體蛋白來(lái)識(shí)別與結(jié)合病原微生物表面的相關(guān)分子模式[11~14]。因而,通過(guò)模式識(shí)別受體蛋白,昆蟲的先天免疫反應(yīng)能夠識(shí)別和結(jié)合不同的病原微生物,從而達(dá)到抗菌和抑菌的作用。動(dòng)物C-型凝集素通過(guò)結(jié)合包括細(xì)菌、真菌和病毒等病原微生物表面的碳水化合物來(lái)促進(jìn)吞噬、黑化和酶原反應(yīng)等免疫反應(yīng)[15~20]。關(guān)于柞蠶的C 型-凝集素及其先天免疫反應(yīng)系統(tǒng)的研究鮮見報(bào)道,研究柞蠶的C-型凝集素是必要的,本研究運(yùn)用RT -PCR 和RACE 技術(shù)從柞蠶中獲得了C 型-凝集素基因的全長(zhǎng)序列并構(gòu)建了一個(gè)能夠表達(dá)Lectin 蛋白的重組表達(dá)載體,以便為今后研究Lectin 蛋白的功能及參與柞蠶的先天免疫反應(yīng)的機(jī)理奠定基礎(chǔ)。

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