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        測(cè)序人生

        2013-12-29 00:00:00管悠南
        南方人物周刊 2013年41期

        2013年11月19日,一位偉大的生物化學(xué)家走完了95年的人生旅程。世界各地的科學(xué)博客和學(xué)術(shù)期刊都在撰文紀(jì)念他,連一向桀驁不馴的基因組科學(xué)家克萊格·文特爾也發(fā)了一條Twitter,表示他是“20世紀(jì)最偉大的科學(xué)家之一,兩次改變了科學(xué)世界前進(jìn)的方向”,即使剛?cè)ナ赖倪@位曾公開批評(píng)文特爾的研究所商業(yè)色彩太重,分享精神不足。著名科學(xué)作者艾德·楊(Ed Young)則寫了一段DNA序列來表示哀悼:CGCATTCCGTTTCGCGAAGATAGCGCGAACGGCGAACGC。

        這位死者在當(dāng)學(xué)生時(shí)成績(jī)普通,從沒拿過獎(jiǎng)學(xué)金,后來卻兩次獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),成為惟一一位兩獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的科學(xué)家;他凡事都愛自己動(dòng)手,不愛上課也不會(huì)帶學(xué)生,但第一個(gè)學(xué)生卻也是諾貝爾獎(jiǎng)得主;他獲得過巨大的榮譽(yù),有以自己名字命名的研究所和技術(shù),卻淡泊名利,甚至拒絕封爵。他就是弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)。

        “富二代”做科研

        桑格出生于英格蘭格洛斯特郡的一個(gè)小鎮(zhèn),父親是一名醫(yī)生,曾在中國(guó)工作,后因肺結(jié)核回國(guó)休養(yǎng)。他有一個(gè)大他一歲的哥哥西奧多,后來在劍橋大學(xué)學(xué)習(xí)農(nóng)學(xué)。桑格一開始想繼承父業(yè),成為醫(yī)生。但去劍橋上大學(xué)之前,他改變了主意,想研究生物了。

        在一次采訪中,桑格表示,促使他轉(zhuǎn)變職業(yè)目標(biāo)的原因是,他發(fā)現(xiàn)自己“與照顧很多人、解決不同的問題相比,更喜歡專注于一個(gè)問題,并進(jìn)行深入的研究”。

        桑格在高中時(shí)不算出類拔萃,他在自傳中承認(rèn),“如果不是父母相當(dāng)富有,我很可能根本進(jìn)不了劍橋”。和很多大科學(xué)家一樣,在大學(xué)里他有些偏科。在物理和數(shù)學(xué)上,盡管與身邊那些起步更早的同學(xué)相比,他學(xué)習(xí)起來有些吃力,但也比拉丁語和歷史要強(qiáng)。

        當(dāng)時(shí)的劍橋大學(xué)要求學(xué)生學(xué)習(xí)兩個(gè)主修學(xué)科和一個(gè)副學(xué)科。桑格選擇了物理和化學(xué)作為主修學(xué)科——這也是科學(xué)專業(yè)學(xué)生的標(biāo)準(zhǔn)選擇,不過第二年,他就因?yàn)閷?shí)在跟不上物理課程的進(jìn)度而轉(zhuǎn)去學(xué)生理學(xué)。在他為選什么作為副學(xué)科傷腦筋的時(shí)候,看到了學(xué)科列表上的一個(gè)詞:生物化學(xué),導(dǎo)師是歐內(nèi)斯特·鮑德溫(Ernest Baldwin)。此前他從沒聽說過這門學(xué)科,不過用化學(xué)來解釋生物現(xiàn)象的思路很吸引他。鮑德溫博士是一位相當(dāng)不錯(cuò)的導(dǎo)師,他很有活力,也懂得如何啟發(fā)學(xué)生,于是桑格在拿到學(xué)士學(xué)位后,決定在劍橋再學(xué)一年高等生物化學(xué)課。連他自己也沒想到的是,他這門課的成績(jī)被列為最優(yōu)。這對(duì)向來功課平庸的他來說是個(gè)不小的鼓勵(lì),讓他決定申請(qǐng)去劍橋剛成立的生物化學(xué)系攻讀博士學(xué)位。此前他對(duì)自己的未來并不確定。

        桑格給生化系寫信,詢問自己能否去那里繼續(xù)求學(xué),一個(gè)月都沒收到回音,于是,這位“富二代”決定親自到系里問問。那時(shí),他的父母剛剛?cè)ナ?,他從母親那里獲得一筆不小的遺產(chǎn)——他母親是一位棉花富商的女兒。他表示可以不需要任何資助,就這樣,有幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室愿意接受他。

        桑格先跟一位有點(diǎn)古怪的蛋白質(zhì)化學(xué)家工作,任務(wù)是從草里提取可以食用的蛋白質(zhì)。這位蛋白質(zhì)化學(xué)家屬于“放手型”導(dǎo)師。他給桑格一大罐凍住的碎草讓他自己研究,而自己不久之后就離開了劍橋。此時(shí)他的化學(xué)知識(shí)顯然不足以支持他獨(dú)立研究,他希望當(dāng)時(shí)還在做博士后的阿爾伯特·紐伯格(Albert Neuberger)給予指導(dǎo)。在紐伯格那里,桑格完成了博士論文。他的博士研究和賴氨酸代謝有關(guān),沒什么特別新穎的地方。但他在紐伯格那里學(xué)到了很多,不僅獲得了豐富的生物化學(xué)知識(shí)和實(shí)驗(yàn)技巧,而且學(xué)會(huì)了如何做研究。

        獲得博士學(xué)位后,桑格在劍橋大學(xué)生物化學(xué)系的新任教授(當(dāng)時(shí)歐洲一般一個(gè)系只有一個(gè)教授)阿爾伯特·查爾斯·奇布諾爾(Albert Charles Chibnall)那里開始了博士后研究。奇布諾爾當(dāng)時(shí)正在研究胰島素。胰島素在人體糖代謝中起到重要作用,如果胰島素分泌不足,就有可能導(dǎo)致糖尿病。1922年,弗雷德里克·班廷和約翰·麥克勞德發(fā)現(xiàn)了胰島素對(duì)糖尿病的治療作用,他們因此獲得了第二年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。在那個(gè)年代,研究胰島素的生化性質(zhì)不僅因?yàn)檫@種蛋白質(zhì)的醫(yī)學(xué)應(yīng)用,還因?yàn)樗钱?dāng)時(shí)僅有的幾種能被提純的蛋白質(zhì)。

        桑格測(cè)序

        蛋白質(zhì)由20種氨基酸首尾相連再盤曲纏繞構(gòu)成,簡(jiǎn)單地說,蛋白質(zhì)是由20個(gè)字母組成的句子。當(dāng)時(shí),生化學(xué)界對(duì)蛋白質(zhì)存在一些爭(zhēng)議。有些人認(rèn)為蛋白質(zhì)只是隨機(jī)的混合物,沒有確定的化學(xué)組成,也無法用化學(xué)方法研究。但奇布諾爾不認(rèn)同這點(diǎn),他希望找到蛋白質(zhì)確定的化學(xué)組成——也就是氨基酸鏈的序列。奇布諾爾發(fā)現(xiàn),胰島素蛋白質(zhì)有很豐富的自由氨基,他據(jù)此認(rèn)為胰島素的氨基酸鏈很短,因?yàn)樵谂懦恍┢渌蛩睾螅挥邪被徭湹囊欢瞬艓в凶杂砂被?。所以,他讓桑格找到一種方法,可以準(zhǔn)確鑒定出胰島素上的自由氨基,這樣就能找到一些胰島素的長(zhǎng)度和氨基酸成分的線索。

        桑格的方法是尋找一種化學(xué)物質(zhì),可以“黏”在自由的氨基上作為標(biāo)記。但要找到這種化學(xué)物質(zhì)并不簡(jiǎn)單。首先,它必須有足夠的活性,這樣靈敏度才足夠,并且可以在日常條件下使用。其次,它和自由氨基的結(jié)合必須非常緊密,即使在蛋白質(zhì)被打碎研究的時(shí)候也不會(huì)掉下來。它最好還要有明顯的特征,幫助實(shí)驗(yàn)人員鑒定出來。

        1958年,桑格(中)與其他諾貝爾獎(jiǎng)得主合影

        桑格最終選擇了2,4-二硝基氟苯。這種物質(zhì)在常溫下就能和自由的氨基穩(wěn)定地發(fā)生反應(yīng),而且在“黏住”氨基后會(huì)呈現(xiàn)出黃色。桑格將蛋白質(zhì)徹底打碎,然后提取出只被標(biāo)記黏住的那個(gè)氨基酸并進(jìn)行分析,就知道蛋白質(zhì)鏈中最頂端的那個(gè)氨基酸是什么了。如果不把蛋白質(zhì)徹底打碎,而是讓它斷成幾個(gè)片段,就能鑒定更多位置的氨基酸,并最終得到完整的氨基酸序列。桑格用“拼盤子”來比喻整個(gè)分析過程:雖然很難判斷在地上摔成20塊碎片的盤子原本的樣子是什么,但如果你把碎片收集起來,拼在一起,就會(huì)看到盤子上的圖案。

        1953年,桑格成功地測(cè)序了胰島素的氨基酸序列。直到今天,他的方法仍有應(yīng)用,2,4-二硝基氟苯現(xiàn)在被稱為桑格試劑,而它和自由氨基的反應(yīng)則被稱為桑格反應(yīng)。1958年,桑格單獨(dú)獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

        1962年,桑格來到劍橋的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(Laboratory of Molecular Biology)。許多重要的生物學(xué)進(jìn)展都是在這里出現(xiàn)的,比如DNA的結(jié)構(gòu)和復(fù)制原理。雖然桑格當(dāng)時(shí)還不知道DNA序列和蛋白質(zhì)序列的關(guān)系,但他知道DNA是基因的材料,而人類的遺傳信息就儲(chǔ)存在DNA的序列里。所以,他希望能像給蛋白質(zhì)測(cè)序那樣給DNA測(cè)序。

        如果說蛋白質(zhì)是由20個(gè)字母組成的句子,那么DNA的字母只有4個(gè)。但DNA卻比蛋白質(zhì)長(zhǎng)得多,有時(shí)會(huì)有數(shù)百萬個(gè)字母。所以給DNA測(cè)序被認(rèn)為是幾乎不可能完成的工作。

        一開始,桑格想用與蛋白質(zhì)測(cè)序類似的方法來給核酸測(cè)序:打破DNA,就像把盤子砸碎在地上一樣。但進(jìn)展并不順利,因?yàn)橥ㄟ^這種方法進(jìn)行測(cè)序的前提是找到一種合適的方法打破DNA,然后把不同的碎片分離出來,再找出一個(gè)特定的碎片進(jìn)行研究。他沒有在DNA上找到合適的類似方法,于是決定反其道而行之,不在“打碎”DNA的過程中對(duì)其進(jìn)行測(cè)序,而是在合成DNA的過程里尋找它的序列信息。

        1958年桑格在英國(guó)劍橋的家中

        他利用模板合成想測(cè)序的DNA序列,然后通過“人造字母”讓DNA合成終止。人造字母能發(fā)出熒光,告訴研究人員在合成終止位置上的是什么字母。如果說桑格在發(fā)明蛋白質(zhì)測(cè)序技術(shù)的時(shí)候參考了很多前人的研究,那么他的DNA測(cè)序技術(shù)卻更富有想象力和原創(chuàng)性,所以被命名為“桑格測(cè)序法”。

        桑格測(cè)序法給生物科學(xué)帶來了巨大影響。在他提出這一技術(shù)的二十多年后,為人類的DNA進(jìn)行測(cè)序的人類基因組計(jì)劃使用的就是桑格測(cè)序法,他也因?yàn)镈NA測(cè)序技術(shù)而與保羅·伯格(Paul Berg)和沃特·吉爾伯特(Walter Gilbert)分享了1980年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),成為惟一一位兩度獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)的科學(xué)家。

        實(shí)驗(yàn)工人

        兩個(gè)諾貝爾獎(jiǎng)讓桑格走到哪里都有人追著向他詢問成功的秘訣,謙虛的他總是表示,自己運(yùn)氣很好,“我總在合適的時(shí)間碰到合適的人和合適的問題?!彼毖宰约簩?duì)教學(xué)和行政不感興趣,據(jù)說他還因授課差被學(xué)生轟下臺(tái),但他的第一個(gè)博士生羅德尼·羅伯特·波特(Rodney Robert Porter)后來也獲得了諾貝爾獎(jiǎng)。在談到這位因戰(zhàn)爭(zhēng)耽誤了時(shí)間,比自己還年長(zhǎng)的學(xué)生時(shí),桑格表示,“他教我的比我教他的多?!?/p>

        與很多有著輝煌經(jīng)歷的教授不同,桑格65歲就退休了。他認(rèn)為,與其到了這個(gè)年齡還堅(jiān)持做水準(zhǔn)日趨下降的研究,還不如把位置讓給年輕人。他想把時(shí)間花在自己感興趣卻一直沒精力投入的事情上,比如打理一個(gè)花園。后來,他經(jīng)營(yíng)的花園相當(dāng)有名,甚至成為一個(gè)景點(diǎn)。他還拒絕了英國(guó)女王準(zhǔn)備給他的爵位,因?yàn)樗幌胱寗e人稱他為Sir。

        桑格在自傳中寫道,研究科學(xué),“想”、“說”和“做”都很重要,“我思考能力還行,不善交談,但我在43年的職業(yè)生涯里一直努力去做實(shí)驗(yàn)?!痹谥袑W(xué)時(shí)代,如果說成績(jī)并不突出的他有什么特長(zhǎng)的話,就是做木工活了。這一愛好既鍛煉了他的動(dòng)手能力,也影響了他的一生。在漫長(zhǎng)的科研生涯中,他一直都很愛動(dòng)手,自稱“實(shí)驗(yàn)工人(bench worker)”,很少坐在辦公室里寫作和整理資料。功成名就之后,他還發(fā)表了大量以第一作者署名的文章,這在同行中實(shí)屬罕見。

        正是勤奮和專注,讓自認(rèn)沒有天賦的桑格能在測(cè)序領(lǐng)域里書寫一個(gè)又一個(gè)傳奇。也許像艾德·楊那樣用DNA序列來紀(jì)念桑格最為恰當(dāng)——那段DNA序列對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)序列是:RIPFREDSANGER(安息吧,弗雷德·桑格)。

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