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        靶向c-Raf-1基因的反義核酸抗乙型肝炎病毒活性研究

        2013-10-29 09:36:20黃海張秀娟謝佩雯王學(xué)軍王升啟
        生物技術(shù)通訊 2013年5期
        關(guān)鍵詞:反義培養(yǎng)液孵育

        黃海 ,張秀娟 ,謝佩雯 ,王學(xué)軍 ,王升啟

        1.河南中醫(yī)學(xué)院,河南 鄭州 450003;2.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所,北京 100850

        乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染嚴(yán)重影響人類(lèi)健康。目前,治療乙肝病毒的藥物主要有2大類(lèi),即干擾素和核苷類(lèi)似物,但這2類(lèi)藥物仍然存在不同程度的副作用且均不能徹底清除HBV,尤其對(duì)HBV表面抗原(hepatitis B surface protein,HBsAg)的清除作用微弱,而HBsAg的表達(dá)是造成HBV免疫耐受的關(guān)鍵因素之一[1]。因此,尋找能抑制HBsAg的藥物將是未來(lái)抗HBV治療的重中之重。

        尋找病毒和宿主之間的相互作用關(guān)系并發(fā)現(xiàn)有效的抗病毒藥物靶點(diǎn),是當(dāng)前病毒學(xué)研究的重點(diǎn)和熱點(diǎn),治療方法從傳統(tǒng)的靶向病毒向靶向宿主基因發(fā)展已成為一種新趨勢(shì),并且在許多抗病毒治療探索中均取得了重要進(jìn)展[2-5]。HBV感染是引起人類(lèi)肝細(xì)胞癌的重要潛在致病因子。HBV基因組中具有轉(zhuǎn)錄激活活性的HBx蛋白,可引發(fā)c-Raf-1/MEK激酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)[6],促進(jìn)HBV的表達(dá),致使細(xì)胞增殖周期失調(diào),進(jìn)而形成腫瘤。眾多研究數(shù)據(jù)表明,宿主基因c-Raf-1參與了HBV在肝細(xì)胞內(nèi)的復(fù)制[7],并且c-Raf-1的活化在肝癌的發(fā)展中也起重要作用[8]。這就提示我們c-Raf-1基因可能是抗HBV藥物設(shè)計(jì)的潛在作用靶點(diǎn),抑制c-Raf-1可能起到抗HBV復(fù)制及其疾病進(jìn)程的作用。

        反義核酸(antisense oligonucleotide)是根據(jù)堿基互補(bǔ)原理,利用一段特異互補(bǔ)的DNA或RNA片段抑制或封閉特定基因表達(dá)的一門(mén)技術(shù),是在mRNA水平干擾基因功能,開(kāi)發(fā)新藥的一種方法[9]。我們通過(guò)設(shè)計(jì)并篩選能特異性抑制c-Raf-1基因的反義核酸,驗(yàn)證通過(guò)干擾c-Raf-1基因的功能是否具有抑制HBV表達(dá)的作用。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        4~5周齡C57/BL6雄性小鼠購(gòu)自軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心;HBV穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞HepG2.2.15由本實(shí)驗(yàn)保存,在含10%胎牛血清(FBS,Hyclone公司)、380 μg/mL G418的DMEM細(xì)胞培養(yǎng)液[M&C Gene Technology(Beijing)Ltd.]中,于 37℃、5%CO2條件下培養(yǎng);GenJet Ver.II轉(zhuǎn)染試劑購(gòu)自SignaGen公司;HBsAg及乙肝e抗原(HBeAg)定性檢測(cè)試劑盒購(gòu)自上??迫A有限公司;HBsAg及HBeAg定量檢測(cè)試劑盒購(gòu)自北京泰格有限公司;Cell Counting Kit-8(CCK-8)試劑盒購(gòu)自日本同仁化學(xué)研究所(Dojin?do);反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自北京天根生化科技公司;TRIzol購(gòu)自Invitrogen公司。

        1.2 靶向c-raf-1基因反義核酸的設(shè)計(jì)

        根據(jù)GenBank中人和小鼠c-raf-1基因mRNA序列(人:NM_002880;小鼠:NM_029780)的同源區(qū),用 Antisense Design軟件(http://sfold.wadsworth.org)進(jìn)行基于RNA二級(jí)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)的計(jì)算機(jī)輔助反義核苷酸設(shè)計(jì),通過(guò)GenBank聯(lián)機(jī)BLAST比對(duì),保證所選擇的靶序列具有較好的特異性,設(shè)計(jì)并合成3條靶向 c-raf-1 的反義核苷酸 Raf-565(5′-TTGCTTGTC TTAGAAGGATC-3′)、Raf-943(5′-TAGTAGGTACT TTGGTGCTA-3′)和 Raf-3145(5′-AAACCTGTATT CCTGGCTTC-3′)。

        1.3 脂質(zhì)體介導(dǎo)瞬時(shí)轉(zhuǎn)染寡核苷酸

        將生長(zhǎng)狀態(tài)良好的HepG2.2.15細(xì)胞分別按7×103/孔接種于96孔板,每個(gè)實(shí)驗(yàn)組設(shè)置3個(gè)重復(fù)孔。細(xì)胞于37℃、5%CO2、飽和濕度條件下培養(yǎng)12~24 h,待細(xì)胞達(dá)到60%~70%融合時(shí),參照SignaGen公司GenJet Ver.II轉(zhuǎn)染試劑操作說(shuō)明進(jìn)行轉(zhuǎn)染,將脂質(zhì)體和寡核苷酸按3∶1的體積質(zhì)量比混勻,每孔轉(zhuǎn)染的反義核酸體積為 100 μL,終濃度為 0.4 μmol/L。同時(shí)設(shè)立轉(zhuǎn)染試劑對(duì)照組,轉(zhuǎn)染8 h后去除含脂質(zhì)體-寡核苷酸的轉(zhuǎn)染液,用含10%FBS的DMEM正常培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng),轉(zhuǎn)染96 h后收集細(xì)胞培養(yǎng)液,檢測(cè)HBsAg和HBeAg的表達(dá)。

        1.4 細(xì)胞上清HBsAg和HBeAg的檢測(cè)

        收集細(xì)胞上清,按照HBsAg和HBeAg的ELISA檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū)操作步驟進(jìn)行。即取50 μL細(xì)胞培養(yǎng)液加入包被有HBsAg或HBeAg抗體的96孔板中,每孔加入50 μL的HBsAg或HBeAg對(duì)應(yīng)的酶標(biāo)結(jié)合物,封板,振蕩混勻,于37℃溫箱孵育30 min,手工洗板5次,加入顯色液A和B,封板,振蕩混勻,于37℃溫箱孵育15 min,加終止液50 μL,振蕩混勻,酶標(biāo)儀上測(cè)定D450nm值。

        1.5 反義核酸細(xì)胞毒性檢測(cè)

        分 別 以 0.4、0.8、1.6、3.2 μmol/L 的 濃 度 轉(zhuǎn) 染HepG2.2.15細(xì)胞,每個(gè)藥物做3個(gè)復(fù)孔,同時(shí)設(shè)立轉(zhuǎn)染試劑對(duì)照組(按最高劑量),參照SignaGen公司GenJet Ver.II轉(zhuǎn)染試劑操作說(shuō)明進(jìn)行轉(zhuǎn)染,將脂質(zhì)體和寡核苷酸按3∶1的體積質(zhì)量比混勻,每孔轉(zhuǎn)染的反義核酸體積為 100 μL,終濃度為 0.4 μmol/L。轉(zhuǎn)染8 h后換正常細(xì)胞培養(yǎng)液(含10%FBS的DMEM細(xì)胞培養(yǎng)液)繼續(xù)培養(yǎng),轉(zhuǎn)染96 h后按照CCK-8說(shuō)明書(shū)檢測(cè)反義核酸的細(xì)胞毒性,細(xì)胞加入CCK-8后于37℃孵育箱中孵育0.5~1 h,酶標(biāo)儀上測(cè)定D450nm值。

        1.6 RT-PCR檢測(cè)c-Raf-1基因mRNA水平

        反義核酸 Raf-3145分別以 0.4、0.8、1.6 μmol/L的濃度轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞,并設(shè)正義序列(1.6 μmol/L,5′-TTTGGACATAAGGACCGAAG-3′)、隨機(jī)序 列(1.6 μmol/L,5′-CGGTACAGCCGTTCAATCG A-3′)和轉(zhuǎn)染試劑對(duì)照組(按最高劑量)。轉(zhuǎn)染8 h后換正常細(xì)胞培養(yǎng)液(含10%FBS的DMEM細(xì)胞培養(yǎng)液),37℃、5%CO2繼續(xù)培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染96 h后用TRIzol RNA提取試劑盒提取HepG2.2.15細(xì)胞總RNA,并取 1~2 μg RNA 作為模板,加入 2 μL 5×cDNA緩沖液及無(wú)RNase的ddH2O 6 μL,于42℃孵育 3 min,再將其與 2 μL 10×Fast RT 緩沖液、1 μL RT Enzyme Mix和2 μL RQ-RT Primer Mix混合,42℃孵育15 min,95℃孵育3 min,得到cDNA。參照GenBank中人c-Raf-1的基因序列設(shè)計(jì)PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增,同時(shí)以GAPDH作為內(nèi)參對(duì)照。c-Raf-1基因上游引物為5′-AAGATGCCGTGTTTG ATGGC-3′,下 游 引 物 為 5′-ATCCTGGAAACAGAC TCTCG-3′;GAPDH 上 游 引 物 為 5′-GCGGGAAATC GTGCGTGACATT-3′,下游引物為 5′-GATGGAGTT GAAGGTAGTTTCGTG-3′[10]。 PCR 反 應(yīng) 體 系 包 括2.5 ng cDNA,Taq酶(TaKaRa公司)0.25 μL,10×PCR緩沖液5 μL,dNTP混合液4 μL,上、下游引物各 1 μL,滅菌蒸餾水 35 μL。PCR 反應(yīng)條件:94℃30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,30個(gè)循環(huán)。取PCR產(chǎn)物進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳。

        1.7 反義核酸體內(nèi)藥效學(xué)評(píng)價(jià)

        取4~5周齡C57/BL6雄性小鼠50只,每只尾靜脈注射相當(dāng)于體重10%的PBS和6 μg pHBV1.18質(zhì)粒[11],在 5~8 s內(nèi)注射完畢,2 d 后檢測(cè) HBsAg和HBeAg的表達(dá),并分為模型對(duì)照組和3個(gè)給藥組(劑量分別為 30、10、3 mg/kg),每組10只;腹腔注射隔天給藥,給藥容積0.2 mL,對(duì)照組注射0.2 mL PBS,檢測(cè)體重變化;分別于第 2、8、14、21、28、42 d尾靜脈取血,取 10 μL 血與 190 μL PBS 混勻,5000 r/min離心5 min取上清,定量檢測(cè)HBsAg和HBeAg的含量。按化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū)步驟進(jìn)行操作,取已離心上清50 μL加入已包被有HBsAg或HBeAg抗體的96孔板中,每孔再加入50 μL酶標(biāo)結(jié)合物,封板,振震蕩混勻,于37℃溫箱中孵育30 min,手工洗板5次,加入發(fā)光液A和B,封板,避光,振蕩混勻,酶標(biāo)儀檢測(cè)發(fā)光值。

        1.8 做圖及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        用軟件Graph Pad Prism 5做圖,進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)以x±s表示,假設(shè)檢驗(yàn)采用t檢驗(yàn)或方差分析,P值以星號(hào)表示(***為P<0.001,**為P<0.01,*為P<0.05)。

        2 結(jié)果

        2.1 靶向c-Raf-1的反義核酸抗HBV篩選

        以0.4 μmol/L劑量轉(zhuǎn)染反義核酸至HepG2.2.15細(xì)胞,ELISA檢測(cè)細(xì)胞上清中的HBsAg和HBeAg表達(dá)水平,結(jié)果見(jiàn)圖1,反義核酸Raf-3145對(duì)HBsAg具有較好的抑制作用。

        2.2 反義核酸Raf-3145抗HBV的劑量依賴(lài)關(guān)系

        分別將反義核酸Raf-3145以0.2、0.4、0.8和1.6 μmol/L的劑量轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞,正義序列與反義序列劑量為1.6 μmol/L,考察Raf-3145抑制HBV的劑量依賴(lài)關(guān)系,ELISA方法檢細(xì)胞上清中HBsAg和HBeAg水平,結(jié)果顯示Raf-3145對(duì)HBsAg的表達(dá)具有一定的抑制作用,并和劑量呈正相關(guān)(圖2)。

        圖1 反義核酸對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞上清HBsAg、HBeAg表達(dá)的抑制作用

        2.3 反義核酸Raf-3145對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞的毒性檢測(cè)

        分別將反義核酸 Raf-3145 以 0.4、0.8、1.6、3.2 μmol/L的劑量轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞,8 h后換液正常培養(yǎng),并于轉(zhuǎn)染96 h后加入CCK-8,于37℃、5%CO2孵育箱中孵育0.5~1 h,于酶標(biāo)儀上檢測(cè)D450nm值,結(jié)果顯示當(dāng)給藥濃度在3.2 μmol/L時(shí)細(xì)胞稍顯毒性(圖3)。

        2.4 RT-PCR檢測(cè)反義核酸Raf-3145對(duì)c-Raf-1基因mRNA水平的抑制作用

        分別將反義核酸Raf-3145以0.4、0.8和1.6 μmol/L的劑量轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞,正義序列與反義序列濃度為1.6 μmol/L,8 h后換液正常培養(yǎng),并于轉(zhuǎn)染96 h后提取細(xì)胞總RNA,濃度結(jié)果顯示細(xì)胞總RNA純度較好(D260nm/D280nm為1.8~2.0),瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示無(wú)降解。取等量的總RNA 1 μg,按要求進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,Raf-3145對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞中靶基因c-Raf-1的抑制效果比較明顯,并呈現(xiàn)一定的劑量依賴(lài)關(guān)系(圖4)。

        圖2 Raf-3145對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞上清HBsAg和HBeAg表達(dá)抑制的劑量依賴(lài)關(guān)系

        圖3 CCK-8檢測(cè)反義核酸對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞的毒性作用

        圖4 Raf-3145對(duì)HepG2.2.15細(xì)胞內(nèi)c-Raf-1基因mRNA水平的抑制作用

        2.5 反義核酸Raf-3145抗HBV體內(nèi)藥效學(xué)評(píng)價(jià)

        利用HBV小鼠水動(dòng)力模型評(píng)價(jià)了反義核酸Raf-3145的體內(nèi)抗HBV活性,ELISA定量檢測(cè)結(jié)果表明只有Raf-3145高劑量組對(duì)HBsAg呈現(xiàn)出較明顯的抑制作用,其他組對(duì)HBsAg和HBeAg的抑制作用不明顯,個(gè)別時(shí)間點(diǎn)還呈現(xiàn)了一定的促進(jìn)作用(圖5)。與對(duì)照組比較,各給藥組均無(wú)明顯的體重下降趨勢(shì);解剖結(jié)果肉眼未見(jiàn)明顯器質(zhì)性病變,表明在該劑量范圍內(nèi)未見(jiàn)明顯毒性(圖6)。

        圖5 反義核酸Raf-3145對(duì)小鼠血清中HBsAg、HbeAg表達(dá)的抑制作用

        圖6 反義核酸Raf-3145對(duì)小鼠體重的影響

        3 討論

        Raf激酶有3種不同亞型,即Raf-1/c-Raf-1、Raf-A和Raf-B。Raf-A和Raf-B表現(xiàn)出獨(dú)特的組織表達(dá)形式,但c-Raf-1的表達(dá)更廣泛[12]。目前,對(duì)于HBV是如何調(diào)節(jié)c-Raf-1表達(dá)的機(jī)制還不是很清楚,但有研究顯示,HBV能通過(guò)增強(qiáng)Raf-1啟動(dòng)子的活性,提高其在HepG2.2.15細(xì)胞中的表達(dá)[13]。以往研究c-Raf-1在肝細(xì)胞肝癌組織中的表達(dá)多數(shù)與Raf1/MAPK信號(hào)通路的激活有密切關(guān)系,且c-Raf-1在此過(guò)程中起重要作用[14]。HBV轉(zhuǎn)錄激活的2種蛋白均可引發(fā)該通路的激活,HBV的X蛋白更是與肝癌的發(fā)生、發(fā)展有著密切關(guān)系[15]。另外,c-Raf-1還與其他多種癌癥的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)[3,16-19]。c-Raf-1作為癌癥治療的靶點(diǎn)已有相關(guān)報(bào)道,Kasid等證明用特異反義核酸ISIS-5132干擾c-Raf-1基因后,能夠抑制無(wú)胸腺小鼠體內(nèi)的人類(lèi)肺、卵巢及乳腺腫瘤異種移植物的生長(zhǎng)[20],并首次證明了c-Raf-1基因是抗癌癥研究中有效的靶點(diǎn);還有研究顯示用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染的靶向c-Raf-1的反義核酸可明顯抑制卵巢癌細(xì)胞c-Raf-1蛋白的表達(dá)[21]。

        當(dāng)前治療乙肝的藥物主要靶向病毒自身,容易產(chǎn)生耐藥性,靶向HBV復(fù)制必需的宿主基因有望解決這一問(wèn)題。c-Raf-1在HBV復(fù)制過(guò)程中的機(jī)制雖不是很清楚,但其在HBV復(fù)制中的關(guān)鍵角色卻是確定的。本研究的新穎之處在于首次利用反義技術(shù)設(shè)計(jì)靶向宿主基因c-Raf-1的反義核酸,探討c-Raf-1作為抗HBV靶點(diǎn)的有效性。為了便于體內(nèi)外同步篩選驗(yàn)證,我們選擇的靶序列為人鼠同源序列,同時(shí)盡量避免脫靶效應(yīng)。體內(nèi)外結(jié)果顯示Raf-3145對(duì)HBsAg的表達(dá)表現(xiàn)出較好的抑制作用??紤]到c-Raf-1基因參與了HBV的復(fù)制過(guò)程,且有研究顯示c-Raf-1在肝癌患者體內(nèi)的表達(dá)與HBV有關(guān)[13],因此靶向c-Raf-1的藥物不但可抑制HBsAg的表達(dá),有利于打破免疫耐受,而且可能延緩HBV導(dǎo)致的肝癌發(fā)展進(jìn)程,具有重要的研究和開(kāi)發(fā)價(jià)值。

        綜上所述,本研究篩選并證實(shí)靶向基因c-Raf-1的反義序列Raf-3145具有一定的抑制HBsAg表達(dá)的活性,進(jìn)而驗(yàn)證了靶基因c-Raf-1的可靠性??紤]到反義序列Raf-3145具有的潛在開(kāi)發(fā)價(jià)值,值得對(duì)其進(jìn)行進(jìn)一步的藥效學(xué)和毒性研究。

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