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        半張量積在布爾網(wǎng)絡同步中的應用

        2013-10-24 10:17:32樊永艷

        張 靜,樊永艷

        (滄州師范學院)

        1 布爾網(wǎng)絡

        近年來布爾型網(wǎng)絡以及同步分析被逐漸運用于大型基因調(diào)節(jié)網(wǎng)絡全局行為的分析研究,其優(yōu)點是結構簡單明了.另外,它在生命科學、金融科學以及其他一些典型復雜系統(tǒng)研究中都起到非常重要的作用.布爾網(wǎng)絡[1-2]G(V,F(xiàn))由結點狀態(tài)集V={X1,X2,…,Xn}和布爾函數(shù)集F={f1,f2,…,fn}組成.結點i在t+1時刻的狀態(tài)Xi∈{0,1}是由其他一些與它相連通的結點,,…在t時刻的狀態(tài),,…,決定的,即

        網(wǎng)絡在t時刻的狀態(tài)由所有結點的狀態(tài)向量→X(t)=X1(t)X2(t)…Xn(t)來描述.很明顯,對于一個有n個結點的網(wǎng)絡,它的狀態(tài)空間由00…0到11…1的2n種狀態(tài)組成的.

        圖1 節(jié)點A和B組成的布爾網(wǎng)絡

        圖1[3]是由兩個節(jié)點A和B組成的布爾網(wǎng)絡,它的動態(tài)系統(tǒng)為

        其 中 ∨ (∧)意 思 是 max(A(t),B(t))(min(A(t),B(t))).

        2 半張量積

        矩陣的半張量積是近期中科院系統(tǒng)所程代展教授在文獻[4]中提出的一種新的矩陣乘法,它是對普通矩陣乘法的推廣.對于普通矩陣,矩陣A、B只有矩陣A的列數(shù)與矩陣B的行數(shù)相等才可以相乘.而矩陣的半張量積可以解決非等維數(shù)的矩陣相乘,即矩陣A的列數(shù)與矩陣B的行數(shù)不相等的矩陣相乘.矩陣的半張量積的應用領域很廣,它主要用來處理多維數(shù)組及處理非線性問題,在邏輯、幾何、代數(shù)、物理、控制系統(tǒng)及Morgan等等問題中均可找到它的應用[4-6].

        定義1[4]設 A ∈ Mm×n,B ∈ Mp×q.記 n 與 p的最小公倍數(shù)為t=lcm{n,p}.定義A與B的半張量積為

        這里Mm×n表示所有m×n矩陣的集合,?表示kronecker積,?代表左半張量積.

        定義2[4]換位矩陣 W[m,n]是一個 mn × mn矩陣,定義如下:它的行和列都是由雙指標(i,j)標注,列是按照索引Id(i,j;m,n)排列,行是按照索引 Id(j,i;n,m)排列,并且位于[(I,J),(i,j)]上的元素的值為

        命題1[4](1)換位矩陣的逆和轉(zhuǎn)置為

        (2)當m=n時,上式變?yōu)?/p>

        m=n的情形特別重要,為了簡化符號,記

        引理1[4]設A是一個邏輯變量,定義降冪矩陣為,那么對于任意的p×4q矩陣Ψ有ΨA2=ΨMrA.

        定義3[4](1)(經(jīng)典)邏輯論域Dt是指

        (2)(經(jīng)典)邏輯變量P是指在Dt中取值的變量,即P∈Dt;

        記T0≡T≡1和F0≡F≡0分別表示“真”和“假”.

        定義4[4](1)r元邏輯算子是指映射 σ:

        為了使用矩陣表示,記

        定義5[4]稱2×2r矩陣Mσ為r元邏輯算子σ的機構矩陣,如果

        考慮4個基本的二元邏輯算子;析取,P∨Q;合取,P∧Q;蘊涵,P→Q;等值,P?Q.4個基本二元邏輯算子的結構矩陣如下:

        3 半張量積在布爾網(wǎng)絡中的應用

        應用半張量積,就可以將布爾網(wǎng)絡的邏輯方程轉(zhuǎn)化成為代數(shù)方程[7],邏輯變量就表達成了向量形式,定義T=1 ~,F(xiàn)=0 ~,其中是單位陣In的第i列,則邏輯變量A(t)在D:={,}中取值.

        對于每個邏輯算子ξ=ξ(A1,…,An)存在一個 ξ的結構矩陣,記為 Mξ∈ M2×2n,表示為

        例如,對于∧和∨,分別為Mc和Md,Mc= σ2[1,2,2,2,2],Md= σ2[1,1,1,2].例如 A(t+1)=A(t)∨B(t)可以被表示為代數(shù)形式:

        B(t+1)=A(t)∧B(t)可以被表示為代數(shù)形式:

        基于以上,將一個邏輯動態(tài)系統(tǒng)轉(zhuǎn)化為一離散時間動態(tài)系統(tǒng)的方法,可以得到一個網(wǎng)絡過渡矩陣L.把邏輯動態(tài)方程轉(zhuǎn)化為離散時間的動態(tài)方程,一個有 n個節(jié)點 Ai,i=1,2,…,n的布爾網(wǎng)絡被表示為

        其中 ξi,i=1,2,…,n 是邏輯函數(shù)(算子).

        應用(12),Ai(t+1)=WiA1(t)A2(t)…An(t),i=1,2,…,n,定義 x(t)=A1(t)A2(t)…An(t).可以得出

        應用半張量積性質(zhì)以及降冪矩陣Mr=σ4[1,4],(16)可以被表示為x(t+1)=Lx(t).其中L被叫做過渡矩陣.

        由圖 1,計算其過渡矩陣,設 x(t)=A(t)B(t),那么

        則 L=Md(I4? Mc)(I2? w[2])Mr(I2? Mr)= δ4[1,2,2,4]

        4 布爾網(wǎng)絡的同步分析

        在生態(tài)環(huán)境中,存在著許多同步現(xiàn)象,如夏日青蛙,知了的齊鳴,螢火蟲一致發(fā)光,蟋蟀群的叫聲有節(jié)奏地唱和,鳥兒成群的飛;不僅是生態(tài),從核子到宇宙、從物理到化學,乃至人類社會,都廣泛存在著同步現(xiàn)象,如心肌細胞和大腦神經(jīng)網(wǎng)絡的同步,鐘擺同步現(xiàn)象,劇場中觀眾自發(fā)鼓掌同步等.對于復雜系統(tǒng)內(nèi)部個體之間通過局部相互作用(耦合),從一種狀態(tài)突然變成另一種狀態(tài),逐漸的自組織形成了每個個體狀態(tài)一致的現(xiàn)象,稱作同步現(xiàn)象.

        布爾網(wǎng)絡可以用邏輯函數(shù)來表示,如圖2.假設有一個簡單的布爾網(wǎng)絡,有四個結點,分別為A、B、C、D,并且兩兩相連,假設結點 A受結點 B和結點D的狀態(tài)控制,節(jié)點B則受結點A和結點C的狀態(tài)控制,結點C受結點B和結點D的狀態(tài)控制,結點D受結點C和結點A的狀態(tài)控制.如果給結點A、C“或”布爾作用,給結點B、D“與”布爾作用,分別用“0”和“1”表示結點處于“是”和“否”兩種狀態(tài).

        圖2 邏輯函數(shù)布爾網(wǎng)絡

        則邏輯函數(shù)為:

        通過給定的布爾作用,如果四個結點在某一時刻T的狀態(tài)確定,則各結點在下一時刻T+1的狀態(tài)也可以相應地確定,表1給出了四個結點在不同時刻可能的16種狀態(tài)的真值.若在某一時刻T0,四個結點的狀態(tài)均為0或1,則這個布爾網(wǎng)絡同步.通過計算,得出,A、B、C、D初始狀態(tài)為1011、1110、1111時可以達到同步狀態(tài)為1,初始狀態(tài)為0000時可以達到同步狀態(tài)為0.其余的初始狀態(tài)最終進入循環(huán)狀態(tài),達不到同步.

        表1 邏輯函數(shù)布爾網(wǎng)絡真值表

        利用邏輯算子研究布爾網(wǎng)絡的同步.

        一個邏輯變量是指一個命題,如果這個命題是真的,就說這個邏輯變量取值為“真”或“1”,如果這個命題是假的,就說這個邏輯變量取值為“假”或“0”.

        對于上面的四個節(jié)點有布爾作用的網(wǎng)絡同步問題,可以把每個節(jié)點的狀態(tài)看成一個邏輯變量,狀態(tài)為1代表這個命題是真的,狀態(tài)為0代表這個命題是假的.

        可以將以上問題轉(zhuǎn)化為以下邏輯方程:

        若在T+k時刻網(wǎng)絡同步,則A、B、C、D四個邏輯變量在T+k時刻同時取值為“真(即1)”或“假(0)”.那么,應用邏輯算子,給出(19)式和(20)式:

        對(19)式在T+1時刻的邏輯值,有如下計算:

        根據(jù)(21)式可以得出ac(b+d-bd)=1,則共有三個解:

        這就意味著,對于在T時刻為上面解中的三種狀態(tài)時,在下一時刻該網(wǎng)絡可以達到同步狀態(tài)為1.同樣地,可以用式(20)解出,對于在T時刻四個結點狀態(tài)只有為0000時,在下一時刻該網(wǎng)絡可以達到同步狀態(tài)為0,與真值表分析法結果相同.

        在第3部分中,介紹了一個邏輯函數(shù),可以找到一個過渡矩陣L,使下一狀態(tài)x(t+1)=Lx(t).對于一個已知的初始狀態(tài),在何時可以達到同步狀態(tài)為1的問題,可以歸納為解x(t)=的問題.同樣的,當 x(t)=時,可以達到同步狀態(tài)為0.

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