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        中國荷斯坦牛IL8基因SNP-233(G>A)不同基因型的表達(dá)差異研究

        2013-08-04 06:49:06陳仁金王珍珍楊章平毛永江冀德君朱孝榮
        中國牛業(yè)科學(xué) 2013年6期
        關(guān)鍵詞:基因型定量乳房

        陳仁金,王珍珍,楊章平,毛永江,冀德君,朱孝榮

        (1.徐州醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,江蘇 徐州 212004;2.徐州醫(yī)學(xué)院神經(jīng)生物學(xué)研究中心,江蘇 徐州 212004;3.揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)科學(xué)院,江蘇 揚(yáng)州 22500)

        乳房炎是奶牛最常見的疾病之一,在世界范圍內(nèi)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,研究者嘗試許多方法用于控制這種復(fù)雜的疾病,包括改進(jìn)牧場的管理、對干奶牛進(jìn)行抗生素治療、注射疫苗和監(jiān)控臨床乳房炎等。隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,用生物技術(shù)手段來預(yù)防和控制乳房炎成為熱點(diǎn)之一。

        IL-8自發(fā)現(xiàn)以來,成為在趨化性細(xì)胞因子中是一個(gè)比較活躍的研究領(lǐng)域,各種非特異性炎癥的病理發(fā)生過程中頻繁地有IL-8的參與,以及IL8基因易于受到外界的刺激而被激活,因此IL-8可能在炎癥、免疫反應(yīng)和機(jī)體防御反應(yīng)中具有廣泛的作用。對于IL-8在人類上研究較多[1-3],而與奶牛疾病方面的研究最近幾年越來越受關(guān)注。IL-8易于受到外界的刺激而被激活,已研究證明IL-8蛋白和mRNA的表達(dá)與奶牛乳房炎有密切的聯(lián)系[4]。當(dāng)牛乳房受感染后,IL-8能誘導(dǎo)宿主防御系統(tǒng)抵抗病菌的侵入,同時(shí)IL-8會(huì)大量聚集。IL8基因的表達(dá)量也顯著增加[5-7]。研究發(fā)現(xiàn)IL8基因-233(G>A)和2789(A>G)&2862(T>C)位點(diǎn)對SCS顯著相關(guān);了探索該位點(diǎn)不同基因型個(gè)體在血液中的表達(dá)差異,對該位點(diǎn)形成的不同基因型個(gè)體熒光定量PCR分析。對IL8基因的抗病機(jī)理進(jìn)行初步探索,為奶牛抗乳房炎性狀候選基因的研究積累基礎(chǔ)分子數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

        選取揚(yáng)大牧場健康的中國荷斯坦牛30頭。胎次在2~3胎,處于泌乳中期。保證IL8基因各個(gè)基因型10頭。尾靜脈采血,ACD抗凝劑,新鮮血樣提取RNA,提取的RNA-70℃保存。

        1.2 引物設(shè)計(jì)

        根據(jù)用于熒光定量的目的基因IL8基因的mRNA序列(GenBank:NM_173925)設(shè)計(jì)引物,內(nèi)參基因β-actin引物根據(jù) mRNA序列(GenBank:AY141970)設(shè)計(jì)。引物由上海生工生物工程有限公司合成。引物見表1。

        表1 熒光定量PCR引物

        1.3 RT-PCR

        反應(yīng)過程參照TaKaRa RNA AL PCRTMKit(AMV)反轉(zhuǎn)錄試劑盒使用說明,按步驟進(jìn)行。將血液中總RNA作為模板在滅菌的0.2mL PCR離心管中依次加入以下組分的樣品。反轉(zhuǎn)錄體系為20 μL(反應(yīng)液在冰上配制):在0.2mL的PCR管中加入1μg的總RNA,Oligo dT Primer 1μL,5×PrimeScriptTMBuffer 4μL,Random primers 1μL,PrimeScriptTMRT Enzyme Mix I 1μL,加 RNase Free dH2O至總體積為20μL。將加好試劑的PCR管瞬時(shí)離心后放在PCR儀上進(jìn)行反應(yīng)。反轉(zhuǎn)錄條件如下:37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng))85℃5sec(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng))所得產(chǎn)物即為cDNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR

        采用SYBR GreenⅠ染料法進(jìn)行熒光定量,熒光定量PCR體系為20μL:

        以上步驟均為冰上操作,每個(gè)樣本設(shè)三個(gè)重復(fù)。

        熒光定量PCR擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性1min;95℃變性30s,60℃退火15s,72℃延伸34s(data collection),40個(gè)循環(huán);為分析擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,PCR擴(kuò)增結(jié)束后采集多個(gè)信息點(diǎn)進(jìn)行溶解曲線分析,程序?yàn)椋?5℃ 15s,60 ℃ 1min;95 ℃ 15s,60℃15s。

        1.5 統(tǒng)計(jì)軟件與方法

        Primer Premier 5.0,SPSS11.0統(tǒng)計(jì)分析軟件熒光定量計(jì)算采用2-△△CT方法[8]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 RNA的提取

        RNA提取結(jié)果見圖1總RNA經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢出3條亮帶,從上到下分別為28s,18s和5s,說明提取的RNA完整性良好,無明顯降解,其OD260/OD280在1.8左右,純度較高,可用于后續(xù)的實(shí)驗(yàn)。

        2 結(jié)果與分析

        2.2 IL8基因突變位點(diǎn)3種基因的相對定量表達(dá)分析

        IL8基因-233(G>A)位點(diǎn)的突變產(chǎn)生3種基因型。AA、AG和GG 3種基因型在血液中的熒光定量的△CT見表2,GG基因型的△CT極顯著低于AA和AG基因型(P<0.01)。GG基因型的相對表達(dá)量極顯著高于AA和AG基因型(P<0.05)(圖2)。

        圖2 IL8基因-233(G>A)位點(diǎn)不同基因型的表達(dá)量

        表2 IL8基因-233(G>A)位點(diǎn)不同基因型個(gè)體的△CT和RQ值

        3 討論

        IL8是一種重要的趨化因子,具有刺激中性粒細(xì)胞、淋巴細(xì)胞發(fā)生趨化游走,介導(dǎo)細(xì)胞在炎癥部位聚集、活化以及修復(fù)損傷的組織等功能[9]。然而,這些作用必須通過其與相應(yīng)受體(interleukin-8receptor,IL8R,即CXCR)結(jié)合并借助信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)來實(shí)現(xiàn)[10]。在大腸桿菌感染引起的乳房炎的奶中,IL-8含量顯著增加[11,12]。在金黃色葡萄球菌感染的奶牛乳房炎泌乳物中,能檢測到IL-8趨化活性,但在非乳房炎泌乳物中沒有此活性[13]。所以在乳房炎發(fā)生時(shí),IL-8誘導(dǎo)激發(fā)中性粒細(xì)胞時(shí)起著重要的作用。

        對于IL8基因的-233(G>A)位點(diǎn),GG基因型的表達(dá)量顯著高于其它兩種基因型(P<0.05),所以GG基因型有較強(qiáng)的乳房炎抗性。233(G>A)位點(diǎn)位于IL8基因的5′側(cè)翼區(qū),該突變可能影響該基因表達(dá)調(diào)控,結(jié)果顯示,突變使該基因的表達(dá)量下降。對于其機(jī)理,需要進(jìn)一步進(jìn)行分析研究。

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