袁小亮 張?zhí)焱?朱家馨 鄭文爭(zhēng) 雷建平 涂少華 羅一鈞 劉惟優(yōu)
·論 著 ·
江西省結(jié)核分枝桿菌耐二線抗結(jié)核藥的分子學(xué)特征
袁小亮 張?zhí)焱?朱家馨 鄭文爭(zhēng) 雷建平 涂少華 羅一鈞 劉惟優(yōu)
目的 初步明確江西省耐二線抗結(jié)核藥相關(guān)基因突變的特征,評(píng)價(jià)等位基因特異性多重PCR(multiplex allele-specific polymerase chain reaction,MAS-PCR)檢測(cè)二線抗結(jié)核藥耐藥性的可行性。方法 采用DNA測(cè)序方法和MAS-PCR技術(shù),對(duì)江西省52株耐二線抗結(jié)核藥的結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行耐藥相關(guān)基因突變位點(diǎn)檢測(cè)。結(jié)果 DNA測(cè)序分析:39株耐氧氟沙星(Ofx)菌株中,32株存在gyrA基因錯(cuò)義突變,2株發(fā)生gyrB基因錯(cuò)義突變。29株耐卡那霉素(Km)或卷曲霉素(Cm)菌株中,22株為rrs1401位點(diǎn)A→G突變。52株耐二線抗結(jié)核藥的結(jié)核分枝桿菌,40株為北京基因型(76.92%,40/52),其中17株北京基因型菌株發(fā)生gyrA-GAC94GGC突變(42.50%,17/40),19株北京基因型菌株發(fā)生rrs-A1401G突變(47.50%,19/40)。北京基因型與基因突變類型gyrA-GAC94GGC和rrs-A1401G無(wú)明顯相關(guān)性(χ2=1.16、1.92,P值均>0.05)。MAS-PCR檢測(cè)Ofx耐藥株的敏感度為61.54%(24/39),檢測(cè)Km或Cm耐藥株的敏感度為79.31%(23/29)。結(jié)論gyrA基因94位密碼子突變是江西省結(jié)核分枝桿菌Ofx耐藥的主要機(jī)制;rrs-A1401G突變則是Km或Cm耐藥的主要原因。MAS-PCR方法對(duì)于快速檢測(cè)二線抗結(jié)核藥的耐藥性有一定的臨床應(yīng)用價(jià)值。
分枝桿菌,結(jié)核; 抗藥性,細(xì)菌; 抗生素類,抗結(jié)核; 卡那霉素; 卷曲霉素硫酸鹽; 聚合酶鏈反應(yīng); 江西
耐多藥(multidrug-resistant,MDR)和廣泛耐藥(extensively drug-resistant,XDR)結(jié)核病的出現(xiàn)對(duì)全球結(jié)核病防控提出了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。2007—2008年全國(guó)結(jié)核病耐藥基線調(diào)查顯示:肺結(jié)核耐多藥率為8.32%,廣泛耐藥率為0.68%[1]。二線抗結(jié)核藥是治療耐多藥結(jié)核病的主要藥物。研究提示:氟喹諾酮類藥物能明顯改善耐多藥結(jié)核病患者的預(yù)后;相反,對(duì)氟喹諾酮類耐藥意味著較低治愈率和更高的死亡率[2-3]。因此,快速明確二線抗結(jié)核藥的耐藥性,對(duì)于制定合理化療方案和評(píng)估耐多藥結(jié)核病患者的預(yù)后至關(guān)重要。不同地區(qū)耐藥相關(guān)基因突變類型和頻率不盡相同[4-5],明確局部區(qū)域 Mtb耐二線抗結(jié)核藥的基因突變位點(diǎn)類型及頻率分布特征,將為臨床快速診斷耐二線抗結(jié)核藥的結(jié)核病提供重要的分子生物學(xué)信息。
近年來(lái),等位基因特異性多重聚合酶鏈反應(yīng)(multiplex allele-specific PCR,MAS-PCR)已成功用于一線抗結(jié)核藥耐藥性的分析[6],但其在二線抗結(jié)核藥耐藥性檢測(cè)的應(yīng)用研究較少。此外,MASPCR對(duì)不同區(qū)域的結(jié)核分枝桿菌抗結(jié)核藥耐藥性的檢測(cè)效能(敏感度)差異可能很大。所以,筆者對(duì)來(lái)自江西省耐二線抗結(jié)核藥的結(jié)核分枝桿菌臨床分離株進(jìn)行了MAS-PCR和耐藥相關(guān)基因DNA測(cè)序分析,初步明確該地區(qū)二線抗結(jié)核藥耐藥相關(guān)基因突變特征,探討MAS-PCR在二線抗結(jié)核藥耐藥性檢測(cè)的可行性?,F(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
一、菌株來(lái)源和藥敏實(shí)驗(yàn)
1.菌株來(lái)源:2010年7月至2011年6月期間篩選的52株耐二線抗結(jié)核藥的MDR結(jié)核分枝桿菌臨床分離株,來(lái)自江西省胸科醫(yī)院(MDR37株)和贛州市第五人民醫(yī)院(MDR15株)的52例肺結(jié)核患者。其中男35例,女17例,年齡18~76歲,平均(42.6±14.5)歲。52株耐藥結(jié)核分枝桿菌主要從肺結(jié)核患者的痰及肺泡灌洗液標(biāo)本培養(yǎng)分離獲得。同時(shí),以實(shí)驗(yàn)室保存的30株敏感菌株作為陰性對(duì)照。實(shí)驗(yàn)參照菌株H37Rv(ATCC27294)由江西省胸科醫(yī)院惠贈(zèng)。參照文獻(xiàn)[7]進(jìn)行菌株鑒定。
2.藥敏試驗(yàn):采用世界衛(wèi)生組織全球結(jié)核病耐藥監(jiān)測(cè)項(xiàng)目指南推薦的1%間接比例法進(jìn)行藥敏試驗(yàn)(drug sensitivity test,DST)[8]。藥敏羅氏培養(yǎng)基(嘉偉生物制品有限公司,杭州)藥物終濃度為:異煙肼(INH)0.20μg/ml,利福平(RFP)40μg/ml,氧氟沙星(Ofx)2μg/ml,卡那霉素(Km)30μg/ml,卷曲霉素(Cm)40μg/ml。
二、基因組DNA的提取
按照細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]說(shuō)明書的步驟,提取結(jié)核分枝桿菌基因組DNA溶液約100μl(2.0~3.0μg)。
三、北京基因型菌株的鑒定
按照Chen等[9]建立的以RD105為分子標(biāo)志的定向缺失多重酶鏈聚合反應(yīng)技術(shù)(the RD105 deletion targeted multiplex PCR,DTM-PCR)對(duì)所收集的52株耐藥結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行北京基因型菌株鑒定。結(jié)核分枝桿菌如果存在RD105基因片段缺失則為北京基因型菌株,電泳圖上可見761 bp大小的條帶;RD105基因片段不缺失則為非北京基因型,電泳圖上可見1466 bp大小的條帶。
四、MAS-PCR方法檢測(cè)gyrA 90、94位密碼子和rrs 1401位點(diǎn)突變
目前認(rèn)為,結(jié)核分枝桿菌產(chǎn)生Ofx耐藥主要與gyrA基因耐藥決定區(qū)突變有關(guān),對(duì)Km和Cm耐藥主要與rrs基因突變有關(guān)。因此,本研究針對(duì)gyrA基因90、94位密碼子和rrs 1401位點(diǎn)突變進(jìn)行MAS-PCR分析。MAS-PCR檢測(cè)的對(duì)象包括30株敏感陰性對(duì)照菌株、相應(yīng)的耐藥臨床分離菌株及實(shí)驗(yàn)參照菌株H37Rv。
1.引物設(shè)計(jì):gyrA基因94位密碼子和rrs 1401位點(diǎn)突變檢測(cè)的引物設(shè)計(jì)參照文獻(xiàn)[10]進(jìn)行。gyrA基因90位密碼子突變分析則根據(jù)結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv的gyrA基因全序列(NC-000962)和點(diǎn)檢原理自行設(shè)計(jì)內(nèi)向引物I2(表1)。用于gyrA基因第94位密碼子MAS-PCR突變分析的引物包括gyrA正反向引物F、R和內(nèi)向引物I1(表1);相應(yīng)地,gyrA基因第90位密碼子為gyrA正反向引物F、R和內(nèi)向引物I2(表1),rrs 1401位點(diǎn)為rrs正反向引物F、R和內(nèi)向引物I3(表1)。引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
2.PCR擴(kuò)增體系及反應(yīng)條件:參照文獻(xiàn)[10]進(jìn)行。
3.結(jié)果判讀:擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳120 V,30 min,0.5μg/ml EB染色,以電泳凝膠圖像分析系統(tǒng)(Tanon-2500,上海天能科技有限公司)觀察結(jié)果。根據(jù)PCR原理,gyrA基因94位密碼子野生株可擴(kuò)增出427 bp和260 bp 2條片段,而突變株相應(yīng)的條帶260 bp缺失(圖1a)。類似地,gyrA基因90位密碼子野生株可見427 bp和252 bp 2條片段,突變株252 bp條帶缺失(圖1b)。rrs基因1401位點(diǎn)野生株可見481 bp和353 bp 2條片段,突變株353 bp條帶缺失(圖1c)。
表1 用于靶基因擴(kuò)增及MAS-PCR反應(yīng)的引物序列
圖1 MAS-PCR檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌gyrA和rrs基因突變電泳圖
五、PCR-DNA測(cè)序分析
對(duì)結(jié)核分枝桿菌gyrA、gyrB和rrs基因核心突變區(qū)進(jìn)行體外擴(kuò)增,引物分別為gyrA-F、R,gyrB-F、R和rrs-F、R(表1)。退火溫度及擴(kuò)增片段大小如表1所示。PCR產(chǎn)物送深圳華大基因測(cè)序。gyrA、gyrB和rrs擴(kuò)增片段測(cè)序引物分別為gyrAR、gyrB-F和rrs-F。測(cè)序結(jié)果應(yīng)用NCBI在線軟件Blast 2 Sequences(http://blast.ncbi.nlm.nih. gov/Blast.cgi)與標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv相應(yīng)序列進(jìn)行比對(duì)分析。
六、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
應(yīng)用SPSS 16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。以χ2檢驗(yàn)或Fisher確切概率法(當(dāng)最小理論值小于5時(shí)采用)統(tǒng)計(jì)分析計(jì)數(shù)資料(構(gòu)成比)的差異;在α= 0.05雙側(cè)檢驗(yàn)水準(zhǔn)下,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
一、耐藥表型和北京基因型菌株的鑒定
52株MDR結(jié)核分枝桿菌(其中16株XDR菌株)耐二線抗結(jié)核藥:Ofx 39株(75.00%),Km 28株(53.85%),Cm 14株(26.92%),具體見表2。
52株耐藥結(jié)核分枝桿菌中40株為北京基因型(40/52,76.92%),12株為非北京基因型(12/52,23.08%)。
二、DNA測(cè)序分析
1.gyrA和gyrB基因突變:除了參照菌株H37Rv和1株Ofx耐藥株,38株耐Ofx的臨床分離菌株及30株Ofx敏感的陰性對(duì)照菌株gyrA基因第95位點(diǎn)均存在AGC→ACC突變,第21位點(diǎn)均可見GAG→CAG錯(cuò)義突變。39株耐Ofx菌株中,32株存在gyrA基因錯(cuò)義突變,突變率為82.05%(32/39),涉及90(3/32,9.38%)、91(2/32,6.25%)及94位點(diǎn)(27/32,84.38%),其中以94位點(diǎn)GAC(天冬氨酸)→GGC(甘氨酸)突變最常見(20/32,62.50%)。只有2株耐Ofx菌株存在gyrB基因錯(cuò)義突變,突變率5.13%(2/39);其中1株MDR菌株gyrB基因第540位點(diǎn)GAA→GAC突變的同時(shí)伴有g(shù)yrA基因第94位點(diǎn)GAC→GGC突變。突變類型和頻率詳見表2。gyrA和gyrB基因突變聯(lián)合檢測(cè)Ofx耐藥性的敏感度為84.62% (33/39),6株Ofx耐藥菌株沒有發(fā)現(xiàn)突變。
表2 52株耐藥結(jié)核分枝桿菌表型耐藥模式和耐藥基因突變類型
2.rrs基因突變:30株Km及Cm敏感的陰性對(duì)照菌株均未發(fā)現(xiàn)突變。29株耐Km或Cm結(jié)核分枝桿菌中,6株rrs基因未發(fā)現(xiàn)突變;在發(fā)生突變的23株細(xì)菌中,22株為rrs1401位點(diǎn)A→G突變,另1株為rrs1402位點(diǎn)C→T堿基替換(表2)。DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)該地區(qū)耐氨基糖苷類的MDR菌株檢出率為79.31%(23/29),以rrs-A1401G(95.65%,22/23)突變?yōu)橹鳌?/p>
3.耐藥基因突變類型與北京基因型的關(guān)系:40株北京基因型耐藥菌株中,17株發(fā)生gyrAGAC94GGC突變(42.50%,17/40),19株發(fā)生rrs-A1401G突變(47.50%,19/40)。12株非北京基因型菌株中,3株發(fā)生gyrA-GAC94GGC突變,3株發(fā)生rrs-A1401G突變。統(tǒng)計(jì)分析提示:北京基因型與Ofx耐藥相關(guān)的最常見的基因突變類型gyrAGAC94GGC無(wú)明顯相關(guān)性(χ2=1.16,P>0.05);北京基因型與Km及Cm耐藥相關(guān)的最常見的基因突變類型rrs-A1401G無(wú)明顯相關(guān)性(χ2=1.92,P>0.05)。
三、MAS-PCR檢測(cè)gyrA和rrs基因點(diǎn)突變分析
1.MAS-PCR檢測(cè)gyrA基因突變:在MASPCR檢測(cè)的69株(包括30株Ofx敏感的陰性對(duì)照菌株和39株Ofx耐藥的臨床分離株)結(jié)核分枝桿菌臨床分離株中,30株Ofx敏感株均未提示有突變。39株耐Ofx結(jié)核分枝桿菌中,24株提示有突變(表3)。經(jīng)測(cè)序證實(shí)為94位點(diǎn)GAC→GGC或GAC→GCC突變的21株均為陽(yáng)性,而存在90位點(diǎn)GCG→GTG突變的3株也為陽(yáng)性。與比例法比較,敏感度為61.54%(24/39);與DNA測(cè)序比較,敏感度為72.73%(24/33)。
表3 MAS-PCR和DNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)二線抗結(jié)核藥耐藥性的敏感度
2.MAS-PCR檢測(cè)rrs基因突變:在MAS-PCR檢測(cè)的59株(包括30株Km或Cm敏感的陰性對(duì)照菌株和29株Km或Cm耐藥的臨床分離株)結(jié)核分枝桿菌中,30株敏感株均未提示有突變。29株耐Km或Cm菌株中,23株提示有突變(表3)。經(jīng)測(cè)序證實(shí)存在1401位點(diǎn)A→G突變的22株菌株均為MAS-PCR陽(yáng)性,而存在1402位點(diǎn)C→T突變的1株卻錯(cuò)判為1401位點(diǎn)A→G突變。與比例法比較,敏感度為79.31%(23/29);與DNA測(cè)序比較,敏感度為100.00%(23/23)。
一、結(jié)核分枝桿菌耐二線抗結(jié)核藥物的相關(guān)基因突變特征分析
DNA測(cè)序分析提示:38株耐Ofx菌株及30株敏感陰性對(duì)照菌株的gyrA基因第95位點(diǎn)均存在AGC→ACC突變,第21位點(diǎn)均可見GAG→CAG錯(cuò)義突變。第95位點(diǎn)AGC→ACC突變?yōu)樘烊欢鄳B(tài)現(xiàn)象[11]。第21位點(diǎn)GAG→CAG突變很少報(bào)道,但最近已證實(shí)與耐藥無(wú)關(guān),認(rèn)為是天然多態(tài)現(xiàn)象和物種進(jìn)化遺傳標(biāo)志[12]。本研究DNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)MDR菌株耐Ofx的敏感度為84.62%,與其他研究報(bào)道相一致[13-14]。32株gyrA基因錯(cuò)義突變分別發(fā)生第90(9.38%)、91(6.25%)和94 (84.38%)位密碼子上,未發(fā)現(xiàn)既往文獻(xiàn)報(bào)道的第74和88位密碼子突變[11-12]。只有2株gyrB基因點(diǎn)突變陽(yáng)性。這說(shuō)明gyrA基因突變是江西地區(qū)結(jié)核分枝桿菌對(duì)氟喹諾酮產(chǎn)生耐藥的主要機(jī)制,以94位密碼子突變(27株)為主。本實(shí)驗(yàn)中在gyrA和gyrB基因耐藥決定區(qū)均無(wú)突變的6株耐Ofx結(jié)核分枝桿菌耐藥機(jī)制尚不清楚,有待進(jìn)一步研究。此外,DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)該地區(qū)耐氨基糖苷類的MDR菌株檢出率為79.31%(23/29),以rrs A1401G(95.65%,22/23)突變?yōu)橹鳌?/p>
有研究表明北京基因型與rpoB基因突變、katG基因第315位突變、rpsL基因第43位突變及gyrA基因第94位突變有顯著相關(guān)性[14-16];但也有報(bào)道北京基因型與結(jié)核分枝桿菌耐藥基因突變位點(diǎn)分布并無(wú)相關(guān)性[17-18];本研究結(jié)果支持后者。各地報(bào)道的北京基因型與結(jié)核分枝桿菌耐藥基因突變種類的相關(guān)性有所不同,其原因可能是區(qū)域差異所致[18]。此外,本研究樣本選擇局限于耐多藥結(jié)核分枝桿菌以及樣本量偏小,也是影響研究結(jié)果的重要因素。
二、MAS-PCR技術(shù)檢測(cè)原理及效能分析
MAS-PCR方法常用于已知突變基因的檢測(cè)。其實(shí)驗(yàn)原理基于耐熱Taq DNA聚合酶缺乏3′→5′外切酶校正活性,在同一個(gè)反應(yīng)體系中設(shè)計(jì)兩條外引物和一條內(nèi)引物,其中內(nèi)引物的3′端末端正好對(duì)應(yīng)待測(cè)突變位點(diǎn),若此堿基對(duì)形成錯(cuò)配,鏈延伸反應(yīng)就會(huì)因3′,5′-磷酸二酯鍵形成障礙而受阻。對(duì)于野生型菌株,3條引物均可以起作用,合成2種PCR產(chǎn)物;而當(dāng)待測(cè)位點(diǎn)第1或第2個(gè)核苷酸發(fā)生突變時(shí),在嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臈l件下,內(nèi)引物作用的效率大大降低,因此只能見到外引物合成的長(zhǎng)片段[19-20]。與常規(guī)藥敏結(jié)果比較,本研究MAS-PCR對(duì)氟喹諾酮類藥物耐藥株的檢出率為61.54%,這一結(jié)果稍高于夏強(qiáng)等[20]的研究報(bào)道;與DNA測(cè)序敏感度(84.62%)比較,兩者差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.05,P<0.05)。與比例法和DNA測(cè)序相比,MAS-PCR對(duì)于耐氨基糖苷類結(jié)核分枝桿菌的檢出率分別為79.31%和100.00%。相對(duì)Ofx,MAS-PCR對(duì)耐Km或Cm結(jié)核分枝桿菌顯示了更好的敏感度。其原因在于結(jié)核分枝桿菌對(duì)Km、Cm和Ofx耐藥機(jī)制不同造成的,Km或Cm耐藥相關(guān)的rrs基因突變類型較單一,而Ofx耐藥相關(guān)的gyrA基因突變位點(diǎn)分布及頻率變化則復(fù)雜得多。
三、MAS-PCR技術(shù)檢測(cè)效能的改進(jìn)措施及缺陷分析
不同地區(qū)耐藥相關(guān)基因突變類型和頻率不盡相同,因此,MAS-PCR檢測(cè)敏感度的區(qū)域差異可能很大。本研究DNA測(cè)序顯示江西省39株耐Ofx結(jié)核分枝桿菌菌株中有5株存在gyrA基因第94位點(diǎn)GAC→AAC突變,如果針對(duì)這種突變進(jìn)行引物設(shè)計(jì)將之覆蓋,MAS-PCR的敏感度可能將從61.54%(24/39)提高到74.36%(29/39)。此外,1株rrs1402位點(diǎn)C→T突變通過(guò)MAS-PCR卻錯(cuò)判為1401位點(diǎn)A→G突變,所幸rrs1402位點(diǎn)C→T突變引起了結(jié)核分枝桿菌 Km耐藥[21]。如果其他與耐藥無(wú)關(guān)的基因多態(tài)性被擴(kuò)增,就會(huì)導(dǎo)致假陽(yáng)性。此外,由于分子生物學(xué)方法本身的限制,DNA測(cè)序和MAS-PCR分析結(jié)果陰性的樣本并不能排除表型耐藥的可能[22]。
目前,DNA測(cè)序技術(shù)是分子生物學(xué)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌耐藥性的金標(biāo)準(zhǔn)。MAS-PCR方法不能明確耐藥相關(guān)基因突變的堿基置換,敏感度也不及DNA測(cè)序技術(shù),但它的優(yōu)勢(shì)在于操作簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì),不需要昂貴的儀器,幾個(gè)小時(shí)內(nèi)就可以得到結(jié)果[6]。此外,常規(guī)藥敏檢測(cè)方法耗時(shí)長(zhǎng)(數(shù)周),延誤患者治療,導(dǎo)致耐藥發(fā)生和結(jié)核傳播的機(jī)會(huì)增加[23-24]。因此,在結(jié)核病高發(fā)和耐藥形勢(shì)嚴(yán)峻的區(qū)域,對(duì)于快速診斷耐二線抗結(jié)核藥的結(jié)核病、指導(dǎo)臨床合理用藥,MAS-PCR不失為一種有應(yīng)用價(jià)值的檢測(cè)手段。
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Molecular characteristics of the second-line antituberculosis drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Jiangxi province
YUAN Xiao-liang*,ZHANG Tian-tuo,ZHU Jia-xin,ZHENG Wen-zheng,LEI Jian-ping,TU Shao-hua,LUO Yi-jun,LIU Wei-you.*Department of Respiratory Medicine,the 1st Affiliated Hospital of Gannan Medical College,Ganzhou 341000,China
ZHANG Tian-tuo,Email:zhtituli@163.com
Objective To initially ascertain molecular characteristics of the second-line antituberculosis drugresistant M.tuberculosis clinical isolates in Jiangxi,and to evaluate the feasibility of multiplex allele-specific polymerase chain reaction(MAS-PCR)assay for the detection of the second-line drug resistance in M.tuberculosis clinical isolates.Methods Fifty-two second-line drug-resistant isolates and 30 pan-susceptible isolates from Jiangxi province were analyzed for gene mutations related to the second-line drug resistance using MAS-PCR and DNA sequencing.Results DNA sequencing indicated that 32 of 39 ofloxacin(Ofx)-resistant isolates displayed missense mutations in gyrA gene,and the most common mutations were observed at codon 94(n=27),and only 2 isolates showed single-point mutation in gyrB gene.In addition,22 of 29 kanamycin(Km)-or capreomycin(Cm)-resistant isolates had an A-to-G transition at nucleotide position 1401 of rrs gene.It is shown that the Beijing genotype was predominant(76.92%,40/52)among the 52 drug-resistant strains.Of 40 Beijing genotype strains,17 strains (42.50%)displayed gyrA-GAC94GGC mutations,and 19 strains(47.50%)showed rrs-A1401G mutations.No relationship could be demonstrated between Beijing genotype and gyrA-GAC94GGC or rrs-A1401G mutations(χ2= 1.16,1.92,P value>0.05).In comparison with the phenotypic data,the sensitivities of the detection of Ofx resistance,and Km or Cm resistance using MAS-PCR were 61.54%(24/39)and 79.31%(23/29)respectively.Conclusion In Jiangxi province,gyrA mutation is the main molecular mechanism of Ofx resistance in M.tuberculosis,and an A1401G mutation in the rrs geneis the main cause of Km or Cm resistance.MAS-PCR,an assay with technical simplicity,short turnaround time,and low cost,could be useful for screening second-line drug-resistant M.tuberculosis,particularly in resource-limited areas with a high prevalence of tuberculosis and drug resistance.
Mycobacterium tuberculosis; Drug resistance,bacterial; Antibiotics,antitubercular; Kanamycin; Capreomycin sulfate; Polymerase chain reaction; Jiangxi
2013-04-01)
(本文編輯:張曉進(jìn))
341000贛州,贛南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院呼吸科(袁小亮、劉惟優(yōu));中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院呼吸科(張?zhí)焱小⒅旒臆?、鄭文?zhēng));江西省胸科醫(yī)院結(jié)核科(雷建平),檢驗(yàn)科(涂少華);江西省贛州市第五人民醫(yī)院檢驗(yàn)科(羅一鈞)
張?zhí)焱?,Email:zhtituli@163.com