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        基于文獻(xiàn)定量及知識(shí)圖譜方法的醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究現(xiàn)狀分析

        2013-05-11 08:28:00李國棟
        中國科技信息 2013年24期
        關(guān)鍵詞:題錄信息學(xué)可視化

        李國棟

        南陽醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)校,河南 南陽 473058

        1.概述

        醫(yī)學(xué)信息學(xué)是一門興起于上個(gè)世紀(jì)70年代基于醫(yī)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、信息管理學(xué)、和統(tǒng)計(jì)學(xué)的新興交叉學(xué)科,隨著醫(yī)學(xué)院校對(duì)醫(yī)學(xué)信息教育的開展和醫(yī)療事業(yè)單位信息化的發(fā)展,醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究逐漸深入,對(duì)本學(xué)科領(lǐng)域以及相關(guān)領(lǐng)域的研究文獻(xiàn)數(shù)量不斷增加。本文通過用文獻(xiàn)定量分析和可視化分析的方法,對(duì)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析,以知識(shí)圖譜的形式顯示學(xué)科發(fā)展路徑,揭示醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究領(lǐng)域的特點(diǎn)、研究前沿和發(fā)展趨勢,為今后更加深入的研究提供參考。

        2.數(shù)據(jù)來源及工具

        使用萬方知識(shí)服務(wù)平臺(tái)進(jìn)行文獻(xiàn)檢索并導(dǎo)出2003年以來有關(guān)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)術(shù)論文的題錄,文獻(xiàn)題錄包含標(biāo)題、作者、關(guān)鍵詞、摘要、機(jī)構(gòu)、來源等字段供分析使用。使用的軟件有中文文獻(xiàn)檢索管理軟件NoteExpress、文獻(xiàn)題錄信息統(tǒng)計(jì)分析工具SATI 3.2、可視化文獻(xiàn)分析軟件Gephi,這些軟件用于加工整理文獻(xiàn)信息、分析數(shù)據(jù)和進(jìn)行可視分文獻(xiàn)分析。

        3.方法與步驟

        3.1 搜集文獻(xiàn)數(shù)據(jù)

        使用萬方知識(shí)服務(wù)平臺(tái)的高級(jí)檢索功能進(jìn)行文獻(xiàn)檢索,檢索式為“關(guān)鍵詞:(醫(yī)學(xué)信息) + 關(guān)鍵詞:(醫(yī)學(xué)信息學(xué))* Date:2003-2013”,得到1,548條文獻(xiàn)信息,再用數(shù)據(jù)庫的“導(dǎo)出”功能導(dǎo)出NoteExpress格式的文獻(xiàn)題錄,將題錄導(dǎo)入NoteExpress進(jìn)行查重、去除無效數(shù)據(jù)等操作,最后得到1387條文獻(xiàn)題錄數(shù)據(jù)。

        3.2 數(shù)據(jù)定量分析

        3.2.1 抽取字段和詞頻排序 從NoteExpress導(dǎo)出符合要求的題錄數(shù)據(jù),使用SATI3.2進(jìn)行處理,使用“字段抽取”和“頻次統(tǒng)計(jì)”功能統(tǒng)計(jì)出作者、關(guān)鍵詞、機(jī)構(gòu)、期刊來源等字段的詞頻進(jìn)行排序,以供后序的詞頻分析使用。

        3.2.2 詞頻分析 通過對(duì)對(duì)各個(gè)字段的詞頻進(jìn)行排序,對(duì)論文高發(fā)階段、核心作者和機(jī)構(gòu)群體、核心期刊群體等進(jìn)行分析,用表格和圖表的形式呈現(xiàn)出分析結(jié)果,展示醫(yī)學(xué)信息學(xué)學(xué)科領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀。

        3.2.3 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析 使用軟件SATI3.2生成關(guān)鍵詞的高頻詞共現(xiàn)關(guān)系矩陣,進(jìn)行格式處理以后導(dǎo)入可視化分析軟件Gephi生成高頻關(guān)鍵詞的共現(xiàn)關(guān)系圖譜,直觀地反映出研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)和前沿,并預(yù)測醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的發(fā)展趨勢。

        4. 結(jié)果分析

        4.1 文獻(xiàn)定量分析

        4.1.1 發(fā)文數(shù)量分析 本研究共獲得文獻(xiàn)題錄信息1387條,其中包括期刊論文965條、會(huì)議論文259條、學(xué)位論文163條。從2003年以來醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究領(lǐng)域研究的學(xué)術(shù)論文分布如圖1所示。從圖中可以看到2003年至2006年對(duì)醫(yī)學(xué)信息的研究論文數(shù)量呈上升趨勢(前期),2006年至2010年數(shù)量則穩(wěn)定于高位(中期),而在2011、2012兩年里本學(xué)科領(lǐng)域的研究文獻(xiàn)數(shù)量呈下降趨勢(后期)。這說明在前期醫(yī)學(xué)與信息管理、計(jì)算機(jī)技術(shù)相結(jié)合的背景下,研究熱點(diǎn)頻繁出現(xiàn),相關(guān)的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)數(shù)量激增。對(duì)醫(yī)學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域的研究在中期熱點(diǎn)集中,發(fā)展迅速,因此學(xué)術(shù)文獻(xiàn)的數(shù)量居高穩(wěn)定。而在后期由于本學(xué)科領(lǐng)域熱點(diǎn)的研究已經(jīng)趨于成熟,熱度漸消,因此整體的學(xué)術(shù)研究文獻(xiàn)數(shù)量處于下降趨勢,隨著學(xué)科領(lǐng)域理論與技術(shù)的不斷進(jìn)展,將會(huì)產(chǎn)生新的學(xué)科熱點(diǎn),發(fā)文數(shù)量也會(huì)進(jìn)入下一個(gè)循環(huán)周期。

        圖1 發(fā)文量逐年分布圖

        4.1.2 作者分析 通過對(duì)第一作者字段的抽取和詞頻統(tǒng)計(jì),對(duì)所有866名作者的發(fā)文量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)排序,并將在本學(xué)科研究領(lǐng)域中發(fā)文量超過4篇的作者列出(表1)??梢钥吹?,以第一作者發(fā)表4篇以上的作者有28人,一共發(fā)表169篇,占總數(shù)的12.2%,其中發(fā)表數(shù)量最多的有13篇,10篇2人,9篇3人,7篇32人,6篇3人,5篇6人,4篇10人,其余發(fā)文量3篇及3篇以下的共有837人。由此顯示,醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科研究隊(duì)伍已經(jīng)形成了以吉林大學(xué)王偉教授和上海中醫(yī)藥大學(xué)包含飛研究員為代表的核心作者群體,研究的學(xué)科范圍涵蓋了醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育、生物醫(yī)學(xué)信息、醫(yī)院信息化建設(shè)、數(shù)字資源建設(shè)、醫(yī)學(xué)信息服務(wù)、云計(jì)算等學(xué)科,包含飛的單篇最高被引次數(shù)為22次,王偉的被引次數(shù)為12次,這說明作者論文的質(zhì)量和影響力也能夠代表本學(xué)科領(lǐng)域的學(xué)術(shù)水平。

        表1 第一作者發(fā)文量統(tǒng)計(jì)(部分)

        4.1.3 來源期刊分析

        根據(jù)本文統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(表2),從2003年至今國內(nèi)共有250種中文期刊發(fā)表了1387篇有關(guān)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的學(xué)術(shù)論文,其中發(fā)表數(shù)量在10篇以上的期刊共有12種,合計(jì)發(fā)文474篇,占總量的34.2%,其中《醫(yī)學(xué)信息學(xué)雜志》發(fā)表130篇,《中華醫(yī)學(xué)圖書情報(bào)雜志》發(fā)表125篇,《醫(yī)學(xué)信息》發(fā)表60篇,發(fā)表41篇,可以看出以《醫(yī)學(xué)信息學(xué)雜志》、《中華醫(yī)學(xué)圖書情報(bào)雜志》、《醫(yī)學(xué)信息》、《醫(yī)學(xué)情報(bào)工作》等期刊為代表的期刊群已經(jīng)成為進(jìn)行醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的主要學(xué)術(shù)交流陣地,在這些期刊上發(fā)表的相關(guān)學(xué)術(shù)論文代表了本學(xué)科領(lǐng)域研究的發(fā)展方向趨勢。

        表2 來源期刊統(tǒng)計(jì)表(部分)

        4.1.4 關(guān)鍵詞統(tǒng)計(jì)分析

        關(guān)鍵詞是能夠反映文獻(xiàn)實(shí)質(zhì)內(nèi)容的詞匯,通過它對(duì)文獻(xiàn)內(nèi)容的標(biāo)引,我們能夠快速地通過檢索工具得到符合我們要求的文獻(xiàn)。通過對(duì)大量關(guān)鍵詞數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析,可以準(zhǔn)確地把握學(xué)科領(lǐng)域的研究動(dòng)態(tài)和發(fā)展趨勢。本文圍繞“文獻(xiàn)信息”和“文獻(xiàn)信息學(xué)”主題從文獻(xiàn)題錄的關(guān)鍵詞字段中共抽取出現(xiàn)次數(shù)2次以上的關(guān)鍵詞574個(gè),詞頻在10次以上的關(guān)鍵次一共46個(gè),詞頻在30次以上的關(guān)鍵詞有 “醫(yī)學(xué)信息資源”、“醫(yī)學(xué)信息服務(wù)”、“信息服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)信息檢索”、“醫(yī)學(xué)信息學(xué)應(yīng)用”、“醫(yī)學(xué)改革”、“醫(yī)學(xué)圖書館”、“醫(yī)院圖書館”等,從這些調(diào)頻關(guān)鍵詞的分布可以看出近年來醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)主要分布情況。對(duì)了2003年以來各年文獻(xiàn)中高頻關(guān)鍵詞的前10名的統(tǒng)計(jì)清晰地展示出醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的研究脈絡(luò),可以看到“醫(yī)學(xué)信息資源”、“醫(yī)學(xué)信息服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)信息管理”等研究主題始終貫穿在醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究的過程,同時(shí)“醫(yī)學(xué)圖書館”、“互聯(lián)網(wǎng)”、“醫(yī)院信息系統(tǒng)”、“數(shù)據(jù)挖掘”等研究熱點(diǎn)也在隨著時(shí)間推移而不斷涌現(xiàn)和變換。而近3年來在研究大方向不變的情況下,“醫(yī)學(xué)信息教育”、“教學(xué)方法”、“教學(xué)改革”、“醫(yī)學(xué)信息管理”、“醫(yī)院信息系統(tǒng)”等關(guān)鍵詞逐漸出現(xiàn),說明有關(guān)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育、醫(yī)學(xué)信息管理應(yīng)用的研究開始成為學(xué)科研究的前沿和熱點(diǎn)。

        4.2 文獻(xiàn)可視化分析

        文獻(xiàn)信息可視化分析是情報(bào)學(xué)研究的重要領(lǐng)域之一,特別是近年來功能強(qiáng)大的可視化分析軟件通過對(duì)海量數(shù)據(jù)的挖掘分析功能為研究者準(zhǔn)確、直觀地提示學(xué)科領(lǐng)域熱點(diǎn)和前沿提供了強(qiáng)大的技術(shù)手段,在文獻(xiàn)定量分析的基礎(chǔ)上,用多維圖譜對(duì)學(xué)科領(lǐng)域研究進(jìn)行共詞分析、共引分析、聚類分析和時(shí)區(qū)分析。本文使用可交互的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系可視化分析軟件Gephi對(duì)2003年以來醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究文獻(xiàn)進(jìn)行了關(guān)鍵詞共現(xiàn)可視化分析。具體方法是使用SATI3.2對(duì)文獻(xiàn)題錄進(jìn)行處理,生成關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系矩陣,用Gephi對(duì)共現(xiàn)關(guān)系矩陣進(jìn)行數(shù)據(jù)清洗之后繪制出關(guān)鍵詞聚類和共現(xiàn)關(guān)系圖譜(圖2)從而展示出醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究領(lǐng)域聚焦的熱點(diǎn)以及它們之間的關(guān)聯(lián)。

        從圖2的關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系圖譜中可以看到,從2003年以來對(duì)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究圍繞“醫(yī)學(xué)信息”和“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”兩個(gè)主題又逐步形成了不同的研究熱點(diǎn),圖中節(jié)點(diǎn)的顏色分組代表了對(duì)關(guān)鍵詞聚類分析結(jié)果,節(jié)點(diǎn)之間的連線則反映了關(guān)鍵詞之間的共現(xiàn)關(guān)系。為了更加清晰地了解文獻(xiàn)信息學(xué)的進(jìn)展?fàn)顩r,本例對(duì)文獻(xiàn)信息以年為單位進(jìn)行切割,并選取2003年、2008年和2012年的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行了可視化分析對(duì)比(圖3、圖4、圖5)。

        圖2 2003年以來醫(yī)學(xué)信息學(xué)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系圖譜

        圖3 2003年醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜

        圖4 2008年醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜

        圖5 2012醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜

        通過圖3,可以看出2003年圍繞醫(yī)學(xué)信息學(xué)主題開展的研究有“醫(yī)學(xué)信息管理”、“遠(yuǎn)程醫(yī)療”、“數(shù)據(jù)庫”、“網(wǎng)絡(luò)環(huán)境”、“圖書館”、“信息服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)信息學(xué)應(yīng)用”、“醫(yī)院信息系統(tǒng)”等,出現(xiàn)了“醫(yī)學(xué)信息服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)圖書館”和“醫(yī)院圖書館”等研究熱點(diǎn)。圖4顯示2008年 “醫(yī)學(xué)信息學(xué)” 研究領(lǐng)域出現(xiàn)的熱點(diǎn)有“信息服務(wù)”、“循證醫(yī)學(xué)”、“醫(yī)院信息系統(tǒng)”、“教學(xué)改革”、“醫(yī)學(xué)信息服務(wù)”。圖5顯示在“醫(yī)學(xué)信息學(xué)”研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)仍圍繞著“醫(yī)學(xué)信息服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)信息管理”、“醫(yī)學(xué)圖書館”等主題開展,聚類分析顯示出“軍隊(duì)醫(yī)學(xué)應(yīng)用”、“醫(yī)學(xué)信息教育”、“醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)”、“重點(diǎn)學(xué)科”、“決策”等主題的研究也在逐步升溫。通過對(duì)三幅關(guān)鍵詞共現(xiàn)關(guān)系圖譜的對(duì)比,還可以看出2003年和2008年的共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)比較簡單,焦點(diǎn)集中,而2012年的共現(xiàn)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜,焦點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)豐富,這說醫(yī)學(xué)信息學(xué)作為一門新興的交叉學(xué)科,正在加速與其他學(xué)科整合,學(xué)科領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)不斷涌現(xiàn)的發(fā)展趨勢。

        5.結(jié)語

        海量的文獻(xiàn)信息數(shù)據(jù)中包含了學(xué)科領(lǐng)域研究的各種隱藏信息,通過數(shù)據(jù)挖掘析出有用的數(shù)據(jù),再用文獻(xiàn)定量和可視化分析的方法,可以清晰地顯示出該學(xué)科領(lǐng)域研究的演進(jìn)過程。本文通過文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)和定量分析、可視化分析的方法,使用目前最前沿的學(xué)科知識(shí)圖譜軟件對(duì)醫(yī)學(xué)信息學(xué)學(xué)科領(lǐng)域研究的演進(jìn)過程和前沿?zé)狳c(diǎn)進(jìn)行了分析,為本學(xué)科研究者把握學(xué)科前沿,深入開展研究提供了可靠的參考。

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