劉珊珊 彭斌等
摘 要:【目的】為了探明引起海南省和河南省甜瓜褪綠黃化的病因,【方法】提取從海南三亞和河南鄭州采集的甜瓜葉片的RNA,用CCYV特異性引物進(jìn)行外殼蛋白基因的克隆、測序,并與GenBank中同屬或同種病毒的cp基因核苷酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹?!窘Y(jié)果】結(jié)果顯示,RT-PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,所得條帶在880 bp左右,與預(yù)期的一致;構(gòu)建cp基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),樣品與瓜類褪綠黃化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)的親緣關(guān)系很近,屬于同一個分枝,而與該病毒同屬不同種的南瓜黃矮失調(diào)病毒(Cucurbit yellow stunting disorder virus,CYSDV)和大麥黃矮病毒(Barley yellow dwarf virus,BYDV) 的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),屬于不同的分枝?!窘Y(jié)論】證實海南省和河南省甜瓜褪綠黃化病是由瓜類褪綠黃化病毒引起。
關(guān)鍵詞: 甜瓜; 瓜類褪綠黃化病毒; 外殼蛋白基因; 黃化
中圖分類號:S652 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1009-9980?穴2013?雪02-0291-03
瓜類褪綠黃化病是一種近年爆發(fā)的新病害,病原為瓜類褪綠黃化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)。該病毒屬于長線病毒科(Closteroviridae)毛形病毒屬(Crinivirus),通過煙粉虱以半持久性方式傳播,已知在自然界主要侵染葫蘆科作物的甜瓜、西瓜、黃瓜。植物感染CCYV后,通常中下部葉片先感染,逐步向上發(fā)展,新葉常無癥狀。葉片開始出現(xiàn)褪綠, 隨著病情發(fā)展,葉片黃化,同時仍能看見保持綠色的局部組織, 最后全葉黃化,但葉脈仍保持綠色。該病害最早于2004年在日本發(fā)現(xiàn)[1],我國于2007年,在上海、寧波發(fā)現(xiàn),目前已分布于廣西、江蘇、山東、浙江[2]和臺灣[3],此外該病在蘇丹[4]和黎巴嫩也有發(fā)生。關(guān)于該病害在我國的南北分布仍然不清楚,2011年我們實地調(diào)查海南三亞和河南鄭州的甜瓜病毒病發(fā)生情況,觀察到設(shè)施甜瓜普遍發(fā)生黃化。從發(fā)病的大棚采集病葉,通過病毒外殼蛋白基因(cp)的克隆和序列分析,證實樣品系CCYV病毒感染。
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 樣品 2011年3月在海南三亞樂東縣佛羅鎮(zhèn)長流村、福塘村、鶯歌海、尖峰鎮(zhèn);2011年10月在河南鄭州河南農(nóng)業(yè)大學(xué)實驗園區(qū)采集表現(xiàn)褪綠黃化的甜瓜葉片,編號分別為SY1、SY2、SY3、SY4和ZZ1,保存于-80 ℃。
1.1.2 試劑 M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs、RNAiso Plus試劑、TaqDNA聚合酶、Ribonuclease Inhibitor和T載體pMD18-T等分子生物學(xué)試劑,產(chǎn)品購自寶生物工程有限公司;75%乙醇(DEPC處理水配制)、氯仿、異戊醇等均為國產(chǎn)分析純試劑。
1.2 方法
1.2.1 植物總RNA的提取 參照TaKaRa RNAiso Plus試劑盒的說明,從所采集的甜瓜葉片中提取總RNA。稱取0.2 g樣品于干熱滅菌的研缽中加液氮研磨,加700 μL的RNAiso Plus后勻漿,靜置5 min,12 000 r·min-1、4 ℃離心5 min,取上清加入140 μL的氯仿振蕩混勻,靜置5 min,12 000 r·min-1、4 ℃離心15 min,取上清并加入等體積的異丙醇,靜置10 min,12 000 r·min-1、4 ℃離心10 min。加入1 mL的75%乙醇洗滌沉淀,12 000 r·min-1、4 ℃離心5 min,棄上清保留沉淀,晾干,溶解于30 μL的DEPC處理水中。
1.2.2 cp基因擴(kuò)增 根據(jù)GenBank發(fā)表的CCYV的cp序列,設(shè)計一對特異性引物CP-F: CGTAAGTGATCGCAATCAAT,CP-R: AGTGATCACTTGACCATCTCC,擴(kuò)增片段長度876 bp。引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
以提取的總 RNA 為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反應(yīng)體系為10 μL。向經(jīng)過DEPC處理的0.2 mL的離心管中加入3 μL RNA、1 μL CP-R 10 μmol·L-1、3.5 μL dNTPs 25 mmol·L-1、2 μL 5×M-MLV Buffer、0.2 μL的RNA酶抑制劑 40 u·μL-1和0.3 μL的M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶200 u·μL-1,42 ℃水浴1 h。
PCR反應(yīng)采用15 μL體系,含ddH2O 7.7 μL、10×PCR緩沖液 1.5 μL、dNTPs 2.5 mmol·L-11 μL、反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2.5 μL、10 μmol·L-1的CP-F和CP-R各1 μL、5 u·μL-1 Taq DNA聚合酶 0.3 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性 3 min;94 ℃ 變性1 min、58 ℃ 退火1 min、72 ℃ 延伸1 min,共30個循環(huán);最后72 ℃總延伸10 min。
1.2.3 目的片段的回收 PCR產(chǎn)物經(jīng)1%的低熔點瓊脂糖凝膠電泳、EB染色后在凝膠成像系統(tǒng)上觀察、拍照,用大連寶生物工程有限公司的小量DNA片段快速膠回收試劑盒回收目的片段。
1.2.4 PCR產(chǎn)物克隆 PCR產(chǎn)物回收后與pMD18-T連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。37 ℃培養(yǎng)14~16 h,挑取單菌落,37 ℃ 200 r·min-1培養(yǎng),3~5 h后PCR鑒定轉(zhuǎn)化結(jié)果,轉(zhuǎn)化成功的菌液送到上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序。
1.2.5 序列分析 利用DNAMAN軟件比較所得序列與GeneBank中CCYV的cp基因序列的相似性。
2 結(jié)果與分析
2.1 RT-PCR結(jié)果
采用RT-PCR方法對從河南與海南采集的甜瓜葉片進(jìn)行檢測,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果顯示,產(chǎn)物大小在880 bp左右,與預(yù)期的一致2.2 核苷酸序列測定與同源性分析
對含有擴(kuò)增片段克隆的大腸桿菌菌液進(jìn)行序列測定,獲得了SY1、SY2、SY3、SY4和ZZ1 5個CCYV分離物的部分基因組序列。擴(kuò)增的片段長876 bp,包含完整的cp基因序列(4941~5693nt;753 bp)和部分cpm基因序列(5693~5740 nt;48 bp)。
用DNAMAN將所得的5個分離物的cp基因的核苷酸序列與GenBank中提交的所有CCYV以及該病毒同屬的南瓜黃矮失調(diào)病毒(Cucurbit yellow stunting disorder virus, CYSDV)和大麥黃矮病毒(Barley yellow dwarf virus, BYDV )的cp基因核苷酸序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn)這5個分離物與CCYV的親緣關(guān)系很近,屬于同一個分枝,而與CYSDV和BYDV的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),屬于不同的分枝,因此可以確定該病毒是CCYV。
3 討 論
瓜類褪綠黃化病最早于2004年在日本由Okuda等[1]發(fā)現(xiàn),直到2010年病原才被發(fā)布,該病由CCYV引起。2007年秋季,在我國寧波、上海、山東發(fā)生甜瓜、西瓜和黃瓜的大面積黃化,通過研究證明這些地區(qū)發(fā)生的瓜類黃化病原是CCYV[2]。世界上目前已知該病害分布于日本、蘇丹、黎巴嫩、中國,在我國分布于廣西、江蘇、山東、浙江和臺灣。由于煙粉虱傳播的病毒病害容易大范圍、大地域的傳播發(fā)生,我們認(rèn)為除上述這些地區(qū)外,可能會有更大范圍的傳播和分布,因此調(diào)查中國最南部的海南省和中部的河南省,發(fā)現(xiàn)秋季種植的甜瓜均發(fā)生大面積黃化,這些黃化的癥狀和病害發(fā)生流行的特點與Gu等[2]報道過的中國沿海省份地區(qū)如寧波、上海和山東所發(fā)生的瓜類黃化病相同,因此推測是同一種病害。本實驗通過對從海南三亞、河南鄭州采集的樣品進(jìn)行CCYV cp基因克隆和序列分析,證實CCYV在海南、河南這兩省均有發(fā)生。
瓜類褪綠黃化病毒由煙粉虱以半持久的方式進(jìn)行傳播,僅由成蟲帶毒,該病的發(fā)生與病害發(fā)生地?zé)煼凼陌l(fā)生有著很大的關(guān)系,病害發(fā)生季節(jié)與煙粉虱大發(fā)生時期相一致。B型和Q型煙粉虱傳播該病毒,而Q型煙粉虱傳播的作用可能更大,因此對煙粉虱生物型分布的了解將有助于此病害發(fā)生地的調(diào)查研究。目前還沒有發(fā)現(xiàn)種子攜帶該病毒的情況,而該病害的發(fā)生季節(jié)性非常明顯,主要集中在8—10月份,與大多數(shù)地區(qū)的煙粉虱大爆發(fā)時期一致,同時我們觀察到春季也有發(fā)生,這應(yīng)該取決于瓜類作物種植的環(huán)境,如果是溫室周年種植瓜類作物,那么也會引起春季發(fā)生該病害。
由于該病害是新突發(fā)病害,關(guān)于該病害的研究還非常少,加強該病害流行學(xué)方面的研究無疑有利于我們控制病害。從該病毒在世界及我國的分布來看,該病害已經(jīng)在許多地方分布,所以了解該病毒的遠(yuǎn)距離傳播方式對防止該病害進(jìn)一步蔓延有著重要意義。
本試驗結(jié)果表明,海南三亞、河南鄭州發(fā)生瓜類褪綠黃化病,說明該病害可能分布于南至海南北至河南的所有地區(qū)。隨著病害的蔓延,極可能會在更大的地域分布。因此監(jiān)測與控制該病害,對于西瓜、甜瓜、黃瓜的產(chǎn)業(yè)持續(xù)健康發(fā)展是非常重要的。
參考文獻(xiàn) References:
[1] OKUDA M, OKAZAKI S, YAMASAKI S, OKUDA S, SUGIYAMA M. Host range and complete genome sequence of Cucurbit chlorotic yellows virus, a new member of the genus Crinivirus[J]. Phytopathology,2010,100(6): 560-566.
[2] GU Q S, LIU Y H, WANG Y H, HUANGFU W G, GU H F, XU L, SONG F M,BROWN J K. First report of Cucurbit chlorotic yellows virus in cucumber, melon, and watermelon in China[J]. Plant Disease, 2011,95(1): 73.
[3] HUANG L H,TSENG H H , LI J T, CHEN T C. First report of cucurbit chlorotic yellows virus infecting cucurbits in Taiwan[J]. Plant Disease, 2010,94(9): 1168.
[4] HAMED K,MENZEL W,DAFALLA G, GADELSEED A M A, WINTER S. First report of Cucurbit chlorotic yellows virus infecting muskmelon and cucumber in Sudan[J]. Plant disease, 2012,95(11):1321.