他1999年被選拔為兵團(tuán)學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后，先后主持省部級(jí)科研項(xiàng)目20多項(xiàng)，其中近五年主持或參加省部級(jí)科研項(xiàng)目10多項(xiàng)。2003-2005年他是科技部西部專(zhuān)項(xiàng)機(jī)采棉綜合配套技術(shù)產(chǎn)業(yè)化與示范的首席專(zhuān)家；2004-2006年他主持科技部成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目特早熟長(zhǎng)絨棉“新海22號(hào)”的中試與示范；在十一五期間，他主持國(guó)家科技支撐計(jì)劃雜交棉種質(zhì)資源創(chuàng)新及強(qiáng)優(yōu)勢(shì)組合選育（經(jīng)費(fèi)386萬(wàn)元），率領(lǐng)項(xiàng)目組選育出雜交棉品種4個(gè)，推廣雜交棉509萬(wàn)畝（其中自育新品種29.9萬(wàn)畝），創(chuàng)經(jīng)濟(jì)效益14.19億元，2010年獲科技部十一五國(guó)家科技計(jì)劃執(zhí)行突出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)。

他就是新疆農(nóng)墾科學(xué)院棉花所書(shū)記兼副所長(zhǎng)鄧福軍，鄧福軍長(zhǎng)期致力于棉花育種、栽培、農(nóng)業(yè)技術(shù)管理、技術(shù)服務(wù)與技術(shù)推廣工作，作為新疆兵團(tuán)學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人，兼任新疆土壤肥料學(xué)會(huì)理事，新疆農(nóng)學(xué)會(huì)理事、新疆兵團(tuán)作物學(xué)會(huì)常務(wù)理事、新疆品種審定委棉花專(zhuān)業(yè)組副組長(zhǎng)，新疆兵團(tuán)棉花學(xué)會(huì)理事長(zhǎng)、新疆石河子大學(xué)碩士生導(dǎo)師。

多年來(lái)，鄧福軍主持或參加選育出棉花新品種12個(gè)，獲得省級(jí)及省級(jí)以上科技進(jìn)步獎(jiǎng)15項(xiàng)。其中參加選育出長(zhǎng)絨棉新品種新海8號(hào)，獲1989年兵團(tuán)科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)；參加完成大面積推廣復(fù)播綠肥豐產(chǎn)配套栽培項(xiàng)目，1993年獲農(nóng)業(yè)部豐收二等獎(jiǎng)；參加完成棉花高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)及地膜回收技術(shù)推廣項(xiàng)目，1995年獲農(nóng)業(yè)部豐收二等獎(jiǎng)；2004年選育出特早熟長(zhǎng)絨棉新品種新海22號(hào)，填補(bǔ)了北疆不能種植長(zhǎng)絨棉的歷史空白，并于2005年獲兵團(tuán)科學(xué)技術(shù)進(jìn)步二等獎(jiǎng)。2005年2月選育出彩色棉新品種新彩8號(hào)，2006年獲兵團(tuán)科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)。2008年11月主持完成的機(jī)采棉綜合配套技術(shù)產(chǎn)業(yè)化開(kāi)發(fā)與示范獲兵團(tuán)科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)。參加完成的新陸早33號(hào)選育及推廣，2011年獲兵團(tuán)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)。主持完成的雜交棉新品種選育及配套技術(shù)研究與示范2012年獲兵團(tuán)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)。主持選育出的棉花新品種“新陸早45號(hào)”被確定為2012年石河子主推品種，推廣125萬(wàn)畝。參加編寫(xiě)的《新疆棉花苗情診斷圖譜》科普書(shū)，多次再版，發(fā)行2.6萬(wàn)冊(cè)，2009年獲農(nóng)業(yè)部、中國(guó)農(nóng)學(xué)會(huì)中華農(nóng)業(yè)科技獎(jiǎng)。主持編寫(xiě)的職業(yè)技能鑒定教材《農(nóng)藝工-棉花》再版6次，發(fā)行16.4萬(wàn)冊(cè)，深受農(nóng)工和廣大讀者的歡迎。先后在《新疆農(nóng)墾科技》、《中國(guó)棉花》、《世界農(nóng)業(yè)》等省或省級(jí)以上刊物發(fā)表學(xué)術(shù)論文50多篇；曾十多次被評(píng)為深受讀者喜愛(ài)的好文章。其中，1992年4月論文入選參加了在人民大會(huì)堂召開(kāi)的中國(guó)科協(xié)首屆青年學(xué)術(shù)年會(huì)和1999年在杭州召開(kāi)的中國(guó)科協(xié)首屆學(xué)術(shù)年會(huì)。

在主持多項(xiàng)科研工作的同時(shí)，根據(jù)兵團(tuán)棉花生產(chǎn)發(fā)展的需要和兵團(tuán)農(nóng)業(yè)局、科技局的統(tǒng)一安排，鄧福軍率服務(wù)組赴農(nóng)六師紅旗農(nóng)場(chǎng)、29團(tuán)、30團(tuán)、130團(tuán)進(jìn)行科技服務(wù)與扶貧工作。2000年赴農(nóng)六師紅旗農(nóng)場(chǎng)進(jìn)行科技服務(wù)，使紅旗農(nóng)場(chǎng)棉花籽棉單產(chǎn)由上年的110-130kg提高到205kg；2001年赴農(nóng)二師29團(tuán)進(jìn)行科技服務(wù)工作，創(chuàng)該團(tuán)植棉面積、總產(chǎn)、單產(chǎn)均創(chuàng)歷史最好水平；2002年，赴農(nóng)二師30團(tuán)技術(shù)服務(wù)，推動(dòng)了該團(tuán)棉花高產(chǎn)、高效綜合技術(shù)的推廣，棉花生產(chǎn)水平名列全師上游；2007—2009年赴農(nóng)七師130團(tuán)技術(shù)服務(wù)，帶動(dòng)了該團(tuán)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的調(diào)整，促進(jìn)了高產(chǎn)高效農(nóng)業(yè)的發(fā)展。

鄧福軍堅(jiān)持在生產(chǎn)一線(xiàn)進(jìn)行科技服務(wù)，通過(guò)舉辦培訓(xùn)，提高棉農(nóng)素質(zhì)；通過(guò)田間指導(dǎo)和現(xiàn)場(chǎng)咨詢(xún)，提高棉農(nóng)植棉水平；通過(guò)試驗(yàn)與示范，確定當(dāng)?shù)刈钸m宜的栽培技術(shù)；每年分赴各師植棉團(tuán)場(chǎng)，針對(duì)兵團(tuán)棉花生產(chǎn)在品種布局、栽培技術(shù)、綜合防治、種子生產(chǎn)方面存在的問(wèn)題等進(jìn)行考察、現(xiàn)場(chǎng)咨詢(xún)、指導(dǎo)、決策、提出建議。在工作方法上，他堅(jiān)持定期檢查與評(píng)比，無(wú)論是半年檢查還是年末總結(jié)，都能針對(duì)項(xiàng)目進(jìn)展、存在問(wèn)題，及時(shí)協(xié)調(diào)人員與資金，從嚴(yán)管理，堅(jiān)持實(shí)事求是、密切協(xié)作原則。品種審定后，與相關(guān)師局協(xié)商棉花制種、試驗(yàn)示范，注重新品種、新技術(shù)的推廣與培訓(xùn)。

多年來(lái)，鄧福軍在棉花育種、栽培和技術(shù)服務(wù)行業(yè)取得了巨大的成績(jī)，為推動(dòng)我國(guó)棉花生產(chǎn)乃至農(nóng)業(yè)的發(fā)展做出了不可替代的貢獻(xiàn)！