說起生物統(tǒng)計學，很多人可能一頭霧水，不知道是研究什么的?！吧锝y(tǒng)計學是采用統(tǒng)計學的定量分析方法研究生命科學相關問題的一門交叉學科，目前已被廣泛應用于生命科學的各個領域中”，作為復旦大學生物統(tǒng)計學研究所正高級P I的胡躍清這樣解釋道。因此，也可以說，生物統(tǒng)計學是一門始終圍繞著生命而奔走的學科。

胡躍清多年從事統(tǒng)計遺傳學，統(tǒng)計法證學和統(tǒng)計診斷學的研究工作，在John Wiley Sons出版著作“Statistical DNA Forensics： Theory， Methods and Computation”，在American Journal of Epidemiology， Annals of Human Genetics， Biometrics， Forensic Science International， Genetic Epidemiology， Genetics， Heredity， Human Heredity， International Journal of Legal Medicine， Journal of Human Genetics， Journal of the Royal Statistical Society Series A， Scandinavian Journal of Statistics， Statistics in Medicine， Transfusion等國際著名刊物上發(fā)表科學論文。

樹立科學理想走上研究道路

1981-1988年就讀中山大學數(shù)學系獲理學學士學位和理學碩士學位，2003-2007年就讀香港大學統(tǒng)計與精算學系獲哲學博士學位。1988-2003年任東南大學助教/講師/副教授，2007-2009年任香港大學統(tǒng)計與精算學系助理教授。從2010年，他開始擔任復旦大學生物統(tǒng)計學研究所正高級PI。胡躍清的求學道路走得很順暢，也走得相當精彩，令人艷羨。

談到自己的研究領域，胡躍清顯得有些興奮，一串串專業(yè)術語脫口而出：“我主要是利用和發(fā)展統(tǒng)計學方法和模型研究遺傳流行病的病理機制，親源效應檢測，復雜疾病基因定位，全基因組關聯(lián)分析，基因拷貝數(shù)變異和稀有變異相關問題研究，二代測序數(shù)據分析，DNA混合物的量化研究和相關統(tǒng)計軟件編制。”

科研道路上，胡躍清一直嚴格要求自己，立志創(chuàng)新。2005年，他憑借“DNA混合遺跡的法證研究及其分析軟件，以改善罪證確認可靠性”項目獲第九屆“挑戰(zhàn)杯”二等獎，該項目利用人體DNA紋印的獨一無二性進行個體身份的鑒定，建立和發(fā)展了一套完整的統(tǒng)計模型，在多種復雜情形下得出評價DNA混合遺跡的計算公式，編制相應的電腦分析軟件，程序運行效率高，界面友好，結果可直接生成分析報告。此套量化軟件已在香港、澳門、文萊、捷克斯洛伐克、比利時等國家和地區(qū)的法證實驗室得到應用。

承擔重要項目潛心致力研究

從2004年第一次在人類基因組中發(fā)現(xiàn)大規(guī)模的拷貝數(shù)變異開始，越來越多的科學家將注意力轉移到拷貝數(shù)變異這種新的重要的遺傳變異形式。并且，他們堅信，隨著測序技術的進一步發(fā)展以及在全球范圍內收集更多的樣本，將會發(fā)現(xiàn)更多的拷貝數(shù)變異。

許多科學家推測，拷貝數(shù)變異可能會通過影響基因的表達從而影響人類的多態(tài)性和對疾病的易感性。隨著對拷貝數(shù)變異研究的不斷深入，人們發(fā)現(xiàn)越來越多的復雜疾病都可能和拷貝數(shù)變異有關聯(lián)。另外也有報道稱，拷貝數(shù)變異會涉及到一些藥物代謝基因，從而影響患者的藥物代謝能力，這可以幫助我們理解為什么同樣的藥物用在不同的人身上會有不同的效果。因此，拷貝數(shù)的變異和很多復雜疾病都有著密切的關系，而關于拷貝數(shù)變異和復雜疾病之間的關聯(lián)分析研究是拷貝數(shù)變異研究中的一個重要組成部分。

基于拷貝數(shù)變異在遺傳學研究中的重要意義，胡躍清作為主持人承擔了國家自然科學基金面上項目“基于拷貝數(shù)變異的疾病易感基因定位中的統(tǒng)計方法研究”，該研究項目屬于統(tǒng)計遺傳學的研究范疇，人類復雜易感疾病基因的定位是一個非常熱門同時有異常困難的話題。

伴隨著人類基因組計劃的不斷深入和不斷完善，研究人員可以利用分析的數(shù)據也越來越多，當然其數(shù)量是海量級的。如何去挖掘其中對我們有用的信息是目前的研究重點之一。統(tǒng)計學在其中扮演著一個非常重要的角色。統(tǒng)計遺傳學則是統(tǒng)計學和遺傳學的廣度和深度結合。從已查閱到的文獻來看，國外的研究隊伍比較強大，而國內的研究隊伍實力相對較弱，人員相對較少。應該說，我國非常需要同時具備統(tǒng)計學和遺傳學的人才，此外還當然包括計算機編程的能力。已有的基于家系數(shù)據的研究結果限于雙親家庭，單個小孩，質量性狀值，數(shù)據的缺失跟個體的基因型無關，并且大多都是SNPs數(shù)據，這在很大程度上限制了研究結果的應用范圍。而胡躍清主持的這一項目則預期在一般家系基于基因拷貝數(shù)變異的關聯(lián)分析研究、遺傳印記基因的檢測、各種性狀基因的定位、當個體的生存狀態(tài)依賴于個體本身的基因型時的疾病易感性基因的定位、以及數(shù)據缺失的依賴性研究有所突破。目前已在基于家系數(shù)據的關于疾病和基因拷貝數(shù)之間的關聯(lián)分析研究方面取得了較好的進展。

作為主持人，胡躍清還承擔了上海市浦江人才計劃項目“檢測與癌癥相關聯(lián)的遺傳及環(huán)境因素的統(tǒng)計學方法研究”，該項目的特色之處在于：用統(tǒng)計學方法研究跟癌癥相關聯(lián)的影響因素，具體來說是（1）發(fā)展交叉熵來衡量病例組和對照組中稀有變異的分布的不同，取代傳統(tǒng)的只比較分布的平均值是否相同的做法，綜合考慮SNPs之間的依賴關系和不同的影響方向，檢測對癌癥有影響的特有變異模式。（2）盡管可以利用當下熱門的高通量二代測序技術來發(fā)現(xiàn)稀有變異，但由于測序成本的居高不下，要想在短時間內讓它走向大眾還不太現(xiàn)實?？紤]到幾個常見變異就可以組成一個稀有單倍型變異，直接對GWAS時期花巨資構建的寶貴數(shù)據資源進行二次開采，發(fā)展相應的檢驗稀有單倍型的方法，極大降低研究成本。（3）目前處理高維數(shù)據的成熟方法還相當匱乏，人們還沒有合適的模型/工具來同時刻畫遺傳因素、環(huán)境因素、以及它們之間的交互作用的影響。發(fā)展logistic回歸模型，結合BayesianLASSO的思想，做高維參數(shù)的假設經驗問題。（4）為了極大的消除一些公共背景噪音對分析結果的影響，分層抽取對照組變得越來越流行。采用把分層變量看成協(xié)變量或基于分層變量的條件分布，高效檢驗出相關聯(lián)的稀有變異。同時還可以考慮對照組匹配抽樣和嵌套抽樣場合下的數(shù)據分析。

該項目亦有許多創(chuàng)新之處，諸如現(xiàn)有的大多數(shù)研究基因-環(huán)境因素相互作用的方法都是針對常見變異的，現(xiàn)有的定位稀有SNPs的關聯(lián)分析方法常常不考慮它們跟環(huán)境協(xié)變量之間的相互作用。該項目著眼于研究單倍型遺傳因素、環(huán)境因素以及它們之間的相互作用對癌癥的影響。該項目提出的方法可以充分利用豐富的GWAS資源來研究稀有變異。對稀有單倍型來說，這是一塊未曾開發(fā)的處女地，里面蘊含了極其有用的信息。與直接利用二代測序數(shù)據檢測稀有變異不同，對GWAS數(shù)據庫中的信息進行二次挖掘和利用是極具創(chuàng)新性的。同時，該項目首次考慮稀有單倍型和環(huán)境因素的互作，這在文獻中也是屬于首創(chuàng)。

此外，該項目將著重對GWAS時期構建的基因型和表性數(shù)據庫dbGaP這一寶貴資源進行二次開發(fā)，發(fā)展新穎的統(tǒng)計學方法，高效檢測出跟各種癌癥有關聯(lián)的遺傳因素（稀有SNPs和稀有單倍型）、環(huán)境因素以及它們之間的相互作用，評估稀有變異是否會增加患病的風險，以及在各種癌癥數(shù)據中的應用。從而為癌癥的基因療法提供非?？少F的統(tǒng)計學依據，為疾病的預防提供很好的理論依據。這將較客觀地評估和預測各種遺傳因素、環(huán)境因素（包括它們之間的互作）的患病風險，以及對揭示各種癌癥和其它復雜疾病的遺傳基礎做出重要貢獻。

2012年12月16日復旦大學成立了生物統(tǒng)計學和計算生物學系，我國生物統(tǒng)計學專業(yè)高等教育的歷史由此翻開了新的一頁?！斑@是我生命中的一件大事”，胡躍清動情地說。寄予這樣一個嶄新的高等教育平臺，培養(yǎng)出我國自己的生物統(tǒng)計學專業(yè)人才，吸引一批既懂統(tǒng)計學又懂生物學的年輕人加入到生物統(tǒng)計學研究隊伍，極大發(fā)展和提升我國的科學研究實力，在國際大舞臺上發(fā)表更多高水準的科學研究論文。