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        神經(jīng)網(wǎng)絡在GRAPPA算法中的應用

        2013-02-21 04:02:58汪金波彭良玉周雪山

        王 惠,汪金波 ,彭良玉,周雪山

        (1.湖南師范大學 物理與信息科學學院,湖南 長沙410081;2.華南理工大學 理學院,廣東 廣州,510640;3.深圳職業(yè)技術學院,廣東 深圳 518055)

        近20年來,核磁共振成像MRI[1](Magnetic Resonance Imaging)得到了廣泛的應用,是臨床診斷的有利工具。然而,傳統(tǒng)的核磁共振成像技術的發(fā)展一直受到磁場梯度以及射頻硬件性能的限制。并行核磁共振成像技術pMRI(parallel Magnetic Resonance Imaging)使用多個射頻接收線圈同時接收感應信號,縮短了成像時間,突破了該限制[2]。傳統(tǒng)GRAPPA(Generalized Auto-calibrating Partially Parallel Acquisitions)算法是目前應用最廣泛的并行成像方法之一,利用K空間的平移不變性,使用自校準信號擬合得到的權重,重建出未采樣的K數(shù)據(jù),得到完整的K空間數(shù)據(jù),從而重建出完整圖像[3]。然而,GRAPPA算法中用于重建的數(shù)據(jù)是包含噪聲的測量值,使得由線性關系計算得到的權重系數(shù)與真實的權重系數(shù)間存在偏差。本文將神經(jīng)網(wǎng)絡應用于GRAPPA算法中,利用自適應BP(Back Propagation)學習算法對權重系數(shù)進行訓練,再結合欠采樣數(shù)據(jù)和權重系數(shù)重建出未采樣數(shù)據(jù),減少了GRAPPA算法中的權重誤差,重建出質(zhì)量較好的圖像。

        1 傳統(tǒng)GRAPPA算法

        傳統(tǒng)GRAPPA重建算法的前提是K空間具有線性平移不變性,即K空間的任一數(shù)據(jù)點可以通過對其鄰近數(shù)據(jù)點進行線性擬合而得到。其擬合公式[4]為:

        其中,等式左邊表示要擬合到第j個線圈的自校準數(shù)據(jù),等式右邊的Sl(ky+bRΔky)表示第l個線圈的欠采樣數(shù)據(jù),n表示權重系數(shù)。j、l表示線圈個數(shù),m、b表示擬合塊分別在頻率、相位編碼方向的取值,Nb表示擬合塊個數(shù),R表示降采樣倍數(shù),Δky表示相位編碼步長。計算出權重系數(shù)后,將式(1)左邊取為待重建數(shù)據(jù),則可重建出未采樣數(shù)據(jù)。

        若用b表示K空間中心的全采樣數(shù)據(jù),A表示欠采樣的數(shù)據(jù),x表示權重系數(shù),則擬合權重系數(shù)的過程可以用矩陣形式表示為:

        實際用于估算權重的數(shù)據(jù)值并非信號的真實值,而是包含噪聲的測量值。用A、b表示自校準數(shù)據(jù)中包含噪聲的測量值,表示無噪聲的真實值,則:

        其中,δA和 δb表示自校準數(shù)據(jù)的測量噪聲,f表示、之間的線性關系。在實際估算權重系數(shù)時,使用的是測量值,即:

        由此可見,權重系數(shù)存在一個偏差 δx, δx=x-,其大小依賴于測量值A和b中包含的噪聲。圖1描繪了GRAPPA權重系數(shù)偏差δx與噪聲的函數(shù)關系[5]。

        從圖1可以看出,GRAPPA權重系數(shù)的偏差與噪聲變化之間的關系是非線性的。但是在傳統(tǒng)GRAPPA中,使用線性關系來計算權重,因此需要引入新的方法擬合GRAPPA算法中權重系數(shù),以期提高精確度。

        2 神經(jīng)網(wǎng)絡在GRAPPA中的應用

        所謂的自適應BP算法是指正向傳播中,網(wǎng)絡的權值固定不變,每一層神經(jīng)元的狀態(tài)僅影響下一層神經(jīng)元的狀態(tài),最后產(chǎn)生的輸出作為網(wǎng)絡的實際響應,而誤差信號則由輸出端開始逐層向前傳播,突觸權值全部根據(jù)自適應的誤差修正規(guī)則[6]來調(diào)整。誤差信號反向傳播經(jīng)過網(wǎng)絡,隨著誤差逆?zhèn)鞑バ拚粩噙M行,網(wǎng)絡對輸出模式的正確率也逐步上升[7]。

        在這種新方法中,假設激勵函數(shù)為Ψ,則將式(2)改寫為:

        其中,Ψ是由神經(jīng)網(wǎng)絡決定的任意函數(shù)。利用神經(jīng)網(wǎng)絡重建的流程圖如圖2所示。

        圖2 利用神經(jīng)網(wǎng)絡重建流程圖

        從圖2可以看出,圖像重建主要分為訓練階段和重建階段。在訓練階段,使用自校準數(shù)據(jù)對神經(jīng)網(wǎng)絡進行訓練,在神經(jīng)網(wǎng)絡滿足一定的條件之后停止訓練。在重建階段,結合訓練階段訓練好的神經(jīng)網(wǎng)絡和欠采樣K空間數(shù)據(jù)重建出未采樣數(shù)據(jù),得到完整的K空間數(shù)據(jù)。對所有通道的K空間數(shù)據(jù)做傅里葉逆變換,并利用平方和SOS(Sum of Squares)算法得到最終圖像[8]。神經(jīng)網(wǎng)絡訓練、重建過程如圖3所示。

        (1)訓練階段

        在訓練階段,使用的數(shù)據(jù)是已知的自校準數(shù)據(jù),即K空間中心的全采樣數(shù)據(jù)。神經(jīng)網(wǎng)絡的輸入為被擬合數(shù)據(jù)點周圍鄰近的數(shù)據(jù)點,期望輸出為被擬合數(shù)據(jù)點。同GRAPPA算法的擬合過程一樣,利用神經(jīng)網(wǎng)絡進行擬合,得到期望輸出,即較精確的權重系數(shù)。

        (2)重建階段

        在重建階段,將欠采樣的K空間數(shù)據(jù)作為輸入,使用的神經(jīng)網(wǎng)絡為在訓練階段訓練好的神經(jīng)網(wǎng)絡,輸出即為重建出來的未采樣數(shù)據(jù)。使用重建出的數(shù)據(jù)依次對未采樣數(shù)據(jù)的相應行進行填充,直到將所有線圈的未采樣點填充完為止,則得到完整的K空間數(shù)據(jù)。

        3 重建結果與分析

        使用偽影強度AP(Artifact Power)值來定量評價重建圖像的性能,AP值越小,重建圖像與參考圖像越接近,重建精度越高。AP的計算公式為:

        其中,Irecon表示重建圖像,Iref表示參考圖像,在實驗中將全采樣的圖像作為參考圖像。

        本文所用數(shù)據(jù)為8通道的頭線圈在3T的GE系統(tǒng)上通過T1加權的自旋回波序列采集得到的人體二維腦部數(shù)據(jù)。采集參數(shù)設置為TR=700 ms,TE=11 ms,矩陣大小為 256×256,F(xiàn)OV為 22 cm×22 cm,層數(shù)=10。 本文采用Sigmoid函數(shù)激勵的單隱含層前向神經(jīng)網(wǎng)絡。隱含層神經(jīng)元個數(shù)為 12,迭代次數(shù)為 2 000,允許誤差為 0.000 01。擬合塊大小為5×4,自校準行數(shù)N=32。重建結果如圖4所示。可以看出,R=2時,圖像重建質(zhì)量很好;R=3時,有較明顯的偽影;R=4時,偽影嚴重。當by=4,bx=5,ACS=32時,不同加速因子下GRAPPA重建和神經(jīng)網(wǎng)絡重建的AP值對比如表1所示。

        表1 不同加速因子下GRAPPA重建和神經(jīng)網(wǎng)絡重建的AP值(10-4)

        從表1可以看出,當R=2時,神經(jīng)網(wǎng)絡算法圖像重建質(zhì)量較好,AP值也較理想。但隨著R增大及訓練樣本數(shù)量的減少,使訓練后得到的權重系數(shù)精度下降,導致重建圖像的偽影加重。另外,參與訓練的訓練樣本是K空間中心數(shù)據(jù),信號強度較大,而邊緣的較弱數(shù)據(jù)沒有參與訓練,導致重建出的位于邊緣的未采樣數(shù)據(jù)不精確,從而導致偽影。

        由于受到噪聲、截斷誤差等的影響,GRAPPA擬合、重建過程并非是嚴格的線性關系,而是非線性關系。因而,將神經(jīng)網(wǎng)絡引入到GRAPPA算法中,對GRAPPA權重系數(shù)進行訓練,得到較準確的權重系數(shù),再利用采樣數(shù)據(jù)進行重建,從而得到完整的K空間數(shù)據(jù),重建出圖像。實驗結果表明,R=2時能夠重建出質(zhì)量很好的圖像,基本無偽影,而圖像偽影隨著R的增大趨向于嚴重。這是因為隨著R的增大,訓練樣本數(shù)量減少,并且邊緣信號較弱的數(shù)據(jù)并沒有參與訓練,使得重建結果不太精確。今后將在這一方面做更深入的研究。

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