在臺灣眾多情報機構中，“軍事情報局”是派遣間諜的主力?！败娗榫帧鼻吧硎谴竺ΧΦ能娊y(tǒng)。幾十年來，大陸的臺諜事件，幾乎都與“軍事情報局”有關。

上世紀50－70年代，臺灣情報機關對大陸的工作重點是“政治顛覆，內(nèi)部策反，敵后游擊”，暗殺、爆炸等暴力手段成為其最主要的活動方式，如毛人鳳指揮的“克什米爾公主號”客機爆炸事件等。

從上世紀50年代中期開始，“軍情局”還通過空投或迂回方式派遣間諜潛入大陸，指揮潛伏特務和策動殘余反革命分子進行暴亂等破壞活動。另一方面，臺灣當局槍殺了“大量共諜”，如“吳石案”等。

臺灣間諜的暴力突擊行動收效甚微，至上世紀70年代末戛然而止。從上世紀80年代開始，海峽兩岸交往日益增多，臺灣“軍情局”的工作重心也由暗殺等轉為“心戰(zhàn)、策反、煽動”。外圍諜報人員被吸收進“軍情局”并源源不斷地派赴大陸。實際上，一些人是被迫成為臺灣間諜的。據(jù)臺灣雜志爆料，臺灣著名歌星鄧麗君因需要去新加坡演出，向臺灣有關部門提出出境申請，但臺當局以批準出境演出為交換條件，要求她進行情報工作。香港商人姜建國于1985年5月從大陸購買一批蠶絲運到臺灣后，被臺灣當局扣押，對方以此要挾他為“軍情局”服務。僅過了一年，他便被我有關部門抓獲。

1995 年至 1996 年，“臺海危機”爆發(fā)，大陸對臺軍演。李登輝揚言：“大陸所發(fā)的導彈不是實彈，而是空包彈?！边@引起了我安全部門的高度警惕，由此揪出了潛伏多年的解放軍大校邵正宗和少將劉連昆。

類似的事件在2003年再度上演。陳水扁為求勝選連任，點出了大陸在沿海部署的導彈數(shù)目和分布情況。我安全部門很快鎖定了一批行動詭秘、出入異常的“臺商”，將“軍情局”上校李運溥建立的間諜網(wǎng)連根拔掉，另一名解放軍少將劉廣智也因涉案被捕。

據(jù)《環(huán)球時報》報道，自1949年國民黨政府敗守臺灣至今，總計有3000多名臺灣特務“以身殉職”。但一位臺灣情報部門前高官透露，半個多世紀以來，因失手被捕、死亡、失蹤的臺灣諜報人員，多達1.9萬余人。在兩岸關系緩和改善的當代，諜戰(zhàn)手段不再囿于傳統(tǒng)方式。“網(wǎng)軍”尤其是“黑客”成為臺灣情報部門的另一股力量。

2008年上半年，國家互聯(lián)網(wǎng)應急中心監(jiān)測發(fā)現(xiàn)，大陸地區(qū)外的木馬控制端IP有98230個，其中來自中國臺灣的占到65%。臺灣諜報機關還制訂了一系列網(wǎng)絡專項計劃，在全球設立了數(shù)十個網(wǎng)絡情報工作據(jù)點，以大陸周邊國家為主陣地，采用狼群戰(zhàn)術進行網(wǎng)上竊密和情報滲透。此外，臺灣間諜還潛伏在大陸的一些軍事網(wǎng)站和軍事論壇上，尋找可能提供情報的人員。

近幾年，兩岸交流持續(xù)增溫。臺灣對大陸的網(wǎng)絡入侵，比之前有所降低。2010年，國家互聯(lián)網(wǎng)應急中心監(jiān)測發(fā)現(xiàn)的境外木馬控制端IP，臺灣占到4.8%。