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        茄子耐鹽種質(zhì)親緣關(guān)系的RAPD分析

        2012-08-10 02:22:20吳雪霞查丁石朱宗文李賢
        中國蔬菜 2012年4期

        吳雪霞查丁石朱宗文李賢

        (上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所,上海市設(shè)施園藝技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 201403)

        隨著設(shè)施栽培的快速發(fā)展,設(shè)施內(nèi)土壤次生鹽漬化日趨嚴(yán)重,導(dǎo)致蔬菜作物的生長發(fā)育受到抑制,產(chǎn)量和品質(zhì)降低,嚴(yán)重影響了蔬菜生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展和蔬菜生產(chǎn)者的經(jīng)濟(jì)效益(郭文忠 等,2004;黃毅和張玉龍,2004)。因此,如何克服設(shè)施內(nèi)土壤鹽害,實(shí)現(xiàn)設(shè)施蔬菜生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展,是目前生產(chǎn)上面臨的一個(gè)迫切問題。茄子(SolanuMmelongenaL.)在世界上大多數(shù)地區(qū)皆有栽培,尤以亞洲、非洲、地中海沿岸、歐洲中南部、中美洲種植廣泛,其中亞洲茄子產(chǎn)量占世界總產(chǎn)量的86%。目前茄子已成為我國設(shè)施栽培的主要蔬菜之一,土壤次生鹽漬化也嚴(yán)重影響了茄子的產(chǎn)量與品質(zhì)。

        對(duì)于鹽漬化土壤的利用主要采取兩種措施,一是用化學(xué)或物理方法改造土壤;二是通過生物技術(shù)培育耐鹽作物品種。前者不僅耗資巨大,且隨著大量化學(xué)物質(zhì)的加入加重了土壤的次生鹽漬化。有效利用分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),對(duì)于加快培育優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)耐鹽茄子新品種具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。因此,上海市設(shè)施園藝技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室通過對(duì)上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所茄子課題組現(xiàn)有茄子資源進(jìn)行耐鹽鑒定,在篩選出芽期和幼苗期均耐鹽的 14份茄子種質(zhì)資源的基礎(chǔ)上,對(duì)14份耐鹽茄子材料進(jìn)行遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析,為茄子耐鹽品種選育提供理論指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        本試驗(yàn)共選用14份耐鹽茄子材料(表1),均經(jīng)過2009~2010年2 a耐鹽性鑒定。

        表1 供試茄子材料名稱及特征特性

        1.2 試劑

        試驗(yàn)所用的提取DNA、PCR試劑和瓊脂糖均購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司。

        1.3 模板DNA提取

        分別取不同材料的幼葉,用CTAB法提取茄子基因組DNA,具體參照張永平等(2007)的方法。采用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的純度,-20 ℃冰箱內(nèi)保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 RAPD反應(yīng)體系

        RAPD擴(kuò)增反應(yīng)采用20 μL的反應(yīng)體系,其中包含25 mmol·L-1MgCl22.0 μL,10×PCR Buffer 2.0 μL,10 mmol·L-1dNTP 0.5 μL,5 U·μL-1TaqE 0.2 μL,10 ng·L-1模板 DNA 3.0 μL,0.1 μmol·L-1Primer 3.0 μL,滅菌雙蒸水9.3 μL,加蓋1滴礦物油進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性 5 min;94 ℃變性 1 min,35 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1.5 min,5 個(gè)循環(huán);94 ℃變性 1 min,50 ℃退火1 min,72 ℃延伸1.5 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min后4 ℃保存(馬金駿,2008)。

        1.5 電泳檢測

        PCR擴(kuò)增產(chǎn)物在1.2%瓊脂糖凝膠(含EB)電泳分離,電壓120 V,時(shí)間約1.5 h,Gel DocTMEQ 170-8060凝膠成像儀進(jìn)行觀察并拍照分析。

        1.6 數(shù)據(jù)分析

        選擇清晰的譜帶進(jìn)行統(tǒng)計(jì),擴(kuò)增產(chǎn)物在相同遷移位置有條帶賦值為1,無條帶賦值為0,建立原始數(shù)據(jù)矩陣。應(yīng)用NTSYS-pc(version 2.1)軟件處理并采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析(李懷志 等,2011),得到遺傳相似系數(shù),并根據(jù)遺傳相似系數(shù)建立聚類分析圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 RAPD標(biāo)記的多態(tài)性分析

        采用100個(gè)RAPD隨機(jī)引物對(duì)14份耐鹽茄子材料的DNA進(jìn)行擴(kuò)增,篩選出具有多態(tài)性且擴(kuò)增條帶清晰的隨機(jī)引物10個(gè)。對(duì)這10個(gè)隨機(jī)引物的擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì),共擴(kuò)增出 102條帶,其中多態(tài)性條帶 79條,多態(tài)性程度為77.45%。引物S28和S124的多態(tài)性位點(diǎn)比例較高,分別為84.62%和83.33%(表2、圖1)。

        2.2 遺傳相似系數(shù)分析

        利用遺傳統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對(duì) RAPD擴(kuò)增所得多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行分析,得出14份耐鹽茄子材料的遺傳相似系數(shù)在 0.316~0.975之間(表3),其中 E13與其他材料的的遺傳相似系數(shù)在0.316~0.405之間,E6與其他材料的遺傳相似系數(shù)在0.405~0.506之間,說明E13和E6與其他材料親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。E1和E3、E12和E14的遺傳相似系數(shù)最大,均為0.975,即兩者之間的親緣關(guān)系最近。

        表2 RAPD引物擴(kuò)增結(jié)果及多態(tài)性比例

        圖1 引物S28和引物S124的RAPD擴(kuò)增結(jié)果

        表3 14份耐鹽茄子材料的遺傳相似系數(shù)

        2.3 聚類分析

        采用UPGMA法構(gòu)建14份耐鹽茄子材料的遺傳關(guān)系聚類圖(圖2),在遺傳相似系數(shù)為0.47時(shí),可將14份耐鹽茄子材料分為3類:第1類群只含有1份種質(zhì)E13(CGN17497),來源于云南的茄屬野生近緣種SolanuMnigrumLinn,不能和栽培種進(jìn)行雜交,更多的是具有雜草的性狀,沒有太多的利用價(jià)值;第2類群也只含有1份種質(zhì)E6(Gilo),具有半栽培種的性狀,在栽培上用作砧木或作為觀賞茄,植株生長適應(yīng)力強(qiáng),抗病蟲,抗倒伏,果實(shí)中小扁圓形,果皮淺綠色,味道甘苦,和廣泛栽培的茄子雜交能獲得可育后代,是育種和遺傳研究中可以直接利用的材料;第3類群均為栽培種,包括12份材料(占總材料的85.71%),來源不同、形態(tài)各異。對(duì)類群3在遺傳相似系數(shù)0.805處切割,可分為2個(gè)亞類,第1亞類包含9份種質(zhì),除E5果實(shí)卵形、果皮為白紫色外,其余為長棒形或長卵形,果皮為黑紫色或綠色;第2亞類包括3份種質(zhì),E8、E9和E10,果實(shí)為長卵形或羊角形,果皮為白綠色或紅紫色。同時(shí),第3類群同一亞類所包含種質(zhì)均來自不同地方,因此推斷茄子所屬類群與地理來源無關(guān)。

        圖2 14份耐鹽茄子材料聚類分析圖

        3 結(jié)論與討論

        從本試驗(yàn)聚類分析結(jié)果來看,茄子遺傳親緣關(guān)系遠(yuǎn)近與地理位置并無必然聯(lián)系,這與李懷志等(2011)的研究結(jié)果相同,這可能是由于茄子種植商業(yè)化,地區(qū)之間相互引種導(dǎo)致交流頻繁,使種質(zhì)間地域差異性降低。同時(shí)本試驗(yàn)中聚類分析首先將所有材料分為野生近緣種、半栽培種和栽培種3類,說明茄子材料間存在一定程度的遺傳分化,分子標(biāo)記對(duì)遺傳變異比較敏感,對(duì)遺傳多樣性分析非常有效。

        優(yōu)異豐富的種質(zhì)資源是育種工作的基礎(chǔ),而種質(zhì)基礎(chǔ)的寬窄和遺傳多樣性的豐缺、親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近則是育種成敗的關(guān)鍵。從本試驗(yàn)結(jié)果來看,耐鹽栽培茄子材料間遺傳相似系數(shù)非常大,遺傳背景比較狹窄,對(duì)茄子耐鹽品種的選育非常不利,因此應(yīng)加強(qiáng)種質(zhì)的收集和創(chuàng)新工作,拓寬我國茄子耐鹽種質(zhì)的遺傳基礎(chǔ)。在茄子耐鹽育種中應(yīng)盡量選擇遺傳相似性系數(shù)較小,耐鹽性差異大的材料配制雜交組合。

        郭文忠,劉聲鋒,李丁仁,趙順山.2004.設(shè)施蔬菜土壤次生鹽漬化發(fā)生機(jī)理的研究現(xiàn)狀與展望.土壤,36(1):25-29.

        黃毅,張玉龍.2004.保護(hù)地生產(chǎn)條件下的土壤退化問題及其防治對(duì)策.土壤通報(bào),35(2):212-216.

        李懷志,張峻,李翔,陳火英.2011.應(yīng)用SRAP標(biāo)記對(duì)茄子品種進(jìn)行遺傳多樣性分析與指紋圖譜構(gòu)建.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),34(4):18-22.

        馬金駿.2008.不結(jié)球白菜種質(zhì)資源遺傳多樣性的初步研究〔碩士論文〕.揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué).

        張永平,朱為民,崔輝梅.2007.上海地區(qū)番茄煙粉虱傳雙生病毒PCR檢測.上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),23(4):100-101.

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