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        河南周口番茄黃化曲葉病病原分子鑒定

        2012-06-06 05:52:20胡京昂劉雪霞蔡雨惠曹剛強(qiáng)應(yīng)芳卿
        長(zhǎng)江蔬菜 2012年20期
        關(guān)鍵詞:雙生曲葉黃化

        胡京昂 ,劉雪霞 ,蔡雨惠 ,曹剛強(qiáng) ,應(yīng)芳卿

        番茄黃化曲葉病 (Tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)是威脅番茄生產(chǎn)的一種嚴(yán)重病害,發(fā)病的植株葉片邊緣呈鮮黃色、卷曲,葉脈褪綠,葉肉變厚,葉片變小,嚴(yán)重時(shí)植株矮化萎縮,一旦發(fā)生,番茄產(chǎn)量會(huì)受到很大的損失,嚴(yán)重時(shí)造成絕產(chǎn)。近幾年該病在中國(guó)自南向北迅速傳播蔓延,廣東、江蘇、安徽、山東、河北、河南、浙江、上海、北京、臺(tái)灣等地均已有報(bào)道[1~9]。在國(guó)內(nèi)大部分省市該病是由雙生病毒科 (Geminiviridae)菜豆金色花葉病毒屬(Begamovirus) 番茄黃化曲葉病毒 (Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)侵染引起。

        TYLCV寄主主要是番茄、曼陀羅、辣椒、菜豆和煙草等,傳毒介體為煙粉虱,同時(shí)可經(jīng)嫁接傳播,但不能經(jīng)機(jī)械摩擦和種子傳毒[10]。番茄黃化曲葉病毒病已經(jīng)成為為害世界許多地區(qū)番茄生產(chǎn)的毀滅性病害,已給熱帶和亞熱帶地區(qū)很多國(guó)家的番茄生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失。

        2007年在黃河以南的扶溝縣夏秋茬番茄和開封縣、中牟縣越冬溫室番茄地里均發(fā)現(xiàn)典型黃化曲葉癥狀,且煙粉虱發(fā)生嚴(yán)重;2008年在黃河以北的內(nèi)黃縣也發(fā)生類似的癥狀;自2009年以來(lái),除新野縣以外,河南各番茄產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生,主產(chǎn)區(qū)發(fā)生尤為嚴(yán)重。為了明確引起河南省番茄黃化癥狀的病毒種類及其起源變異,2011年秋季我們?cè)诓^(qū)采集病樣,并對(duì)其部分基因組進(jìn)行了克隆和分析,結(jié)果表明,引起河南省番茄黃化曲葉癥狀的病原為番茄黃化曲葉病毒,這是該病毒病在河南地區(qū)發(fā)生的首次分子檢測(cè)報(bào)道。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        病樣采集:2011年秋季在周口地區(qū)采集具有黃化曲葉病毒病典型癥狀,植株矮化、葉片卷曲、葉色褪綠、葉片增厚、具黃化癥狀的番茄葉片,-80℃保存?zhèn)溆?,編?hào)為HN-ZK。

        菌株與載體:大腸桿菌DH5a、pMD18-T載體均購(gòu)自寶生物(大連)有限公司。

        1.2 葉片總DNA提取

        利用CTAB法提取番茄葉片總DNA,取0.1 g番茄葉片樣品,液氮中充分研磨,轉(zhuǎn)入1.5 mL離心管,加入600μL 65℃ 預(yù)熱的3%CTAB抽提緩沖液 (3%CTAB,200 mmol/L Tris-HCl,140 mmol/L NaCl,40 mmol/L EDTA,0.2%巰基乙醇), 混勻后于65℃ 溫育 30 min,再用 600 μL 氯仿/異戊醇(24∶1)抽提兩次后,上清液中加入等體積的異丙醇,經(jīng)異丙醇沉淀后,取沉淀經(jīng)70%乙醇洗滌,干燥后溶于TE中,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 PCR擴(kuò)增、克隆和序列分析

        根據(jù)雙生病毒共同區(qū)及外殼蛋白基因保守序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物 PA/PB[11]。 PA:5′-TAATATTACCKGWKGVCCSC-3′,PB:5′-TGGACYTTRCAWGGBCCTTCACA-3′(K=G 或 T;W=A 或 T;V=A,C 或G;S=C 或 G;Y=C 或 T;R=A 或 G;B=C,T 或 G),擴(kuò)增雙生病毒基因間隔區(qū)和部分外殼蛋白基因約500 bp的特異片段,并進(jìn)行克隆和序列測(cè)定,上述引物由北京賽百盛生物技術(shù)有限公司合成。

        PCR反應(yīng)體系:10×PCR反應(yīng)緩沖液 2.5μL,dNTPs 1.0 μL (2.5 mmol/L),PA/PB 引物各 1.0 μL(100 ng/μL),Taq 酶 0.2 μL (5 U/μL), 模板 DNA 1.0μL,加ddH2O至總體積25μL。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,按下列條件進(jìn)行 30個(gè)循環(huán)(94℃變性 45 s,50℃復(fù)性 45 s,72℃延伸 1 min),72℃延伸10 min。取5μL PCR產(chǎn)物,加入loading buffer和Gene Finder后,用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,在可見(jiàn)光透視儀上顯示電泳結(jié)果。經(jīng)杭州博日科技有限公司的膠回收試劑盒純化約500 bp PCR產(chǎn)物,把純化后的PCR產(chǎn)物克隆到pMD18-T載體(TaKaRa),陽(yáng)性克隆經(jīng)驗(yàn)證后送北京三博遠(yuǎn)志生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

        1.4 序列分析

        獲得的DNA序列用DNAMAN Version 4.0進(jìn)行處理和分析,根據(jù)相似性明確病毒種類,進(jìn)化樹構(gòu)建采用Mega 4.0的臨近相鄰法 (Neighbor-joining)。序列比對(duì)和進(jìn)化分析中所用病毒(分離物)有:番茄黃化曲葉病毒廊坊分離物 (TYLCV-Langfang;JF833036),番茄黃化曲葉病毒浙江分離物 (TYLCV-ZJHZ12;FN256256),中國(guó)番茄黃化曲葉病毒四川分離物(TYLCV-SC65A-3;GU199588),中國(guó)番茄黃化曲葉病毒廣西分離物 (TYLCV-CHI;AF311734),廣東番茄黃化曲葉病毒廣東分離物(TYLCGDV-G3;AY602166),番茄黃化曲葉病毒安徽分離物(TYLCV-AH-HB1;FN650807),番茄黃化曲葉病毒江蘇分離物 (TYLCV-JSNJ1;FN256259),番茄黃化曲葉病毒北京分離物 (TYLCV-Beijing3;GU983859),番茄黃化曲葉病毒上海分離物(TYLCV-sh10;EU031444)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PCR檢測(cè)結(jié)果

        以提取的番茄葉片DNA為模板,用通用引物PA/PB進(jìn)行PCR檢測(cè),從HN-ZK樣品中擴(kuò)增出約500 bp的特異性條帶(圖1),結(jié)果表明,河南周口種植的番茄被煙粉虱傳播的雙生病毒侵染。

        2.2 序列分析

        圖1 PCR檢測(cè)結(jié)果M:DL1000 DNA Marker;1:HN-ZK 樣品

        圖2 雙生病毒基因組DNA-A部分片段核苷酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

        將PCR得到的500 bp左右的條帶回收并克隆測(cè)序,序列全長(zhǎng)為539 bp,序列的GenBank登錄號(hào)為JQ754307。獲得的DNA序列用DNAMAN Version 4.0進(jìn)行處理和分析,該序列與番茄黃化曲葉病毒分離物AH-HB1的序列相似性高達(dá)98.7%,與其他番茄黃化曲葉病毒分離物序列相似性均在97%以上,而與中國(guó)番茄黃化曲葉病毒和廣東番茄黃化曲葉病毒分離物序列相似性均在75%以下,這表明樣品HN-ZK已被番茄黃化曲葉病毒感染而導(dǎo)致番茄黃化曲葉病的發(fā)生。將樣品雙生病毒基因組DNA-A部分片段與其他9個(gè)具有代表性的雙生病毒分離物核苷酸序列構(gòu)建系統(tǒng)關(guān)系樹(圖2),結(jié)果顯示,廣東番茄黃化曲葉病毒、中國(guó)番茄黃化曲葉病毒和番茄黃化曲葉病毒分別在3個(gè)不同的分支,其中河南分離物與來(lái)源于安徽、上海、浙江、江蘇、河北廊坊和北京的番茄黃化曲葉病毒分離物單獨(dú)聚為一個(gè)小分支,河南分離物與安徽分離物親緣關(guān)系相對(duì)較近。

        3 結(jié)論與討論

        近幾年,番茄黃化曲葉病在河南省各地相繼暴發(fā),特別是秋延后番茄,給我省的番茄生產(chǎn)造成了巨大的損害。本研究利用分子生物學(xué)技術(shù),檢測(cè)了河南周口番茄黃化曲葉病的病原,通過(guò)PCR、克隆測(cè)序發(fā)現(xiàn),侵染周口番茄的雙生病毒為番茄黃化曲葉病毒。鑒于該病在我國(guó)的傳播基本呈現(xiàn)自南向北、自東向西的蔓延趨勢(shì),以及序列對(duì)比表明,河南分離物與安徽分離物序列相似性最高達(dá)到98.7%,從構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹也可以看出,河南分離物與安徽分離物的親緣關(guān)系最近,推測(cè)河南番茄黃化曲葉病毒可能來(lái)源于安徽。

        雙生病毒種類繁多,在上海、浙江、江蘇、安徽和北京等省市多為番茄黃化曲葉病毒侵染引起,河南的番茄黃化曲葉病已經(jīng)初步鑒定為番茄黃化曲葉病毒侵染,但本研究?jī)H克隆測(cè)序了一個(gè)地區(qū)的病害樣本,下一步將在河南各地采集病害樣本,進(jìn)行全面的檢測(cè)和鑒定,徹底明確河南省內(nèi)為害番茄的雙生病毒種類和分布。

        [1]何自福,虞皓.警惕廣東番茄煙粉虱傳雙生病毒病的發(fā)生[J].廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2003(4):41-43.

        [2]季英華,熊如意,程兆榜,等.江蘇省番茄黃化曲葉病的病原分子診斷[J].園藝學(xué)報(bào),2008,35(12):1 815-1 818.

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        [9]周濤,師迎春,陳笑瑜,等.北京地區(qū)番茄黃化曲葉病毒的鑒定及防治對(duì)策[J].植物保護(hù),2010,36(2):116-118.

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