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        利用3對(duì)SSR標(biāo)記鑒定兩優(yōu)287種子純度及對(duì)雜株類型的定量分析

        2012-05-28 09:24:32郭承亮耿月明
        種子科技 2012年8期
        關(guān)鍵詞:大田純度雜交

        郭承亮,耿月明

        (湖北省種子集團(tuán)有限公司,湖北 武漢 430070)

        種子純度是種子質(zhì)量的一個(gè)核心指標(biāo),是企業(yè)購(gòu)銷種子的關(guān)鍵依據(jù),也是企業(yè)生存之根本。種子純度檢測(cè)主要有海南大田種植鑒定(以下簡(jiǎn)稱“南鑒”)、大田正季種植鑒定(以下簡(jiǎn)稱“正鑒”)以及SSR分子標(biāo)記鑒定等方法。三種方法各有特點(diǎn):“南鑒”和“正鑒”是以田間種植方式,從植株的典型特異性判別、鑒定種子純度。“南鑒”具有鑒定相對(duì)準(zhǔn)確、時(shí)間上相對(duì)提前的優(yōu)點(diǎn),但海南冬季屬短日低溫條件,感光類型及兩系不育系表現(xiàn)正常結(jié)實(shí),兩系雜交水稻種子純度鑒定結(jié)果往往失真;“正鑒”具有鑒定準(zhǔn)確、鑒定結(jié)果與大田生產(chǎn)吻合度高的優(yōu)點(diǎn),但時(shí)間明顯滯后,從歷年發(fā)生的重大種子質(zhì)量事件來看,絕大多數(shù)是在得知種子純度不合格之前種子已經(jīng)銷售到千家萬戶無法“召回”,最終釀成無法挽回的損失。SSR分子標(biāo)記是檢測(cè)DNA水平上的生物個(gè)體差異,由于具有數(shù)量豐富、多態(tài)性高、遺傳共顯性、譜帶擴(kuò)增穩(wěn)定、精度高、檢測(cè)時(shí)間短、不受環(huán)境條件影響、實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單等特點(diǎn)廣受重視;可以將呈父母本互補(bǔ)帶型的雜交種與其雙親、甚至一些異源花粉造成的雜交種區(qū)分開,因此成為品種鑒定的理想分子標(biāo)記,在雜交水稻種子純度鑒定研究中得到了越來越廣泛的應(yīng)用[1~4]。在目前的實(shí)驗(yàn)操作中,由于受單個(gè)標(biāo)記檢測(cè)的局限性,不能將一些雜株以及一些異源花粉造成的雜交種區(qū)分開。本研究首先利用24對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)兩優(yōu)287及其大田正季鑒定中的9種雜株類型進(jìn)行特異性分析,最終篩選出可將雜株類型相對(duì)區(qū)分開的3對(duì)SSR標(biāo)記,并利用其對(duì)正季鑒定中的同一份樣本進(jìn)行分析,鑒定出的種子純度及所含雜株類型比例與大田正季鑒定中的結(jié)果基本吻合。本研究通過多對(duì)標(biāo)記對(duì)雜交水稻種子同一份樣本進(jìn)行純度鑒定以及雜株類型定量分析,系統(tǒng)比較了兩種方法的鑒定結(jié)果,并分析了檢測(cè)結(jié)果的差異性原因,為公司兩優(yōu)287種子的銷售提供了質(zhì)量保證。

        1 材料和方法

        1.1 水稻材料

        本研究包含2個(gè)試驗(yàn):試驗(yàn)一中的雜株類型來自正季鑒定中收集的9種雜株類型,試驗(yàn)二所用樣品為正季鑒定材料中的同一份樣本。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 試驗(yàn)一:在湖北省種子集團(tuán)有限公司鄂州基地正季種植并按照當(dāng)?shù)卦耘喙芾矸椒ㄔ耘鄡蓛?yōu)287樣品,調(diào)查雜交稻表型性狀,并統(tǒng)計(jì)雜株類型和田間調(diào)查鑒定結(jié)果。取正季鑒定中9種雜株類型與雜交種F1,取其葉片參照CTAB法[5]提取DNA,按照PCR擴(kuò)增10μL體系:1 μL DNA 模板, 1 μL 10×PCR buffer,0.8 μL 25 mmol的 MgCl2,0.2 μL 的 10 mmol dNTP,0.1 μL 的10 μmol正 向 引物 (primer F),0.1 μL 的 反 向引物(primer R),0.2 μL rTaq 酶 (Takara,5 U/μL),6.6 μL滅菌ddH2O。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5 min,32~35個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,然后72℃延伸7 min。PCR電泳檢測(cè):采用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳。

        1.2.2 試驗(yàn)二:取正季鑒定中同一份樣本的1920粒水稻種子,采用簡(jiǎn)易法提取DNA[6~9]:剪取0.5 cm長(zhǎng)的水稻幼苗(幼葉或幼莖),放入96PCR板的孔中,每孔加入 40μL 0.25 mol/L的 NaOH,在沸水中煮 30 s,然后加入 40μL 0.25 mol/L的 HCl和 20μL 0.5 mol/L的Tris(pH 8.0,含有體積分?jǐn)?shù)為0.25%的IGEPALCA630)的混合液,在沸水中煮沸 2 min,用1μL進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其余4℃保存。然后按照試驗(yàn)一中的方法進(jìn)行。

        2 結(jié)果和分析

        2.1 試驗(yàn)一鑒定結(jié)果

        通過田間調(diào)查鑒定了兩優(yōu)287雜交稻材料的純度,選取其中的9種雜株類型,包括不育系9802 s、父本、紫稈紅稃尖、變異株1(比兩優(yōu)287矮)、變異株2(比兩優(yōu)287高)、紫稈遲熟株、遲熟株1(遲熟25天以上)、遲熟株2(遲熟15天左右)、青稞,歸類并統(tǒng)計(jì)雜株總數(shù)及所占比例,結(jié)果見表1。

        2.2 試驗(yàn)二純度鑒定及對(duì)雜株類型分析結(jié)果

        利用24對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)兩優(yōu)287大田正季鑒定中的這9種雜株類型進(jìn)行差異化分析,最終篩選出3對(duì)SSR標(biāo)記RM19、RM71、RM224可以將這9種雜株類型相對(duì)區(qū)分開:通過RM71可以鑒別4和5(變異株1和變異株2)以及7(紫稈遲熟株);通過RM19可以鑒別1(不育系);通過RM71與RM19同時(shí)可以將3和6歸在一起鑒別出來;通過RM71、RM19、RM224可以將2、8、9分別鑒定出來,結(jié)果見表 1。

        表1 兩系雜交水稻種子純度大田正季鑒定和三對(duì)SSR標(biāo)記鑒定結(jié)果

        2.3 試驗(yàn)一與試驗(yàn)二純度鑒定及雜株類型分布結(jié)果比較

        通過3對(duì)SSR標(biāo)記和田間調(diào)查,鑒定了兩優(yōu)287雜交稻材料的純度并對(duì)雜株類型進(jìn)行定量分析 (見表1),結(jié)果表明,經(jīng)過多對(duì)SSR標(biāo)記檢測(cè)的純度為96.61%,而田間調(diào)查鑒定結(jié)果為97.10%,分子標(biāo)記檢測(cè)和田間調(diào)查鑒定結(jié)果基本吻合,各種雜株類型的分布基本一致,但是通過分子標(biāo)記檢測(cè)到0.31%的其它基因型的雜株。

        3 討論與結(jié)論

        本研究結(jié)合大田正季種植鑒定,利用多對(duì)SSR標(biāo)記系統(tǒng)分析了兩優(yōu)287純度、各雜株類型相互間的區(qū)別并對(duì)樣本進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì)。按照需求,選取了其中的3對(duì)SSR標(biāo)記,可以將9種雜株類型全部鑒定出來并相對(duì)應(yīng)歸類。研究還發(fā)現(xiàn),利用多對(duì)SSR標(biāo)記鑒定的結(jié)果與大田正季鑒定的結(jié)果基本一致,各種雜株類型所占的比例也基本一致。但是通過3對(duì)SSR標(biāo)記鑒定分析,還發(fā)現(xiàn)與9種雜株類型的基因型不一致的其他一些基因型雜株,對(duì)這些基因型所代表的雜株表現(xiàn)型還有待在正季鑒定中進(jìn)一步研究。

        本次研究對(duì)同一份樣本采取兩種鑒定方法鑒定種子純度,產(chǎn)生一定的差異。研究認(rèn)為,造成多對(duì)SSR標(biāo)記鑒定純度偏低的主要原因是:有一些雜株在正季鑒定中不表現(xiàn)出雜株表現(xiàn)型,而SSR標(biāo)記能較明顯的顯示出是雜株,3對(duì)SSR標(biāo)記檢測(cè)中發(fā)現(xiàn)有0.31%的其它雜株類型的基因型。其次,兩優(yōu)287的父本在大田正季鑒定中也較難以明顯鑒定出來,所以也導(dǎo)致大田正季鑒定的父本所占比例較SSR標(biāo)記鑒定的結(jié)果低0.12%。

        本研究是本公司利用自己建立的生物實(shí)驗(yàn)室,結(jié)合企業(yè)所在制種基地的實(shí)際生產(chǎn)情況,將兩優(yōu)287大田制種和SSR標(biāo)記試驗(yàn)純度鑒定結(jié)合起來進(jìn)行分析比較,首次嘗試采用多對(duì)SSR標(biāo)記精確鑒定兩優(yōu)287的種子純度及所含雜株類型定量分析。我們下一步擬采用這種方法,對(duì)每一個(gè)品種所有的雜株類型進(jìn)行SSR標(biāo)記特性分析,初步建立每個(gè)品種的SSR標(biāo)記指紋庫,然后結(jié)合大田制種的實(shí)際情況,選取幾對(duì)SSR標(biāo)記進(jìn)行種子純度及雜株類型定量分析,確保公司種子安全。

        [1]柳 達(dá),周元坤,王世才,等.兩優(yōu)287秈型雜交早稻栽培技術(shù)要點(diǎn)[J].實(shí)用技術(shù),2006,(5).

        [2]彭鎖堂,顏啟傳,王學(xué)德,等.水稻單粒種子DNA提取及RAPD程序優(yōu)化研究[J].上海交通大學(xué)學(xué)報(bào),2002,20(1):34 ~ 37.

        [3]周嵐.SSR分子標(biāo)記技術(shù)及其在玉米種子鑒定上的應(yīng)用[J].中國(guó)種業(yè),2005,(6):51 ~ 52.

        [4]李晶熠,何平,李仕貴,等.利用微衛(wèi)星標(biāo)記鑒定雜交水稻岡優(yōu) 22 種子純度的研究[J].生物工程學(xué)報(bào),2000,l6(2):211~214.

        [5]蘇順宗,黃玉碧,楊俊品,等.利用SSR鑒定水稻雜交種子純度的研究[J].種子,2003,22(1):23 ~ 25.

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        [8]譚孟君,肖層林,詹慶才.利用SSR分子標(biāo)記鑒定雜交稻種子金優(yōu) 299 純度研究[J].交交水稻,2006,21(4):11 ~ 14.

        [9]李穩(wěn)香,詹慶才.雜交水稻種子純度SSR指紋圖譜標(biāo)記鑒定技術(shù)研究[J].中國(guó)種業(yè),2006,(3):21 ~ 22.

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