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        水稻OsDCL3b基因組織表達分析和沉默載體的構建

        2012-04-29 09:07:53岳怡涵張健廖鵬飛李紹波
        湖北農業(yè)科學 2012年24期
        關鍵詞:水稻基因

        岳怡涵 張健 廖鵬飛 李紹波

        摘要:采用熒光定量PCR方法分析了秈稻93-11根、莖、葉和花藥中OsDCL3b基因的表達,發(fā)現(xiàn)水稻不同組織OsDCL3b的表達量存在明顯差異,花藥中表達量最多,根中表達量最少。重點構建了水稻OsDCL3b基因的沉默載體,通過農桿菌介導轉化粳稻中花11,獲得了轉基因T0代陽性植株,為進一步研究OsDCL3b基因的功能打下了基礎。

        關鍵詞:OsDCL3b基因;組織表達;載體構建;基因沉默;水稻

        中圖分類號:Q943.2 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2012)24-5788-03

        Dicer或Dicer-like(DCL)蛋白通過產生siRNA(silencingRNA)和miRNA(microRNA)等小分子非編碼RNAs(non-codingRNAs,ncRNAs)[1]來調控其他相關基因的表達,進而影響真核生物的生長發(fā)育、抗病抗蟲性和逆境適應性等[2-4]。

        在水稻中,已報道至少存在8個可能的DCL蛋白基因[5]。最初,Liu等[6,7]對OsDCL1和OsDCL4進行了功能分析,發(fā)現(xiàn)OsDCL1與miRNA的生物形成密切相關,缺失OsDCL1的生物個體在幼苗期出現(xiàn)發(fā)育停滯現(xiàn)象,如植株矮化、葉片卷曲、根扭曲等現(xiàn)象。OsDCL4主要影響大小為21nt的siRNA的生物形成,與擬南芥同源基因AtDCL4不同的是,沉默或缺失OsDCL4既影響生物個體的營養(yǎng)生長,又影響生物個體的生殖生長,而AtDCL4僅影響生物個體的營養(yǎng)生長。隨后,Urayama等[8]的研究表明,敲除OsDCL2的轉基因植株中內源性dsRNA病毒的含量水平將明顯降低,植株表現(xiàn)為矮化和育性降低等。Wu等[9]證實,OsDCL3a與lmiRNA(longmicroRNA)的產生密切相關。最近,Song等[10]進一步報道了OsDCL4、OsDCL3b和OsDCL1的功能;其中OsDCL3b的功能為首次報道,報道中僅指出了OsDCL3b的直接生物學功能是加工產生大小為24nt的?。遥危粒@些?。遥危辆烤拐{控哪些相關功能基因的表達,以及相關功能基因的表達變化又如何影響轉基因植株的生長發(fā)育、抗病抗蟲性或逆境適應性等尚未見報道?;谠诙i稻93-11花藥中獲得的OsDCL3b的全長cDNA序列(GenBank登錄號:DQ208406),采用熒光定量PCR方法研究了秈稻93-11不同組織部位OsDCL3b基因的表達差異,并利用RNA干擾技術構建了OsDCL3b基因的沉默載體,采用農桿菌介導法轉化粳稻中花11,獲得了轉基因T0代陽性植株,為進一步研究OsDCL3b基因加工產生的各種小分子ncRNA究竟調控了哪些相關基因的表達、進而影響轉基因植株的生長發(fā)育、抗病抗蟲性或逆境適應性等打下了重要的基礎。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 植物材料、菌種與質粒 秈稻93-11和遺傳轉化所用材料粳稻中花11種子均由南昌大學生命科學與食品工程學院植物遺傳研究室保存。用于基因沉默的質粒pYL為改造的RNAi-Ubi[11],由華南農業(yè)大學劉耀光教授惠贈。大腸桿菌Top10F′、農桿菌EHA105由南昌大學生命科學與食品工程學院植物遺傳研究室保存。

        1.1.2 主要試劑 DL2000DNAMarker、PCR反應所用DNA聚合酶購自天根生化科技(北京)有限公司,質粒小量提取試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司,植物RNA提取試劑盒、反轉錄試劑盒購自Invitrogen公司,T4DNA連接酶、限制性內切酶BamHⅠ、HindⅢ、MluⅠ和PstⅠ購自Fermentas公司,PCR引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        1.2 方法

        1.2.1 總RNA的提取和正向干涉片段的RT-PCR擴增 按Invitrogen公司的TRIzol試劑盒提取秈稻93-11花藥的總RNA后,將其反轉錄成cDNA,再用引物OsDCL3b-Si:5′-AATTGGATCCTCTAGACTCGAGGGTAAAGG-3′和OsDCL3b-Xi:5′-CCGGAAG

        2 結果與分析

        2.1 OsDCL3b在秈稻93-11根、莖、葉和花藥中的表達結果

        2.2 沉默載體的構建結果

        2.3 轉基因T0代陽性植株的鑒定結果

        3 討論

        前人的研究結果表明,粳稻OsDCL3b在營養(yǎng)組織中往往低水平表達,在花器官和種子發(fā)育初期則高水平表達[5]。本研究結果進一步顯示,秈稻OsDCL3b基因在秈稻93-11的花藥中表達量最高,在其他組織中表達量均較低,尤其是在根中的表達量幾乎只有花藥中的50%。由此推測,OsDCL3b基因在水稻花藥中高水平表達可能是水稻穗子的生長發(fā)育所必需的,但有待于進一步試驗證實。

        最近,Song等[10]首次報道了OsDCL3b的直接生物學功能是加工產生24nt的?。遥危?,但是,這些小RNA具體調控了哪些相關基因的表達,進而可能會導致轉基因植株出現(xiàn)哪些差異表型等尚未見報道。研究獲得的轉基因T0代陽性植株為進一步研究OsDCL3b基因的功能打下了重要基礎。

        參考文獻:

        [1]XIEZ,JOHANSENLK,GUSTFSONAM,etal.GeneticandfunctionaldiversificationofsmallRNApathwaysinplants[J].PLoSBiol,2004,2(5):642-652.

        [2]BERNSTEINE,CAUDYA,HANNONG,etal.RoleforabidentateribonucleaseintheinitiationstepofRNAinterference[J].Nature,2001,409(6818):363-365.

        [3]LEEYS,NAKAHARAK,PHYAMJW,etal.DistinctrolesforDrosophiladicer-1anddicer-2inthesiRNA/miRNAsilencingpathways[J].Cell,2004,117(1):69-81.

        [4]MARGISAR,FUSAROAAF,SMITHANA,etal.Theevolutionanddiversificationofdicersinplants[J].FEBSLetter,2006,580(10):2442-2450.

        [5]KAPOORM,ARORAR,LAMAT,etal.Genome-wideidentification,organizationandphylogeneticanalysisofDicer-like,ArgonauteandRNA-dependentRNApolymerasegenefamiliesandtheirexpressionanalysisduringreproductivedevelopmentandstressinrice[J].BMCGenomics,2008,9(1):451.

        [6]LIUB,LIPC,LIX,etal.LossoffunctionofOsDCL1affectsmicroRNAaccumulationandcausesdevelopmentaldefectsinrice[J].PlantPhysiol,2005,139(1):296-305.

        [7]LIUB,CHENZY,SONGXW,etal.OryzasativaDicer-like4revealsakeyroleforsmallinterferingRNAsilencinginplantdevelopment[J].PlantCell,2007,19(9):2705-2718.

        [8]URAYAMAS,MORIYAMAH,AOKIN,etal.Knock-downofOsDCL2inricenegativelyaffectsmaintenanceoftheendogenousdsRNAvirus,Oryzasativaendornavirus[J].PlantCellPhysiol,2010,51(1):58-67.

        [9]WUL,ZHOUH,ZHANGQ,etal.DNAmethylationmediatedbyamicroRNApathway[J].MolCell,2010,38(3):465-475.

        [10]SONGX,LIP,ZHAIJ,etal.RolesofDCL4andDCL3binricephasedsmallRNAbiogenesis[J].PlantJ,2011,69(3):462-474.

        [11]胡旭霞,劉耀光.植物RNA干涉載體的構建及其在水稻基因表達沉默中的應用[J].分子植物育種,2006,4(5):621-626.

        [12]韋靖鸞,陳 深,曾列先,等.水稻白葉枯病抗性基因Xa7候選基因的實時熒光定量表達分析[J].分子植物育種,2011,9(1):9-16.

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