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        BraSDG8 RNA干擾載體的構(gòu)建及其對(duì)擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化

        2012-01-29 11:27:58謝青軒虢婷婷
        湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年13期
        關(guān)鍵詞:擬南芥甲基化結(jié)構(gòu)域

        姜 玲,謝青軒,虢婷婷,阮 穎

        (湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長(zhǎng)沙 410128)

        組蛋白甲基化作為一個(gè)重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記[1],對(duì)植物開花起調(diào)控作用[2]。擬南芥SDG8(SET DOMAIN GROUP 8)編碼的是一種組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶[3],約含有1 806個(gè)氨基酸序列,能特異催化組蛋白H3K36的雙、三甲基化,是FLC表達(dá)所需的表觀遺傳記憶密碼之一,在抑制植物早花過(guò)程中起重要作用[4]。功能缺失的擬南芥sdg8突變體[5-6]36的雙、三甲基化水平顯著降低,開花調(diào)控的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子FLC的轉(zhuǎn)錄激活受到抑制[7],進(jìn)而植株表現(xiàn)為早花表型[8]。

        BraSDG8是湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物發(fā)育與表觀遺傳調(diào)控研究室在白菜型油菜中克隆的擬南芥SDG8的同源基因,cDNA全長(zhǎng)4 963 bp,編碼1 654個(gè)氨基酸,結(jié)構(gòu)域的組成與擬南芥SDG8完全一致,包含 AWS(associated with SET)domain、SET domain和Post SET domain 3個(gè)結(jié)構(gòu)域,同屬于ASH1家族,推測(cè)BraSDG8與SDG8具有相似的生物學(xué)功能[9]。筆者通過(guò)構(gòu)建pFGC5941-BraSDG8 RNA干擾載體及農(nóng)桿菌介導(dǎo)的擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化,旨在為進(jìn)一步研究白菜型油菜BraSDGG8的功能奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        擬南芥(Arabidopsis thaliana)哥倫比亞生態(tài)型Col,大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α,農(nóng)桿菌(A-grobacterium tumefaciens)GV3101 和 pFGC5941 表達(dá)載體由湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物發(fā)育與表觀遺傳調(diào)控實(shí)驗(yàn)室保存;pMD-19 T Vector購(gòu)自TAKARA公司。

        1.2 方法

        1.2.1 BraSDG8-1片段的擴(kuò)增 比對(duì)擬南芥SDG8和BraSDG8 cDNA序列,根據(jù)保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,分別在5′端導(dǎo)入2個(gè)酶切位點(diǎn)(AscⅠ/BamHⅠ),預(yù)計(jì)擴(kuò)增產(chǎn)物大小為443 bp,引物序列如下。

        BraSDG8-1 F:5′-GGCGCGCCGGATCCCCAAG CATCAAGTGGCTCT-3′(NcoⅠ/XbaⅠ)

        BraSDG8-1 R:5′-CCATGGTCTAGAGCACAGA GTTGATAACTTCTGAATCTGGT-3′

        PCR擴(kuò)增(Tm=57℃),回收片段,連接至pMD19-T載體構(gòu)建成pMD19-T-BraSDG8-1,熱激法轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,將陽(yáng)性菌落經(jīng)PCR驗(yàn)證后送博尚生物公司測(cè)序,所得結(jié)果在The Brassica database(BRAD)上進(jìn)行序列比對(duì)分析。

        1.2.2 BraSDG8 RNA干擾載體的構(gòu)建 如圖1所示,BamHⅠ和XbaⅠ雙酶切載體pMD19-TBraSDG8-1和pFGC5941,將目的片段反向插入至查爾酮內(nèi)含子與Ocs終止子之間,構(gòu)建表達(dá)載體p-BraSDG8-1;然后AscⅠ和NcoⅠ雙酶切載體pMD19-T-BraSDG8-1和p-BraSDG8-1,將目的片段正向插入至35 S啟動(dòng)子與查爾酮內(nèi)含子之間,構(gòu)建BraSDG8 RNA干擾載體,記為p-BraSDG8。

        將構(gòu)建好的RNA干擾載體分別導(dǎo)入大腸桿菌DH5α和農(nóng)桿菌GV3101中,測(cè)序驗(yàn)證。

        1.2.3 擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化 采用浸花法將p-BraSDG8載體轉(zhuǎn)化野生型擬南芥Col生態(tài)型。通過(guò)卡那霉素(濃度為40 mg/L)篩選獲得抗性苗,改良的CTAB法提取葉片總DNA,PCR檢測(cè)。引物序列如下。

        35s825F:5′-ATCCCACTATCCTTCGCAAGACC CTT-3′

        Intron825R:5′-TGACTCCATCTTATTCCCTCCG TTTC-3′

        2 結(jié)果與分析

        2.1 BraSDG8-1干擾片段的克隆與檢測(cè)

        克隆得到440 bp左右的目的片段,將目的片段連接至pMD19-T載體上,通過(guò)熱激法轉(zhuǎn)至大腸桿菌DH5α中,獲得陽(yáng)性菌落,PCR檢測(cè)片段為440 bp左右,符合預(yù)期片段大?。▓D2)。

        將目的片段測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與RNA干擾片段進(jìn)行序列比對(duì),同源性達(dá)100%,MegAlign比對(duì)(圖3),BraSDG8-1基因片段序列完整正確,可用于后

        2.2 干擾載體的酶切驗(yàn)證

        用BamHⅠ和XbaⅠ分別單酶切p-BraSDG8驗(yàn)證(圖4),最終分別得到了1 300 bp和2 500 bp左右的條帶,符合預(yù)期片段大小,表明BraSDG8 RNA干擾載體p-BraSDG8構(gòu)建成功。

        2.3 轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌的質(zhì)粒PCR檢測(cè)

        通過(guò)凍融法將干擾載體轉(zhuǎn)至根癌農(nóng)桿菌GV3101,提取陽(yáng)性菌落質(zhì)粒,進(jìn)行質(zhì)粒PCR檢測(cè),擴(kuò)增得到的條帶大小為400 bp左右(圖5),與設(shè)計(jì)的目的片段大小443 bp相符,說(shuō)明干擾載體已轉(zhuǎn)化至根癌農(nóng)桿菌中。

        2.4 抗性苗的PCR檢測(cè)

        通過(guò)改良的CTAB法提取抗性苗總DNA,擴(kuò)增結(jié)果如圖6,檢測(cè)得到1株陽(yáng)性植株。片段大小與預(yù)期片段大小一致,為1 200 bp左右。

        2.5 BraSDG8沉默的轉(zhuǎn)基因植株的表型觀察

        在含有卡那霉素(濃度為40 mg/L)的MS培養(yǎng)基上,抗性苗生長(zhǎng)健壯,子葉飽滿而呈綠色,根系發(fā)育正常,而非抗性苗子葉呈黃色,個(gè)體較小,根長(zhǎng)相對(duì)短?。▓D7)。與野生型擬南芥Col生態(tài)型相比,在營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期,轉(zhuǎn)基因植株的蓮座葉數(shù)目以及生長(zhǎng)狀態(tài)都沒有明顯區(qū)別;在生殖生長(zhǎng)期,轉(zhuǎn)基因植株的花期并未縮短,只是花苔數(shù)目和果莢數(shù)目變少,每個(gè)果莢的結(jié)實(shí)率降低。

        3 討 論

        組蛋白甲基化作為一個(gè)重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記[10-11],是植物發(fā)育過(guò)程中的重要調(diào)節(jié)方式,其主要是由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(histone methyltransferases,HMTs)來(lái)調(diào)控的[12-13]。其中,組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(histone lysine methyltransferase,HLMT)是一類含有 SET(Su(var),Enhancer of zeste,Trithorax)結(jié)構(gòu)域的家族[14]。進(jìn)化上保守的SET結(jié)構(gòu)域包含約130個(gè)氨基酸序列,形成一個(gè)結(jié)狀結(jié)構(gòu)的酶催化中心[15],通過(guò)催化組蛋白甲基化來(lái)影響染色體的結(jié)構(gòu)進(jìn)而調(diào)控基因的表達(dá)[16]。早前的研究顯示,在擬南芥中發(fā)現(xiàn)了約47個(gè)SET DOMAIN GROUP(SDG)基因[17],分別命名為 SDG1~SDG47,其中 SDG8,SDG25,SDG27和SDG30編碼的SET結(jié)構(gòu)域蛋白涉及植物開花時(shí)間的調(diào)控[18]。RNAi是研究基因功能的重要方法[19-20]。BraSDG8是擬南芥SDG8的同源基因,二者的相似性非常高,筆者通過(guò)構(gòu)建干擾載體轉(zhuǎn)化擬南芥,在克隆得到BraSDG8全長(zhǎng)cDNA序列的基礎(chǔ)上,選取其中一段保守片段構(gòu)建RNA干擾載體pFGC5941-BraSDG8,并通過(guò)農(nóng)桿菌GV3101介導(dǎo),浸花法轉(zhuǎn)化野生型擬南芥Col,獲得了穩(wěn)定遺傳的轉(zhuǎn)基因植株。但是與野生型擬南芥(Col)相比,該轉(zhuǎn)基因植株開花時(shí)間、植株大小、蓮座葉數(shù)目等表型并未有明顯差異,其具體的原因有待進(jìn)一步研究。

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