沈永剛 (江蘇省南通市動物衛(wèi)生監(jiān)督所 226008)
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南通地區(qū)犬細小病毒流行病學調(diào)查
沈永剛 (江蘇省南通市動物衛(wèi)生監(jiān)督所 226008)
本調(diào)查中,筆者對2008~2010具有臨床癥狀的犬的糞便樣品進行PCR分析,確定南通地區(qū)犬細小病毒流行類型。結果表明,CPV-2b為目前主要流行病毒株,CPV-2a的比例很低,沒有CPV-2c和CPV-2型。
犬細小病毒 聚合酶鏈式反應 分子特征
犬細小病是犬細小病毒(Canine parvovirus,CPV)引起的犬的一種以病程短、傳染性強、死亡率高為特點的傳染病。犬細小病毒最先于1978年在美國分離到,為了與先前眾所周知的犬細小病毒區(qū)分開又將其命名為犬細小病毒II型(CPV-2)。CPV-2出現(xiàn)后就風靡全球,現(xiàn)在CPV-2流行于大多數(shù)家養(yǎng)犬和野生犬,該病對我國養(yǎng)犬業(yè)造成了極大的危害。通過單克隆抗體和限制性內(nèi)切酶對細小病毒的分析,發(fā)現(xiàn)了一個新的抗原類型命名為CPV-2a,1979年左右CPV-2a在美國廣泛蔓延并且在1980~1981年替代了原始病毒株。隨后,大約在1984年另一種抗原變異體CPV-2b被發(fā)現(xiàn),并且在1986年后美國大部分地區(qū)CPV-2b毒株又取代了CPV-2a毒株。現(xiàn)在CPV-2c又在意大利首次鑒定出來。盡管丹麥、德國、法國、西班牙、日本、澳大利亞、意大利和非洲分離株CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c病毒株比例不同,通過對這些分離株抗原特異性分析顯示:同一型的CPV-2病毒傳播時,新的抗原類型的病毒株的出現(xiàn)陸續(xù)就取代了原有病毒株。在中國,犬細小病毒發(fā)生感染最早于1982年被發(fā)現(xiàn),隨后全國大范圍內(nèi)爆發(fā)高發(fā)病率與死亡率的犬出血性腸炎,然而到目前為止關于CPV流行的抗原類型信息很少。筆者根據(jù)3種抗原變異體的基因標記建立了多聚酶鏈式反應(PCR)方法來對犬細小病毒株進行分型,并且用這種方法對南通地區(qū)犬細小病毒開展流行病學調(diào)查。
1.1 主要試劑 dNTP Mixture、Taq(5U/ml)、10×Buffer電泳緩沖液、DL2000 Markers和II限制性內(nèi)切酶均購自大連寶生物工程有限公司;瓊脂糖為基因公司產(chǎn)品。引物合成:上海生工生物工程有限公司合成。
1.2 樣品 樣品來自2008~2010年間揚州大學動物醫(yī)院經(jīng)免疫膠體金試紙條檢測為CPV強陽性的病犬糞便。取CPV陰性犬糞便作為陰性對照,CPV活疫苗作為陽性對照。
1.3 DNA的制備 樣品用磷酸鹽緩沖液(PBS,10%,w/v)稀釋,然后8000r/min高速離心5min,取上清煮沸10min后冰浴。為了去除抑制聚合酶活性的殘留物質(zhì),在PCR擴增前DNA樣品用蒸餾水進行1:10稀釋。
1.4 PCR引物設計 所有PCR引物設計根據(jù)GenBank中公布的CPV-2,2a,2b和2c的VP2衣殼基因序列(Accession No. AY380577, DQ340434,DQ025992,AB054223)設計而成。引物A(上游引物:5'-GGATGGGTGGAAATCACA GC-3',下游引物:5'-ATAACCAACTCAGCTGGTC-3')分別位于VP2基因2954-2973 bp和3780-3799 bp處,用于擴增VP2上游序列,目的片段大小為815 bp。引物B (上游引物:5'-TCCAGAAGGAGATTGGATTC-3',下游引物:5'-TTCTAGGTGCTAGTTGAGATT-3')分別位于4012-4031 bp和4509–4529 bp處,用來擴增VP2基因的下游序列,目的片段大小為518 bp,該擴增產(chǎn)物中包含一個II特異性酶切位點用于特異性的鑒定CPV-2c。
1.5 PCR反應 PCR反應參照文獻并做微小改動,將反應中的MgCl2濃度調(diào)整為1.5mM。PCR反應程序為:94℃變性30s,52℃退火45s,72℃延伸1min,共30個循環(huán)。PCR擴增產(chǎn)物1.2%瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(EB)染色后凝膠成像系統(tǒng)拍照觀察。
1.6 PCR產(chǎn)物限制性內(nèi)切酶酶切反應 限制酶II能夠選擇性的識別CPV-2c VP2基因4060-4064 bp處GAAGA序列。通過引物B擴增獲得的PCR產(chǎn)物取10μl根據(jù)說明用5單位II限制性內(nèi)切酶,37℃酶切3h,然后用1%的瓊脂糖凝膠電泳,EB染色后紫外凝膠成像系統(tǒng)拍照觀察。
1.7 測序 將PCR擴增產(chǎn)物送至上海生物工程有限公司測序。
2.1 PCR擴增結果 以陽性對照為PCR模板,經(jīng)PCR擴增和瓊脂糖凝膠電泳,可以清晰地觀察到兩條與預期大小(815bp,518bp)相一致的目的條帶。從臨床健康犬糞便樣品中未獲得擴增條帶,說明PCR反應體系正確,經(jīng)PCR分析,239份糞便樣品中,有230份經(jīng)PCR擴增出現(xiàn)了2條特異性的目的條帶。
2.2 限制片段長度多態(tài)性(RFLP)和測序結果 為了檢測出樣品中可能存在的CPV-2c型毒株,用II限制性內(nèi)切酶進行RFLP分析,結果顯示230份樣品中沒有CPV-2c型毒株。因此隨機選取23(10%)份樣品送去測序,結果顯示23份樣品為CPV-2a和CPV2b型(見表1)。
表1 23份陽性樣品的來源與分型
23份樣品測序顯示僅僅2/23份的VP2蛋白在426位點處有AAT密碼子,這是CPV-2a的特征,然而其余21份樣品在VP2蛋白同一位點處為GAT密碼子,是CPV-2b的特征(見表2)。
表2 23份樣品PCR產(chǎn)物的序列分析氨基酸位點
就像1970年CPV-2的出現(xiàn)和突然消失令人驚訝一樣,犬細小病毒發(fā)生了很多變化,例如病毒在短短的幾年內(nèi)宿主范圍的迅速擴大。病毒的變異體如此之多部分是由于其突變速度就像RNA病毒的進化速度那么快所導致的,這些病毒對家養(yǎng)犬和野生物種的健康具有潛在的負面危害已經(jīng)引起了人們廣泛的關注。雖然犬細小病毒新的變異體CPV-2c第一次在意大利被檢測出后就在其他歐洲國家和南美出現(xiàn),但在本研究中筆者并沒有發(fā)現(xiàn)CPV-2c,而且發(fā)現(xiàn)了CPV-2b出現(xiàn)的頻率極高(21/23),這也說明CPV-2b是目前南通地區(qū)犬細小病毒流行的主要毒株。盡管我國在1982年即發(fā)現(xiàn)了CPV,但在過去的幾年里并沒有關于CPV基因型的統(tǒng)計分析,無法分析CPV的進化過程。本調(diào)查結果指出在南通地區(qū)的CPV-2b突變體比CPV-2a突變體更流行,這與美國和英國的流行趨勢相一致;而在德國和西班牙,CPV2a和CPV2b的發(fā)生幾率相當;相比之下,澳大利亞則以CPV-2a的感染更為常見。對于CPV突變體在世界范圍內(nèi)分布不同的原因還不清楚。除了CPV-2b,筆者還鑒定了南通地區(qū)存在CPV-2a型的毒株,經(jīng)序列分析,結果表明該毒株的基因型序列與已報道的nj01/06毒株序列果完全相同。由于南通和南京在地理位置上非??拷虼藦倪@兩個地方分離到基因型完全一致的毒株是完全有可能的。據(jù)知,目前在亞洲除了越南之外沒有關于CPV-2c的報道。因此,更多的樣品、更深入細致的調(diào)查亟待開展,只有這樣,才能了解和掌握CPV在未來的流行和發(fā)展趨勢。
(2011–07–06)
S858.292
A
1007-1733(2011)10-0060-02